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環(huán)狀RNA hsa_circ_0010985對胃癌細胞增殖與凋亡的影響

2019-10-16 06:41:44劉文博趙奇紅顧康生
關(guān)鍵詞:意義差異檢測

高 敏,劉文博,趙奇紅,王 華,顧康生

胃癌(gastric cancer,GC)的發(fā)病率、死亡率在我國高居第二位[1]。GC患者早期缺乏特異性癥狀,往往明確診斷時已處于進展期,其5年生存率不足30%[2]。所以,GC的早期診斷尤為重要,目前臨床常用于GC輔助診療的腫瘤標志物[癌胚抗原(carcinoembryonic antigen,CEA)、糖類抗原CA199(carbohydrate antigen 19-9,CA19-9)]等特異性、敏感性不強[3],因此,迫切需要尋找新的腫瘤標志物,用于GC的早期診斷及預(yù)后評估。近年來,隨著對非編碼RNA的研究深入,微小RNA(microRNA,miRNA)、長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA, lncRNA)、環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)在GC中的作用逐漸被揭曉[4-5]。其中,circRNA以其普遍性、穩(wěn)定性、高度保守性以及組織特異性等優(yōu)勢[6],有望成為理想的腫瘤早期診斷的分子標志物。課題組前期通過circRNA芯片測序發(fā)現(xiàn)hsa_circ_0010985在GC耐藥患者血漿中高表達,提示其可能參與GC的化療耐藥,而其對GC細胞的生物學(xué)功能及其臨床意義尚不清楚(待發(fā)表)。該研究主要探討hsa_circ_0010985在GC細胞和組織中的表達以及對GC細胞增殖和凋亡的影響和臨床意義。

1 材料與方法

1.1 組織標本收集2017年3月~2017年7月安徽醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院胃腸外科共43例GC組織標本及距腫瘤邊緣>5 cm處癌旁正常組織標本,離體后立即液氮灌運輸并長期保存至-196 ℃液氮中備用。

1.2 主要試劑人GC細胞系、人正常胃黏膜細胞均為安徽醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院營養(yǎng)與食品衛(wèi)生學(xué)系實驗室保存;細胞培養(yǎng)基RPMI-1640及胎牛血清購自美國Gibco公司;RNA提取試劑TRIzol、Lipofectamine 2000轉(zhuǎn)染試劑盒購自美國Invitrogen公司;逆轉(zhuǎn)錄試劑盒購自大連TaKaRa公司;SYBR Green熒光定量PCR試劑盒購自北京全式金生物技術(shù)有限公司;細胞計數(shù)方法(cell counting kit-8,CCK-8)試劑盒購自合肥白鯊生物科技有限公司;AnnexinV-FITC凋亡檢測試劑盒購自美國BD公司;siRNA設(shè)計與合成由上海吉瑪制藥技術(shù)公司完成;引物設(shè)計及合成由上海生物工程有限公司完成。

1.3 細胞培養(yǎng)正常胃黏膜細胞株GES-1和GC中分化細胞株SGC7901和AGS以及低分化細胞株BGC823均使用含10%胎牛血清的RPMI-1640培養(yǎng)液,在含5%CO2、37 ℃的培養(yǎng)箱中培養(yǎng),每天觀察細胞生長狀態(tài),常規(guī)2~3 d更換培養(yǎng)基,當細胞匯合度達70%~80%時進行實驗。

1.4 實時熒光定量PCR(quantificational real-time polymerase chain reaction, qRT-PCR)用TRIzol提取細胞和組織中的總RNA,用逆轉(zhuǎn)錄試劑盒將總RNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,然后通過SYBR Green熒光定量PCR試劑盒進行PCR擴增,GAPDH作為內(nèi)參基因,引物序列為:hsa_circ_0010985 F:5′-CT GATGGGCACCTCTGTTGG-3′,R: 5′-GCTCATAGTCT GCCAATGGAAC-3′;GAPDH F:5′-AATGAAGGGGT CATTGATGG-3′,R:5′-AAGGTGAAGGTCGGAGTCA A-3′;反應(yīng)條件為:95 ℃、5 s,55 ℃、30 s,72 ℃、20 s,共40個循環(huán)。

1.5 細胞轉(zhuǎn)染取對數(shù)生長期的細胞,經(jīng)清洗、消化、重懸后,在轉(zhuǎn)染前1 d接種于6孔板內(nèi),接種密度約為60%~70%,在培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h后進行轉(zhuǎn)染。第2天,將10 μl siRNA溶于250 μl Opti-mem減血清培養(yǎng)基,輕輕混勻后,室溫孵育5 min,將8 μl lipofectamine 2000TM溶于另一250 μl Opti-mem減血清培養(yǎng)基中,輕輕混勻后,室溫孵育5 min,然后將兩管溶液混合后,室溫靜置20 min后將其加入6孔板的相應(yīng)孔中,補足培養(yǎng)基至2 ml,6~8 h后根據(jù)細胞狀態(tài)決定是否換液。

