彭 飛,王傳喜,江宏磊,江寧宇,謝 陽,陳路劼,江 紅,連云陽
福建省微生物研究所,福建省新藥(微生物)篩選重點實驗室,福州 350007
放線菌是生物活性物質的重要來源,隨著從鏈霉菌(Streptomyces sp.)中發現新活性物質概率的降低,稀有放線菌[1]逐步成為關注的熱點,如Nocardia、Micromonospora、Microbispora、Saccharothrix、Streptosporangium 等[2,3]。鏈孢囊屬(Streptosporangium)放線菌作為一類稀有放線菌,其產生的許多次級代謝產物因具有抗菌、抗腫瘤等廣泛的生物學活性而備受關注,如 platomycins[4]、sibiromycin[5]、sinefungin[6]。
本實驗室從海洋沉積物中分離篩選出一株放線菌FIM09-1157,其發酵代謝產物具有抑制神經氨酸酶活性。本文采用形態學描述和16S rDNA序列分析對該菌株進行初步分類學研究,同時利用各種化學分離技術從放線菌FIM 09-1157發酵液中獲得活性代謝產物T1并進行結構解析,研究其體外神經氨酸酶抑制活性。
AV-400核磁共振儀(美國Bruker公司),TMS為內標;質譜儀(Aligent Quattro Premier Triple Quadrupole mass spectrometer);高效液相色譜儀(SHIMADZU 20A-DAD);Agilent ultimate XB-C18色譜柱(10 × 250 mm,5 μm);Sephadex LH-20(Pharmacia公司);柱色譜硅膠(200~300目)和硅膠H及薄層色譜硅膠GF254(青島海洋化工廠);神經氨酸酶抑制劑篩選試劑盒(碧云天生物技術研究所)。
FIM09-1157來自于福建省微生物研究所菌種保藏中心,從臺灣海峽的海泥樣品中分離得到,其發酵代謝產物具有神經氨酸酶抑制活性。
形態觀察:菌株FIM09-1157的孢子懸液在高氏-天冬素瓊脂平板上劃線,同時斜插無菌蓋玻片,35℃培養,分別于5、10、20天取出蓋玻片,在光學顯微鏡及電鏡下觀察菌絲及孢子形態特征。
16S rDNA序列分析:菌株總DNA提取采用劉志恒等人的方法[7]。以總DNA為模板,引物序列如下:27f:5'-agagtttgatcctggctcag-3';1492r:5'-tacggctaccttgttacgactt-3',Tag酶進行PCR擴增。擴增程序采用:94℃預變性2 min,94℃變性40 s,54℃退火40 s,72℃延伸3 min,共30個循環,最后72℃延伸10 min。PCR產物的測序由北京泰京生物有限公司完成。測序結果在NCBI進行BLAST比對,再通過軟件Clustalx(version 1.8)對擴增序列和GenBank中近緣典型菌種的序列進行比對,用MEGA4.1構建系統發育樹。
斜面培養基采用含1%NaCl的ISP-3,成熟的培養物從斜面培養基中接入種子培養基:可溶性淀粉15 g;葡萄糖5 g;蛋白胨5 g;酵母粉5 g;K2HPO40.5 g;MgSO4·7H2O 0.5 g;CaCO31 g;NaCl 0.5 g;(NH4)2SO40.5 g;H2O 1000mL;pH7.5;28℃ 220 rpm培養72 h,以8%接種量轉接發酵培養基:可溶性淀粉40 g;葡萄糖5 g;黃豆餅粉20 g;蛋白胨5 g;燕麥 5g;NaCl 0.5 g;MgSO4·7H2O 0.5 g;K2HPO40.5 g;CaCO31 g;H2O 1000 mL;pH7.5;28 ℃ 220 rpm培養120 h。
放線菌FIM09-1157發酵液40 L,4500 rpm離心15 min得上清液。菌絲體用3倍體積的甲醇浸泡2 h,離心后用水稀釋成20%的甲醇浸泡液,上述兩部分合并經大孔吸附樹脂HP-20吸附,甲醇洗脫,洗脫液減壓濃縮蒸干,加入適量的乙酸乙酯溶解提取3次,合并乙酸乙酯溶液,蒸干得粗品。
粗品用甲醇溶解后硅膠拌樣,上硅膠柱,氯仿-甲醇梯度洗脫,神經氨酸酶活性檢測跟蹤,TLC分析合并相同活性餾份,濃縮后采用Sephadex LH-20凝膠分離,氯仿:甲醇(1∶1)洗脫,活性與TLC跟蹤,活性餾份進一步經反相C18色譜柱層析(5% ~100%甲醇-水梯度洗脫)和半制備HPLC(ultimate XB-C18,5 μm,10 ×250 mm,甲醇:1‰氨水 =1∶4,238 nm)純化,得到化合物 T1(40mg,tR=25 min)。
采用96孔熒光酶標板測定,每孔依次加入70 μL神經氨酸酶檢測緩沖液,10 μL神經氨酸酶(0.3 U/mL),5 μL待測樣品(對照孔以緩沖液代替)和5 μLMilli-Q水。振動混勻1 min,37℃孵育2 min,每孔再加入10 μL神經氨酸酶特異性熒光標記底物(80 mmol/L),振動混勻1 min,37℃孵育20 min后用M5多功能酶標儀(美國Molecular Devices公司)測定熒光強度(F)。激發波長為360 nm,檢測波長為440 nm。
計算樣品對神經氨酸酶的抑制率和半數抑制濃度。公式:抑制率(%)=(F對照-F樣品)/F對照×100%。
菌株FIM09-1157接種在含1%NaCl的燕麥瓊脂上,28℃培養20 d后,菌落呈圓形,直徑約1~3 cm,邊緣整齊,菌落隆起,表面稍皺折,菌落表面被一層粉紅色粉狀的孢子層覆蓋,基絲的顏色為深粉紅色(Deep Pink),菌落周圍未見可溶性色素產生?;z生長豐富,分枝較少,無橫隔,不斷裂,氣絲上有孢囊形成,孢囊圓形,直徑5 ~8 μm(圖1)。

