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字典學習中字典尺度對DICOM圖像壓縮的影響

2015-10-22 08:04:13賈小林劉雨嬌
液晶與顯示 2015年6期
關鍵詞:效果實驗

酉 霞,陳 菲,賈小林,劉雨嬌,楊 勇

(1.西南科技大學計算機科學與技術學院,四川綿陽621010;

2.四川省綿陽市中心醫院,四川綿陽621000)

字典學習中字典尺度對DICOM圖像壓縮的影響

酉 霞1?,陳 菲1,賈小林1,劉雨嬌1,楊 勇2

(1.西南科技大學計算機科學與技術學院,四川綿陽621010;

2.四川省綿陽市中心醫院,四川綿陽621000)

隨著醫院數字化醫療進程的加快,醫學影像的數據量日益增大,醫學影像資料的存儲空間和獲取速度受到很大的限制.文章在研究主流字典學習算法基礎上,提出使用不同尺度的MOD、K-SVD、ILS-DLA、RLS-DLA字典算法對DICOM圖像進行壓縮存儲,以及恢復再現的方法.與經典的JPEG和JPEG2000壓縮算法相比,字典學習算法壓縮和恢復效果較好,特別是采用較小尺度的字典時,壓縮效果更為突出:當壓縮比為20時,采用4×4尺度的RLS-DLA字典,論文算法的峰值信噪比(PSNR)較JPEG算法高出7.8 dB,比JPEG2000算法高出1 dB.

字典學習;圖像壓縮;DICOM圖像;字典尺度

1 引 言

隨著計算機硬件技術的發展,醫院能夠采用大量的數字成像設備進行檢查,如,計算機X線檢查、計算機體層攝影(CT)檢查、磁共振(MR)成像檢查、數字超聲成像檢查等等,這些檢查使醫學數據量急劇上升.為了有效管理這些數據,越來越多的醫院進行了數字化的改造,數字化醫院的建立對影像歸檔及通信系統(Picture Archiving and Communication Systems,PACS)的需求不斷增加.PACS系統中存儲影像的文件都遵循DICOM 3.0標準,為DICOM文件.通常對醫學圖像進行無損壓縮,其恢復圖像較清晰,但壓縮比較低,僅為2.5倍左右[1].所以,研究出針對DICOM文件中的醫學圖像壓縮方法對PACS系統顯得尤為重要.

目前圖像壓縮標準有:JPEG和JPEG2000等方式.JPEG標準的正式名稱為:信息技術-數字壓縮和連續色調靜止圖像的編碼.其實際上是包括無損編碼模式的,但是在大多數產品中并不支持,典型使用的JPEG是一種基于離散余弦變換(DCT)的有損壓縮方法,其壓縮過程中,較高的壓縮比會使得圖像產生馬賽克失真. JPEG2000是在2000年為了取代原來的JPEG標準提出的圖像壓縮標準.其采用離散小波變換(DWT),避免了JPEG采用的DCT變換造成的馬賽克失真;在數據編碼上采取與JPEG不同的思維,使用一樣的數據編碼可以使用多種手段解碼來得到不同質量的圖像,從而增加了可擴展性和可編輯性.但是,因其編碼的核心部分的算法,已經被大量注冊專利,用JPEG 2000存在版權和專利的風險,開發出免授權費的商用編碼器是不太可能的.

1999年K.Engan等人提出了最優方向法(MOD)[2],人們開始逐步探尋獲取字典的方法;2006年,M.Aharon等人提出K奇異值分解(KSVD)字典學習算法[3],因K-SVD在去噪、模式識別等的優秀表現,人們開始關注字典學習領域;2008年O.Bryt等人K-SVD算法用于人臉圖像壓縮[4],是第一次將稀疏表示和字典學習用于圖像壓縮的一個探索;2010年K.Skretting和K. Engan提出了遞推最小二乘字典學習算法(RLSDLA)[5],2011年,他們探索了RLS-DLA在自然圖像上的壓縮效果,并與K-SVD算法進行對比[6],在最終效果中,取得了優于JPEG2000的效果.在以上探討的過程中,只是針對自然圖像進行研究,字典的原子均為8×8的方塊.本文針對醫學常見的DICOM格式的顱腦CT圖像,使用不同尺度的字典進行壓縮對比.

本文第2部分先介紹圖像信息壓縮框架,然后介紹本文采用的字典學習的基本思想,最后給出壓縮效果的評價指標;第3部分是實驗過程及實驗結果分析;第4部分總結全文并提出進一步研究的方向.

