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全流程病理樣本追蹤和管理系統(tǒng)的使用體會(huì)

2020-11-03 10:15:18包春娟
關(guān)鍵詞:界面實(shí)驗(yàn)室系統(tǒng)

李 麗,陳 菲,包春娟,包 驥,朱 琨

為提高科研病理實(shí)驗(yàn)室開(kāi)放平臺(tái)的工作效率和實(shí)現(xiàn)病理樣本的全面追蹤,四川大學(xué)華西醫(yī)院病理研究室與賽默飛世爾科技共同研發(fā)了一套適用于科研病理實(shí)驗(yàn)室的全流程病理樣本追蹤和管理系統(tǒng)(以下簡(jiǎn)稱PathTraq)。PathTraq覆蓋科研病理實(shí)驗(yàn)室樣本處理的每個(gè)流程,確保進(jìn)入實(shí)驗(yàn)室的每個(gè)樣本都能被及時(shí)正確地處理。2017年3月病理實(shí)驗(yàn)室試運(yùn)行PathTraq,經(jīng)不斷更新完善能真正實(shí)現(xiàn)病理樣本從進(jìn)入實(shí)驗(yàn)室到完成制片,樣本每個(gè)處理流程的操作時(shí)間、操作人員、操作儀器都能完整地記錄到PathTraq,并通過(guò)二維碼實(shí)現(xiàn)包埋盒和玻片打號(hào)系統(tǒng)與PathTraq無(wú)縫連接,實(shí)現(xiàn)按需打印,有效避免流程中過(guò)多的人為操作帶來(lái)的差錯(cuò),有效提高工作效率及準(zhǔn)確性[1]。現(xiàn)將本實(shí)驗(yàn)室兩年來(lái)PathTraq的使用體會(huì)介紹如下。

1 材料與方法

1.1 材料與儀器設(shè)備PathTraq系統(tǒng),架構(gòu)在云平臺(tái)上,云平臺(tái)海量的存儲(chǔ)空間可以滿足PathTraq數(shù)據(jù)的長(zhǎng)期存檔。賽默飛全套病理設(shè)備(包括取材臺(tái)、包埋盒打印機(jī)、脫水機(jī)、包埋機(jī)、冷臺(tái)、石蠟切片機(jī)、冷凍切片機(jī)、玻片打號(hào)機(jī)、全自動(dòng)HE染色機(jī)及免疫組化染色機(jī)、封片機(jī))及數(shù)碼攝像頭、與病理設(shè)備相連接的電腦6臺(tái)、二維碼掃描槍6把。

1.2 PathTraq流程

1.2.1病理申請(qǐng) 本院各科研項(xiàng)目課題組的老師及研究生在本病理實(shí)驗(yàn)室管理員的允許下申請(qǐng)到登錄PathTraq系統(tǒng)的賬號(hào)。當(dāng)課題組有實(shí)驗(yàn)動(dòng)物組織樣本需送檢時(shí),登錄PathTraq系統(tǒng)進(jìn)行科研病理申請(qǐng),申請(qǐng)成功后可獲得唯一的病理申請(qǐng)二維碼。

1.2.2樣本登記 病理實(shí)驗(yàn)室接收樣本的老師通過(guò)胸牌號(hào)登陸PathTraq系統(tǒng),掃描病理申請(qǐng)二維碼并核對(duì)送檢樣本信息,核對(duì)無(wú)誤后即可在樣本登記界面完成樣本登記。每個(gè)病理申請(qǐng)二維碼完成樣本登記后即可生成匹配的唯一病理號(hào)。

1.2.3取材工作站 各課題組送檢的復(fù)雜無(wú)序的科研組織樣本包埋盒編號(hào)經(jīng)PathTraq簡(jiǎn)化成有規(guī)律的編號(hào)(病理號(hào)+蠟塊流水號(hào)+取材部位的信息),取材部位的信息需送檢者登錄PathTraq取材界面輸入。PathTraq系統(tǒng)根據(jù)取材記錄自動(dòng)打印包埋盒,每個(gè)包埋盒上均有唯一的二維碼,徹底取代使用PathTraq前包埋盒上無(wú)序的手工編號(hào)(圖1)。

