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PirAB毒力正在向親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的非副溶血弧菌中轉(zhuǎn)移

2016-09-03 10:44:28陳營李云冰張文文譚鮮英廣州利洋水產(chǎn)科技股份有限公司煙臺大學(xué)
當(dāng)代水產(chǎn) 2016年9期
關(guān)鍵詞:檢測

■ 陳營李云冰張文文譚鮮英( 廣州利洋水產(chǎn)科技股份有限公司 煙臺大學(xué))

PirAB毒力正在向親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的非副溶血弧菌中轉(zhuǎn)移

■ 陳營12李云冰1張文文1譚鮮英1(1 廣州利洋水產(chǎn)科技股份有限公司 2 煙臺大學(xué))

副溶血弧菌是一種嗜鹽性海洋細(xì)菌,廣泛分布于海水、海底泥沙、浮游生物和魚、蝦、貝類動物中。在夏秋季,副溶血弧菌是全球沿海地區(qū)致人腹瀉的主要病原菌,在我國此菌也長期居于食物中毒已檢出致病菌的前列。近些年,在對蝦養(yǎng)殖中出現(xiàn)了一株特殊的副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus,Vp),由于攜帶1個約69kb的大質(zhì)粒,使其完全不同于從臨床上和環(huán)境中分離的菌株。該菌株在質(zhì)粒上有兩個與昆蟲致病相關(guān)的毒素基因pirA和pirB,它們分別表達(dá)1個13 kDa和50kDa的外毒素蛋白PirA和PirB,我們稱這個菌株為PirAB型副溶血弧菌(PirAB-Vp)。由于pirAB毒素基因在質(zhì)粒上,通過質(zhì)粒在細(xì)菌種內(nèi)和種間的轉(zhuǎn)移,細(xì)菌可以獲得相應(yīng)的毒力。Kondo等首次報道了PirAB毒力通過質(zhì)粒向非副溶血弧菌中轉(zhuǎn)移的現(xiàn)象。他們在越南北部地區(qū)的病蝦中分離出1株弧菌KC13.17.5,通過對此菌株的基因組測序,發(fā)現(xiàn)它屬于哈維氏弧菌(V.harveyi)。隨后,Liu等在V.owensii中也檢測出pirAB毒素基因,這是1個與哈維氏弧菌親緣關(guān)系很近的1個弧菌新種。在此之后,我們也檢測出攜帶pirAB毒素基因的哈維氏弧菌,并在今年的檢測中發(fā)現(xiàn)了更多該毒力基因向其它弧菌、甚至腸道細(xì)菌轉(zhuǎn)移的現(xiàn)象。

本文分析了PirAB毒力向非副溶血弧菌轉(zhuǎn)移的現(xiàn)象以及PirAB非副溶血弧菌之間的親緣關(guān)系,希望為對蝦疾病的防控提供一定的理論指導(dǎo)。

表1 基于16S rDNA的PirAB非副溶血弧菌的親緣關(guān)系分析

1 材料和方法

1.1 材料

1.1.1 病蝦和水樣的采集

在養(yǎng)殖南美白對蝦發(fā)病時,采集病蝦的肝胰腺和水樣,接種TCBS平板。然后,送利洋公司研究所進(jìn)行PirAB-Vp檢測。

1.1.2 病蝦和水體PirAB-Vp檢測

挑取TCBS平板上的單菌落或轉(zhuǎn)接的過夜培養(yǎng)物,煮沸法制備細(xì)菌基因組模板,采用PCR方法進(jìn)行副溶血弧菌和pirA毒素基因的檢測,選取部分?jǐn)y帶pirA毒素基因的非副溶血弧菌進(jìn)行16S rDNA測序。

1.1.3 PirAB非副溶血弧菌的16S rDNA鑒定

采用細(xì)菌16S rDNA通用引物27F和1492R,進(jìn)行PirAB非副溶血弧菌16SrDNA序列的PCR擴(kuò)增。經(jīng)上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司對16S rDNA序列進(jìn)行部分測序后,在美國國家生物工程信息中心(NCBI)網(wǎng)站上進(jìn)行Blast比對分析,確定分離菌株的最可能種屬。

1.1.4 分離菌株的親緣關(guān)系分析

采用歐洲生物信息學(xué)網(wǎng)站(EMBL)上的Clustal Omega軟件,以網(wǎng)上已知的哈維氏弧菌的16S rDNA序列(基因庫編號:NR_102976)為參照標(biāo)準(zhǔn), 逐一對測定的16S rDNA部分序列與之進(jìn)行比對分析,確定兩者之間的親緣關(guān)系大小。

