石 潔,朱巖昆,鄭丹薇,馬曉光,王少華,李 輝,邢 進,吳彩霞
河南省疾病預(yù)防控制中心 鄭州 450016
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維生素D受體基因 rs2222570位點多態(tài)性與結(jié)核發(fā)病相關(guān)性的meta分析*
石 潔,朱巖昆,鄭丹薇,馬曉光,王少華,李 輝,邢 進#,吳彩霞
河南省疾病預(yù)防控制中心 鄭州 450016
#通信作者,女,1966年6月生,碩士,主任醫(yī)師,研究方向:結(jié)核病的防控,E-mail:hncdcxj@163.com
結(jié)核病;維生素D受體基因;rs2222570;meta分析
目的:判斷維生素D受體(VDR)基因rs2222570位點多態(tài)性與結(jié)核發(fā)病風(fēng)險的關(guān)聯(lián)性。方法:用關(guān)鍵詞“維生素D受體多態(tài)性”和“結(jié)核病”搜索數(shù)據(jù)庫中相關(guān)研究,根據(jù)各研究間的異質(zhì)性,使用隨機或固定效應(yīng)模型進行meta分析。最終有20篇文獻納入研究。對基因型以及合并后產(chǎn)生的遺傳模型和等位基因多態(tài)性與結(jié)核發(fā)病的相關(guān)性進行分析。結(jié)果:F 等位基因攜帶者結(jié)核發(fā)病風(fēng)險降低(OR=0.84,95%CI=0.73~0.95); 顯性模型遺傳模式降低結(jié)核發(fā)病風(fēng)險(OR=0.74,95%CI=0.60~0.92)。結(jié)論:VDR基因rs2222570位點多態(tài)性與結(jié)核發(fā)病風(fēng)險有關(guān)。
中國作為結(jié)核病高負擔國家,每年有100萬人發(fā)病。結(jié)核桿菌攜帶者中只有十分之一發(fā)病[1],這表明結(jié)核病的發(fā)病情況受到環(huán)境和遺傳因素交互作用的影響。目前已有很多學(xué)者[2-7]對結(jié)核病候選基因的多態(tài)性進行了研究,尤其是維生素D受體(vitamin D receptor,VDR)基因。人體內(nèi)維生素D3缺乏會增加結(jié)核病易感性[8-9],因為維生素D3的活性代謝物二羥維生素D可幫助單核吞噬細胞抑制胞內(nèi)結(jié)核桿菌的生長[10-11]。而VDR基因遺傳因子的改變會對二羥維生素D的細胞學(xué)功能產(chǎn)生影響。近年來國內(nèi)外學(xué)者針對VDR基因rs2222570位點與結(jié)核病的關(guān)系展開了系列研究,但結(jié)果存在分歧。因此作者對該位點多態(tài)性與結(jié)核發(fā)病進行了系統(tǒng)綜述,以期對VDR基因rs2222570位點多態(tài)性與結(jié)核易感性之間的關(guān)系得出更系統(tǒng)和針對性的結(jié)論。
1.1 文獻檢索 英文文獻來源為Pubmed數(shù)據(jù)庫、谷歌學(xué)術(shù)、Springer、Wiley、Elsevier S全文數(shù)據(jù)庫;檢索詞為tuberculosis、vitamin D、polymorphism、vitamin D receptor,或者 tuberculosis、vitamin D、vitamin D receptor、SNP。中文文獻來源為CNKI、萬方醫(yī)學(xué)網(wǎng)、維普數(shù)據(jù)庫;檢索詞為結(jié)核病、維生素D、維生素D受體、多態(tài)性,或者為結(jié)核病、維生素D、維生素D受體、SNP。
1.2 文獻納入和排除標準 納入標準:①國內(nèi)外公開發(fā)表的關(guān)于結(jié)核病和VDR基因rs2222570位點多態(tài)性的文獻。②所有病例均符合WTO結(jié)核病診斷標準。③研究設(shè)計為病例對照研究。④研究中有等位基因、基因型頻率的具體數(shù)據(jù)。⑤研究對象對照組的基因型頻率符合Hardy-Weinberg平衡。排除標準:①綜述和評論。②重復(fù)發(fā)表的文獻。③研究類型不屬于病例對照研究。④未設(shè)立對照組,只針對結(jié)核病發(fā)病情況的研究。⑤其他位點的研究。⑥資料不完整、數(shù)據(jù)描述不清楚的文獻。⑦對照組基因型不符合Hardy-Weinberg平衡。⑧文獻所在雜志級別較低。
1.3 統(tǒng)計學(xué)處理 用Revman 5.3軟件對數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計處理和分析。效應(yīng)變量選擇OR值。用基于χ2的Q檢驗統(tǒng)計量和I2進行異質(zhì)性檢驗;若存在異質(zhì)性,使用隨機效應(yīng)模型;若存在較小的異質(zhì)性,用固定效應(yīng)模型。繪制漏斗圖進行發(fā)表偏倚評估,同時對所納入的數(shù)據(jù)用Stata 12.0進行Begg's和Egger's線性回歸檢驗。
2.1 文獻檢索結(jié)果 根據(jù)檢索策略,初步檢索到英文文獻521篇,中文文獻258篇。通過閱讀中文題目和摘要,排除720篇,篩選出59篇文獻。認真閱讀全文按照納入和排除標準進行審核,排除33篇文獻。對納入的26篇文獻的對照組進行Hardy-Weinberg平衡檢驗,排除6篇,最終納入20篇文獻進行meta分析(表1)。共計包括結(jié)核病患者4 896例和健康對照6 057例。

