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三個亨廷頓舞蹈病家系APEX基因氧化還原功能區變異檢測

2013-12-17 07:39:58魏志茹陳文哲申夢姣崔健健李曉文
鄭州大學學報(醫學版) 2013年2期
關鍵詞:檢測

周 璐,姜 楠,魏志茹,陳文哲,申夢姣,崔健健,李曉文

1)鄭州大學臨床醫學系 鄭州450052 2)鄭州大學基礎醫學院細胞生物學與醫學遺傳學教研室 鄭州450001

#通訊作者,女,1955年8月生,本科,教授,研究方向:遺傳病的分子機制與基因診斷,E-mail:Lixiaowen@zzu.edu.cn

亨廷頓舞蹈癥(Huntington's disease,HD)是以神經系統退行性改變為主要特征的常染色體顯性遺傳病,主要由于IT15 基因CAG 重復序列異常擴增,導致其所編碼的亨廷頓蛋白結構與功能異常[1]。臨床上表現為慢性進行性加重舞蹈樣動作、認知及精神障礙的“三聯征”,多在30 至40 歲發病,患病后15~20 a 死亡。脫嘌呤/嘧啶核酸內切酶(aprimidinic/apurinic endonuclease/redoxfactor-1,APEX)是堿基切除修復途徑的關鍵酶之一,并作為一種多功能蛋白,在一些神經系統病變中發揮著重要的作用。該研究初步探討APEX 基因氧化還原功能區變異與亨廷頓舞蹈癥發生的相關性。

1 對象與方法

1.1 研究對象 3 個HD 家系均來自河南省,獲知情同意后,共抽取26例正常個體和10例HD 患者外周靜脈血各3 mL,所有受檢者均經IT15 基因診斷。

1.2 APEX 基因變異的檢測 采用單鏈構象多態性(SSCP)檢測。采用酚-氯仿法提取基因組DNA。APEX 基因(ACCESSION:M92444)氧化還原功能區序列來源于GenBank,利用Primer 軟件,設計第1~3 外顯子的擴增引物(表1)。3 個外顯子的多態性位點在Genewindow 查得:E1 有8 個多態性位點,E2 不含多態性位點,E3 有5 個多態性位點。引物合成由上海生工公司完成。

表1 PCR 擴增引物及擴增片段長度

反應體系共20 μL:Mix 10 μL,上、下游引物各1 μL,DNA 模版2 μL,ddH2O 6 μL。PCR 反應條件:95℃預變性5 min,94℃30 s,55℃30 s,72℃30 s,30 個循環;然后在72℃條件下延伸7 min;4℃保存。制備8 g/L 非變性聚丙烯酰胺凝膠(交聯比為49:1),0.5×TBE 預電泳30 min。將PCR 產物加樣電泳,130 V 電壓12 h,銀染顯色。數碼相機拍照并制成干膠保存。患者和家系正常個體擴增產物由北京金唯智生物公司測序。

2 結果

所有樣本APEX 基因的3 個外顯子擴增片段均未發現異常電泳條帶。將3 個家系內的正常個體和HD 患者的擴增產物進行DNA 測序和比對,正常個體與HD 患者之間未發現差異,部分結果見圖1、2。

3 討論

HD 的病理改變表現為具有高度區域選擇性的腦萎縮和神經元脫失。化學性質活潑的自由基是腦缺血再灌注、阿爾茨海默病和肌萎縮性側索硬化癥等神經退行性疾病、腦動脈粥樣硬化等神經系統病變的重要原因之一[2-4],APEX 可作為調節真核細胞基因表達的氧化還原信號傳導蛋白[5],影響著氧化應激下的細胞生存,在上述神經系統病變中發揮著重要的作用[6]。作者檢測亨廷頓舞蹈病家系成員中APEX 基因氧化還原功能區,以探討亨廷頓舞蹈病的發生中是否有該基因變異。

1989年日本Orita 等[7]最早使用SSCP 技術。通過非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳[8],可以非常敏銳地將構象上有差異的分子分離開。結合PCR 技術,可靈敏地檢測已知突變,篩選未知突變。該研究采用SSCP-DNA 測序的方法檢測亨廷頓舞蹈病家系成員中APEX 基因氧化還原功能區的3 個外顯子,可檢測多個多態性位點的改變,避免了酶切技術造成的大工作量。

DNA 損傷存在多種修復機制,包括堿基切除修復、核苷酸切除修復、錯配修復和重組修復等,其中堿基切除修復(base excision repair,BER)是糾正自發突變和外源性活性化合物引起DNA 損傷的最活躍途徑,在維持遺傳物質穩定性方面具有重要作用。Jakupciak 等[9]認為:DNA 合成中,DNA 復制叉遇到CTG 或CAG 重復序列時會在2 條鏈上形成斷裂,并產生40~400 個重復單位的缺口,啟動重組修復過程。APEX 是BER 修復途徑的限速酶[10],與DNA 聚合酶、連接酶等相互作用,促進DNA 的修復。APEX 可在AP 部位的5'端切斷DNA 鏈,亦可在3'磷酸殘基形成3'-羥基引物,參與長補丁修復。APEX 修復功能的缺失可導致基因突變和微衛星不穩定。該研究結果未見HD 患者APEX 基因變異,表明該基因氧化還原功能區變異不是導致HD 患者IT15 微衛星序列異常擴增的危險因素。

[1]高歌,陳曉蕾,付汪星,等.兩個亨廷頓舞蹈病家系IT15基因(CAG)n 檢測[J].鄭州大學學報:醫學版,2010,45(6):936

[2]Kawase M,Fujimura M,Morita-Fujimura Y,et al.Reduction of apurinic/apyrimidinic endonuclease expression after transient global cerebral ischemia in rats :implication of the failure of DNA repair in neuronal apoptosis[J].Stroke,1999,30 (2):441

[3]Shaikh AY,Martin LJ.DNA base-excision repair enzyme apurinic/apyrimidinic endonuclease/redox factor-1 is increased and competent in the brain and spinal cord of individuals with amyotrophic lateral sclerosis[J].Neuromolecular Med,2002,2(1):47

[4]Hall JL,Wang X,Van Adamson,et al.Overexpression of Ref-1 inhibits hypoxia and tumor necrosis factor-induced endothelial cell apoptosis through nuclear factor-κB independent and dependent pathways[J].Circ Res,2001,88(12):1247

[5]陳欣,劉艷霞.APE/Ref-1 在中樞神經系統氧化應激反應中的保護作用[J].中國生物化學與分子生物學報,2006,22(5):355

[6]Prabhakar NR,Kumar GK,Nanduri J,et al.ROS signaling in systemic and cellular responses to chronic intermittent hypoxia[J].Antioxid Redox Signal,2007,9(9):1397

[7]Orita M,Suzuki Y,Sekiya T,et al.Rapid and sensitive detection of point mutations and DNA polymorphisms using the polymerase chain reaction[J].Genomics,1989,5:874

[8]樂曉萍,杜鵬,張欽憲,等.聚丙烯酰胺凝膠銀染技術改良[J],鄭州大學學報:醫學版,2001,36(4):395

[9]Jakupciak JP,Wells RD.Gene conversion (recombination)mediates expansions of CTG[middle dot]CAG repeats[J].J Biol Chem,2000,275(51):40003

[10]Evns AR,Limp-Foster M,Kelley MR.Going APE over ref-1[J].Mutat Res,2000,461(2):83

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