楊 寧,包雨卓,趙浡彤,呂 巖,彭瞰看,田 宇,徐慶華,于 晶,王軍虹,蒼 晶
(1.東北農業大學生命科學學院,黑龍江哈爾濱 150030; 2.廣東白云學院,廣東廣州 510450)
低溫脅迫是限制小麥產量的主要因素。ABA是重要的植物激素之一。研究證實,外源施加ABA能夠促進植物體內ABA的合成和運輸,增加滲透調節物質的含量,提高抗氧化酶活性,誘導抗寒相關基因表達以及促進相關酶的重新合成,從而提高植物抗寒性[1-2]。氟啶酮是ABA合成的抑制劑,通過抑制ABA前體物質類胡蘿卜素的合成,從而抑制植物體內ABA的合成[3-4]。用氟啶酮作對照,可進一步明確哪些蛋白可能受到ABA的誘導。
雙向電泳技術是蛋白質組學研究的關鍵技術,在植物抗逆相關研究中應用日趨廣泛,對植物抗寒等抗性研究已取得了一些進展。Meza-Basso等[5]首次通過雙向電泳技術在油菜中發現受低溫誘導的蛋白,并在多種植物中得到應用。Hashimoto等[6]采用雙向電泳在對低溫脅迫下水稻幼苗的研究中發現,水稻葉鞘、葉片和根系在低溫處理后出現39個蛋白差異點。Cui等[7]采用雙向電泳對不同溫度處理下水稻幼苗葉片蛋白進行分離,鑒定到41個低溫誘導蛋白。Gao等[8]采用雙向電泳在對鹽芥蓮座葉響應低溫脅迫的蛋白研究中發現,所有參與RNA代謝、防御和蛋白代謝的蛋白質都顯著上調。
東農冬麥1號是首例可在北方高寒地區安全越冬的強抗寒冬小麥品種,返青率大于85%。本課題組前期研究發現,東農冬麥1號分蘗節是其物質準備能力和抗寒代謝適應最強的器官,在冬小麥安全越冬中起重要作用[9]。鑒于此,本試驗以東農冬麥1號為材料,于三葉期分別外源噴施10 μmol·L-1ABA和50 μmol·L-1氟啶酮,待大田自然降溫至4 ℃和-25 ℃時取分蘗節,采用聚丙烯酰胺凝膠電泳對各處理組全蛋白進行分離,然后進一步采用雙向電泳分離蛋白,篩選出與ABA調控相關或與低溫應答相關的差異蛋白后進行質譜分析,探討外源ABA對低溫下冬小麥蛋白質組的影響,進而揭示冬小麥抗寒的蛋白質基礎及其與ABA調控的關系。
供試冬小麥(TriticumaestivumL.)材料為東農冬麥1號,由東北農業大學小麥育種研究室提供。
選取籽粒飽滿一致的冬小麥種子于東北農業大學試驗田播種。完全區組設計,3次重復,小區行長1.5 m,10行區,行距0.2 m,播種量為450粒·m-2,播深5 cm,常規管理。待冬小麥生長至三葉期時,分別采用10 μmol·L-1ABA、50 μmol·L-1氟啶酮(二者濃度為前期試驗確定的最適濃度)進行葉面噴施,用量為0.25 L·m-2,以噴施等量蒸餾水為對照。分別于10 d最低溫平均4 ℃和-25 ℃時取樣。各處理分別取50株長勢相似的麥苗,將分蘗節剪成0.5 cm的小段,混勻后用液氮迅速冷凍,于-80 ℃冰箱保存備用。
全蛋白的提取參照Damerval等[10]的方法并略作改進。取1.0 g樣品在液氮中充分研磨,轉入50 mL離心管中。加入10 mL預冷的10% 三氯乙酸(TCA)/丙酮溶液,于-20 ℃冰箱放置45 min。4 ℃、16 000 r·min-1離心15 min,棄上清,重懸沉淀。加入10 mL預冷的10% TCA/丙酮溶液,于-20 ℃冰箱放置45 min。4 ℃、16 000 r·min-1離心15 min,棄上清,沉淀中加入預冷的80%丙酮,振蕩混勻后于-20 ℃冰箱放置45 min(重復兩次該步驟)。棄上清,沉淀低溫冷凍干燥成粉末狀。
在上述所得到的粉末狀蛋白質樣品中加入500 μL裂解液(7 mol·L-1尿素、2 mol·L-1硫脲、4% CHAPS、65 mol·L-1DTT、2% IPG buffer)混勻,渦旋振蕩20 min,4 ℃過夜。取上清,用蛋白質定量試劑盒(2-D Quant-Kit,GE-Healthcare)定量。