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1.2.4脫水工作站 操作者登入PathTraq系統(tǒng)進(jìn)入脫水界面,掃描當(dāng)日需脫水的組織包埋盒二維碼,匹配對(duì)應(yīng)的脫水機(jī),然后點(diǎn)擊開(kāi)始脫水,第二天脫水結(jié)束時(shí),在脫水界面點(diǎn)擊脫水結(jié)束。PathTraq系統(tǒng)能夠追蹤每個(gè)樣本的脫水狀態(tài),包括開(kāi)始時(shí)間、結(jié)束時(shí)間、操作技術(shù)員等信息。

1.2.5包埋工作站 操作者登入PathTraq系統(tǒng)進(jìn)入包埋界面,掃描包埋盒二維碼,系統(tǒng)自動(dòng)提示樣本的詳細(xì)信息,方便包埋時(shí)核對(duì),如有異常能夠及時(shí)發(fā)現(xiàn)。若發(fā)現(xiàn)包埋的組織塊數(shù)與取材記錄的組織塊數(shù)不符、組織缺失,可以進(jìn)行包埋備注,并致電送檢者到現(xiàn)場(chǎng)確認(rèn)。

1.2.6切片工作站 操作者登入PathTraq系統(tǒng)進(jìn)入切片界面,掃描蠟塊二維碼,系統(tǒng)顯示蠟塊詳細(xì)信息,并自動(dòng)打印玻片,從源頭杜絕撈錯(cuò)片的情況發(fā)生。若發(fā)現(xiàn)組織內(nèi)含線頭或脫水不全等異常問(wèn)題及時(shí)進(jìn)行切片備注,組織內(nèi)含線頭及時(shí)與送檢者確認(rèn),脫水不全操作者要告知實(shí)驗(yàn)室負(fù)責(zé)人,以便找出脫水不全的原因,及時(shí)解決,保證切片質(zhì)量。

1.2.7染色封片 操作者登入PathTraq系統(tǒng)進(jìn)入染色界面,掃描玻片二維碼記錄染色封片的操作人、操作時(shí)間。

1.2.8制片確認(rèn) 操作者登入PathTraq系統(tǒng)進(jìn)入制片確認(rèn)界面,集成二維碼批量掃描儀,能夠大批量、自動(dòng)、快速地掃描玻片。支持手動(dòng)添加樣本,并完成制片確認(rèn)操作。

1.3 PathTraq功能

1.3.1查詢工作站 送檢者登入PathTraq系統(tǒng)進(jìn)入查詢界面,輸入病理號(hào)或送檢者姓名進(jìn)行查詢。一旦查詢到已制片確認(rèn),送檢者可以到病理實(shí)驗(yàn)室取走石蠟組織塊及其染色的所有玻片。病理實(shí)驗(yàn)室工作人員不需花時(shí)間電話告知送檢者樣本已處理結(jié)束。

1.3.2統(tǒng)計(jì)報(bào)表 其常用統(tǒng)計(jì)功能可以滿足常規(guī)工作量統(tǒng)計(jì)(各操作步驟、染色項(xiàng)目、每位工作人員的月度工作量),便于病理實(shí)驗(yàn)室的績(jī)效評(píng)估,提高技術(shù)人員的工作積極性。

2 結(jié)果

PathTraq系統(tǒng)在本病理實(shí)驗(yàn)室運(yùn)行2年多,經(jīng)上萬(wàn)個(gè)樣本測(cè)試,從樣本進(jìn)入實(shí)驗(yàn)室、樣本登記、取材、脫水、包埋、切片到染色完成(常規(guī)HE染色、特殊染色、免疫組化染色及免疫熒光染色等),目前全流程病理樣本追蹤系統(tǒng)(圖2)涵蓋上述所有操作環(huán)節(jié)。每個(gè)步驟的操作時(shí)間、操作人員、操作儀器及操作程序都能完整地記錄到追蹤系統(tǒng),避免實(shí)驗(yàn)過(guò)程中人為差錯(cuò),一旦出錯(cuò)系統(tǒng)也能及時(shí)追蹤,同時(shí)保證實(shí)驗(yàn)操作的規(guī)范化和標(biāo)準(zhǔn)化。