2 不同尺度字典的圖像壓縮方案

2.1基于不同尺度字典的圖像壓縮框架

不同尺度字典的圖像壓縮方案主要涉及字典學習、利用字典進行壓縮和解壓縮.其中,字典學習也稱為字典訓練,主要包括:

(1)對圖像的不同尺度(4×4、8×8、16× 16的圖像塊)的分解,得到不同尺度的圖像塊作為訓練集;

(2)在訓練集的基礎上,初始化字典;

(3)使用稀疏編碼算法得到初始的稀疏解矩陣,分別利用不同字典學習算法更新字典原子.

(4)重復(3),得到訓練的字典.

利用字典進行壓縮,主要包括以下3步:

(1)將帶壓縮的圖像信息進行不同尺度的分解;

(2)使用稀疏編碼算法得到稀疏解矩陣,求解過程中,設置目標峰值信噪比(PSNR);

(3)對稀疏解進行熵編碼,得到壓縮圖像位流.

解壓縮的過程是壓縮過程的逆過程.壓縮和解壓縮的簡要流程如圖1所示.

圖1 圖像信息的壓縮和解壓縮過程Fig.1 Process of Image compression and decompression

2.2字典學習算法

字典學習主要需要通過訓練集得到一個字典,信號通過字典和相應的系數來表示.一個訓練集B={bi∈RN}iM=1,字典學習中學習得到的字典D∈RN×K,需要表示的向量為X∈RK×M,重建的矩陣為=DW,重建的誤差為R=X-=X-DW,使得重建誤差R最小,使用成本函數f(·),這可以表述為最小化問題[5.7]:

通常,字典學習可以通過3步來實現,分別為:

(1)初始化字典;

(2)保持已有字典D不變,求解稀疏解W;

(3)保持已有稀疏解W不變,更新字典D.

其中,在(2)中主要用到的求解稀疏解的算法有:匹配追蹤算法(MP)[8]、正交匹配追蹤算法(OMP)[9]、順序匹配追蹤(ORMP)[10]等.其中,MP是一種復雜度較低的貪婪算法:在每一次迭代求解過程中,先選擇與當前誤差最相關的一個原子,其次基于該原子求解稀疏解對應的元素值,最后根據求解得到的稀疏解更新重構誤差R. OMP是MP的改進算法,在選擇原子的過程中,使得當前誤差與當前所選的字典原子相互正交,這也正是OMP的由來.

在(3)中主要用到字典學習算法包括:最優方向法(MOD)、K奇異值分解法(K-SVD)、迭代最小二乘法(ILS-DLA)[11]、遞推最小二乘法(RLSDLA)、在線字典學習法(ODL)[12]等.其中,MOD算法通過交替使用以上(2)和(3)步方式學習字典:在第k次迭代過程中,基于D(k-1)稀疏編碼每一個xi求解出對應的ωi,并構成稀疏解矩陣W(k);然后通過表達式(2)所示更新字典矩陣D.

與MOD算法每次迭代都更新整個字典D不同的是,K-SVD按原子亂序依次更新每個原子來更新整個字典D.ILS算法是MOD算法的擴展,其將訓練集分為無限制的塊、無限制的重疊的塊、受限制的重疊的塊進行最小二乘迭代更新.RLS算法是在ILS算法的基礎上引入遺忘因子λ,使得其在遞推的過程中逐漸脫離初始化字典對最后結果的影響.

本文主要OMP算法求解稀疏解,選擇MOD、K-SVD、ILS-DLA、RLS-DLA四種字典學習算法在不同原子尺度下與JPEG和JPEG2000進行實驗對比.

2.3壓縮效果的評價指標

實驗評估指標主要從圖像的客觀保真度和主觀保真度進行評價.

圖像客觀保真度常用一個指標是峰值信噪比[13](Peak Signal to Noise Ratio,PSNR),其單位為d B.PSNR通常通過均方誤差(Mean Square Error,MSE)進行定義,定義式(3),兩個m×n的單色圖像I和K,其中I是原圖,K是I經過壓縮過后的圖,那么MSE定義為公式(4):

其中:MAXI是表示圖像點顏色的最大數值,本文中每個采樣點用8位表示,那么就是255.由式(3)和式(4)可知,PSNR值越大,就代表失真越少,圖像質量越高.

3 實驗和結果分析

本文在真實圖像上進行圖像壓縮.實驗采用綿陽市中心醫院提供的DICOM文件格式的顱腦CT圖像.先進行預處理,提取圖像信息后,對圖像信息進行字典學習和壓縮效果的比較.

