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大腸癌易感基因hMLH1、hMSH2的篩查

2012-08-20 05:46:24侯睿智安治國毛靜濤侯治富
中國實驗診斷學 2012年1期
關鍵詞:基因突變差異

侯睿智,安治國,魏 君,毛靜濤,侯治富*

(1.吉林大學中日聯誼醫院,吉林 長春 130033;2.北京龍邁達科技有限公司,北京 100176)

大腸癌易感基因hMLH1、hMSH2的篩查

侯睿智1,安治國1,魏 君1,毛靜濤2,侯治富1*

(1.吉林大學中日聯誼醫院,吉林 長春 130033;2.北京龍邁達科技有限公司,北京 100176)

目的 探討hMLH1、hMSH2基因多態性與大腸癌發病危險的研究。方法采用大樣本隨機對照試驗,運用PCR和DNA直接測序方法,篩查外周血單個核細胞DNAhMLH1、hMSH2基因多態性。結果大腸癌組hMLH1-exon12 1151T→A的突變陽性率為12.20%,與對照組(6.10%)相比,無顯著差異(P>0.05);而hMSH2-exon1 IVS1+9C→G的突變陽性率為46.70%,與對照組(33.33%)相比差異顯著(P<0.05)。在各年齡組間,hMLH1-exon12、hMLH1-exon12突變無顯著性差異(P>0.05)。危險性分析表明,攜帶hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變發生大腸癌的相對危險性為無基因突變組的1.75倍,若不攜帶基因突變,其腸癌發病率將降低42.9%;若在人群中無hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變發生,則大腸癌的發病率將降低20%。結論hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變可作為大腸癌發病的危險因素,并可作為檢測指標。

大腸癌;多態性;hMSH2

(ChinJLabDiagn,2012,16:0049)

hMSH 2基因位于染色體區域2p 21,在遺傳連鎖分析中,是最早被確定的影響遺傳性非息肉性大腸癌(HNPCC)綜合征的一個重要的候選基因。其編碼產物hMSH 2蛋白與hMSH 6或hMSH 3形成異二聚體,并以異二聚體復合物的形式識別、結合DNA復制中的錯誤位點,借以消除子代序列中的錯誤,使DNA復制按照母模板序列正常復制。

hMLH1基因位于染色體3p 21-23,與hMSH 2基因一樣與HNPCC有關。其基因編碼產物hMLH1蛋白本身無酶活性,與hMLH3,hPMS2或hPMS1形成異二聚體,借以結合其他的DNA修復蛋白。

早期的研究表明,hMSH2基因的16個外顯子和hMLH1基因的19個外顯子都能發生致病性突變。目前尚沒有關于這兩個基因致病性突變、或是多態性的評價標準。在本項研究中,試圖通過大樣本隨機對照試驗,探索在大腸癌中這種突變的致病性或致病危險性。

1 對象與方法

1.1 患者選擇與分組150例大腸癌患者均為2007年-2009年吉林大學中日聯誼醫院住院病例。其中,男性86例,女性64例;平均年齡為49.5歲。診斷標準采用全國大腸癌病理研究協作組2002年制定的《全國大腸癌病理研究統一規范》。另選取150例健康體檢者作為對照,其中男性79例,女性71例;平均年齡47歲。

1.2 去靜脈全血,分離單個核細胞提取DNA,用QIAGEN旋轉柱純化樣本。

1.3 PCR擴增目的基因片段由寶生物工程(大連)有限公司合成引物。hMLH1-exon12上游引物5′-ACAGACTTTGCTACCAGGACTTG-3′,下 游引 物 5′-TGTCTTATCCTCTGTGACAATGG-3′。hMSH2-exon1上游引物 5′-TCGCGCATTTTCTTCAACC-3′,下 游 引 物 5′-GTCCCTCCCCAGCACGC-3′。PCR循環參數為:充分變性95 ℃、5 mins,變性95℃、40s,退火55℃、40s,延伸72℃、60s。35個循環,再充分延伸72℃、5mins。經瓊脂糖電泳鑒定PCR產物。

1.4 DNA序列測定PCR反應管內加入1μl的3M醋酸鈉,1μl EDTA和25μl無水乙醇,吹打混合均勻。室溫放置15-30min,12 000rpm,4℃15-20min離心,小心吸棄溶液,加入70%的乙醇漂洗,12 000rpm,4℃8-10min離心,再次加入70%的乙醇漂洗,上述條件離心,開蓋閉光晾置,至殘余酒精徹底揮發干凈,使PCR產物純化。加入10μl hidi(甲酞胺),95℃變性2-3min,立即冰浴,即可上機。比較在測序圖上的相應堿基序列峰型,如果出現峰型重疊,根據峰型的顏色、波幅,判定置換的堿基。

