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紅麻線粒體基因atp6過表達載體的構建與轉化

2019-04-26 09:44:12韋美玲廖小芳李枝玲周步進孔祥軍劉一丁李宏偉周瑞陽
西南農業學報 2019年12期
關鍵詞:煙草

韋美玲,廖小芳,李枝玲,周步進,鄭 杰,孔祥軍,劉一丁,李宏偉,周瑞陽*

(1.廣西大學農學院, 廣西 南寧 530004;2.廣西農業科學院經濟作物研究所, 廣西 南寧 530007)

【研究意義】紅麻(HibiscuscannabinusL.)是錦葵科(Malvaceae)木槿屬(Hibiscus)一年生韌皮纖維作物,其莖稈和韌皮纖維已廣泛應用于造紙、紡織、汽車制造及家具等領域,是我國重要的經濟作物[1-2]。紅麻具有耐旱、易栽培等特點,適宜種植區域廣,且具有極大的生物產量和較強的二氧化碳吸收能力。因此,紅麻被認為是21世紀最具潛力的經濟作物[3]。紅麻以收獲莖稈或韌皮纖維為主要栽培目的,其雜種優勢十分明顯。2002年,周瑞陽教授在海南冬繁的紅麻野生型UG93后代中發現一株雄性不育突變體,當即以栽培種為父本與之雜交(測交),發現部分F1代表現完全雄性不育,證實該突變株屬于細胞質雄性不育(CMS)類型[4],此后于2003年選育出高抗紅麻炭疽病的CMS系K03A及其相應的保持系K03B,并實現紅麻三系配套[5],于2008年選育出世界上第一個由CMS系配制的紅麻雜交種紅優1號[6]。已有研究表明,植物CMS與線粒體基因atp6密切相關,紅麻三系雜交種雖已成為國家麻類產業技術體系的主推品種,但迄今關于紅麻CMS的分子機理仍未闡明。因此,構建紅麻線粒體基因atp6過表達載體遺傳轉化體系,對紅麻線粒體基因的遺傳轉化及功能研究具有重要意義。【前人研究進展】最早發現atp6基因對植物CMS具有調控作用的是在玉米CMS-T的rrn26基因和atp6基因部分序列共轉錄時,編碼一個與線粒體內膜密切相關的毒性蛋白,導致玉米CMS[7-8]。隨后發現油菜Pol型CMS系中atp6/orf224共轉錄引起油菜CMS-Pol型CMS[9-10]。同時,水稻CMS-BT的orf79基因和CMS-HL的orfH79基因與線粒體atp6基因共轉錄,編碼一個N端與COX1相似的毒性膜蛋白,導致水稻CMS-HL型和CMS-BT型CMS[11]。此外,有研究發現芥菜atp6/orf228共轉錄產物編碼的毒性蛋白與atp6/orf263基因編碼的膜蛋白分別導致芥菜CMS-Hau型和CMS-Tour型CMS[12-13],甜菜preSatp6基因編碼產生35 kD膜蛋白引起甜菜CMS-Owen型CMS[14]。李剛[15]采用iTRAQ(同重標簽相對與絕對定量)標記紅麻CMS系L23A和保持系L23B花藥線粒體蛋白,發現ATP6在不育系中的表達量顯著低于保持系,推測ATP6對紅麻花藥發育發揮重要作用。在同質異核不育系P3A中,atp6基因的編碼區(CDS)序列與保持系P3B相比缺失30 bp,基于CDS序列差異特征對紅麻現有的CMS系、保持系、F1和F2代及104份種植資源進行檢測,證實不育系中30 bp的缺失與紅麻細胞質雄性不育密切相關[16]。廖小芳[17]用Northern blotling對紅麻質核同源的UG93A和UG93B的atp6基因進行轉錄本分析,發現不育系比保持系多一個大小為2.0 kb的轉錄本,且atp6基因在不育系中的表達量顯著低于保持系,推測atp6基因可能與紅麻CMS密切相關。【本研究切入點】目前,關于紅麻atp6基因過表達載體遺傳轉化體系構建的研究鮮見報道。【擬解決的關鍵問題】以紅麻UG93A花藥cDNA為模板,通過同源克隆技術克隆atp6基因的CDS全長序列;利用In-Fusion基因融合技術構建pBI121-atp6-EGFP植物過表達載體,通過農桿菌介導法轉化野生型煙草,經抗性篩選和目的基因PCR驗證轉基因煙草,為紅麻線粒體基因的遺傳轉化和功能研究打下基礎。

