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XRCC1基因多態(tài)性與彌漫大B細(xì)胞型非霍奇金淋巴瘤預(yù)后的關(guān)系

2016-12-26 09:41:49高宇魏楠李夢潔江皓
浙江醫(yī)學(xué) 2016年12期
關(guān)鍵詞:研究

高宇 魏楠 李夢潔 江皓

XRCC1基因多態(tài)性與彌漫大B細(xì)胞型非霍奇金淋巴瘤預(yù)后的關(guān)系

高宇 魏楠 李夢潔 江皓

目的 探討X射線損傷交叉互補(bǔ)蛋白1(XRCC1)基因多態(tài)性與彌漫大B細(xì)胞型非霍奇金淋巴瘤(DLBCL)患者預(yù)后的關(guān)系。方法 選取XRCC1基因3個(gè)單核苷酸多態(tài)性(SNPs)對DLBCL患者進(jìn)行基因分型,并回顧分析患者預(yù)后情況,采用logistic回歸分析XRCC1基因型與患者預(yù)后的關(guān)系。結(jié)果 入選65例患者,平均年齡(59.7±8.0歲);其中腫瘤相關(guān)死亡患者31例(47.7%)。XRCC1基因rs25487基因型頻率在死亡組與存活組無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P>0.05),而等位基因頻率兩組間有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,其中A等位基因頻率在死亡組中明顯高于存活組(40.3%vs 22.1%,P<0.05)。AA、GA、GG 3組基因型患者腫瘤相關(guān)病死率分別為75.0%(6/8)、54.2%(13/24)、36.4%(12/33)。rs25487位點(diǎn)A等位基因的加性模型中,每增加一個(gè)拷貝的A等位基因,風(fēng)險(xiǎn)是增加前的2.208倍(95%CI:1.039~4.694,P<0.05)。校正年齡、性別、吸煙、B癥狀及和治療方式后,A等位基因仍然顯著增高患者死亡風(fēng)險(xiǎn)(OR=2.382,95%CI:1.057~5.367,P<0.05)。結(jié)論 XRCC1基因rs25487多態(tài)性與DLBCL的預(yù)后相關(guān)。

非霍奇金淋巴瘤 XRCC1基因 多態(tài)性 預(yù)后

非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkin’s lymphoma,NHL)是一種常見的血液系統(tǒng)惡性腫瘤,近30年來發(fā)病率有明顯的增加趨勢,目前已成為全球癌癥死亡的第五大病因。NHL發(fā)病危險(xiǎn)因素除了病毒感染、大劑量輻射、接觸有害的化工原料、服用某些免疫抑制劑導(dǎo)致免疫功能障礙外,遺傳易感性在其發(fā)病中也起著重要作用[1]。X射線損傷交叉互補(bǔ)蛋白1(X-ray repair cross complementary protein 1,XRCC1)是一種與堿基切除修復(fù)/單鏈斷裂修復(fù)直接相關(guān)的蛋白,參與鉑類藥物引起的DNA損傷修復(fù)過程[2]。有研究顯示XRCC1基因多態(tài)性和NHL的發(fā)生密切相關(guān)[3-4],但是目前關(guān)于XRCC1基因多態(tài)性與NHL預(yù)后的關(guān)系尚未明確。由于不同病理類型的NHL患者預(yù)后不同,故本研究以NHL的常見類型彌漫大B細(xì)胞型淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)患者為對象,探討DLBCL患者XRCC1基因多態(tài)性與其預(yù)后的關(guān)系。

1 對象和方法

1.1 對象 選擇浙江醫(yī)院腫瘤科及血液科2009年3月1日至2014年3月1日病理明確診斷的DLBCL患者65例,排除4例非腫瘤相關(guān)死亡患者。患者納入標(biāo)準(zhǔn):(1)經(jīng)病理組織學(xué)檢查確診為DLBCL;(2)經(jīng)過系統(tǒng)規(guī)范化療。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)伴有全身多器官功能衰竭者;(2)伴有其他惡性腫瘤者;(3)觀察期內(nèi)發(fā)生非腫瘤相關(guān)死亡患者。其中男45例,女20例,女性患者占33.3%;年齡40~76(59.7±8.0)歲。所有患者均為南方漢族。42例(64.6%)患者有B癥狀,B癥狀定義為發(fā)熱(體溫38℃以上)、盜汗、體重減輕(就診前6個(gè)月內(nèi)無其他原因體重減輕10%以上)。30例(46.2%)患者有吸煙史,吸煙定義為一生中連續(xù)或累積吸煙6個(gè)月或以上者。患者治療結(jié)束后每3~6個(gè)月進(jìn)行腫瘤狀態(tài)評估,隨訪形式為門診、住院復(fù)查及電話隨訪,截止觀察日期為2015年3月1日。NHL相關(guān)死亡指患者死于本病及本病相關(guān)并發(fā)癥。

