呂燕寧,李 潔,杜軼威,黎新宇, 王全意,陳麗娟
?
一株人血源豬鏈球菌的分離鑒定與毒力基因檢測
呂燕寧1,2,李 潔1,杜軼威1,黎新宇1, 王全意1,陳麗娟1
目的 對北京某醫院就診的一例疑似人感染豬鏈球菌病患者的血液來源菌株進行鑒定與毒力因子檢測分析。方法 將患者血液分離菌株接種哥倫比亞血瓊脂平板,經革蘭氏染色鏡檢、血清凝集試驗、VITEK 2 Compact微生物分析儀以及基質輔助激光解析電離飛行時間質譜(MALDI-TOF-MS)檢測后,再用PCR技術檢測豬鏈球菌種特異性基因(16S rRNA)和豬鏈球菌2型特異性莢膜多糖編碼基因(cps2J)以及多個毒力基因:溶菌酶釋放相關蛋白(mrp)、溶血素(sly)、細胞外蛋白因子(ef)、谷氨酸脫氫酶(gdh)、纖粘連蛋白結合蛋白(fbps)、甘油醛-3-磷酸脫氫酶(gapdh)的編碼基因和毒力相關基因orf2。結果 傳統細菌鑒定方法和蛋白質譜技術以及核酸檢測方法將這株患者血源性細菌分離株鑒定為豬鏈球菌2型,該菌株的毒力基因cps2J、sly、ef、gdh、fbps、gapdh和orf2的PCR檢測均為陽性,mrp基因為陰性。結論 該株人血源細菌分離株為豬鏈球菌2型sly+/ef+/mrp強毒株。
豬鏈球菌;VITEK;MALDI-TOF-MS;毒力基因;聚合酶鏈反應
豬鏈球菌(S.suis)是一種人獸共患病病原體,根據其莢膜抗原的差異,豬鏈球菌可分為35個血清型,即1~34型和1/2型。其中豬鏈球菌2型流行最為廣泛,不僅能引起大規模的動物疫病而導致生豬養殖業的巨大經濟損失,還可引起人偶發病例甚至造成人間疫情的暴發,嚴重者致人死亡,對公眾健康尤其是高危人群的生命安全構成嚴重威脅,是一種危害嚴重的人獸共患病病原。近年來國內已發生多起人感染豬鏈球菌病疫情,九十年代末我國江蘇省部分地區,連續兩年出現由豬鏈球菌2型引起的豬群疫病暴發,數萬頭生豬死亡,數十人感染豬鏈球菌病,死亡14例[1];2005年四川省發生了國內外迄今為止報告的最大規模人感染豬鏈球菌病疫情,200多人感染,38人死亡[2],也由豬鏈球菌2型引起的;人感染豬鏈球菌病散發病例在其它省份也時有發生[3-5]。因此對該致病菌的快速鑒定與甄別以及毒力分析可以為患者的快速診斷和有效治療以及突發疫情的迅速處置提供依據。本研究對2015年在北京市某醫院就診的1例人感染豬鏈球菌疑似病例血液中分離的菌株進行了分離鑒定與毒力分析,現將結果報告如下。
1.1 病例信息 患者張某,男,52歲,來自河北省廊坊市,于2015年12月11日發病,就診于當地醫院,病情加重后于13日轉至北京某醫院急診科,主要癥狀為意識障礙,譫妄,躁動不安,伴有發熱、惡心、嘔吐,二便失禁?;颊咴诠ぷ鲉挝回撠熦i、牛、羊、驢、雞、鴨的飼養工作,其住所臨近豬舍,2014-2015年其工作場所均有病死豬情況發生,發病前1周,患者接觸過1只病死豬,對病死豬去毛時,手部有傷口。臨床診斷為人感染豬鏈球菌病、化膿性腦膜炎、急性腦梗死。
1.2 樣本 該病例的血培養物(BD公司BACTEC Plus Aerobic/F血培養瓶,全自動需氧培養24 h)。
1.3 試劑 哥倫比亞血瓊脂平板(貨號為PB0123A)購自英國OXOID公司,豬鏈球菌1型和2型抗血清(貨號分別為22280 Type 1和22280 Type 2)購自丹麥SSI公司,豬鏈球菌2型單克隆抗體由中國疾病預防控制中心提供,VITEK2革蘭氏陽性細菌鑒定卡(貨號21342)購自法國生物梅里埃公司,PCR試劑為Invitrogen Platinum○RPCR SuperMix(貨號11306-016)購自美國賽默飛公司。
