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應(yīng)用CRISPR/Cas9技術(shù)制備MrgD基因敲除小鼠模型

2018-07-24 07:19:44宋麗妮張怡塵楊金奎
關(guān)鍵詞:小鼠血糖實(shí)驗(yàn)

曹 曦 宋麗妮 張怡塵 李 奇 楊金奎*

(1.首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京同仁醫(yī)院內(nèi)分泌科,北京100730;2.糖尿病防治研究北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京100730)

基因修飾動(dòng)物模型是在活體動(dòng)物上開展基因功能研究、尋找合適藥物作用靶標(biāo)的重要工具[1]。近年來新興的一種來源于細(xì)菌的成簇的規(guī)律間隔的短回文重復(fù)序列(clustered regularly interspaced short palindromicrepeat, CRISPR)及臨近相關(guān)基因(CRISPR-associated, Cas)系統(tǒng)經(jīng)過改造后,因其操作簡便、效率高而成為最熱門的基因編輯技術(shù),即 CRISPR/Cas9 技術(shù)。其與鋅指核酸內(nèi)切酶(zinc finger endonuclease, ZFN)和類轉(zhuǎn)錄激活因子效應(yīng)物核酸酶(transcription activator-like effector nuclease, TALEN)一樣可用于各種復(fù)雜基因組的編輯。目前CRISPR/Cas9技術(shù)已經(jīng)成功在細(xì)菌、水稻、小鼠、大鼠、斑馬魚、人等物種上得到運(yùn)用[2-3],由于其突變效率高、制作簡單及成本低的特點(diǎn),被認(rèn)為是一種具有廣闊應(yīng)用前景的基因組定點(diǎn)改造分子工具。

CRISPR/Cas9技術(shù)的具體原理是:Cas9 是一種特殊的核酸內(nèi)切酶,能與 sgRNA(single-guide RNA)結(jié)合,sgRNA 是人工合成的 tracrRNA(trans-activating RNA)/crRNA(crispr RNA)復(fù)合體。sgRNA 3′端 20個(gè)堿基通過堿基配對(duì)原則與目標(biāo) DNA 配對(duì)結(jié)合,其中sgRNA 所識(shí)別配對(duì)序列緊緊相鄰的目標(biāo)DNA 序列必須是NGG(N代表任一堿基,即前導(dǎo)間隔相鄰基序列 (protospacer adjacentmotif, PAM)[4],然后Cas9蛋白在crRNA引導(dǎo)序列靶標(biāo)的特定位點(diǎn)剪切雙鏈DNA,打斷目標(biāo)基因,再通過非同源重組(non-homologous end-joining, NHEJ)修復(fù)機(jī)制,隨機(jī)插入或刪除一定數(shù)量的堿基,產(chǎn)生錯(cuò)誤修復(fù)甚至移碼突變,而達(dá)到敲除靶基因的目的[5]。

腎素-血管緊張素系統(tǒng)(renin-angiotensin system, RAS)在冠狀動(dòng)脈粥樣硬化性心臟病(以下簡稱冠心病)、糖尿病心肌病及糖尿病腎病中起重要作用。ACE2-Ang-(1-7)-Mas軸作為新發(fā)現(xiàn)的 RAS 調(diào)節(jié)軸,可拮抗經(jīng)典軸ACE/Ang Ⅱ/AT1(Ang Ⅱtype 1 receptor)的生物效應(yīng)。在2001~2002年間,兩個(gè)研究小組同時(shí)發(fā)現(xiàn)了屬于G蛋白偶聯(lián)受體家族的新型受體,該受體被命名為Mrg[6]或與感覺神經(jīng)元有關(guān)的特異性G蛋白偶聯(lián)受體(sensory neurons specic receptor, SNSR)[7]。其中,MrgD是Mrg家族的一員,最初被發(fā)現(xiàn)在神經(jīng)性疼痛的調(diào)節(jié)中起作用[8]。眾所周知,Ang(1-7)已被確定為Mas受體的天然內(nèi)源性配體[9]。然而,進(jìn)一步研究[10]顯示,Mrg家族與Mas受體有很高的同源性,并且用Ang(1-7)作用于過表達(dá)MrgD的細(xì)胞后促進(jìn)了花生四烯酸的釋放與轉(zhuǎn)錄激活。這些研究說明在Mrg受體家族和RAS之間可能存在著相互作用。所以,本研究運(yùn)用CRISPR/Cas9 技術(shù),設(shè)計(jì)了針對(duì)MrgD的sgRNA,成功誘導(dǎo)了MrgD的靶向突變,初步篩選后獲得MrgD基因敲除的小鼠,為糖尿病發(fā)病機(jī)制研究提供了動(dòng)物模型。

