曾 濤,何 德(廣東醫學院醫學檢驗學院,廣東東莞 523808)
泛素-核糖體蛋白S27a(UBRPS27a)是泛素和核糖體蛋白的融合蛋白,由RPS27A基因編碼[1]。核糖體蛋白S27a(RPS27a)為核糖體40S亞基組成蛋白之一,除參與蛋白質合成外,還具有其他重要功能。RPS27A基因在多種活性增殖細胞中高度表達,其過表達是肝癌、胃癌、結腸癌等多種惡性腫瘤的典型特征,很可能是惡性轉化細胞或腫瘤組織的標志物,但其在腫瘤細胞中的功能作用及其分子機制尚未清楚[2-5]。本研究以原核系統表達人UBRPS27a,旨在為進一步研究其結構與功能奠定基礎。
1.1 材料 原核表達載體pGEX4T-1、人急性早幼粒細胞白血病HL-60細胞株、大腸埃希菌JM109及BL21(DE3)由廣東醫學院生物化學與分子生物學研究所保存。Taq DNA聚合酶、限性內切酶BamHⅠ和SmaⅠ、DNA T4連接酶、DL2000 DNA分子標記物、λHindⅢ標記物、載體PMD18-T購自TaKaRa公司。質粒抽提試劑盒和DNA凝膠回收試劑盒購自TIANGEN公司。TRIzol試劑和反轉錄(RT)聚合酶鏈反應(PCR,RT-PCR)試劑盒購自Invitrogen公司。其他試劑均為國產或進口分析純。
1.2 方法
1.2.1 RPS27A基因cDNA全長克隆 根據人RPS27A基因cDNA序列(GenBank NM_002954)以及pGEX4T-1載體上的多克隆位點設計上游引物P1(5′-CGC GGA TCC ATG CAG ATT TTC GTG AA-3′,下劃線部分為BamHⅠ酶切位點)及下游引物P2(5′-TCC CCC GGG TTA CTT GTC TTC TGG TTT G-3′,下劃線部分為SmaⅠ酶切位點),由上海生工公司合成。收集對數生長期HL-60細胞,TRIzol試劑抽提總RNA,Oligo dT18引物反轉錄合成RPS27AcDNA第1鏈;以P1和P2為引物,RT-PCR擴增RPS27A編碼區cDNA片段全長,擴增反應條件為95℃5min,94℃45s、52℃1min、72℃1min循環35次,72℃10min,取擴增產物進行2.0%瓊脂糖凝膠電泳,在紫外分析儀上觀察擴增結果并拍照;將膠回收法純化的目的片段與PMD18-T載體進行T/A克隆重組,挑選單克隆菌落,PCR鑒定陽性克隆送上海生工公司測序;用質粒提取試劑盒抽提經測序驗證克隆正確的質粒DNA(TRPS27A)。
1.2.2 pGEX4T-1-RPS27A重組質粒構建 以BamHⅠ和SmaⅠ對T-RPS27A質粒和pGEX4T-1載體進行雙酶切,酶切產物用瓊脂糖凝膠電泳分離;膠回收法純化的目的基因DNA片段與線性載體DNA片段在T4連接酶作用下連接過夜,轉化感受態JM109細菌;挑取單克隆菌落接種于含氨芐西林(Amp+)LB培養基中,37℃振蕩培養過夜,提取質粒DNA,PCR與雙酶切法鑒定后將陽性候選克隆送上海生工公司測序。
1.2.3 重組質粒誘導表達 以測序驗證正確的pGEX4T1-RPS27A重組質粒轉化感受態BL21細菌,挑選單克隆菌落,PCR與雙酶切法鑒定;將含重組質粒的BL21細菌接種于Amp+LB培養基,振蕩培養過夜;將過夜培養菌按體積比1∶30接種于新鮮LB培養基,37℃劇烈振蕩培養至A600約為0.5,加1mmol/L異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)培養4h;以冰預冷磷酸鹽緩沖液懸浮菌體,超聲破碎,離心取上清進行12%十二烷基硫酸鈉聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE),考馬斯亮藍R250染色后觀察結果。
2.1 RPS27A基因cDNA全長克隆 RT-PCR擴增產物經瓊脂糖凝膠電泳,在200bp與500bp之間發現1條清晰DNA條帶,大小與目的基因預期片段480bp相符(見圖1)。