1 材料與方法

1.1 試驗材料

試驗于2017年5月至2018年4月在廣西大學農學院綜合樓植物遺傳育種實驗室進行。紅麻不育系UG93A、植物表達載體pBI121及野生型煙草種子為本課題組保存提供;根癌農桿菌EHA105感受態細胞、大腸桿菌感受態DH5α細胞和高保真酶購自北京全式金生物技術有限公司;紅麻花藥總RNA提取試劑盒購自北京華越洋公司,限制性內切酶KPnI、XbaI和M×Buffer購自TaKaRa公司。PCR產物回收試劑盒、質粒提取試劑盒和標準DNA-Marker購自南京諾唯贊生物科技有限公司和北京艾德萊生物科技有限公司,引物合成由深圳華大基因科技有限公司完成,菌液測序由生工生物工程(上海)股份有限公司完成。

1.2 試驗方法

1.2.1 引物合成 通過Premier 5.0設計atp6、EGFP及pBI121載體上游引物序列,具體序列信息如表1。

1.2.2atp6基因過表達載體構建與轉化 (1)過表達基因片段克隆。根據試劑盒說明提取紅麻UG93A的總RNA(北京華越洋生物科技有限公司),參照全式金反轉錄試劑盒說明將UG93A總RNA反轉錄合成cDNA;以此為模板,用引物組合eF-atp6-F/eF-atp6-R擴增atp6基因CDS全長序列。

表1 本研究所用引物序列

注:下劃線部分為與pBI121載體同源序列。

Note:The sequences with a line are homologous sequences of PBI121 vector.

PCR反應體系50.0 μl:cDNA 2.5 μl,10×PCR Buffer 25.0 μl,Primer F(eF-atp6F) 1.5 μl,Primer R(eF-atp6R) 1.5 μl,ddH2O補足50.0 μl。擴增程序:95 ℃預變性5 min;95 ℃變性30 s,56.5 ℃退火30 s,72 ℃延伸80 s,進行30個循環;72 ℃復性10 min,4 ℃保存;最后用1.0 %瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產物,用DNA膠回收試劑盒回收目的片段,-20 ℃保存備用。

(2)目的載體構建。提取本課題組構建的pBI121-FullHcpdil5-2a-EGFP載體質粒,用限制性內切酶XbaI和KpnI對該載體進行雙酶切。酶切體系50.0 μl:10×Buffer 5.0 μl,XbaI 2.5 μl,KpnI 2.5 μl,質粒DNA 1.0 μg,ddH2O補足50.0 μl。切下FullHcpdil5-2a基因后得到線性載體pBI121,用DNA膠回收試劑盒回收切下的線性載體pBI121。將回收到的atp6基因全長片段與上述線性載體pBI121進行同源重組反應,其反應體系為:線性載體(pBI121)4.0 μl,插入片段(atp6基因)0.7 μl,5×CE Multis Buffer 4.0 μl,Exnase Multis 2.0 μl,ddH2O 9.3 μl。用移液槍上下輕微吹打幾次混勻,37 ℃反應30 min,反應結束立即置于冰浴中冷卻5 min直接進行大腸桿菌轉化。

(3)目的條帶檢測與測序。在無菌超凈工作臺上,隨機挑取白色菌落8個,置于盛有1 mL LB液體培養基(加入終濃度0.1 mg/mL的Kan)的2 mL離心管中;37 ℃下200 r/min振蕩培養12 h;按照目的基因擴增反應體系及程序進行菌液PCR檢測;1.0 %瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR擴增產物,有目的條帶則為陽性菌落;在超凈工作臺上,將每個陽性克隆菌液分為2份,每份加入150.0 μl 60 %甘油,混勻,其中一份隨機選取4個陽性克隆并編號,送至生工生物工程(上海)股份有限公司測序,另一部分菌液-80 ℃保存備用。利用DNAMAN 8對測序結果進行分析。選擇正確的克隆進行質粒提取,并轉化農桿菌EHA105感受態細胞,為農桿菌侵染煙草葉盤法作準備。