1.4 儀器 法國生物梅里埃VITEK 2 Compact全自動細菌鑒定及藥敏分析系統,德國布魯克公司的MALDI Biotyper微生物快速鑒定系統,美國伯樂公司的iCycler PCR儀以及德國Qiagen公司的毛細管核酸電泳儀QIAXCEL。
1.5 細菌分離培養與染色鏡檢 將血培養物取200 μL接種于血瓊脂平板劃線培養,置37 ℃,5%二氧化碳培養箱培養24 h,觀察菌落特征,挑取單個可疑菌落進行革蘭染色后鏡檢。
1.6 血清分型試驗 挑取菌落分別與豬鏈球菌1型和2型抗血清做玻片凝集試驗,同時設生理鹽水對照。
1.7 篩檢生化試驗 觸酶實驗,取潔凈玻片1張,接種環挑取菌落,加3% H2O21滴,立即觀察結果。
1.8 VITEK 2 Compact全自動細菌鑒定儀檢測 挑取單個菌落轉種血瓊脂平板,于37 ℃,5%二氧化碳培養箱培養24 h。用消毒棉簽沾取適量菌苔,以0.45%的氯化鈉溶液配制濃度為0.5~0.65 Mac單位的菌懸液3 mL;將預溫25 ℃的VITEK 2革蘭氏陽性細菌鑒定卡用已配制好濃度的菌懸液進行自動填充后,置于讀卡器中進行反應,反應結束后儀器自動讀卡并打印出最終結果。
1.9 基質輔助激光解析電離飛行時間質譜(MALDI-TOF-MS)檢測 以5 mL乙腈 + 0.25 mL三氟乙酸(TFA)+ 4.75 mL純水配制10 mL標準溶劑。以標準溶劑配制飽和HCCA基質溶液(終濃度為10 mg/mL)備用。以接種環取單一菌落,加入1 mL 70%乙醇振蕩滅活,離心去上清,再向沉淀中加入70%甲酸50 μL以及乙腈50 μL,振蕩離心取上清待測。取1 μL上清滴于樣品盤上晾干,再加上1 μL基質溶液,晾干后上機檢測。
1.10 豬鏈球菌靶基因檢測 菌株DNA制備:刮取1-2接種環菌苔加入150 μL三蒸水中,振蕩混勻制成菌懸液,100 ℃煮沸10 min;14 500 r/min離心10 min,取上清液于-20 ℃冰箱中保存備用。參照相關文獻的引物序列及PCR方法檢測豬鏈球菌種特異的16S rRNA基因和豬鏈球菌2型cps2J基因以及其他毒力基因:莢膜多糖(cps)、溶菌酶釋放蛋白(mrp)、溶血素(sly)、細胞外因子(ef)、甘油醛-3-磷酸脫氫酶(gadph)、谷氨酸脫氫酶(gdh)、粘連蛋白/纖粘連蛋白結合蛋白(fbps)和毒力相關因子orf2。引物序列、退火溫度及產物片段大小詳見表1。反應體系(20 μL)為上下游引物(10 μmol/L)各1 μL、模板DNA 1 μL、預混液17 μL混合而成。反應條件為預變性95 ℃、4 min,變性95 ℃、30 s,退火30 s,退火溫度參見表1,延伸72 ℃、1 min,35個循環,最后延伸72 ℃、7 min。
表1 豬鏈球菌基因檢測引物及其產物大小
Tab.1 Primers ofStreptococcussuisgene detection and product sizes

目的基因Targetgene引物序列(5′?3′)Primerssequence產物大小/bpSizeofproducts退火溫度/℃Annealingtemperature參考文獻References16SrRNACAGTATTTACCGCATGGTAGATAT32860[6]GTAAGATACCGTCAAGTGAGAAcps2JGTTGAGTCCTTATACACCTGTT45060[7]CAGAAAATTCATATTGTCCACCmrpGGTATACCTTGCTGGTACCGTTC53260[7]AGTCTCTACAGCTGTAGCTGGslyAGTTCGCACTTGATTTTAAG150051[7]AATACATTGCCAGATTACTCefACAAAGGCGTAGGTTCAATC26956[7]CGGCATCAAGAATGTCTTTGgdhGCAGCGTATTCTGTCAAACG65756[8]CCATGGACAGATAAAGATGGorf2CAAGTGTATGTGGATGGG85856[8]ATCCAGTTGACACGTGCAfbpsTGTCCTCAACATCCGCA18460[9]CATTGTCCAACTGACGAATCTCCTCgapdhTGACAAGAAAGTAACTGCTGA12348[9]CAATGAACCGAATGAGA