1 材料與方法

1.1 材料

實(shí)驗(yàn)所用的小鼠均為 C57BL/6J 品系,體質(zhì)量18~24 g,購自北京維通利華實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心[實(shí)驗(yàn)動(dòng)物許可證號(hào):SCXK(京) 2016-0011]。小鼠飼養(yǎng)于北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部SPF級(jí)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心,恒溫恒濕,12 h光照,12 h黑暗,自由采食。實(shí)驗(yàn)所使用的所有動(dòng)物均經(jīng)過首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京同仁醫(yī)院動(dòng)物委員會(huì)批準(zhǔn)。

1.2 方法

1.2.1 靶序列的選擇

筆者從NCBI小鼠基因組網(wǎng)站得到MrgD基因(Gene ID: 211578)的序列和結(jié)構(gòu)信息。遵從CRISPR/Cas9介導(dǎo)的基因組定點(diǎn)突變靶點(diǎn)設(shè)計(jì)原則,應(yīng)用在線sgRNA靶序列設(shè)計(jì)軟件(http://crispr. mit. edu/),將小鼠MrgD基因(NM-203490.3)第一個(gè)外顯子序列進(jìn)行分析,得到評(píng)分較高的sgRNA序列(靶點(diǎn)序列:5′-CTCGCCATGGCCACGTGTGT-3′)。

1.2.2 顯微操作與F0代鑒定

上述sgRNA及Cas9 mRNA進(jìn)行小鼠受精卵胞質(zhì)注射、回輸、分娩等常規(guī)操作。3周齡F0代小鼠剪取尾尖0.5 cm置于1.5 mL的EP管內(nèi),加入500 μL裂解液和1 μL蛋白酶K貯存液,將上述EP管置于55 ℃恒溫水浴鍋水浴過夜,待消化完全,酚/氯仿法抽提基因組 DNA。以小鼠基因組DNA為模板,通過PCR擴(kuò)增sgRNA靶向位點(diǎn)兩側(cè)各約200bp的序列。引物序列如下:MF, 5′-TGGCAGAGAGGTGGAGTGTA-3′; MR, 5′-ATGGGGAAAAGCACGGAGAG-3′。

PCR產(chǎn)物經(jīng)純化、變性、緩慢退火,進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳分離鑒定。為進(jìn)一步驗(yàn)證,將PCR產(chǎn)物進(jìn)行TA克隆測(cè)序(測(cè)序由諾賽基因公司完成)。

1.2.3 繁育MrgD基因敲除的純合小鼠

將含有MrgD基因大片段敲除的F0代小鼠與野生型C57BL/6J小鼠進(jìn)行繁育,得到F1代小鼠。剪取尾尖0.5 cm,經(jīng)消化提取基因組DNA,用引物MF及MR進(jìn)行PCR擴(kuò)增,瓊脂糖凝膠電泳分離鑒定及測(cè)序,篩選F1代(雜合子)。然后,以篩選出的F1代(雜合子)小鼠作為親本,交配繁育F2代,得到的F2代再進(jìn)行基因鑒定,最終得到MrgD基因敲除純合體小鼠,從而建立突變?nèi)后w。

1.2.4 體質(zhì)量監(jiān)測(cè)

將小鼠分為4組(每組10只):同周齡雄性C57BL/6J小鼠(A組)、同周齡雌性C57BL/6J小鼠(B組)、同周齡雄性MrgD敲除(MrgD-/-)小鼠(C組)及同周齡雌性MrgD-/-小鼠(D組),以普通飼料進(jìn)行喂養(yǎng)并監(jiān)測(cè)體質(zhì)量。

1.2.5 空腹血糖監(jiān)測(cè)

將實(shí)驗(yàn)動(dòng)物喂養(yǎng)至16周齡時(shí)尾靜脈取血測(cè)小鼠空腹血糖(fasting blood glucose,F(xiàn)BG)(0 min),血糖測(cè)定用強(qiáng)生公司One-Touch血糖儀及配套試紙。