1.6 CCK-8實驗檢測GC細胞增殖將實驗分為陰性對照(negative control,si-NC )組、siRNA-hsa_circ_0010985-1(si-circ0010985-1)和siRNA-hsa_circ_0010985-2(si-circ0010985-2)組,將對數(shù)生長期細胞按照實驗分組分別接種于96孔板,每孔約為1 000個細胞,每組設(shè)置6個復(fù)孔,24 h后進行轉(zhuǎn)染,轉(zhuǎn)染后0、1、2、3 d分別加入10 μl CCK8繼續(xù)培養(yǎng)2 h后檢測450 nm處各孔的吸光度(optical density,OD)值。

1.7 流式細胞儀檢測GC細胞凋亡率將細胞均勻接種于6孔板,轉(zhuǎn)染48 h后用不含EDTA的胰酶消化,離心后收集細胞,用預(yù)冷PBS洗滌細胞2次后,加入400 μl 1×Annexin V結(jié)合液懸浮細胞,濃度約為1×106個/ml,將其移至流式管中,加入5 μl Annexin V-FITC染色液,輕輕混勻后于4 ℃避光條件孵育15 min后,再加入10 μl PI染色液輕輕混勻后4 ℃避光條件孵育5 min,立即用流式細胞儀檢測。

2 結(jié)果

2.1 hsa_circ_0010985在GC細胞及組織中的表達qRT-PCR檢測結(jié)果顯示,不同細胞組間hsa_circ_0010985表達水平差異有統(tǒng)計學(xué)意義(F=33.372,P=0.000),hsa_circ_0010985在GC細胞中顯著高表達,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。見圖1。癌旁正常組織及GC組織比較,hsa_circ_0010985在GC組織中高表達,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(t=2.487,P<0.05)。見圖2。

圖1 hsa_circ_0010985在不同GC細胞中的表達

圖2 hsa_circ_0010985在GC組織及癌旁正常組織中的表達

2.2 GC組織中hsa_circ_0010985的表達與GC患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系GC組織中hsa_circ_0010985的表達與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移之間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),而與患者性別、年齡、腫瘤直徑、TNM分期、CEA、CA199、腫瘤位置之間差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。見表1。

2.3 GC組織中hsa_circ_0010985的表達與GC診斷的相關(guān)性分析受試者工作特征曲線(receiver operating characteristic curve,ROC)曲線下面積(area under curve,AUC)為0.631(95%CI:0.513~0.748,P<0.05),特異度和靈敏度分別為0.814和0.419。見圖3。

表1 GC組織中hsa_circ_0010985的表達與GC患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系

圖3 hsa_circ_0010985 ROC曲線及AUC

2.4 siRNA轉(zhuǎn)染效率的檢測鑒于hsa_circ_0010985在低分化細胞株BGC-823中顯著高表達,故選擇該細胞株進行小干擾RNA(small interfering RNA,siRNA)轉(zhuǎn)染以敲低hsa_circ_0010985表達,研究其對GC細胞增殖與凋亡的影響。siRNA轉(zhuǎn)染BGC823細胞48 h后,經(jīng)過qRT-PCR檢測,不同組之間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(F=24.627,P=0.000),其中與si-NC組比較,siRNA組可顯著降低細胞內(nèi)hsa_circ_0010985表達,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01)。見圖4。

圖4 qRT-PCR檢測hsa_circ_0010985在BGC823細胞中轉(zhuǎn)染后的差異表達

2.5 CCK8檢測敲低hsa_circ_0010985后對GC細胞增殖的影響CCK-8實驗分別檢測si-NC、si-circ0010985-1和si-circ0010985-2組在不同時間點的細胞增殖情況,實驗結(jié)果顯示:與si-NC組比較,si-circ0010985-1和siRNA-circ0010985-2組細胞增殖能力顯著降低,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。見圖5。

圖5 CCK-8檢測敲低BGC823細胞中hsa_circ_0010985的表達后對GC細胞增殖的影響

2.6 流式細胞儀檢測敲低hsa_circ_0010985對GC細胞凋亡的影響流式細胞儀分別檢測si-NC、si-circ0010985-1和si-circ0010985-2組的細胞凋亡情況。結(jié)果顯示,不同組之間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(F=13.594,P=0.006),與si-NC組比較,si-circ0010985-1和si-circ0010985-2組的細胞凋亡率明顯增高,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01)。見圖6。