3.1DICOM圖像預處理

DICOM文件是按照DICOM 3.0標準存儲的醫學文件,一個單獨DICOM文件包括一個文件頭(存儲有關病人的名字,掃描類型等信息)和圖像數據信息.DICOM圖像是指DICOM文件中的圖像數據,本文研究的對象也正是其圖像數據信息.所以對于DICOM文件,石曉磊等[14]的處理方法,通過分解文件,得到需要進行壓縮的圖像信息存為BMP格式.

3.2字典學習過程

實驗選擇其中8幅BMP格式的圖像,如圖2.隨機選取其中的圖像塊,當圖像塊大小為4× 4、8×8時,每幅圖像選取1 500個圖像塊,一共12 000個圖像塊用于訓練字典,圖像塊大小為16× 16時,每幅圖像選取500個圖像塊,一共4 000個圖像塊用于訓練字典.字典大小分別采用原子大小為4×4、8×8和16×16,字典原子數為600的字典,各個算法設置迭代次數為200次,使用OMP算法求解稀疏系數.

圖2 用作字典學習的圖像Fig.2 Image for dictionary learning

圖3 4種4×4字典經過200次迭代的結果Fig.3 Four 4×4 dictionary results after 200 iterations

經過4種字典學習,字典原子大小為4×4、8×8和16×16得到的字典的如圖3、圖4和圖5.

圖4 4種8×8字典經過200次迭代的結果Fig.4 Four 8×8 dictionary results after 200 iterations

圖5 四種16×16字典經過200次迭代的結果Fig.5 Four 16×16 dictionary results after 200 iterations

從生成的字典可以看出,各種字典學習算法得到的字典有較大區別:

(1)ILS-DLA算法在不同尺度下,對比其他算法,其獲取到更多的深色圖像塊作為字典原子的組成;

(2)RLS-DLA算法在不同尺度下獲取到的字典分布比較均勻,原子間差距不大;

(3)MOD算法獲取到的的字典原子間的差距比較大,每種尺度下都有明顯的深色區域和淺色區域,過度區域的原子較少;

(4)K-SVD算法在4×4的字尺度下,獲取到的字典原子間的差距最大,從圖中可以明顯看出有一部分基本都是由黑色組成,而在8×8和16× 16的尺度下,基本全是黑色組成的原子較少,并且后兩種尺度的字典較為相似.

3.3壓縮圖像的客觀保真度

對比實驗使用JPEG、JPEG2000壓縮方法和字典學習的方法進行.JPEG和JPEG2000壓縮利用MATLAB 2011b自帶的imwrite函數進行實驗;字典學習參考Skretting K[6]的壓縮過程,通過設置不同的量化參數進行實驗.本文展示32號圖(見圖8(a))進行壓縮實驗,在實驗的結果中,尺度為4×4和8×8的字典壓縮及JPEG、JPEG2000壓縮實驗結果如圖6.在比特率為0.4 bpp時(壓縮比為20).尺度為16×16的各種字典壓縮圖像的PSNR在均24 dB以下,主觀評價圖像不可用,不在本文中列出.

圖6 不同方法壓縮結果Fig.6 Results of different compression methods

從圖6實驗結果中可以看出:

(1)總體上使用4×4字典的壓縮效果優于8× 8字典的壓縮效果.在低比特率(低于0.25 bpp)情況下,字典壓縮效果和字典尺度關系不大.

(2)使用4×4字典的壓縮效果明顯優于JPEG,圖像的PSNR平均比JPEG高5 dB,并且接近JPEG2000,在相同比特率下RLS-DLA壓縮后圖像的PSNR比JPEG2000高1 dB.

(3)使用4×4字典的壓縮效果在低比特率(低于0.5 bpp)情況下,均優于JPEG,圖像的PSNR平均比JPEG高2 d B,但是都不及JPEG2000.這是由于JEPG是采用的DCT變換,其在高壓縮比(即低比特率)情況下,會出現明顯的馬賽克失真,影響其峰值信噪比.而JPEG2000采用的是DWT變換,避免馬賽克失真,并且其采用復雜的編碼策略,使其取得優異的壓縮效果.

就不同壓縮效果,進一步對字典進行分析.如圖7,縱坐標表示每個原子像素的平均值,橫坐標表示原子序號.從圖中可以看出當尺度為4× 4比尺度8×8的字典原子之間的差距大.結合圖6,可以看出字典原子差距較大的時候,壓縮效果越好.特別是MOD算法,兩個尺度情況下,字典原子差距沒有其他3種算法的大,因此兩個尺度下壓縮效果接近.