根據蛋白質含量吸取一定體積的蛋白溶液,加適量水化液(7 mol·L-1尿素、2 mol·L-1硫脲、2% CHAPS、20 mmol·L-1DTT、0.5% IPG buffer、0.1%溴酚藍)補齊至450 μL,加入膠條槽中,用24 cm IPG strip覆蓋,通過Ettan IPGphor Ⅲ(GE-Healthcare)進行等電聚焦,聚焦程序設置為:主動水化30 V 10 h,200 V 1 h,500 V 1 h,1 000 V 1 h,4 000 V 1 h,8 000 V 1 h,64 000 Vh聚焦,500 V維持。
第一相等電聚焦結束后,將膠條取出置于放入10 mL膠條平衡緩沖液Ⅰ[6 mol·L-1尿素、75 mmol·L-1Tris-HCl(pH 8.8)、29.3%甘油、2% SDS、0.002%溴酚藍、1% DTT]的水化盤中,平衡15 min。取出后再放入10 mL膠條平衡緩沖液Ⅱ[6 mol·L-1尿素、75 mmol·L-1Tris-HCl(pH 8.8)、29.3%甘油、2% SDS、0.002%溴酚藍、2.5%碘乙酰胺]中平衡15 min。平衡完畢后,將膠條在電極緩沖液中浸泡2 s后轉移到12.5%的SDS-PAGE凝膠上,低熔點瓊脂糖封膠后,應用Ettan Dalt Six(GE-Healthcare)進行第二相SDS-PAGE電泳,20 ℃恒溫下,1 W 30 min,13 W直至溴酚藍移至凝膠底部,電泳停止。
電泳結束后,將膠塊取出置于20%TCA中固定15 min后,用染色液(450 mL蒸餾水、450 mL無水乙醇、100 mL冰乙酸、2.5 g考馬斯亮藍R250)染色2 h后,轉至脫色液中(450 mL蒸餾水、450 mL無水乙醇、100 mL冰乙酸)中,不斷更換脫色液直到條帶清晰可見。
待凝膠背景清晰后,用Ettan Image Scanner掃描儀拍照后,將凝膠保存于含有10%冰乙酸的溶液中。利用ImageMasterTM2D Platinum 7.0軟件(GE Healthcare)對圖像進行分析,篩選出差異表達的蛋白點,選擇相對體積改變大于2倍的蛋白點,借助SPSS進行分析,選擇其中差異倍數在2倍以上的24個蛋白點切膠后進行質譜分析。
用含50%乙腈的25 mmol·L-1碳酸氫銨洗脫后乙腈脫水。56 ℃下用10 mmol·L-1DTT打開二硫鍵,然后暗處55 m mol·L-1IAM處理,進行半胱氨酸的烷基化封閉,最后用胰蛋白酶溶液裂解。裂解液用MALDI-TOF/TOF進行肽指紋圖譜及二級質譜測定。質譜儀檢測時設置參數為:檢測模式為反射模式,譜圖質量范圍為500~3 500 Da,分辨率為50 000。默認每張一級譜圖選擇5個母離子進行二級鑒定。蛋白質膠點鑒定主要是通過試驗產生的質譜數據,與數據庫模擬得到的理論質譜數據進行匹配,從而得到蛋白質鑒定結果。
4 ℃時,各處理組雙向電泳結果如圖1。對圖1各處理組進行軟件分析,得到可匹配的蛋白點587個。ABA處理組與對照組相比,133個蛋白點差異表達變化量達到2倍以上,其中,115個蛋白點上調,18個蛋白點下調(圖1a、圖1b);氟啶酮處理組與對照組相比,59個蛋白點差異表達變化量達到2倍以上,其中,31個點上調,28個點下調(圖1a、圖1c);ABA處理組與氟啶酮處理組相比,差異表達變化量達到2倍以上的點有64個,其中36個點上調,28個點下調(圖1b、圖1c)。
25 ℃時,各處理組雙向電泳結果如圖2。對圖2各處理組進行軟件分析得到可以匹配的蛋白點394個。ABA處理組與對照組相比,61個蛋白點差異表達變化量達到2倍以上,其中,41個蛋白點上調,20個蛋白點下調(圖2a、圖2b);氟啶酮處理組與對照組相比,84個蛋白點差異表達變化量達到2倍以上,其中,29個點上調,55個點下調(圖2a、圖2c);ABA處理組與氟啶酮處理組相比,差異表達變化量達到2倍以上的點有65個,其中34個點上調,31個點下調(圖2b、圖2c)。

a:對照組;b:ABA處理組;c:氟啶酮處理組。圖2同。
a:Control; b:ABA treatment; c:Fluridone treatment. The same in figure 2.