1.5 統計方法采用SPSS13.0統計軟件,對hMSH2基因IVS1+9C→G、hMLH1基因1151T→A多態性進行危險度(Risk)分析和等級相關分析。

2 結果

2.1 PCR擴增結果對150例健康體檢者、150例大腸癌患者外周血單個核細胞DNA進行hMLH1-exon12、hMSH2-exon1 擴 增 后,分 別 在 216bp 和281bp處獲得了擴增產物。其中有147例健康體檢者、82例大腸癌標獲得hMLH1-exon12擴增出結果;126例健康體檢者、90例大腸癌標本獲得hMSH2-exon1擴增出結果。

2.2 DNA序列分析結果對147例健康體檢者和82例大腸癌患者hMLH1-exon12擴增PCR產物進行DNA序列分析(結果見表1,2)。

統計結果表明,大腸癌組的突變陽性率為12.20%,與對照組(6.10%)相比,無顯著差異(P>0.05)。

Tab.1 hMLH1-exon12 1151T→A in colorectal cancer patients

Tab.2 hMLH1-exon12 1151T→A in colorectal cancer of different ages

在各年齡組間,hMLH1-exon12 1151T→A突變陽性率的Kendall等級相關分析表明,無顯著性差異,χ2近似于零,P>0.05)。

對126例健康體檢者和90例大腸癌患者hMSH2-exon1擴增PCR產物進行DNA序列分析(結果見表3,4)。

Tab.3 hMSH2-exon1IVS1+9C→G in colorectal cancer patients

結果表明,大腸癌組的突變陽性率為46.70%,與對照組(33.33%)相比差異顯著(P<0.05)。

危險性分析表明,攜帶hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變發生大腸癌的相對危險性(OR)為無基因突變組的1.75倍;在對照組中,若不攜帶基因突變,其腸癌發病率將降低42.9%(特異危險性百分比AR%);若在人群中無hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變發生,則大腸癌的發病率將降低20%(人群特異危險性百分比PAR%)。

Tab.4 hMSH2-exon1IVS1+9C→G in colorectal cancer of different ages

在各年齡組間,hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變陽性率的Kendall等級相關分析表明,無顯著性差異(χ2=0.139,P>0.05)。

3 討論

大腸癌(Colorectal cancer,CRC)是全球第三個最常見的癌癥,位居肺癌和乳腺癌癌癥之后。60%發生在較發達地區。按年齡標準化率和累計計算,0-74歲人群中大腸癌的發病率和死亡率有明顯的地理變異。在世界各地,捷克發病率最高(43/10萬),非洲(3.6/10萬,除南非)和中南亞(4.5/10萬)發病率最低。歐洲CRC死亡率最高,中非地區死亡率最低。

根據中國衛生部2002年的報告,結直腸癌的發病率已由70年代的第6位升至90年代的第3位,并且年死亡率上升至10.25/10萬,在世界范圍內處于較低水平[1-4]。

大腸癌的確切病因仍不清楚,隨著人們對家族性腺瘤性息肉病、遺傳性非息肉性大腸癌認識的深入,追尋遺傳標志篩查大腸癌成為當今的熱點。本課題組的前期研究也表明,大腸癌p53基因突變率為44%,并于ras基因協同突變[5,6]。揭示了大腸癌發生演變中的遺傳因素的作用。

關于MMR基因突變,國內外有較多的文獻報道。特別是在遺傳性非息肉性結直腸癌(hereditary nonpolyposis colorectal cancer,HNPCC)的研究中,己有大量的錯配修復基因突變資料的積累。在HNPCC中絕大多數的腫瘤是由hMSH2和hMLH1基因的胚系突變引起的,其中hMSH2基因的突變占31%,hMLH1占33%。在散發性結腸癌和胃癌中,己報道的hMLH1基因的突變(42%),較hMSH2基因高(8%)[7]。

有研究發現,至少在白人中hMLH1的 WS14-19多態位點的A和G兩種基因型,預實驗的數據提示這種多態與部分直腸癌的發病有關。Hutter等報道,在結直腸癌患者中hMLH1的突變型IVS14-19G基因型較正常人群的高,分別為55.5%和39.2%,相關危險性G是A的1.93倍。除了荷蘭患者組,其余各組亦得到相同結果。錯配修復基因PMs2中的SNPs與MLH1之間存在蛋白水平的相互作用,可導致基因的改變,進而影響表達蛋白的功能,這三種多態均增加了HNPCC發生危險[7]。