2.1 菌落特征與鏡檢結果 可疑菌株在血瓊脂平板上培養24 h后出現細小突起、光滑濕潤的圓形菌落,半透明略帶灰白色、邊緣整齊,聚集性菌苔周圍呈明顯的α溶血現象,單個菌落周圍α溶血現象不明顯,革蘭染色后油鏡下觀察,細菌呈成對或短鏈狀革蘭氏陽性球菌。結果見圖1。

圖1 細菌的生長形態與革蘭氏染色Fig.1 Growth form and Gram stain of the bacteria

圖2 PCR檢測結果Fig.2 PCR results
2.2 血清分型結果 分離菌株與豬鏈球菌2型抗血清以及豬鏈球菌2型單克隆抗體發生凝集反應,與豬鏈球菌1型抗血清不發生凝集反應。生理鹽水對照未發生凝集現象。
2.3 篩檢生化試驗 無氣泡產生,觸酶試驗陰性。
2.4 VITEK 2 Compact全自動細菌鑒定儀檢測結果 鑒定結果顯示,分離菌株為豬鏈球菌2型。
2.5 基質輔助激光解析電離飛行時間質譜(MALDI-TOF-MS)檢測結果 MALDI-TOF-MS鑒定結果顯示該菌株與豬鏈球菌1型DSM 9683、DSM 9684和豬鏈球菌2型DSM 9682T(German Culture Collection,Braunschweig,Germany)最為相似,分值(Score Value)分別為2.341、2.268和1.870。
2.6 PCR檢測結果 PCR檢測結果顯示豬鏈球菌種特異的16S rRNA基因、豬鏈球菌2型特有的毒力基因cps2J及毒力基因sly、ef、gdh、fbps、gapdh和orf2均出現預期大小的DNA擴增條帶,為陽性;mrp則未見擴增條帶,為陰性。結果見圖2。
豬鏈球菌是一種呈世界性分布的人獸共患病原菌,雖然有35個血清型,并非所有的血清型都有致病性,能感染人的致病血清型主要包括1、2、1/2、7、9和14型6種。毒力最強的是1型,而2型分布最廣泛,是從病豬和患者中分離最多的一種血清型[10],也是我國豬鏈球菌病疫情的主要流行株,但并不是所有的豬鏈球菌2型都具有致病性,其致病力取決于它的毒力因子,根據菌株毒力因子的差異,可將其分為強毒株、弱毒株和無毒株,因此對分離菌株的鑒定、分型以及毒力因子的檢測分析對病人的診斷治療和疫情處置很重要。
傳統的細菌鑒定有一系列的流程和方法,耗時長,程序繁瑣,通常還需要實驗者具有一定的經驗。MALDI-TOF-MS是近年來發展起來的一種新型的有機質譜技術,是一種利用蛋白質譜學的全新的微生物快速檢測和鑒定技術,對于已經分離純化的菌株能夠在短至幾分鐘的時間內進行初步鑒定。目前應用MALDI-TOF-MS技術在檢測和鑒定微生物方面國內外已經取得了很好的進展,尤其是在細菌的種屬鑒定方面,有學者使用MALDI-TOF-MS方法鑒定了129株豬鏈球菌分離株,符合率可達96.9%[11],可以很好的將菌株鑒定到屬的水平。本研究中采用MALDI-TOF-MS方法對分離株進行鑒定,結果顯示該方法可將可疑菌株鑒定為豬鏈球菌,但不能進一步精確區分血清型。因此我們進一步使用了豬鏈球菌1型和2型抗血清以及2型單克隆抗體進行了血清凝集試驗,試驗結果顯示該菌株只能與2型抗血清發生凝集反應,提示該分離株為2型豬鏈球菌。
