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農桿?菌介導葡萄灰葡萄孢遺傳轉化條件優化

2021-11-15 01:57:40李廷剛鞏東營
山東農業科學 2021年10期
關鍵詞:效率

李廷剛,鞏東營

(1.山東省葡萄研究院,山東 濟南 250100;2.山東省農業科學院農產品加工與營養研究所,山東 濟南 250100)

灰霉病是葡萄生長及貯存期的重要病害,在我國主要由灰葡萄孢(Botrytis cinerea)侵染所致[1]。灰葡萄孢在自然界中可侵染200多種植物,包括番茄、絲瓜、草莓、葡萄等[2],多以菌核在植株或者病殘體上越冬,翌年通過分生孢子傳播[3]。灰葡萄孢在葡萄生長過程中可侵染植株嫩莖、葉片、花穗、果實等大部分地上組織,發生嚴重時,可造成減產60%以上;在葡萄貯藏期是第一大病原菌,一旦發生可造成葡萄果粒腐爛,影響貯藏品質,造成嚴重損失[4]。灰葡萄孢寄主范圍廣、變異速度快、抵御不良環境能力強,因此防治極為困難。尋找灰葡萄孢致病基因、探索致病機制,可為灰霉病綜合防控奠定基礎。

遺傳轉化是研究病原菌致病基因功能的重要技術基礎,農桿菌介導的遺傳轉化(Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation,ATMT)是目前應用較為廣泛的轉化技術[5]。農桿菌可以侵染真菌細胞,利用所攜帶的Ti質粒,將T-DNA區隨機整合到受體細胞的基因組中,轉化過程受到多種小分子多糖及酚類物質等的雙重調節,其中乙酰丁香酮(acetosyringone,AS)在該過程中起促進作用[6]。ATMT技術因其轉化受體要求低、操作流程簡單、轉化效率高、轉化子穩定性強、轉化子單拷貝插入等優勢,目前已在水稻稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)、玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)、油菜菌核病菌(Sclerotinia sclerotiorum)、橡膠樹炭疽病菌(Colletotrichum musae)等多種病原真菌中得到廣泛應用[7-10]。

目前,在灰葡萄孢遺傳轉化研究中,ATMT技術也得到了較好的應用。陶嵐[11]利用ATMT技術構建了草莓灰葡萄孢突變體庫,并從中篩選出463個致病力異常的轉化子。王璇等[12]通過篩選基于ATMT技術構建的番茄灰葡萄孢突變體庫,得到分生孢子產生缺陷轉化子BCt78。范雷等[13]通過優化月季灰葡萄孢RoseBc-3的ATMT體系,篩選獲得6類不同表型轉化子。沈衛鋒等[14]利用ATMT技術成功獲得了綠色熒光蛋白重組灰葡萄孢。Zhang等[15]通過篩選番茄灰葡萄孢ATMT突變體庫,得到分生孢子產生缺陷轉化子BCG183,定位確定候選基因BcKMO,進一步證明該基因可參與調控細胞壁降解酶活性、毒素活性和細胞壁完整性等。不同寄主灰葡萄孢具有其自身特異性,目前鮮有關于葡萄灰葡萄孢ATMT的相關研究。本試驗以分離自葡萄的灰葡萄孢BcSD3菌株為材料,研究建立并優化其ATMT體系。

1 材料與方法

1.1 試驗材料

葡萄灰葡萄孢BcSD3菌株(高毒力菌株),于2020年7月分離自山東煙臺‘巨峰’葡萄灰霉病花穗。根癌農桿菌EHA105菌株、質粒pBIG3C(含潮霉素抗性基因)均由本實驗室保存。

1.2 試驗方法

1.2.1 灰葡萄孢分生孢子制備 將灰葡萄孢BcSD3菌株接種于PDA培養基上,參照李廷剛等[16]報道的方法進行誘導產孢;使用滅菌水洗脫分生孢子,并用三層滅菌濾紙過濾去除菌絲等雜質;離心收集分生孢子,并調節至適宜濃度,保存備用。

1.2.2 根癌農桿菌菌液制備 采用熱擊法將pBIG3C質粒轉入根癌農桿菌EHA105菌株中;篩選陽性菌斑接種于LB液體培養基(含50μg/mL卡那霉素)中,于28℃條件下搖培2 d;離心收集菌體,用誘導培養基將菌液稀釋至OD600值等于0.15,繼續培養直至OD600值達到0.8。