表1 納入文獻基本信息
2.2 基因型分析 結(jié)果見表2。VDR基因 rs2222570位點基因型與結(jié)核病發(fā)病無統(tǒng)計學(xué)關(guān)聯(lián)(表2)。Begg's 檢驗和Egger's檢驗結(jié)果表明不存在明顯的發(fā)表偏倚。

表2 VDR基因 rs2222570位點基因型與結(jié)核病發(fā)病相關(guān)性的meta分析結(jié)果
2.3 遺傳模型分析 見圖1~3、表3。結(jié)果表明,顯性模型與結(jié)核發(fā)病有關(guān),Begg's 檢驗和Egger's檢驗結(jié)果表明不存在明顯的發(fā)表偏倚。

圖1 VDR基因 rs2222570位點顯性模型與結(jié)核發(fā)病關(guān)聯(lián)的森林圖

圖2 VDR基因 rs2222570位點隱性模型與結(jié)核發(fā)病關(guān)聯(lián)的森林圖

圖3 VDR基因 rs2222570位點超顯性模型與結(jié)核發(fā)病關(guān)聯(lián)的森林圖表3 VDR基因 rs2222570位點多態(tài)性與結(jié)核發(fā)病相關(guān)性的meta分析結(jié)果

異質(zhì)性來源異質(zhì)性檢驗PI2統(tǒng)計模型OR(95%CI)Begg's檢驗ZPEgger's檢驗tP顯性模型<0.00182%隨機效應(yīng)模型0.74(0.60~0.92)0.450.65-1.950.07隱性模型<0.00165%隨機效應(yīng)模型1.28(0.98~1.69)0.060.94-0.850.08超顯性模型0.850%固定效應(yīng)模型0.95(0.88~1.02)0.520.60-0.940.06
2.4 等位基因分析 因存在明顯異質(zhì)性(I2=73%,P<0.001),故采用隨機效應(yīng)模型,森林圖見圖4。VDR基因 rs2222570位點等位基因F與結(jié)核發(fā)病有關(guān)(OR=0.84,95%CI=0.73~0.95,P=0.007)。結(jié)合顯性模型的結(jié)果說明,F(xiàn)為結(jié)核發(fā)病的保護因素。Begg's 檢驗(Z=0.32,P=0.75)和Egger's檢驗(t=1.90,P=0.07)結(jié)果表明不存在明顯的發(fā)表偏倚。