1.2 治療方案 入選患者采用R-CHOP方案及R-EPOCH方案進(jìn)行化療。R-CHOP方案:利妥昔單抗375mg/m2靜脈滴注,第1天;環(huán)磷酰胺750mg/m2靜脈滴注,第1、8天;阿霉素40mg/m2或表阿霉素50mg/m2靜脈滴注,第1天;長春新堿1.4mg/m2靜脈滴注,第1、8天;強(qiáng)的松80mg/m2口服,第1~5天;21d為1個(gè)周期。R-EPOCH方案:利妥昔單抗375mg/m2靜脈滴注,第1天;第3天開始用EPOCH方案,依托泊苷50mg/(m2·d)、阿霉素10 mg/(m2·d)、長春新堿0.4mg/(m2·d)稀釋于500ml 0.9%氯化鈉注射液中持續(xù)靜脈滴注,連續(xù)4d,采用輸液泵控制滴數(shù);環(huán)磷酰胺750mg/(m2·d)靜脈注射,第8天;強(qiáng)的松80mg/(m2·d)口服,第3~8天。每3周為1個(gè)周期,至少治療4個(gè)周期。其中采用放化療聯(lián)合的患者共11例。

1.3 樣本處理、基因選擇及分型 抽取患者外周靜脈血2~3ml,EDTA抗凝,按照Omega公司血標(biāo)本DNA提取試劑盒操作步驟提取DNA,置于-20℃冰箱長期保存。按照最小等位基因頻率(MAF)>0.05的標(biāo)準(zhǔn),從在線HapMap CHB數(shù)據(jù)庫的XRCC1基因中選取3個(gè)單核苷酸多態(tài)性(SNPs)位點(diǎn)rs25489、rs25487、rs1799782,基本信息見表1。采用Primer 3.0軟件進(jìn)行引物設(shè)計(jì),引物由上海生工生物工程公司合成。擴(kuò)增參數(shù):95℃15min,94℃ 30s,58℃ 90s,72℃ 60s,30個(gè)循環(huán),最后72℃延伸10min。SNP基因分型采用Beckman Coulter公司的GenomeLab SNP stream基因測序平臺及系統(tǒng)自帶的GetGenos 2.2圖形分析軟件。

表1 XRCC1基因SNP位點(diǎn)信息

1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 應(yīng)用SAS統(tǒng)計(jì)軟件(Version 9.0,SAS Institute Inc.Cary,NC,USA)。正態(tài)分布的計(jì)量資料以表示,兩樣本間比較采用t檢驗(yàn);非正態(tài)分布的計(jì)量資料以中位數(shù)和四分位數(shù)間距(IQR)表示,比較采用Wilcoxon秩和檢驗(yàn)。計(jì)數(shù)資料組間比較采用χ2檢驗(yàn)或Fisher’s確切概率法檢驗(yàn)。SNPs哈代溫伯格(Hardy-Weinberg)平衡檢驗(yàn)采用χ2檢驗(yàn)。XRCC1基因型與患者預(yù)后之間的關(guān)系采用logistic回歸分析。

2 結(jié)果

2.1 患者基線特征及隨訪結(jié)果 本研究入選的65例DLBCL患者中發(fā)生腫瘤相關(guān)死亡的共31例(47.7%)。死亡組患者年齡(61.7±5.2)歲大于存活組(57.8±8.7)歲,有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P<0.05),兩組患者中性別分布、吸煙、B癥狀、放化療聯(lián)合的比例均無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(均P>0.05),見表2。