VITEK 2 compact系統是微生物快速檢測分析系統,該系統能夠準確快速地分析出菌株的鑒定結果。馬麗梅等[12]應用此方法對111株豬鏈球菌進行了鑒定,其中110株為豬鏈球菌2型,1株為豬鏈球菌1型,正確率100%。因此作者認為VITEK 2 compact分析系統可作為一種簡便快速的豬鏈球菌鑒定方法。但也指出,該實驗所用的菌懸液配制濃度要非常準確,而且必須以培養18~24 h的新鮮菌落來配制,否則對鑒定結果的影響會較大。本研究應用VITEK 2 compact分析系統對疑似菌株進行了鑒定,并且做了重復實驗,實驗結果也顯示該方法的鑒定結果并非每次都很穩定,其中一次鑒定結果顯示為豬鏈球菌1型,這也是為什么我們要選擇豬鏈球菌1型抗血清進行血清凝集試驗來做進一步的確證,鑒定該菌株到底是1型、2型還是1/2型的原因。
分子生物學技術因其敏感、快速、準確的優點在細菌鑒定和分型方面得到越來越多的應用。豬鏈球菌16S rRNA基因片段具有種特異性,cps2J基因不僅是其毒力基因之一,也是豬鏈球菌2型的型特異性基因,可以作為鑒定豬鏈球菌2型的靶基因,本研究中該分離株的16S rRNA和cps2J基因均為陽性,提示本研究中的疑似菌株為豬鏈球菌2型菌株。豬鏈球菌2型的毒力因子與其致病性密切相關,是判定其毒力強弱的指標。目前認為豬鏈球菌2型的毒力因子主要有cps、mrp、sly、ef、gadph、gdh、fbps、orf2等[13]。ef和mrp的表達與豬鏈球菌2型菌株的毒力有顯著關系。根據mrp和ef及其類似物的存在與否,豬鏈球菌2型存在著以下幾種表現型:mrp+ef+、mrp-ef-、mrp+ef*(ef類似物)、mrp+ef-、mrp*(mrp類似物)ef-、mrp-ef*、mrp-ef+等。我國1998年江蘇省及2005年四川省豬鏈球菌病疫情中的病豬體內分離到的菌株也為mrp+ef+型[14]。由于mrp和ef在非致病菌株中檢出率很低,而在強毒株中檢出率很高,因此mrp和ef常被認為是豬鏈球菌2型高致病性的標志,但其他毒力基因,如sly等也對豬鏈球菌的致病性起重要作用[15-16]。一般認為sly、mrp及ef3個毒力因子可用來區分高致病、低致病與非致病菌株,sly/ef/mrp陽性常被認為是與菌株的高致病性相關的[17]。然而,近年國外研究者從病豬中分離的多個2型豬鏈球菌菌株表現為sly-/ef-/mrp-/+[17-18]。2008-2011年從加拿大分離的127株2型豬鏈球菌中,52%為sly-/ef-/mrp+型,44%為sly-/ef-/mrp-型,并且研究者發現mrp-較mrp+菌株的毒力似乎更強[19]。陳經雕等[7]研究了22株來自人和豬的2型豬鏈球菌,其中有10株(7株人源、3株豬源)為sly+/ef+/mrp+型,另外10株分離自病人的菌株為sly-/ef+/mrp+,2株分離自病豬的菌株分別為sly+/ef+/mrp-和sly-/ef-/mrp-??偠灾瑖鴥热嗽簇i鏈球菌2型分離株多為sly+/ef+/mrp+型。本研究以cps2J、mrp、sly、ef、gadph、fbps、gdh和orf2為靶基因對疑似菌株進行了PCR鑒定,其結果除mrp基因外均為陽性,結合患者危重的臨床表現,表明本例人血源分離菌株為表現型為sly+/ef+/mrp-的豬鏈球菌2型強毒株,與以往的研究結果略有差異,表明mrp基因并不是豬鏈球菌2型致病力強弱的決定性因素。
[1] Zhu XP,Zu RQ,Chen ZH,et al. Analysis on features of dead cases with humanStreptococcussuisinfections[J]. Chin J Epidemiol,2005,6(9): 633-635. (in Chinese)
祝小平,祖榮強,陳志海,等.四川省人感染豬鏈球菌病死亡病例特征分析[J].中華流行學雜志,2005,6(9): 633-635.