本研究采用了PCR-DNA Direct sequencing技術,針對大腸癌患者的外周血單個核細胞的DNA進行了檢測,進一步深入研究hMSH2和hMLH1基因多態與大腸癌發病的相關性和危險性。研究結果表明,hMLH1-exon12 1151T→A突變陽性檢出率,大腸癌組為12.20%,與對照組(6.10%)相比,無顯著差異(P>0.05)。在各年齡組間的Kendall等級相關分析結果無顯著性差異(χ2近似于零,P>0.05)。在hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變分析中,大腸癌組的突變陽性率為46.70%,顯著高于對照組(33.33%)(P<0.05)。進一步的危險性分析提示,攜帶hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變發生大腸癌的相對危險性(OR)為無基因突變組的1.75倍;在對照組中,若不攜帶基因突變,其腸癌發病率將降低42.9%(特異危險性百分比AR%);若在人群中無hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變發生,則大腸癌的發病率將降低20%(人群特異危險性百分比PAR%)。在各年齡組間,hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變陽性率的Kendall等級相關分析無顯著性差異(χ2=0.139,P>0.05)。

盡管這一結果與國外有關大腸腫瘤hMLH1基因和hMSH2基因變異的蛋白表達水平研究結果不完全一致,但結果提示,hMSH2基因突變不僅與HNPCC的發病有關,而且與一定比例散發性大腸癌有關,并且認為hMSH2基因是誘導細胞凋亡而導致腫瘤抑制的一個重要機制。因此,篩查hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變,仍然可以作為大腸腫瘤篩查、早期診斷的參考指標。

[1]Miladinov-Mikov M,Lukic N,Petrovic T.Epidemiological characteristics of colorectal cancer in Vojvodina[A].In:Riboli E,Lambert R,editors.Nutrition and Lifestyle:Opportunities for Cancer Prevention[C].International Agency for Research on Cancer.Lyon:IARC Sci Publ,2002:156,547.

[2]Ferlay J,Parkin DM,Steliarova-Foucher E.Estimates of cancer incidence and mortality in Europe in 2008[J].Eur J Cancer,2010,46(4):765.

[3]Rachet B,Maringe C,Nur U et al.Population-based cancer survival trends in England and Wales up to 2007:an assessment of the NHS cancer plan for England[J].Lancet Oncol,2009,10(4):351.

[4]李 明,顧 晉.中國結直腸癌年來發病模式的變化趨勢[J].中華胃腸外科雜志,2004,7(3):214.

[5]白元松,張秀梅,盧振霞,等.大腸癌ras癌基因、p53抑癌基因突變與臨床研究[J].中國腫瘤臨床,2007,7(2):146.

[6]Hou ZF,Wang WZ,Yang SJ et al.Mutation of P53tumor suppressor gene in colorectal cancer and its relationship with histologic grade and Dukes’stage[J].J N Bethune Univ Med,1999,25(2):140.

[7]Hutter P,Wijnen J,Rey-Berthod C,et al.An MLH1haplotype is over-represented on chromosomes carrying an HNPCC predisposing mutation in MLH1[J].J Med Genet,2002,39(5):323.

Screening of susceptible gene hMLH1and hMSH2in Colorectal cancer

HOURui-zhi,ANZhi-guo,WEIJun,etal.(China-JapanUnionHospitalofJilinUniversity,Changchun130033,China)

ObjectiveTo explore the hMLH1,hMSH2gene polymorphisms and colorectal cancer risk.MethodsUsing large sample randomized controlled trials,hMLH1,hMSH2gene polymorphism of peripheral blood mononuclear cells DNA were screened by PCR and DNA direct sequencing.ResultshMLH1-exon12 1151T->A mutation in colorectal cancer group was 12.20%,there is no significant difference comparing with control group(6.10%)(P>0.05);hMSH2-exon1IVS1+9C->G mutation(46.70%)was significantly higher than control group(33.33%)(P<0.05).But there is no significant difference in ages(P>0.05).Risk analysis shows that,the relative risk with hMSH2-exon1IVS1+9CG mutations in colorectal cancer is 1.75times of control group.The incidence of colorectal cancer will be reduced by 42.9%if it do not carry the gene mutation,and be reduced by 20%in population.ConclusionhMSH2-exon1IVS1+9C->G mutation can be used as the pathogenesis of colorectal cancer risk factors,and can be used as the testing index.

Colorectal cancer;polymorphism;hMSH2

1007-4287(2012)01-0049-03

吉林省科技發展計劃項目(200705308,20090738)

*通訊作者

R735.3+4

A

2010-11-29)

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