圖2 全流程病理樣本追蹤和管理系統(tǒng)操作界面

3 討論

科研病理實(shí)驗(yàn)室是面向全院有科研項(xiàng)目課題組開(kāi)放的病理技術(shù)平臺(tái)。送檢組織主要來(lái)源各課題組實(shí)驗(yàn)動(dòng)物(如大鼠、小鼠、兔、狗等),每次送樣常常是幾組實(shí)驗(yàn)動(dòng)物樣本,實(shí)驗(yàn)室未使用PathTraq系統(tǒng)前各課題組同期送檢樣本的包埋盒編號(hào)凌亂無(wú)規(guī)律,并且課題組解剖動(dòng)物時(shí)習(xí)慣性把送檢組織先放入手工書(shū)寫(xiě)包埋盒再放入固定液,這樣操作不利于組織固定[2]。使用PathTraq系統(tǒng)后嚴(yán)格要求先固定組織再在取材工作站按需打印包埋盒取材,規(guī)范操作后不但有效提高組織的固定效果并且每批送檢樣本有唯一的病理號(hào),讓無(wú)序的蠟塊有序化,從而有效提高工作效率。送檢組織常常除了做常規(guī)HE染色外,同時(shí)還需增加特殊染色、免疫組化、免疫熒光或凋亡檢測(cè)等,PathTraq能按需打印所有染色的切片徹底取代手工書(shū)寫(xiě),不但提高了工作效率且能有效避免手工書(shū)寫(xiě)導(dǎo)致的差錯(cuò)。由于實(shí)驗(yàn)室沒(méi)有配專業(yè)的實(shí)驗(yàn)病理診斷醫(yī)師,所以科研病理實(shí)驗(yàn)室樣本制片確認(rèn)后就跟各課題組交接,由課題組完成閱片采圖等后續(xù)工作。希望未來(lái)實(shí)驗(yàn)室能配專業(yè)的實(shí)驗(yàn)病理診斷醫(yī)師承擔(dān)科研實(shí)驗(yàn)病理閱片工作,共同提高科研水平。

病理實(shí)驗(yàn)室運(yùn)行PathTraq系統(tǒng)的優(yōu)點(diǎn)如下:(1)整個(gè)流程通過(guò)二維碼實(shí)現(xiàn)病理樣本和病理切片的全程追蹤,使得病理流程更加有序、高效;(2)系統(tǒng)無(wú)縫連接病理實(shí)驗(yàn)室包埋盒打號(hào)系統(tǒng)和玻片打號(hào)系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)按需打印,提高工作效率及準(zhǔn)確性;(3)自動(dòng)包埋盒打印和玻片打印功能可有效杜絕手寫(xiě)標(biāo)簽帶來(lái)的字跡模糊難以辨別的問(wèn)題,從而減少病理樣本人為的出錯(cuò)率;(4)每個(gè)步驟的操作時(shí)間、操作人員、操作儀器及操作程序都可以追蹤,責(zé)任到人,有利于病理實(shí)驗(yàn)室的質(zhì)量管理及績(jī)效評(píng)估,從而提高技術(shù)人員的工作積極性;(5)查詢功能除了滿足各課題組查詢病理實(shí)驗(yàn)進(jìn)度,還為各課題后續(xù)保存蠟塊切片提供方便;(6)統(tǒng)計(jì)報(bào)表可以滿足日常工作量統(tǒng)計(jì)(各操作步驟、染色項(xiàng)目、每位工作人員的月度工作量等)。

PathTraq系統(tǒng)亦存在不完善處,其在特殊染色、免疫組化、免疫熒光染色等非常規(guī)HE染色方面有待提高設(shè)備的兼容功能;在實(shí)驗(yàn)室儀器設(shè)備管理、試劑耗材出入庫(kù)管理等方面也有待進(jìn)一步完善,真正實(shí)現(xiàn)病理實(shí)驗(yàn)室開(kāi)放平臺(tái)無(wú)紙化管理,有效提高實(shí)驗(yàn)室的制片質(zhì)量及工作效率。

目前PathTraq系統(tǒng)能適應(yīng)國(guó)內(nèi)科研院校病理實(shí)驗(yàn)室的實(shí)際工作需要,并能顯示出優(yōu)于傳統(tǒng)科研病理實(shí)驗(yàn)室的一些優(yōu)勢(shì),對(duì)提高科研病理技術(shù)人員工作積極性及規(guī)范病理技術(shù)操作有一定幫助。

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