圖4 VDR基因 rs2222570位點等位基因F與結(jié)核發(fā)病關(guān)聯(lián)的森林圖
2.5 敏感性分析 每次去除一個研究,然后計算剩余研究的合并OR值,進行敏感性分析。結(jié)果表明去除任一研究均不改變meta分析最終結(jié)局,只是對合并OR值大小略有影響,說明表明meta分析結(jié)果可靠和穩(wěn)定。
據(jù)WTO統(tǒng)計,目前結(jié)核桿菌感染者約占全球總?cè)丝诘?/3,每天約有8 000人死于結(jié)核病,每年約有300萬人死于結(jié)核病。
作者對VDR受體基因rs2222570位點多態(tài)性與結(jié)核發(fā)病的關(guān)系進行了meta分析,結(jié)果表明兩者存在相關(guān)性,該位點的F等位基因為結(jié)核發(fā)病的保護因素。Selvaraj等[6]2004年的研究也表明該位點FF通過調(diào)節(jié)維生素D的免疫協(xié)調(diào)機制增加了VDR受體的表達。在我國,蘇倩等[29]對重慶地區(qū)人群的研究結(jié)果表明Fok I -ff基因型、吸煙及結(jié)核病患者接觸史在結(jié)核發(fā)病中存在明顯的交互作用。Liu等[13]進行的研究結(jié)果表明結(jié)核病患者較健康對照存在更高的ff基因型頻率。 Wilkinson等[12]研究認為該位點突變?yōu)門不會增加結(jié)核病的發(fā)病風(fēng)險。Bornman等[20]認為VDR受體FokI RFLP 與結(jié)核的發(fā)病沒有相關(guān)性。馮福民等[30]對唐山人群的研究亦未發(fā)現(xiàn)VDR基因型與肺結(jié)核發(fā)病有關(guān)。楊本付等[31]對6篇國外文獻進行meta分析,結(jié)果亦表明尚不能認為VDR基因多態(tài)性是肺結(jié)核易感性的影響因素。
Meta分析中異質(zhì)性產(chǎn)生的原因主要有臨床異質(zhì)性、方法學(xué)異質(zhì)性和統(tǒng)計學(xué)異質(zhì)性。此次Meta分析顯示個別研究存在較大異質(zhì)性。入選文獻涉及的地域、 種族差異較大,性別和年齡分布不同,這些因素均能解釋異質(zhì)性較大的問題。今后可對地域和種族進行分層, 對性別和年齡進行校正后進一步分析。
發(fā)表偏倚是影響meta分析質(zhì)量的一個很重要的因素。雖然VDR受體基因rs2222570位點的FF和ff、Ff和ff以及隱性基因模型存在發(fā)表偏倚,但在顯性模型和等位基因與結(jié)核病的相關(guān)性方面發(fā)表偏倚并不明顯。
此外,該研究仍存在以下局限性:①篩選的文章均為中英文發(fā)表的原始文獻,未納入其他語種,存在語言上的局限性。②納入文獻的基因檢測方法不完全一致,可能導(dǎo)致實驗結(jié)果存在偏倚。③納入的原始文獻數(shù)量有限,樣本量偏小。
綜上所述,該研究結(jié)果表明,VDR基因rs2222570位點F等位基因是結(jié)核發(fā)病的保護因素。
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(2015-12-09收稿 責任編輯王 曼)
Meta analysis on association between vitamin D receptor gene rs2222570 polymorphisms and tuberculosis risk
SHIJie,ZHUYankun,ZHENGDanwei,MAXiaoguang,WANGShaohua,LIHui,XINGJin,WUCaixia
HenanProvinceCenterforDiseaseControlandPrevention,Zhengzhou450016
tuberculosis;vitamin D receptor gene;rs2222570;meta analysis
Aim: To determine the association of the vitamin D receptor(VDR) gene rs2222570 polymorphisms with the risk of tuberculosis(TB). Methods: We searched for association studies correlating the VDR polymorphisms and TB using pre-established keywords in Database system. Meta analysis was conducted with random effects model or fixed effects model to account for heterogeneity between studies. Twenty studies were included in the VDR gene rs2222570 meta analysis. Data were analyzed in respect to associations between genotypes, alleles, genetic model and TB. Results: The results of meta analysis showed that the risk of TB was decreased in the F allele carriers(OR=0.84,95%CI=0.73~0.95); among Henan population with dominant models, the risk of TB was lower(OR=0.74,95%CI=0.60~0.92).Conclusion: VDR gene rs2222570 polymorphisms may be associated with the risk of TB.
10.13705/j.issn.1671-6825.2016.06.021
*“十二五”科技重大專項課題 2014ZX10003002;河南省科技廳課題
R520.2