圖14℃時各處理組的2-DE圖譜
Fig.12-DEmapsofeachtreatmentat4℃
對各處理之間差異倍數達到2倍以上的蛋白點進行篩選,選擇在低溫下變化倍數較大及在ABA處理組和氟啶酮處理組中變化相反的23個蛋白點,和低溫下消失的蛋白點1個,共24個蛋白點(圖3)。其中,21個(點1~14、點16~17、點19~23)在ABA處理組中上調,而在氟啶酮處理組下調;2個(點15、點18)在ABA處理組中下調,而在氟啶酮處理組上調;1個(點24)在4 ℃特異表達,-25 ℃消失的蛋白點。對以上篩選到的24個蛋白點進行質譜分析,均得到了完整的肽指紋圖譜,Mascot數據庫檢索結果如表1示,其中15種為已知蛋白,9種未知蛋白。
由圖4可知,鑒定出的蛋白與譜圖匹配的肽段長度占整個蛋白長度40%~100%、35%~40%、30%~35%、25%~30%的分別有28%、20%、11%、11%,說明鑒定出的蛋白覆蓋率較高,有較高的可信度。

圖3 4 ℃下進行質譜分析的蛋白點
已鑒定出的差異蛋白可分為逆境蛋白、代謝相關蛋白、轉錄翻譯相關蛋白和未知蛋白。逆境蛋白包括低溫誘導蛋白16(點1)、低溫響應RNA結合蛋白(點2)、冷調節蛋白(點16、點17)。代謝相關蛋白包括磷酸甘油酸變位酶(點4)、磷酸甘油酸激酶(點23)、ATP合酶β亞基(點5)、谷胱甘肽S轉移酶1(點7)、26S蛋白酶非ATP酶調節亞基(點10)、谷胱甘肽轉移酶(點11)和谷胱甘肽轉移酶F5(點15)。轉錄翻譯相關蛋白包括新生多肽相關復合物β亞基(點3)、4A真核起始因子(點6)和真核翻譯起始因子5A3(點24)。未知蛋白包括點8、9、12、13、14、18、19、20、21和22。

表1 質譜分析結果Table 1 Results of mass spectrometry

圖例中,百分數表示蛋白鑒定覆蓋率,括號內數字表示覆蓋率范圍內的蛋白種類數。
In the legend,the percentage indicates protein sequence coverage,and the data in the parenthesis indicates the number of protein species within that sequence coverage.