1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

2 結(jié)果

2.1 成功構(gòu)建MrgD大片段基因敲除小鼠

MrgD基因sgRNA及驗(yàn)證引物序列如圖1所示。將sgRNA及Cas9 mRNA混合物通過顯微注射注入小鼠受精卵胞質(zhì),然后回輸移植到假孕的C57BL/6J母鼠中,共得到7只F0代小鼠,分別編碼為1#~7#。對(duì)這7只小鼠進(jìn)行基因組DNA提取與PCR擴(kuò)增,并且通過瓊脂糖凝膠電泳分離鑒定(圖2)。結(jié)果表明,與野生型C57BL/6J小鼠基因型相比,6#小鼠發(fā)生了堿基的插入或缺失,而1、2、3、4、5及7#可能仍為野生型基因型。

為進(jìn)一步確定基因型,將1#~7#小鼠基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物做TA克隆測(cè)序。同時(shí),對(duì)6#小鼠基因組DNA與野生型C57BL/6J小鼠基因進(jìn)行比對(duì),6#小鼠缺失173個(gè)堿基,其中123個(gè)堿基位于CDS區(qū)域,即敲除了MrgD蛋白的前41個(gè)氨基酸(圖3),長片段(500bp)比對(duì)結(jié)果表明不完全匹配,表明6#小鼠可能為嵌合體。因此,6#小鼠為成功構(gòu)建的MrgD大片段基因敲除(嵌合體)的F0代小鼠。

圖1 MrgD基因sgRNA及驗(yàn)證引物序列Fig.1 SgRNA and validation primer sequence for MrgD

圖2 PCR擴(kuò)增MrgD基因敲除序列附近PCR產(chǎn)物Fig.2 PCR amplification of MrgD, delete PCR product near the sequence

圖3 F0代MrgD-/--6#小鼠與野生型小鼠MrgD靶序列比對(duì)Fig.3 Target sequences of MrgD in 6# F0 mouse mated with wild type mice

2.2 MrgD基因敲除小鼠與C57BL/6J野生型小鼠的體質(zhì)量比較

MrgD基因敲除6#小鼠F0通過與C57BL/6J野生型雌性小鼠繁育得到陽性F1代,陽性F1代小鼠繁育得到F2代MrgD-/-純合小鼠用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。

實(shí)驗(yàn)動(dòng)物均飼養(yǎng)于SPF級(jí)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心,并且以普通飼料喂養(yǎng)。通過對(duì)4組實(shí)驗(yàn)動(dòng)物體質(zhì)量的長期監(jiān)測(cè),雄性和雌性C57BL/6J野生型小鼠以及MrgD-/-小鼠體質(zhì)量隨喂養(yǎng)時(shí)間均穩(wěn)定增長。其中,雄性C57BL/6J野生型小鼠以及MrgD-/-小鼠體質(zhì)量于16、17及18周兩組體質(zhì)量達(dá)到一致,18周以后雄性MrgD-/-小鼠體質(zhì)量增長明顯高于雄性C57BL/6J野生型小鼠,但差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(圖4A)。此外,雌性MrgD-/-小鼠體質(zhì)量均稍低于雌性C57BL/6J野生型小鼠,兩組間差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(圖4B)。

圖4 各組小鼠間體質(zhì)量的比較Fig.4 Comparison of weight among different mice groups

A:comparison of weight between group A and C;B:comparison of weight between group B and D;groupA: C57BL/6J male mice;groupB: C57BL/6J female mice;groupC:MrgD-/-male mice;groupD:MrgD-/-female mice.

2.3 各組小鼠空腹血糖比較

分別對(duì)普通飼養(yǎng)的18周齡雄性C57BL/6J小鼠(A組)與MrgD-/-小鼠(C組),以及同周齡雌性C57BL/6J小鼠(B組)與MrgD-/-小鼠(D組)進(jìn)行空腹血糖測(cè)定。結(jié)果顯示,雄性MrgD-/-小鼠與C57BL/6J小鼠空腹血糖差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(圖5A),同樣的,雌性MrgD-/-小鼠與C57BL/6J小鼠空腹血糖差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(圖5B)。后續(xù)實(shí)驗(yàn)筆者計(jì)劃通過高糖、高脂等特殊條件誘導(dǎo),對(duì)MrgD-/-小鼠糖脂代謝進(jìn)行深入研究。