圖1 菌株FIM09-1157掃描電鏡菌絲形態(ISP9+蜜二糖瓊脂28℃培養30 d)Fig.1 Scanning electron micrograph of strain FIM 09-1157 grown on ISP9+melibiose at 28 °C for 30 days.(Bar,10 μm)
測得菌株FIM 09-1157的16S rDNA序列1415 bp(Accession number:JQ910638)與 Genebank中基因序列進行Blast比對,結果發現該菌與Streptosporangiumvulgarestrain ATCC 33329同源性最高,達到99%。采用Neighbor-Jointing法構建FIM 09-1157與近緣典型菌株的16S rDNA系統進化樹(圖2)。菌株FIM 09-1157 與鏈孢囊菌 S.vulgarestrain ATCC 33329、S.purpuratum strain CY-15110 以及 S.yunnanense strain CY-11007處于同一個分枝。16S rDNA序列分析表明菌株FIM 09-1157屬于鏈孢囊菌(Streptosporangium),暫定名 為StreptosporangiumFIM 09-1157。

圖2 FIM09-1157與相關典型菌株的16S rRNA系統進化樹Fig.2 Phylogenetic tree based on the16S rDNA sequences of strain FIM09-1157 and representative species of the genus Streptosporangium(Bootstrap values are shown as percentages at each node)
化合物T1為白色粉末。其甲醇溶液在239 nm和302 nm處有特征UV吸收。ESI-MS:m/z 239[M+H]+,1H-NMR,13C-NMR,1H-1H COSY 以及 HMBC數據如表1所示。綜合分析化合物T1紫外、質譜及核磁等光譜學數據,結合文獻[8],確定化合物T1為硫內酯類化合物Thiotetromycin?;瘜W結構見圖3。

表1 T1的核磁共振數據表Table 1 The NMR spectral data of compound T1

圖3 化合物T1的結構Fig.3 Chemical structure of compound T1
活性篩選發現化合物T1體外具有抑制神經氨酸酶活性,其半抑制濃度 IC50值為92 μmol/L,而神經氨酸酶抑制劑扎那米韋[11]的半抑制濃度IC50值為246.3 μmol/L。當濃度達到210 μmol/L 時,化合物T1對神經氨酸酶的抑制率達到96%。
已發現鏈孢囊菌(Streptosporangium sp.)能夠產生許多結構新穎的活性代謝產物,如Spoxazomicins[9]。本文首次從鏈孢囊菌(Streptosporangium sp.)代謝產物中篩選到硫內酯類抗生素Thiotetromycin,進一步說明了鏈孢囊菌產生次級代謝產物的多樣性。
抗生素Thiotetromycin[8]是1983年日本科學家從鏈霉菌(Streptomyces sp.)的發酵液中分離得到。結構研究發現化合物T1與Thiotetromycin同質,與另一個具有共軛二烯以及5元硫內酯環結構的化合物Thiolactomycin[10]結構相似,兩者僅在內酯環側鏈基團上有微小差異(前者為乙基,而后者的側鏈基團是甲基)。本文首次報道Thiotetromycin具有神經氨酸酶抑制活性,其活性強于目前臨床使用的神經氨酸酶抑制劑扎那米韋,說明此類物質可能具有潛在的抗病毒活性。本項研究發現了硫內酯類化合物新的生物學活性,為從硫內酯類化合物中發現結構新穎的神經氨酸酶抑制劑奠定基礎。
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7 Liu ZH(劉志恒),Jiang CL(姜成林).Modern biology and biotechnology of actinomycete(放線菌現代生物學與生物技術).Beijing:Science Press,2004.293-295.
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