(4)過表達載體質粒雙酶切驗證。選定上述測序成功的一個菌樣,于超凈工作臺上吸取200.0 μl置于盛有100 mL LB液體培養基(加入終濃度0.1 mg/mL的Kan)的200 mL錐形瓶中。37 ℃下200 r/min振蕩培養12 h;根據試劑盒說明提取質粒,進行雙酶切,置于PCR儀中進行37 ℃酶切反應3 h,最后用1.0 %瓊脂糖凝膠電泳檢測雙酶切PCR產物,對過表達載體構建進行驗證。

(5)過表達載體轉化煙草。選取比較健壯的煙草非轉基因無菌苗,摘取葉片,用無菌打孔器分成小塊,轉移至煙草葉片預培養基中25 ℃暗培養3 d。將制備好的農桿菌工程菌液侵染煙草葉片。將預培養后的煙草葉片轉移至200 mL玻璃瓶中,用農桿菌工程菌液懸浮侵染10 min;棄菌液,將煙草葉片轉移至濾紙上吸干葉片表面水分;最后,將煙草葉片轉移至共培養基上(培養基上鋪一層無菌濾紙),25 ℃ 暗培養3 d。將共培養后的煙草葉片取出轉移至培養瓶中,用無菌水漂洗(漂洗4~5次,每次15 min),再用含有500 mg/L頭孢霉素的無菌水漂洗(漂洗3次,每次10 min);倒去漂洗液,將煙草葉片置于無菌吸水紙上,瀝干煙草葉片表面水分;將煙草葉片接種于芽誘導培養基上,在光照強度2000 lx、光照16 h/黑暗8 h交替的條件下26 ℃培養;每隔12 d,將煙草葉片愈傷組織繼代1次,直至長出不定芽。當轉基因煙草不定芽長2~3 cm時,切下不定芽,轉移至生根培養基中誘導不定芽生根,待轉基因幼苗的不定根長5~6 cm時,練苗移栽,進行陽性轉基因煙草檢測。

2 結果與分析

2.1 目的基因的克隆結果

從圖1可看出,以紅麻不育系UG93A的cDNA為模板克隆atp6基因的CDS全長,擴增產物大小為1182 bp。從圖2可看出,不育系UG93A的atp6基因CDS序列與保持系UG93B相比,atp6基因的CDS中有24 bp缺失和3 bp插入,而與紅麻同質異核的CMS系P3A相比,不育系UG93A在atp6基因起始密碼子的下游第59 bp處缺失6個堿基(GTTTTT),推測該位點可能是紅麻線粒體基因重組的活躍位點,即atp6基因與紅麻CMS密切相關。

2.2 過表達載體的構建結果

對保存的pBI121-FullHcpdil5-2a-EGFP載體進行雙酶切,切下片段長度為1314 bp的FullHcpdil5-2a基因,回收長度約為14 829 bp的線性載體pBI121(圖3)。將回收的線性pBI121與atp6基因連接獲得重組載體pBI121-atp6-EGFP,將重組載體連接、轉化、菌液PCR檢測陽性克隆(圖4)。將陽性菌液送至生工生物工程(上海)股份有限公司測序,提取陽性質粒進行雙酶切鑒定,以過表達載體基因pBI121-atp6-EGFP載體質粒作為陽性對照,結果顯示雙酶切切下的目的片段與連接的目的片段(atp6基因)大小一致(圖5),說明過表達載體構建正確,可用于后續的農桿菌轉化。

M:DNA分子質量標準(DL 2000);1:atp6基因 M:DNA marker(DL 2000);1:atp6 gene圖1 目的基因的PCR擴增電泳結果Fig.1 PCR amplification electrophoresis of the target gene

圖2 紅麻UG93A和UG93B的atp6基因序列比對Fig.2 Similarity matching of atp6 gene sequence between UG93A and UG93B in Kenaf

M:DNA分子質量標準(AL 15 000);1:pBI121-Full Hcpdil5-2a-EGFP載體基因;2:線性載體片段pBI121(13 233 bp)及Hcpdil5-2a基因(1314 bp)M:DNA marker(AL 15 000);1:Gene of pBI121-Full Hcpdil5-2a-EGFP vector;2:The linearized pBI121 vector fragment(13 233 bp) and gene of Hcpdil5-2a(1314 bp)圖3 pBI121-Full Hcpdil5-2a-EGFP載體的雙酶切鑒定結果Fig.3 Restriction enzyme digestion of pBI121-Full Hcpdil5-2a-EGFP vector