表2 患者基線特征

2.2 XRCC1基因型及等位基因分布頻率 XRCC1基因SNP的分型成功率為100%。死亡組與存活組患者SNP頻率分布均符合哈代溫伯格(Hardy-Weinberg)平衡。本研究中3個(gè)SNP之間連鎖不平衡程度較弱,未發(fā)現(xiàn)與腫瘤相關(guān)死亡的單倍體型。死亡組和存活組患者間XRCC1基因rs25487位點(diǎn)基因型分布無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P>0.05),但是等位基因頻率有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P<0.05),其中死亡組rs25487的A等位基因頻率明顯高于存活組(40.3%vs 22.1%,P<0.05)。rs25489及rs1799782基因型及等位基因頻率兩組間均無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(均P>0.05),見表3。

2.3 XRCC1基因多態(tài)性與預(yù)后相關(guān)性 XRCC1基因rs25487位點(diǎn)AA、GA、GG 3組基因型NHL患者相關(guān)病死率分別為75.0%(6/8)、54.2%(13/24)、36.4%(12/33),腫瘤相關(guān)病死率隨著rs25487位點(diǎn)A等位基因拷貝增加而增加。在rs25487位點(diǎn)A等位基因的加性模型中,每增加一個(gè)拷貝的A等位基因,患者死亡風(fēng)險(xiǎn)是增加前的2.208倍(95%CI:1.039~4.694,P<0.05);校正患者年齡、性別、吸煙、B癥狀及治療方式后,rs25487位點(diǎn)上的A等位基因仍然顯著增高患者死亡風(fēng)險(xiǎn),是增加前的2.382倍(95%CI:1.057~5.367,P<0.05),見表4。

表3 XRCC1基因型及等位基因頻率分布[例(%)]

表4 XRCC1基因多態(tài)性與預(yù)后分析

3 討論

XRCC1基因是一種重要的DNA修復(fù)基因,它所編碼的蛋白在基因切除修復(fù)和DNA單鏈斷裂修復(fù)過程中都發(fā)揮著十分重要的作用。XRCC1蛋白沒有直接的催化活性,但它可以與DNA聚合酶β、DNA連接酶Ⅲ、聚二磷酸腺苷核糖多聚酶(PARP)結(jié)合形成復(fù)合體,發(fā)揮骨架蛋白的作用,參與堿基切除修復(fù)和DNA單鏈斷裂修復(fù)[2]。

目前,已有較多的研究發(fā)現(xiàn)XRCC1基因rs25487位點(diǎn)多態(tài)性與血液系統(tǒng)腫瘤發(fā)病及預(yù)后密切相關(guān)。Wang等[5]研究發(fā)現(xiàn)XRCC1基因多態(tài)性與兒童急性淋巴細(xì)胞性白血病發(fā)病密切相關(guān),其中攜帶rs25487位點(diǎn)的A等位基因的亞洲兒童患急性淋巴細(xì)胞白血病的風(fēng)險(xiǎn)增加。Monroy等[3]對200例霍奇金淋巴瘤(Hodgkin’s lymphoma,HL)患者和220例對照者進(jìn)行了XRCC1基因多態(tài)性與HL發(fā)病關(guān)系研究,結(jié)果顯示rs25487位點(diǎn)的A等位基因突變可使HL患病風(fēng)險(xiǎn)增加62%。Liu等[6]對中國人群進(jìn)行的XRCC1與NHL相關(guān)性研究中發(fā)現(xiàn),重度吸煙患者組中XRCC1基因rs25487位點(diǎn)GA與AA基因型的患者發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)較GG基因型高3倍。Guillem等[7]研究了XRCC1基因rs25487位點(diǎn)多態(tài)性與自體造血干細(xì)胞移植術(shù)后淋巴瘤(包括NHL)患者預(yù)后的相關(guān)性,發(fā)現(xiàn)攜帶突變型A等位基因的患者死亡風(fēng)險(xiǎn)是野生型患者的2倍,而雜合突變和純合突變基因型患者發(fā)生治療相關(guān)急性髓系白血病的風(fēng)險(xiǎn)也明顯增加。然而,最近Li等[8]的一項(xiàng)薈萃分析顯示rs25487位點(diǎn)A等位側(cè)是NHL發(fā)病的保護(hù)因素,與本研究結(jié)果不一致,其原因主要是由于基因多態(tài)性存在地域及種族差異性,該薈萃分析納入了歐洲高加索人群及亞洲非漢族人群。此外,還有較多研究發(fā)現(xiàn)XRCC1基因rs25487位點(diǎn)多態(tài)性與其他腫瘤發(fā)病及預(yù)后密切相關(guān)[9-10]。