1.2.3 灰葡萄孢對潮霉素B敏感性測定 制備分別含有5、10、25、50、100μg/mL潮霉素B的PDA平板,以不添加潮霉素B的PDA平板作為對照,用打孔器打取灰葡萄孢菌餅接種在PDA平板中心位置;于23℃光暗交替條件下培養3 d,觀察菌落生長情況,每個處理6個平板,設置3次重復。

1.2.4 農桿菌對頭孢噻肟鈉敏感性測定 制備分別含有50、100、200、300、400μg/mL頭孢噻肟鈉的PDA平板,以不添加頭孢噻肟鈉的PDA平板作為對照,取已制備的OD600值為0.15的農桿菌菌液均勻涂布于平板上;于28℃黑暗條件下培養3 d,觀察菌落生長情況,每個處理6個平板,設置3次重復。

1.2.5 遺傳轉化條件優化 在含有不同濃度乙酰丁香酮(AS)的共培養培養基平板上平鋪一張玻璃紙,取100μL農桿菌與灰葡萄孢分生孢子混合液均勻涂布于玻璃紙上,在不同溫度條件下共培養不同時間,后將玻璃紙轉移至新的滅菌培養皿內,覆蓋PDA培養基(內含50μg/mL的潮霉素B和300μg/mL的頭孢噻肟鈉),在適宜溫度條件下光暗交替培養5 d,查看轉化子生長情況。其中所用灰葡萄孢分生孢子濃度分別為1×102、1×103、1×104、1×105、1×106個/mL;所用AS濃度分別為100、200、300、400μmol/mL,以不添加AS培養基平板作為對照;共培養溫度分別為15、20、25、30、35℃;共培養時間分別為24、48、72、96、120 h。

1.2.6 轉化子檢測與鑒定 隨機選取8個轉化子接種于不含抗生素的PDA平板上,待菌落生長至平板3/4面積時,打取菌餅轉接至新的不含抗生素的PDA平板上,連續轉接3代。之后打取菌餅,接種至含有50μg/mL潮霉素B的PDA平板上,觀察菌落生長情況,重復3次。使用CTAB法提取野生型灰葡萄孢和8個轉化子的基因組DNA,分別擴增潮霉素磷酸轉移酶(hph)基因的特異片段。對野生型灰葡萄孢和8個轉化子的基因組DNA進行HindⅢ單酶切,酶切完成后進行瓊脂糖凝膠電泳分析;以hph基因的特異擴增片段為模板,探針標記與檢測方法具體試驗步驟參照地高辛標記檢測試劑盒(羅氏)說明書進行。

1.3 數據處理與分析

使用Microsoft Excel 2010及SPSS 19.0進行數據統計及分析。

2 結果與分析

2.1 灰葡萄孢對潮霉素B敏感性測定

不同濃度潮霉素B對灰葡萄孢抑制作用測定結果如圖1所示,接種灰葡萄孢3 d后,與對照相比,5、10、25μg/mL潮霉素B可對灰葡萄孢菌絲生長產生不同程度的抑制作用,但仍可以生長;當潮霉素B濃度達到50μg/mL時,則可以完全抑制灰葡萄孢菌絲的生長。因此,本試驗選擇50 μg/mL潮霉素B作為轉化子的篩選濃度。

圖1 灰霉病菌在含有不同濃度潮霉素B的PDA培養基上生長情況

2.2 根癌農桿菌對頭孢噻肟鈉敏感性測定

不同濃度頭孢噻肟鈉對農桿菌抑制作用如圖2所示,農桿菌涂布后培養3 d,對照組農桿菌遍布整個平板,隨著頭胞噻肟鈉濃度的不斷提高,存活農桿菌菌落數不斷減少,抑制效果不斷增強;當濃度增至300μg/mL時,可完全抑制其生長。因此,本試驗選擇300μg/mL頭孢噻肟鈉作為轉化子的篩選濃度。

圖2 農桿菌在含有不同濃度頭孢噻肟鈉的PDA平板上生長情況

2.3 分生孢子濃度對轉化效率的影響

由圖3可知,隨分生孢子濃度的增加,每培養皿得到的轉化子數量不斷增加。分生孢子濃度為1×102、1×103、1×104、1×105、1×106個/mL每培養皿分別平均得到3、9、14、31個和67個轉化子。基于試驗操作和轉化子特異性綜合考慮,分生孢子濃度1×105個/mL為最適轉化濃度。