[2] Yin JW,Xu W,Gu WP,et al. Pathogenic analysis of the first isolatedStreptococcussuisfrom infected human in Yunnan Province[J]. J Appl Prevent Med,2012,18(2): 78-80. (in Chinese)
尹建雯,徐聞,古文鵬,等.云南省首例人感染豬鏈球菌病的病原學分析[J].應用預防醫學,2012,18(2): 78-80.
[3] Luo HC,Huang J,Zhang WB,et al. Epidemiological investigation of the first isolatedStreptococcussuisfrom infected human in Beihai[J]. J Public Health Prevent Med,2013,24(5): 74-75. (in Chinese)
羅華初,黃堅,張萬標,等.北海市首例人感染豬鏈球菌病的流行病學調查[J].公共衛生與預防醫學,2013,24(5): 74-75.
[4] Pang W,Liang YH,Zhou Y,et al. Epidemiological investigation of the first cases of human infection with swineStreptococcusin Dalian City[J]. Occup Health,2015,31(8): inside front cover-inside back cover. (in Chinese)
龐為,梁玉紅,周祎,等.大連市首例人感染豬鏈球菌病流行病學調查[J].職業與健康,2015,31(8): 封二-封三.
[5] Ma Q,Li SJ,Liu Y,et al. Etiologic detection and analysis of a humanStreptococcussuisinfection in Guizhou Province,China[J]. Chin J Zoonoses,2015,31(5): 489-492.DOI:10.3969/j.issn.1002-2694.2015.05.021 (in Chinese)
馬青,李世軍,劉英,等. 貴州省一例人感染豬鏈球菌病例的病原學檢測與分析[J]. 中國人獸共患病學報,2015,31(8): 489-492.
[6] Wisselink HJ,Reek FH,Vecht U,et al.Detection of virulent strains ofStreptococcussuistype 2 and highly virulent strains ofStreptococcussuistype 1 in tonsillar specimens of pigs by PCR[J]. Vet Microbiol,1999,67(2): 143-157.
[7] Chen JD,Liu MZ,Ke BX,et al. Analysis on the main virulence genes and molecular typing ofStreptococcussuistype 2 in Guangdong Province[J]. Chin J Zoonoses,2013,29(10): 986-990.DOI:10.3969/j.issn.1002-2694.2013.10.010 (in Chinese)
陳經雕,劉美真,柯碧霞,等,廣東省豬鏈球菌2型菌株毒力基因及分子分型分析[J]. 中國人獸共患病學報,2013,29(10): 986-990.
[8] Jiang NP,Ren YY,Dai Z,et al. Identification of a strain ofStreptococcussuisand the main virulence factors analysis[J]. J Anhui Agri Sci,2011,39(34): 21034-21036. (in Chinese)
江南屏,任瑤瑤,戴甑,等,1株豬鏈球菌的分離、鑒定及其毒力因子研究[J]. 安徽農業科學,2011,39(34): 21034-21036.
[9] Tan C,Liu M,Jin M,et a1. The key virulence-associated genes ofStreptococcussuistype 2 are upregulated and differentially expressedinvivo[J]. FEMS Microbiol Lett,2008,278(1): 108-114.
[10] Gottschalk M,Segura M,Xu J.Streptococcussuisinfections in humans: The Chinese experience and the situation in North America[J]. Anim Healt Res Rev,2007,8(1): 29-45.
[11] Perez-Sancho M,Vela AI,Garcia-Seco T. Assessment of MALDI-TOF MS as alternative tool forStreptococcussuisidentification[J]. Front Public Health,2015,3(8): 202.
[12] Ma LM,Tan LJ. Fast identification ofStreptococcussuistype 2 by VITEK2 compact system[J]. Lab Med Clin,2012,9(13): 1617-1618. (in Chinese)
馬麗梅,譚麗娟. VITEK2 compact 微生物分析系統對豬鏈球菌2型快速鑒定[J]. 檢驗醫學與臨床,2012,9(13): 1617-1618.