圖1 RPS27AcDNA擴增產物瓊脂糖凝膠電泳
2.2 pGEX4T1-RPS27A重組質粒酶切鑒定 PCR鑒定陽性重組質粒雙酶切產物瓊脂糖凝膠電泳顯示,酶切獲得的2個片段分別與pGEX4T-1載體(4 950bp)及RPS27A目的片段(480bp)預期大小相符(見圖2)。測序結果顯示重組質粒中插入DNA片段序列與RPS27A基因cDNA全長完全一致(見圖3)。

圖2 pGEX4T-1-RPS27A重組質粒酶切鑒定
2.3 GST-UBRPS27a融合蛋白誘導表達 pGEX4T-1-RPS27A重組質粒誘導表達產物電泳圖出現了2個過表達蛋白條帶,1條與GST-UBRPS27a融合蛋白相對分子質量(RMM)44×103(GST、UBRPS27a的RMM分別為26×103和18×103)相符,表達效率很高,另出現1條RMM稍小的蛋白條帶(見圖4)。

圖3 pGEX4T1-RPS27A重組質粒中插入DNA片段部分測序圖譜

圖4 SDS-PAGE分析大腸桿菌GST-UBRPS27a重組蛋白的表達
人UBRPS27a蛋白N端是泛素,C端是RPS27a,兩端結構域在不同物種中均高度保守。RPS27a通過C4型鋅指結構域與DNA結合,組成核糖體結構,參與蛋白合成。RPS27a通常與泛素融合,主要存在于細胞質中。泛素在核糖體合成過程中作為分子伴侶,在RPS27a進入核糖體之前對其有保護和穩定作用。本研究擴增了RPS27A基因編碼區全長cDNA,成功構建了pGEX4T-1-RPS27A重組質粒,并在大腸埃希菌中誘導表達了GST-UBRPS27a融合蛋白,為進一步利用GST標簽進行UBRPS27a蛋白純化、制備其單克隆抗體及研究其結構奠定了基礎。蛋白誘導表達產物電泳圖顯示除GST-UBRPS27a融合蛋白高效表達外,另有1條RMM相對較小的條帶(約30×103左右)過表達。為排除其他混雜克隆的干擾,本研究將pGEX4T-1-RPS27A重組克隆在Amp+LB培養基上進行劃線培養,挑取單克隆菌落重新誘導表達后,依然出現該條帶。由此可見該蛋白條帶是特異的,考慮可能為GST-UBRPS27a融合蛋白部分降解產物,有待后續實驗進一步驗證。
RPS27A基因的表達在多種腫瘤組織中異常升高,可能在腫瘤發生、發展中具有重要作用。該基因是一種早期生長反應基因,在結腸癌及胃癌組織中的表達明顯高于周邊正常黏膜組織[4]。而且RPS27A基因在低分化肝癌中的表達較正常水平升高20倍以上,用RNA干擾方法沉默RPS27A基因可導致腫瘤細胞周期停滯及細胞萎縮,說明該基因與肝癌發生有關[6]。RPS27A基因在胰腺癌的癌前病變組織表達水平升高,可用于胰腺癌早期鑒別診斷。深入分析RPS27A基因與腫瘤的關系有利于發現新的腫瘤標志物及臨床治療靶標。但目前對該分子在腫瘤細胞中的具體功能及分子作用機制所知尚少。蛋白激酶CK2與多種腫瘤密切相關,是目前腫瘤治療研究中的靶點之一[7]。黃功華等[8]采用酵母雙雜交技術篩選HL-60細胞cDNA文庫時發現,人UBRPS27a是CK2α′亞基的候選結合蛋白。但酵母雙雜交系統有可能存在假陽性結果。故本研究誘導表達的GST-UBRPS27a融合蛋白為采用GST pull down試驗驗證UBRPS27a與CK2α′亞基的相互作用準備了條件,也為后續研究UBRPS27a結構與功能及其在腫瘤發生發展過程的分子調控機制奠定了基礎。
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