2.3 農桿菌介導的侵染葉盤法轉化煙草

2.3.1 葉盤法轉化煙草 將過表達載體pBI121-atp6-EGFP轉化農桿菌,以保存的煙草K346為轉基因受體,采用農桿菌侵染葉盤法進行轉化,以未侵染農桿菌的野生型煙草為陰性對照,煙草葉盤的芽誘導和根誘導培養階段如圖6所示。其中,圖6-A為芽誘導時期的野生型煙草葉盤(陰性對照),出芽較快且芽點較多;圖6-B的葉盤經過pBI121-atp6-EGFP農桿菌侵染處理,放于含有抗生素的培養基中進行抗性芽篩選培養,出芽慢且芽點明顯變少。說明芽誘導階段轉基因煙草抗性芽獲得率較低。圖6-C(陰性對照)和圖6-D為煙草的根誘導培養階段,與野生型對照(圖6-C)相比,轉基因植株(圖6-D)生長緩慢,根生長也較慢且較少。

2.3.2 轉基因煙草陽性植株的鑒定 將篩選所得

M:DNA分子質量標準(DL2000);2~14:正確連接載體基因pBI121-atp6-EGFPM:DNA marker(DL2000);2-14:Correct connecting vector genes pBI121-atp6-EGFP圖4 pBI121-atp6-EGFP載體的PCR驗證結果Fig.4 PCR varification of pBI121-atp6-EGFP vector

到的抗性植株(pBI121-atp6-EGFP:簡稱B)分別用3對不同的引物組合(ef-atp6-F/EGFP-R、ef-atp6-F/ef-atp6-R和pBI121-Z-F/ef-atp6-R)進行PCR檢測,篩選陽性植株。其中,引物組合ef-atp6-F/EGFP-R是以目的基因atp6的上游序列為正向引物,以表達載體pBI121多克隆位點的EGFP為反向引物,擴增出目的片段約1681 bp;引物組合ef-atp6-F/ef-atp6-R是以atp6基因CDS序列為特異引物,擴增出目的片段約1182 bp;引物組合pBI121-Z-F/ef-atp6-R是以pBI121載體序列為正向引物,以atp6基因下游序列為反向引物,擴增出目的片段約1206 bp。從圖7可看出,以野生型植株和ddH2O為陰性對照、過表達載體質粒為陽性對照,用3對不同的引物組合對經Kan抗性篩選的4株轉基因植株(B1、B2、B3和B4)進行PCR擴增,共獲得2株含pBI121-atp6-EGFP(B)的T0代轉基因陽性植株B1和B2。

3 討 論

3.1 atp6基因與植物CMS的關系

M:DNA分子質量標準(AL 15000);1:載體基因質粒pBI121-atp6-EGFP雙酶切片段atp6(1182 bp);2:對照:載體質粒pBI121-atp6-EGFPM:DNA marker(AL 15000);1:Restriction fragment of atp6(1182 bp) from vector gene plasmid pBI121-atp6-EGFP;2:Control: pBI121-atp6-EGFP vector plasmid圖5 pBI121-atp6-EGFP過表達載體的雙酶切鑒定結果Fig.5 Identified by restriction enzyme digestion of pBI121-atp6-EGFP overexpression vector

A和B為煙草葉盤芽誘導培養,其中A為野生型煙草芽,B為轉基因煙草抗性芽;C和D為煙草根誘導培養,其中C為野生型煙草根誘導生長,D為轉基因煙草植株根誘導生長Induction culture of leaf disc bud of tobacco with A and B,A was wild type tobacco bud,B was transgenic resistant bud;Root induction culture of tobacco with C and D,C was root induction of wild type tobacco,D was root induction of transgenic plants圖6 葉盤法轉化煙草的誘導培養Fig.6 Induced culture of tobacco by leaf disc method