圖7 各字典原子均值對比Fig.7 Contrast of each dictionary atomic mean

3.4壓縮圖像的主觀保真度

下面從主觀保真度的角度進行分析.圖8是在壓縮比為20時(即比特率為0.4 bpp)時,32號原圖(圖8(a))和JPEG、JPEG2000以及各個字典壓縮圖(圖片命名方式為字典名稱-字典尺度)對比.

從圖8可以看出,字典尺度為4×4和8×8時,字典學習都能夠達到JPEG壓縮效果,可以很好保存原圖像的細節,人眼幾乎不能分辨原圖和壓縮圖的區別.ILS-DLA-16和RLS-DLA-16解壓后的圖像亮度比JPEG2000高,更接近原始圖像.

圖8 各算法效果對比Fig.8 Subjective fidelity contrast of each algorithm

4 結 論

本文針對DICOM圖像,使用不同尺度的字典學習算法進行圖像壓縮性能的分析和對比.實驗結果表明:字典原子間差距較小,有較多過度類型原子的時候,字典學習的壓縮效果較好;利用字典學習對DICOM圖像進行壓縮,能優于現在使用的JPEG算法的壓縮效果.并且明字典尺度較小時,壓縮效果較好:當字典尺度在4×4時,圖像壓縮和恢復效果明顯優于JPEG,其中RLS-DLA的壓縮效果優于JPEG2000.

本文研究證明了字典學習和稀疏表達在DICOM圖像壓縮領域有良好的表現,對于DICOM圖像壓縮方法的應用具有積極意義.而且論文研究成果為以下兩方面的研究奠定了基礎:1)對DICOM圖像進行多尺度字典壓縮方法的研究;2)對DICOM圖像中的感興趣區域進行無損編碼,并與字典學習方法相結合,提高圖像壓縮的質量.

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Effects of dictionary scale on dictionary learning for DICOM image compression

YOU Xia1,CHEN Fei1,JIA Xiao-lin1,LIU Yu-jiao1,YANG Yong2

(1.School of Computer Science and Technology,Southwest University of Science and Technology,Mianyang 621010,China;
2.Mianyang Central Hospital,Mianyang 621000,China)

With the accelerated developing of hospital digital medical,the amount of medical imaging data grows dramatically,which affects the data storage space and access speed.This paper proposes a new design which uses different scales dictionaries of MOD,K-SVD,ILS-DLA,RLS-DLA for digital imaging and communications in medicine(DICOM)image compression storage and restore methods based on dictionary learning.Compared with the traditional algorithms JPEG and JPEG2000,the pro-posed method has better performance,especially when the dictionary scale is smaller.For example,when the compression ratio is 20,using 4×4 dictionary scale,the peak signal to noise ratio(PSNR)of the proposed method is 7.8 dB higher than that of JPEG,and 1d B than JPEG2000.

dictionary learning;image compression;DICOM image;dictionary scale

TP391.41

A doi:10.3788/YJYXS20153006.1045

1007-2780(2015)06-1045-07

酉霞(1990-),女,四川簡陽人,碩士研究生,主要研究方向:數字圖像處理,機器學習.E-mail:youzi_2011@ yeah.net

陳菲(1974-),女,四川綿陽人,副教授,碩士研究生導師,主要研究方向:嵌入式系統技術及圖像處理.

賈小林(1975-),男,四川綿陽人,副教授,博士,主要研究方向:數據采集與識別技術.

劉雨嬌(1991-),女,四川綿陽人,碩士研究生,主要研究方向:計算機視覺.

楊勇(1974-),男,四川綿陽人,主治醫師,學士,主要研究方向:影像技術方向.

2015-01-22;

2015-03-24.

國家自然科學基金面上項目(No.61471306);四川省科技廳項目(No.16ZC1720,No.2014JY0230);西南科技大學研究生創新基金(No:14ycxjj0058);四川省教育廳重點項目(No.12ZD1109);綿陽網絡融合工程實驗室開放基金(No:12zxwk11)

Supported by National Natural Science Foundation of China(No.61471306);Sichuan Provincial Science and Technology Support Project(No.16ZC1720,No.2014JY0230);Postgraduate Innovation Fund Project by Southwest University of Science and Technology(No.14ycxjj0058);Major program of Education Department of Sichuan Province(No.12ZD1109);Open funding Program of Network Convergence Laboratory of Mianyang(No.12zxwk11)

?通信聯系人,E-mail:youzi_2011@yeah.net

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