本研究發(fā)現(xiàn),XRCC1基因的rs25487位點(diǎn)多態(tài)性與DLBCL患者預(yù)后密切相關(guān),AA、GA、GG 3組基因型患者的腫瘤相關(guān)病死率分別為75.0%、54.2%和36.4%,隨著A等位基因拷貝增多,患者腫瘤相關(guān)病死率也逐漸升高。XRCC1基因rs25487位點(diǎn)突變會(huì)導(dǎo)致其第399密碼子編碼的氨基酸由精氨酸(Arg)變?yōu)楣劝滨0罚℅ln),第399密碼于位于PARP結(jié)合區(qū)域,因此這3個(gè)位點(diǎn)氨基酸的改變,可能改變XRCC1的功能[11-12]。rs25487位點(diǎn)的變異降低了XRCC1的修復(fù)能力,從而使DNA加合物水平升高,體細(xì)胞突變及染色體畸變增加,同時(shí)該位點(diǎn)的變異會(huì)影響XRCC1基因編碼蛋白的氧化還原功能及DNA修復(fù)功能,將直接決定和影響癌細(xì)胞對鉑類化療藥物耐藥性的高低,使腫瘤惡化進(jìn)展的風(fēng)險(xiǎn)增加[13]。其中攜帶rs25487位點(diǎn)A等位基因的患者對化療藥物的反應(yīng)性較差,從而影響其預(yù)后及遠(yuǎn)期生存率。

本研究結(jié)果提示XRCC1基因rs25487位點(diǎn)多態(tài)性是NHL患者預(yù)后的預(yù)測因子,這提示未來可能可以通過對NHL患者進(jìn)行基因分型,從而評估患者的腫瘤相關(guān)死亡風(fēng)險(xiǎn),為NHL患者個(gè)體化治療提供依據(jù)。但本研究也存在一些不足之處,首先樣本量有限,由于各種客觀條件限制,未能夠進(jìn)一步增加樣本量,可能對統(tǒng)計(jì)效能有一定影響,后續(xù)需累計(jì)病例樣本進(jìn)一步研究;另外本研究的納入人群均為中國南方漢族,XRCC1基因多態(tài)性存在地域種族差異性,故研究結(jié)論不能一概而論,尚需在不同地域及不同種族進(jìn)一步驗(yàn)證。

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Association between DNA X-ray repair cross complementary protein 1(XRCC1)polymorphisms and clinical outcome of patients with diffuse large B-cell lymphoma


GAO Yu,WEI Nan,LI Mengjie,et al.Department of Hematology,Zhejiang Hospital,Hangzhou 310013,China

【 Abstract】 Objective To investigate the association of DNA X-ray repair cross complementary protein 1(XRCC1) polymorphisms with the clinical outcome of patients with non-Hodgkin's lymphoma(NHL). Methods Sixty five patients with diffuse large B-cell lymphoma(DLBCL)(mean age of 59.7±8.0 years)were enrolled in the study,among whom 31(47.7%)died from NHL during follow-up.Three single nucleotide polymorphisms(SNPs)in XRCC1 gene of patients were genotyped.Logistic regression analyses were used to compute odds ratios(ORs)and 95%confidence intervals(CIs). Results Among three SNPs, frequency of A allele of rs25487 was significantly higher in death group than that in survival group(40.3%vs.22.1%,P<0.05).The death rates of patients with AA,GA,and GG genotype were 75.0%(6/8),54.2%(13/24)and 36.4%(12/33),respectively.A allele of rs25487 increased the risk of death in additive model with odds ratio(OR)of 2.208(95%CI:1.039~4.694,P<0.05).After adjusting for age,sex,smoking,B symptoms and treatment,the significance still remained with OR=2.382(95%CI:1.057~5.367,P<0.05). Conclusion rs25487 of XRCC1 gene may be correlated with outcome of DLBCL patients.

Non-Hodgkin's lymphoma XRCC1 gene Polymorphism Prognosis

2015-08-24)

(本文編輯:田云鵬)

310013 杭州,浙江醫(yī)院血液科

高宇,E-mail:zjyyzlk@163.com

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