M1:DNA分子質量標準(AL 15000);1:質粒pBI 121-atp6-EGFP(1681 bp);2:WT;3:H2O;4~7(B1-B4):煙草鑒定材料,其中4和5(B1和B2)為pBI121-atp6-EGFP轉基因材料(1681 bp);M2:DNA分子質量標準(DL2000);8:質粒pBI121-atp6-EGFP(1182 bp);9:WT;10:H2O;11~14(B1-B4):煙草鑒定材料,其中11和12(B1和B2)為pBI121-atp6-EGFP轉基因材料(1182 bp);15:質粒pBI121-atp6-EGFP(1206 bp);16:WT;17:H2O;18~21(B1-B4):煙草鑒定材料,其中18和19(B1和B2)為pBI121-atp6-EGFP轉基因材料(1206 bp)M1:DNA marker(AL 15000);1:pBI 121-atp6-EGFP(1681 bp);2:WT;3:H2O;4-7(B1-B4):Identification of transgenic plant,4 and 5(B1 and B2):transgenic plants of pBI121-atp6-EGFP(1681 bp);M2:DNA marker(DL2000);8:pBI121-atp6-EGFP(1182 bp);9:WT;10:H2O;11-14(B1-B4):Identification of transgenic plant,11 and 12(B1 and B2):Transgenic plants of pBI121-atp6-EGFP(1182 bp);15:pBI121-atp6-EGFP(1206 bp);16:WT;17:H2O;18-21(B1-B4):Identification of transgenic plant,18 and 19(B1 and B2):Transgenic plants of pBI121-atp6-EGFP(1206 bp)圖7 轉基因煙草陽性植株的鑒定結果Fig.7 PCR identification of transgenic positive plants

已有研究表明植物雄性不育與線粒體DNA的變異緊密相關[18-19]。基因重組產生嵌合基因或新的閱讀框,出現新的蛋白基因表達產物或引起正常線粒體基因轉錄、RNA編輯和蛋白翻譯異常,造成線粒體能量代謝或ATP復合體蛋白亞基異常,使線粒體發生功能紊亂,從而產生CMS[20]。atp6是植物線粒體呼吸鏈復合體V的亞基,作為呼吸鏈上重要組成部分,呼吸異常導致能量供應不足,而在小孢子發育過程中需要大量能量,能量供應不足導致花粉敗育[21]。在玉米[8]、油菜[9]、水稻[11]、芥菜[12]和苧麻[22]等植物中均發現atp6基因導致植物CMS。前期對紅麻花粉發育過程的研究表明,atp6在紅麻花粉發育過程中發揮非常關鍵的作用[15],暗示atp6CMS與紅麻CMS密切相關。本研究發現,與紅麻保持系UG93B序列比對,UG93A 的atp6基因CDS有24 bp缺失和3 bp插入,與紅麻的CMS P3A相比,UG93A在atp6基因起始密碼子的下游第59 bp處少6個堿基(GTTTTT),推測該位點可能是紅麻線粒體基因重組的活躍位點,進一步表明atp6基因與紅麻CMS密切相關。關于atp6基因與紅麻CMS的更深層次關系本課題組正在探究。

3.2 過表達載體的構建為紅麻基因功能研究打下基礎

目前,紅麻CMS的分子機理研究雖取得較大進展,但關于紅麻CMS核質作用的分子機制仍未清楚,對紅麻CMS相關atp6基因的研究不夠透徹[23]。為了進一步驗證和分析紅麻UG93S的CMS相關基因atp6功能,本研究以紅麻不育材料UG93A的cDNA為模板利用同源克隆技術克隆atp6基因序列,通過In-Fusion融合技術研究方法成功構建pBI121-atp6-EGFP植物過表達載體,并以農桿菌介導法轉化煙草,獲得2株轉基因陽性煙草植株;利用3對引物組合對轉基因陽性植株進行鑒定,其中兩對引物是利用pBI121表達載體序列與目的基因序列組合的方式進行鑒定,可有效避免單一使用目的基因鑒定轉基因植株易造成的假陽性現象,且操作省時簡便。構建過表達載體是研究紅麻atp6基因的關鍵步驟[24],轉基因煙草的成功獲得為后續從分子蛋白表達、細胞定位及生物學形態等層面開展atp6基因與紅麻CMS功能驗證研究提供材料基礎[25-26]。

4 結 論

從紅麻不育系UG93A中獲得atp6基因CDS全長1182 bp,并以UG93A中atp6基因cDNA為模板成功構建pBI 121-atp6-EGFP過表達載體,轉化野生型煙草后獲得2株轉基因陽性煙草植株。構建的紅麻線粒體基因atp6過表達載體遺傳轉化體系,可用于指導后續atp6基因調控紅麻CMS分子機理研究。

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