2 結(jié)果

2.1 非副溶血弧菌pirA毒素基因的檢測及菌株的親緣關(guān)系分析

2015年10~11月共檢測出22株P(guān)irAB非副溶血弧菌;2016年4月檢測出23株,5月檢測出21株。對部分菌株進(jìn)行了16S rDNA測序鑒定并進(jìn)行親緣關(guān)系分析,見表1。

表2 部分PirAB非副溶血弧菌的來源與親緣關(guān)系分析

在鑒定的菌株中,主要為哈維氏弧菌及與其親緣關(guān)系較近的弧菌,如V.owensii、創(chuàng)傷弧菌(V.vulnificus)、V.shilonii,相似率由100%降至86.89%。也有親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的霍亂弧菌(V.cholerae)、腸桿菌(Enterobacter)、克雷伯氏菌(Klebsiella),相似率為92.32%~94.78%,。

2.2 PirAB毒力已經(jīng)向親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的非副溶血弧菌中轉(zhuǎn)移

2015年10~11月鑒定的PirAB非副溶血弧菌均為哈維氏弧菌。而在今年4月開始出現(xiàn)V.owensii和創(chuàng)傷弧菌。到5月時,檢測出的PirAB非副溶血弧菌種類更多,親緣關(guān)系也更遠(yuǎn),相似率最低至92.32%。更重要的是,從檢測的樣本看,從肝胰腺檢測的菌株親緣關(guān)系相對較近,親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的菌株均是在水中檢出的。而且,除了1株克雷伯氏菌外,其余均來自廣西欽州地區(qū)的養(yǎng)殖水樣,詳見表2。

2.3 各地區(qū)PirAB非副溶血弧菌的檢出情況

2016年4~5月是PirAB-Vp檢出的高發(fā)期,pirA陽性菌株檢出率平均高達(dá)43.4%。其中,PirAB非副溶血弧菌為7.5%(另文發(fā)表)。在送檢的廣東、廣西、福建、海南、江蘇地區(qū)樣本中,均檢出PirAB非副溶血弧菌。其中,以福建、廣西、廣東、海南地區(qū)檢測率較高,江蘇的檢出率最低。廣西只在水中檢出,為最高值25%;福建只在肝胰腺檢出,為最高值26.9%。結(jié)果見圖1。

圖1 4月和5月各地區(qū)PirAB非副溶血弧菌的檢出情況

3 討論

迄今為止,在國內(nèi)外僅見兩例關(guān)于PirAB毒力通過質(zhì)粒向非副溶血弧菌中轉(zhuǎn)移的報道,所轉(zhuǎn)移的非副溶血弧菌為哈維氏弧菌和V.owensii,并無向其它更多弧菌轉(zhuǎn)移的報道。我們在2015年10~11月和2016年4~5月共檢測出66株P(guān)irAB非副溶血弧菌,獲得了很多關(guān)于PirAB毒力轉(zhuǎn)移的資料。

2016年4~5月是pirA陽性菌株檢出的高峰期,造成了攜帶pirAB毒素基因的質(zhì)粒向副溶血弧菌和其他弧菌的廣泛轉(zhuǎn)移,使得PirAB非副溶血弧菌的檢出率高達(dá)7.5%。去年的檢測發(fā)現(xiàn),PirAB毒力轉(zhuǎn)移僅局限于哈維氏弧菌。而到今年的4、5月份,PirAB毒力轉(zhuǎn)移的菌種更多、親緣關(guān)系更遠(yuǎn)、危害更嚴(yán)重。

PirAB非副溶血弧菌在福建、廣西、廣東、海南地區(qū)檢測率較高,局地有高于25%的檢出率,表明毒素基因傳播較活躍。只在廣西地區(qū)的水樣和福建地區(qū)的蝦樣中檢出PirAB非副溶血弧菌,可能與這兩個地區(qū)分別采取的弧菌防控措施有關(guān)。江蘇地區(qū)的PirAB非副溶血弧菌檢出率很低,說明毒素基因傳播的環(huán)境相對比較局限或者養(yǎng)殖水體交換少。

從PirAB非副溶血弧菌的親緣關(guān)系上看,所有親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的菌株均來自養(yǎng)殖水體,說明毒素質(zhì)粒在水中傳播的更廣泛、更頻繁。在一個地域內(nèi),水源可能是毒素質(zhì)粒傳播和擴(kuò)散的主要途徑。由于外界不利環(huán)境的脅迫,會加速毒素質(zhì)粒在細(xì)菌群體間的轉(zhuǎn)移。霍亂弧菌、腸桿菌、克雷伯氏菌是常見的、人的腸道致病菌,這些潛在致病菌在水中出現(xiàn),說明水體受污染的可能性很大,而這種污染加劇了毒素質(zhì)粒的傳播。因此,搞清毒力基因的流行與傳播規(guī)律,控制質(zhì)粒轉(zhuǎn)移,是防止PirAB毒力在弧菌中廣泛流行與傳播的關(guān)鍵。

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