圖4蛋白鑒定覆蓋率分布
Fig.4Distributionofproteinsequencecoverage
低溫誘導蛋白16(cold induced 16, WCI16)(點1)是冬小麥在冷馴化期間誘導的一種蛋白,Sasaki K等[11]的研究從晚期胚胎發育蛋白(late embriogenesis abundant protein, LEA)通常具有的4個特征(超親水性、沸騰溶解度、應力誘導性和應激保護性)證明了WCI16可能代表一類新的LEA蛋白。植物LEA蛋白被認為是一種逆境響應蛋白,低溫、干旱及ABA等均可誘導其表達,其中ABA是LEA蛋白基因表達的重要調節因子,根據LEA蛋白基因表達是否依賴ABA可分為ABA依賴型和非ABA依賴型[12]。本試驗中WCI16在ABA處理組與氟啶酮處理組表達量變化相反的特點,說明該蛋白可能是ABA依賴型LEA蛋白。
RNA結合蛋白(RNA-binding protein, Rbps)是基因表達轉錄后調控的關鍵蛋白[13],植物中編碼該蛋白的基因在玉米、擬南芥、煙草和大麥等植物中均被克隆得到。研究表明,擬南芥中編碼該蛋白的多個基因表達量在低溫條件下顯著增加[14],與本研究中低溫響應RNA結合蛋白(low temperature-responsive RNA-binding protein, LTR-Rbps)在低溫ABA處理下表達量上調的趨勢一致,而在ABA處理組與氟啶酮處理組表達量相反的結果則表明,低溫響應RNA結合蛋白受到外源ABA的誘導。
冷調節蛋白(cold regulated protein, CORPs)(點16、17)是大多數植物在低溫馴化誘導條件下產生的一類特異性蛋白,研究發現,除低溫外,外源ABA、鹽脅迫、干旱、熱激等逆境脅迫均能誘導CORPs產生[15]。本試驗得到的COR蛋白WCOR18與之前報道過的大麥COR蛋白Tma-ap3具有高度同源性[16]。
磷酸甘油酸變位酶(phosphoglycerate mutase, PGAM)(點4)是糖酵解和糖異生途徑中催化3-磷酸甘油酸和2-磷酸甘油酸相互轉化的關鍵酶,一般分為輔因子依賴型PGAM(dPGAM)和輔因子非依賴型PGAM(iPGAM),其中,iPGAM廣泛分布在植物中,并且在響應非生物脅迫中起重要作用。Amme等[17]在擬南芥的低溫脅迫研究中發現,AtiPGAM1表達量顯著升高,說明AtiPGAM1在植物遭受冷脅迫時起正調節作用。本試驗中PAGM在低溫和ABA處理下表達量上升,說明該酶能夠響應植物的低溫脅迫,并可能受到外源ABA的誘導。
磷酸甘油酸激酶(phosphoglycerate kinase, PGK)(點23)的主要功能是作為糖酵解途徑的關鍵酶,催化1,3-二磷酸甘油酸轉化成3-磷酸甘油酸的過程,并產生1分子ATP,逆反應生成1分子ADP[18]。PGK在非生物脅迫下表達量升高產生ATP以增強植物抗性,該結果在水稻[19]和豌豆[20]均已被證實。本研究中PGK在低溫和ABA處理下表達量升高,說明PGK能夠提高植物在低溫脅迫下的抗性,一定量的ABA可能誘導PGK表達量升高從而增強植物抗逆性。
20S蛋白酶體能選擇性降解氧化脅迫受損的蛋白,這一功能不依賴ATP和泛素[21]。本研究中得到的26S蛋白酶體非ATP酶調節亞基(26S proteasome non-ATPase regulatory subunit, 26SRP)(點10)在低溫下表達量增加,可能是為了清除低溫脅迫中被氧化的正常蛋白質,在ABA處理下表達量增加結果則表明,該蛋白可能受到外源ABA的誘導。
ATP合成酶廣泛分布于線粒體膜和葉綠體類囊體膜上。作為在高等植物能量代謝中的關鍵酶之一,它跨膜質子動力促進合成ATP,參與氧化磷酸化和光合磷酸化反應。本試驗中ATP合成酶β-亞基(ATP synthase subunit beta, ATPase-β)(點5)的表達量上調這一結果與Kong等[22]在 OsNAS1轉基因甘藍型油菜鹽脅迫條件下得到的結論一致。基于以上推測,ATP合成酶β-亞基在低溫下ABA處理后參與離子轉運能力增強,從而降低細胞滲透勢,提高植物的抗寒性。