3 討論

胰島素抵抗和胰島β細(xì)胞功能缺陷是2型糖尿病的主要發(fā)病機(jī)制。其中,胰島素抵抗表現(xiàn)為外周組織尤其是肌肉、脂肪組織對(duì)葡萄糖的攝取減少以及抑制肝糖輸出的作用減弱[11]。目前,ACE2-Ang-(1-7)-Mas軸作為新發(fā)現(xiàn)的 RAS 調(diào)節(jié)軸在糖尿病的發(fā)生發(fā)展中起重要作用。本課題組研究結(jié)果表明ACE2/Ang-(1-7)的上調(diào)可以改善小鼠胰島細(xì)胞的氧化應(yīng)激從而減少凋亡,增加胰島素的分泌[12],同時(shí),也可以通過PI3K/Akt通路降低肝細(xì)胞糖異生相關(guān)酶的表達(dá)[13],從而改善血糖水平。另一方面,研究[14]表明ACE2-Ang-(1-7)-Mas軸的激活可以降低骨骼肌、脂肪細(xì)胞中的活性氧簇(reactive oxygen species, ROS),增加胰島素刺激的葡萄糖攝取,從而改善糖代謝。然而,最近發(fā)現(xiàn)的MrgD作為Mrg家族的一員,其轉(zhuǎn)錄翻譯后的蛋白與Mas受體一樣作為Ang(1-7)多肽作用的另一個(gè)新發(fā)現(xiàn)的受體,并且存在著與Ang(1-7)類似的可作用于MrgD受體的多肽[15]。研究表明MrgD可能參與了肺癌等腫瘤的發(fā)生[16]、增加神經(jīng)元興奮性反應(yīng)與調(diào)節(jié)疼痛感覺[17]等過程。但是,MrgD作為Ang(1-7)的受體所起的生理作用還不清楚。所以,構(gòu)建MrgD敲除小鼠模型進(jìn)行后續(xù)一系列研究就顯得極為重要。

圖5 各組小鼠空腹血糖的比較Fig.5 Comparison of fasting blood glucoseamong different mice group

A:comparison of FBG between group A and C;B:comparison of FBG between group B and D;groupA: C57BL/6J male mice;groupB: C57BL/6J female mice;groupC:MrgD-/-male mice;groupD:MrgD-/-female mice.n=10.FBG: fasting blood glucose;MrgD-/-:MrgDknockout mice.

CRISPR/Cas9技術(shù)因其操作簡便、效率高而成為最熱門的基因編輯技術(shù),本研究通過應(yīng)用在線sgRNA靶序列設(shè)計(jì)軟件對(duì)小鼠MrgD基因(NM-203490.3)序列進(jìn)行分析,得到評(píng)分較高的sgRNA,并通過擴(kuò)增后與Cas9 mRNA混合一起通過顯微注射注入小鼠受精卵胞質(zhì),再進(jìn)行回輸、代孕等操作,最終獲得F0代。本實(shí)驗(yàn)成功獲得F0代的6#小鼠(嵌合體),通過繁育最終獲得MrgD基因敲除純合突變體小鼠。雖然,在普通條件飼養(yǎng)下本研究未顯示MrgD基因敲除小鼠與野生型對(duì)照鼠的體質(zhì)量和血糖差異,但是后期實(shí)驗(yàn)通過高糖、高脂等特色條件誘導(dǎo)MrgD基因敲除小鼠,相信能對(duì)MrgD基因進(jìn)行更深入有效的研究。

本研究成功構(gòu)建了MrgD基因敲除小鼠模型,并進(jìn)行了初步試驗(yàn),但還存在一些問題,比如只是在普通飼料喂養(yǎng)下進(jìn)行了體質(zhì)量與血糖的檢測(cè),后續(xù)應(yīng)該再進(jìn)行以高脂飼料喂養(yǎng)誘導(dǎo)后監(jiān)測(cè)血糖,并更進(jìn)一步進(jìn)行糖脂代謝相關(guān)研究。從而為MrgD基因功能與糖尿病相關(guān)性的研究提供新的基礎(chǔ)研究數(shù)據(jù)和結(jié)果。

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