黃 磊 王保強 劉志剛 楊 磊(成都信息工程學院 電子工程系,四川 成都 610225)
生物醫學顯微圖像采集與處理技術研究
黃 磊 王保強 劉志剛 楊 磊
(成都信息工程學院 電子工程系,四川 成都 610225)
本文利用生物醫學顯微鏡獲取顯微圖像,并對其進行研究,探討出適合顯微圖像的處理及分析方法,從而結合醫學超聲技術觀察研究動物組織細胞的活性、表皮等生理特性。該文的主要內容分為:(1)對生物細胞圖像采集與分析的方法進行了討論;(2)描述了常用的圖像處理技術,并且實際應用于細胞圖像技術。然后對生物細胞圖像濾波,細胞圖像二值化,細胞圖像的點運算,圖像形態學處理,圖像分割的方法進行了討論與篩選;(3)對圖像處理結果進行了分析,根據結果得出結論,從而使得生物醫學顯微鏡的生物圖像采集與處理提供一定的依據。
生物圖像;圖像采集;圖像處理;生物顯微鏡
在對生物細胞進行生理及其方面研究時,生物細胞圖像處理是其中一項重要的研究內容,其中圖像處理方法在圖像分析中是一個經典問題,目前的圖像處理中尚無一個通用的處理方法,也不存在一個標準的處理流程,只能根據實際的生物圖像,并結合特定的的算法。以下內容即是對各種常用算法的比較,以便從中選擇。
2.1 圖像預處理
根據作用目標的不同,首先對生物細胞圖像進行預處理,進行亮度、對比度、色調、對比度調節,色彩反相,偽彩、左右鏡像,上下鏡像,圖像旋轉,灰度化圖像個通道內容,圖像拆分圖像合成,線性加權圖像合成,直方圖均衡等,從而使得后面處理效果明顯。
2.2 生物細胞圖像的濾波選擇
生物圖像增強主要是對圖像進行加隨機噪聲,椒鹽噪聲,以及進行均值濾波,孤立點去噪,選擇式掩模平滑濾波,中值濾波,高斯濾波,根據作用目標的不同,選擇不同的濾波方式,圖1為濾波效果圖。
(1)中值濾波
在實際采集的細胞圖像處理時,細胞圖像是含有噪聲的,我們首先要對圖像進行濾波,在濾波方法中比較重用的一個方法就是中值濾波,在濾波過程中對參數進行調整,其中濾波窗口尺寸一 般選擇3。然后對有椒鹽噪聲干擾的圖像進行中值濾波的結果如圖1(g)所示。
(2)均值濾波
在上述的中值濾波方法中,細胞圖像處理的效果雖然比較好,但是為了進一步提高處理的效果,引用了均值濾波。設定細胞數字圖像f(x,y)為M×N的一個陣列,在經過平滑處理后的圖像為g(x,y),得到的平滑圖像為
S-(x,y)像素點的預定領域(不包括(x,y)像素點);
為了比較效果,處理時采取了細胞的局部圖像,其中濾波結果如圖1(e)所示,從圖中可以得出:其中的圖像去噪結果比較良好,但是質量下降了,均值濾波的平滑效果和采用的圖像領域半徑 有關,半徑增加的同時,模糊程度也要增加。
(3)選擇式掩模平滑濾波
實際圖像處理消除噪聲的過程中,都有平均化帶來的缺陷,使的邊緣模糊程度增高。
均值的計算公式為:
方差的計算公式為:
式中,N為各掩模對應的像素個數。
實現效果即圖1(f)。
2.4 圖像分割
(1)Gauss laplacian算子
高斯平滑運算導致圖像中邊緣和其他尖銳不連續部分的模糊,其中模糊程度在于σ的值,如果σ值越大,噪聲的濾波效果越好,同時影響了邊緣檢測,因為丟失了邊緣信息,但是如果取小的情況,又可能留有太多的噪聲,處理平滑不完全,效果依舊不好。經過這個算子對細胞圖像處理的結果如圖2(a)所示。
經過實際比較,LOG算子對噪聲的敏感程度很低,其中σ取值較小時,平滑度較低,會有假邊緣出現,σ取值大時,平滑度要高,但是也丟失了重要的邊緣信息,出現了間隔。(2)Canny算子
想更好的對圖像細胞細節進行保留的同時對細胞圖像分割,從而使用了坎尼(Canny)算子。用Canny邊緣檢測算子對細胞圖像的邊緣檢測結果如圖2中(b)~(f)所示,分別用了5種自適應最優閾值。
用Canny邊緣檢測算子對細胞圖像的邊緣檢測的效果最好,其中的失誤率比較低,而且噪聲影響的并不大,對后續的邊緣檢測進行影響,從而方便了后續的處理。
本文探討了在生物細胞圖像上的數字圖像處理技術的應用,首先對圖像進行預處理,然后對圖像進行去噪和分割,在以上處理方法中處理效果比較良好。為了更好的研究其中的特征信息,仍需要在以下方面進行研究:
(1)對采集到的圖像經過一定手段處理后,如何進行定量的評價圖像質量,從而能判斷出處理方法的好壞,從而制定指定的規則,以便以后圖像處理的便捷。
(2)能提取細胞圖像不便的特征參量,可以選擇更好的參數,例如紋理參數,光密度等,還要考慮從降低某些特征參量,從而提高實際處理中的速度,以便以后大規模的細胞圖像處理,以及分類識別。
(3)如何以軟硬件的形式進行分析處理細胞圖像。
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O426
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黃磊(1991-)男,碩士,研究方向:信號與信息處理。基金項目:成都市科技計劃(12DXYB186JH-005);物理場生物效應與儀器省高校重點實驗室開放課題(2014-1);成都信息工程大學電子工程學院教改項目(生物醫學圖像信息獲取與處理)。