圖6 流式細胞儀檢測敲低hsa_circ_0010985表達后對GC細胞凋亡的影響

3 討論

近年來,circRNA不斷地受到科學(xué)界的關(guān)注,因而越來越多的circRNA被發(fā)現(xiàn),其生物學(xué)功能也被逐漸認識[7-8]。circRNA是前體RNA(pre-mRNA)在形成mRNA過程中,通過反向剪接,并以共價鍵首尾連接形成,由于其特殊的閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu),使得其不易被核酸外切酶降解,因而相較于miRNA和lncRNA更加穩(wěn)定,說明其有望成為疾病診斷及預(yù)后的生物標志物[9]。通常,circRNA在機體內(nèi)的表達水平較低,但是隨著研究的不斷地深入,發(fā)現(xiàn)circRNA可以在特定的細胞或組織中異常表達,可以與miRNA結(jié)合影響轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié),或是調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄,影響剪切等[10]。在腫瘤領(lǐng)域中,對于circRNA的研究主要集中在腫瘤診斷與預(yù)后評估,以及其與miRNA結(jié)合發(fā)揮分子海綿的作用機制等方面。Zhang et al[11]研究發(fā)現(xiàn)circRNA La相關(guān)蛋白4 (circular RNA La-associated protein 4, circLARP4)在GC組織中表達下調(diào),并且通過海綿miR-424和上調(diào)大腫瘤抑制激酶1抑制GC細胞增殖和侵襲,表明circLARP4可能作為腫瘤抑制因子抑制腫瘤發(fā)生發(fā)展。此外,Chen et al[12]研究表明hsa_circ_0000190在GC組織和血漿中下調(diào),其表達水平與腫瘤大小、淋巴轉(zhuǎn)移、遠處轉(zhuǎn)移、TNM分期以及CA199水平顯著相關(guān),并通過ROC曲線分析表明hsa_circ_0000190可能是一種用于GC診斷的新型非侵入性生物標志物。亦有研究[13]報道,與正常組織及細胞相比,circ-0067934在肝癌組織和細胞系中高表達,敲低circ-0067934顯著抑制肝癌細胞的增殖、遷移和侵襲,并誘導(dǎo)其凋亡;在機制研究方面,發(fā)現(xiàn)circ-0067934通過調(diào)節(jié)miR-1324/卷曲蛋白-5(frizzled-5, FZD5)基因激活細胞外因子/b-連環(huán)蛋白(b-catenin)通路,從而促進肝癌的發(fā)生發(fā)展,所以circ-0067934/miR-1324/FZD5/b-catenin信號軸有希望成為肝癌的治療干預(yù)靶點。由此可見,circRNA在惡性腫瘤中異常表達,參與腫瘤細胞的增殖與凋亡等生物學(xué)過程,并與腫瘤的發(fā)生發(fā)展、預(yù)后以及疾病診斷密切相關(guān)。目前為止,本課題所研究的hsa_circ_0010985的生物學(xué)功能及臨床意義在國內(nèi)外報導(dǎo)尚未被研究闡明,因而具有極大的探索意義。

hsa_circ_0010985是mRNA前體在形成SH3結(jié)構(gòu)域結(jié)合富含谷氨酸蛋白基因的剪接過程中,由1號染色體的3號外顯子通過反向剪接形成的長度為465個核苷酸的環(huán)狀RNA分子。在本課題中,前期通過circRNA芯片發(fā)現(xiàn)其在GC化療耐藥患者血漿中高表達,可能參與其GC耐藥的發(fā)生發(fā)展,但是是否參與GC的發(fā)生發(fā)展以及是否具有臨床意義尚不清楚。本研究通過qRT-PCR檢測了1株胃黏膜正常細胞和3株GC細胞,以及43例GC患者的癌組織及癌旁正常組織中has_circ_0010985的相對表達水平,表明has_circ_0010985在GC細胞和組織中均高表達,通過進一步分析顯示hsa_circ_0010985與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移具有一定的相關(guān)性,而與患者的性別、年齡、腫瘤直徑、TNM分期、CEA、CA199、腫瘤位置之間無相關(guān)性。接下來,通過siRNA干擾hsa_circ_0010985在GC細胞中的表達后通過CCK8及流式細胞儀分析其生物學(xué)功能,結(jié)果表明下調(diào)hsa_circ_0010985的表達可抑制GC細胞的增殖并誘導(dǎo)其凋亡。

總之,實驗結(jié)果表明hsa_circ_0010985可能充當促癌基因發(fā)揮作用,并且具有一定的臨床意義,將來有望成為GC診斷的分子標志物。但是,hsa_circ_0010985究竟通過何種機制與途徑發(fā)揮促癌作用,還有待進一步研究及闡明其作用機制。

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