1. CRISPR到底有多準?
自2012年以來,CRISPR一直是分子生物學領域最火的話題之一。CRISPR-Cas9在基因治療方面被寄予厚望,但它必須先克服自己的脫靶效應。研究者們已經找到了不少降低脫靶效應的途徑,但還沒有明確CRISPR-Cas9在整個人類基因組中的脫靶情況,導致這一技術的安全性一直受到質疑。Nature Methods雜志發表的這項研究,為人們提供了全面評估CRISPR-Cas9精確性的測序方法。研究顯示,CRISPR-Cas9只要稍加改善就能大大減少其脫靶效應。
2. 紅肉與癌癥
紅肉的名聲一直很差,它被認為與心臟病、肥胖癥和癌癥有關。由于沒人知道其中的因果關系,吃貨們對紅肉的鐘愛并未受到太大影響。然而加州大學的科學家們發現,紅肉中的一種糖分子可能會直接引發癌癥。除人類以外的大多數哺乳動物都具有這種糖分子。聽到這樣的消息,你暑假還會去燒烤么?
3. DNA甲基化可預測死亡
人的一生可以說是一個不斷做出選擇的過程,比如決定是否節食、鍛煉或者吸煙。這些選擇會對我們的健康和壽命產生或好或壞的影響,不過人們對其中的分子機制還知之甚少。Marioni等人發現,生活方式的累積影響會表現在表觀遺傳學上,而且甲基化模式可以幫助人們預測死亡。
4. 新的分子探針
科學家們從來就不缺研究生物分子互作的工具,從熒光顯微鏡、gel-shift實驗到免疫共沉淀。不過,定量這些互作和動力學分析需要更專業化的復雜方法,比如表面等離子體共振(SPR)。令人慶幸的是,Koussa等人前不久開發了一個快速、簡單又實惠的新方法,這就是“DNA nanoswitches”。
5. 監控蛋白行動的新方法
打開生物書中的細胞示意圖,我們會看到細胞器分散并漂浮在澄清的細胞質中。實際上,細胞內部像高峰時段的紐約地鐵一樣擁擠。那么蛋白要怎樣在這么擁擠的環境中前進呢?科學家們最近開發了一種新技術來觀察這一過程。研究顯示,未折疊蛋白的速度會減慢并陷入交通堵塞。
6. Y染色體萬歲!
一代天驕成吉思汗今年上了一回頭條,科學家們發現,來自成吉思汗和其他幾個強人的Y染色體在亞洲占了相當大的比例。一個男人的Y染色體要想流傳后世,他不僅要擁有很強的生育能力,而且還得有權有勢,以確保自己的后代繼續開枝散葉。據介紹,全世界有0.5%的Y染色體來自成吉思汗。(原文:Y-chromosome descent clusters and male differential reproductive success: young lineage expansions dominate Asian pastoral nomadic populations)
7. 突變體VS嗎啡啉
通過嗎啡啉下調基因表達,是研究斑馬魚基因功能的一種常用方法。科學家們發現,用TALEN、CRISPR-Cas9和ZFN干擾基因表達,往往與使用嗎啡啉得到的表型不同。研究指出,使用嗎啡啉進行基因功能研究,會產生一定程度的脫靶效應,其結果并不可靠。(原文:Reverse Genetic Screening Reveals Poor Correlation between Morpholino-Induced and Mutant Phenotypes in Zebrafish)
8. 用光開關基因
三個研究團隊不約而同的把近來最火的兩種技術結合了起來,那就是CRISPR-Cas9和光遺傳學。他們開發出了可以用光控制的CRISPR-Cas9轉錄激活系統,可以實現更精確的基因表達控制。
9. 基因操作的新時代
四月份,Gantz和Bier發表了本年度最引人注目的重磅技術: MCR(mutagenic chain reaction)。在一個二倍體生物中,如果只有一個等位基因出現隱性功能缺失突變(雜合突變),它往往不會表現出突變性狀。但如果兩個拷貝的等位基因都發生突變(純合突變),該生物就會出現表型突變。MCR以CRISPR/Cas9為基礎,可以自動生成純合的功能缺失突變,也就是兩個等位基因同時發生突變。
10. 肉眼讀取DNA擴增結果
我們都曾在化學課上根據pH試紙的顏色判斷過溶液的酸堿度。NEB公司的研究團隊以同樣的理念(基于pH值的顏色改變)為基礎,開發了一種對pH敏感的變色染料,給DNA擴增賦予了肉眼可見的顏色改變。這一技術在野外研究、田間試驗、臨床診斷等領域有著廣闊的應用前景。