[13] Huan HX,Huang LL,Zhang K. Advance on diversity and virulent factor ofStreptococcussuis[J]. China Anim Husb Vet Med,2014,41(2): 218-223. (in Chinese)
宦海霞,黃莉莉,張科. 豬鏈球菌多樣性及其致病因子研究進展[J]. 中國畜牧獸醫,2014,41(2):218-223.
[14] Zhu WD. Review on the virulence factors ofStreptococcussuistype 2[J]. Live Stock Poultry,2014(7): 52-53. (in Chinese)
朱文斗.豬鏈球菌2型毒力因子的的研究概述[J]. 畜禽業,2014(7): 52-53.
[15] Sanchez Del Rey V,Fernandez-Garayzabal JF,Dominguez L,et al. Screening of virulence-associated genes as a molecular typing method for characterization ofStreptococcussuisisolates recovered from wild boars and pigs[J]. Vet J,2016,209(3): 108-112.
[16] Dong W,Ma J,Zhu Y,et al. Virulence genotyping and population analysis ofStreptococcussuisserotype 2 isolates from China[J]. Infect Genet Evol,2015,36(12): 483-489.
[17] Gottschalk M,LAcouture S,Bonifait L,et al. Characterization ofStreptococcussuisisolates recovered between 2008 and 2011 from diseased pigs in Quebec,Canada[J]. Vet Microbiol,2013,162(2-4): 819-825.
[18] Fittipaldi N,Fuller TE,Teel JF,et al. Serotype distribution and production of muramidase-released protein,extracellular factor and suilysin by field strains ofStreptococcussuisisolated in the United States[J]. Vet Microbiol,2009,139(3/4): 310-317.
[19] Fittipaldi N,Xu J,Lacouture S,et al. Lineage and virulence ofStreptococcussuisserotype 2 isolates from North America[J]. Emerg Infect Dis,2011,17(12): 2239-2244.
Identification and virulence analysis of aStreptococcussuisstrain isolated from human blood
LYU Yan-ning1,2,LI Jie1,DU Yi-wei1,LI Xin-yu1,WANG Quan-yi1,CHEN Li-juan1
(1.BeijingCenterforDiseasesControlandPrevention,BeijingResearchCenterofPreventiveMedicine,Beijing100013,China;2.SchoolofPublicHealth,CapitalMedicalUniversity,Beijing100069,China)
To identify and analyze the virulence of a bacteria strain isolated from the blood of a patient with suspectedStreptococcussuis(S.suis) infection in a hospital of Beijing,we inoculated the bacteria strain isolated from the blood of the patient to the Columbia with sheep blood agar plate,after Gram staining and microscopical examination,serum agglutination test,VITEK 2 Compact microbial identification system test and matrix assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS) test,S.suisspecies specific gene 16SrRNA,S.suisspecies serotype 2 specific virulence gene capsule polysaccharide 2J (cps2J) and virulence gene muramidase-released protein (mrp),hemolysin (sly),extracellular factor protein (ef),glutamate dehydrogenase (gdh) genes,fibronectin-binding protein (fbps),glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (gapdh) genes and virulence correlated gene orf2 were further detected by PCR. Results showed that the suspicious bacteria strain ofS.suiswas identified asS.suistype 2 (S.suis2) by conventional methods,MALDI-TOF-MS and PCR. PCR results showed thatcps2J,sly,ef,gdh,fbps,gapdhandorf2 genes were positive,and mrp gene was negative. In conclusion,the bacteria strain isolated from the patient’s blood is sly+/ef+/mrp-virulentS.suis2.
S.suis; VITEK; MALDI-TOF-MS; virulence gene; PCR
Chen Li-juan,Email: bjcdcchlj@hotmail.com
國家科技重大專項(No.2012ZX10004215-003-001)資助
陳麗娟,Email:bjcdcchlj@hotmail.com
1.北京市疾病預防控制中心,北京市預防醫學研究中心,北京 100013; 2.首都醫科大學公共衛生學院,北京 100069
10.3969/j.issn.1002-2694.2017.07.005
R378.1
A
1002-2694(2017)07-0599-05
2016-07-11 編輯:張智芳
Supported by the National Key Science and Technology Project of China (No. 2012ZX10004215-003-001)