谷胱甘肽轉移酶在植物的初級代謝和次級代謝、耐受脅迫和細胞信號轉導過程中行使許多不同的功能,從而影響植物的生長發育。植物GST家族中的許多成員都與植物抗逆性有關,如對除草劑、高鹽、低溫和紫外輻射等的抗性[23]。Harshavardhanan等[24]在關于甘藍GST的全基因組表征研究中,發現BoGST基因具有潛在的抗寒功能。本研究中谷胱甘肽S轉移酶1(glutathione S-transferase 1, GST1)(點7)、谷胱甘肽轉移酶(glutathione transferase,GST)(點11)在低溫下ABA處理后表達量上調,而谷胱甘肽轉移酶F5(glutathione transferase F5, GSTF5)(點15)則下調,這一結果表明GST參與植物應對低溫脅迫的調控過程,一定濃度ABA能提高植物抗寒性。點15表達量下調,則可能是由于這三種不同的谷胱甘肽轉移酶調控的反應不同導致的,點7、點11和點15的調控機制仍有待進一步研究。
新生多肽復合物β亞基(點3)即為基本轉錄因子3(basic transcription factor 3, BTF3)。有研究從小麥中克隆到一個受凍害脅迫誘導表達上調的BTF3家族基因 TaBTF3,該基因在鹽、干旱、冷、ABA、MeJA和SA脅迫處理下均被誘導表達上調[25],這與本試驗得到的該蛋白在低溫、ABA處理下表達量上調的結果一致。
本研究中真核翻譯起始因子4A(eukaryotic initiation factor 4A, eIF4A)(點6)在低溫ABA處理條件下表達量增加,能夠增加其與真核基因啟動子區域中順式作用元件的特異性結合,通過與其他相關蛋白的相互作用,激活轉錄過程,增強目的基因的表達強度,增加目的蛋白的表達量,從而影響植物抗寒能力。與Stockinger等[26]在研究擬南芥中由 CBF1編碼含有轉錄因子的AP2結構域在低溫脅迫條件下的調節作用時也得到類似的研究結果。
真核細胞翻譯起始因子5A(eukaryotic translation initiation factor 5A3, eIF5A)是真菌、動植物體內普遍存在的蛋白質翻譯起始因子。擬南芥的研究中發現了三個表達特征不同的eIF5Ab編碼基因[27],其中,eIF5A3在細胞分裂活躍的吸脹種子中高表達,在擬南芥中過表達eIF5A3,花瓣從正常的四瓣變為五瓣,葉子變為并生葉,種子變為原來的兩倍大,說明eIF5A3在發育早期促進細胞分裂。本研究中真核翻譯起始因子5A3(點24)在4 ℃下特異表達,該時期恰好是冬小麥分蘗的旺盛期,與其分蘗節的細胞增殖相適應,而在-25 ℃時該蛋白消失,與小麥在-25 ℃低溫下細胞分裂停滯相一致,可能是低溫下eIF5A3不表達的結果。
綜上所述,植物應對低溫是一個復雜的調控過程。本研究發現外源ABA處理下,與對照組相比出現顯著差異的蛋白可分為逆境蛋白、代謝相關蛋白和轉錄翻譯相關蛋白。其中,代謝相關蛋白最多,包括物質代謝和能量代謝。糖代謝相關蛋白在ABA處理下表達量上調,促進植物新陳代謝,為抵御外界脅迫提供一定動力,本課題組前期研究也發現,ABA對東農冬麥1號糖代謝有促進作用[1]。ATP合成酶相關蛋白在ABA處理后表達量上調,為植物體內抵抗脅迫的各種代謝活動提供能量。有兩種低溫誘導的轉錄因子在ABA處理組表達量上調,通過在轉錄水平調控相關目的蛋白的表達量,從而增強植物抗寒性。逆境蛋白都在ABA處理組上調,氟啶酮處理組下調,說明ABA對冬小麥抗逆性的提高起重要作用。此外,本研究還有10種未知蛋白,這主要由于小麥的蛋白信息相對比較匱乏,但近年來蛋白質組學發展迅速,相信隨著蛋白質數據庫的不斷完善,這些問題會很快得到解決。
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