圖3 不同分生孢子濃度對轉化效率的影響

2.4 乙酰丁香酮濃度對轉化效率的影響

當不添加AS時,每個培養皿平均僅得到2個轉化子;隨著AS濃度不斷提高,轉化子數量不斷增加,濃度為200μmol/mL時每個培養皿平均可得到33個轉化子;之后,隨著AS濃度不斷增加轉化子數量不斷減少(圖4)。因此,AS濃度200μmol/mL為最佳轉化濃度。

圖4 不同乙酰丁香酮濃度對農桿菌轉化效率的影響

2.5 共培養溫度對轉化效率的影響

當共培養溫度為15℃時,每培養皿平均可得到7個轉化子;隨著共培養溫度不斷升高轉化子數量呈先增加后減少的趨勢,25℃時轉化效率最高,每培養皿平均可得到32個轉化子,當共培養溫度達到35℃時,每培養皿平均轉化子數量下降到11個(圖5)。因此,25℃為最佳共培養溫度。

圖5 共培養溫度對轉化效率的影響

2.6 共培養時間對轉化效率的影響

當共培養時間為24、48、72、96、120 h時,每皿分別平均可得到18、33、34、26個和22個轉化子;其中,共培養時間為48 h和72 h時轉化效率相當,且無顯著差異(圖6)。共培養時間越長轉化子有多拷貝插入的比例越高,因此,48 h為最適共培養時間。

圖6 共培養時間對轉化效率的影響

2.7 轉化子穩定性檢測及分子鑒定

隨機選取8個轉化子進行遺傳穩定性檢測,結果顯示,在含有50μg/mL潮霉素B的PDA培養基平板上所有轉化子均可正常生長。潮霉素磷酸轉移酶基因特異片段擴增結果如圖7a所示,灰葡萄孢野生型中無條帶,8個轉化子中均可擴增到特異性條帶,且大小與對照相同。表明,TDNA片段已經整合到灰葡萄孢基因組中,并且可以穩定遺傳。

轉化子Southern blot檢測結果如圖7b所示,灰葡萄孢野生型中無任何條帶,8個轉化子均可得到特異性條帶,其中6個轉化子為單拷貝插入,2個轉化子為雙拷貝插入,單拷貝插入比例可達到75%。表明hph基因已經整合到灰葡萄孢基因組中,且多以單拷貝形式插入。

圖7 轉化子PCR檢測及Southern blot分析

3 討論與結論

遺傳轉化是研究真菌基因功能的重要技術手段,常用的遺傳轉化技術包括PEG介導的原生質體遺傳轉化、限制酶介導的原生質體遺傳轉化等[17-19]。ATMT技術因其無需制備原生質體、單拷貝插入率高、操作流程簡單、轉化效率高等優點,在多種真菌遺傳轉化研究中得到了較好的應用[20,21]。但不同真菌間、甚至同一真菌不同種間的遺傳轉化條件存在較大差異,主要受共培養培養基中AS濃度、共培養液中分生孢子濃度、共培養溫度以及共培養時間等因素影響。本研究建立了葡萄灰葡萄孢ATMT體系,為開展其基因功能研究奠定了技術基礎。

分生孢子濃度與轉化效率大致呈正相關趨勢,這主要是因為分生孢子濃度的提高增加了農桿菌侵染的概率,從而提高了轉化效率。由于一個培養皿中轉化子過多會造成菌落相互覆蓋,不利于后期轉化子的分離純化,因此分生孢子應選擇適宜濃度。AS對Ti質粒上vir基因的活化起重要作用,因此在共培養培養基中需加入適當濃度的AS以提高轉化效率。本研究中AS最佳濃度為200μmol/mL,之后隨著濃度繼續提高,轉化效率逐漸下降。推測這可能是因為過高濃度的AS對轉化子產生了毒害作用,抑或是抑制了Ti質粒上的vir基因的表達,從而導致轉化效率下降。

共培養溫度對轉化效率的影響呈正態分布趨勢,最佳共培養溫度為25℃,過低或者過高均會導致轉化效率下降。推測這可能是因為灰葡萄孢分生孢子具有自己最適的生長溫度;同時,Ti質粒上vir基因的表達也較易受到溫度的影響。本研究中最適共培養時間為48 h,共培養時間過短會導致農桿菌未能完成侵染,從而造成轉化效率不高;共培養時間過長,也會導致轉化效率下降。這或許是因為共培養時間過長導致轉化子生活力衰弱,從而影響轉化效率。此外,共培養時間過長還易導致轉化子中多拷貝插入的現象,為后續開展基因功能研究帶來不便[22]。

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