999精品在线视频,手机成人午夜在线视频,久久不卡国产精品无码,中日无码在线观看,成人av手机在线观看,日韩精品亚洲一区中文字幕,亚洲av无码人妻,四虎国产在线观看 ?

基于網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)探討蒼耳子的毒性機(jī)制※

2022-03-22 08:18:22樊黎麗侯超峰杜一杰孟義人
中醫(yī)藥通報(bào) 2022年3期
關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)庫信號(hào)

陳 珂 樊黎麗 侯超峰 杜一杰 孟義人 孟 泳▲

蒼耳子(xanthii Fructus),始載于《神農(nóng)本草經(jīng)》,是菊科植物的成熟帶總苞果實(shí),其味苦、辛,性溫,歸肺經(jīng),有毒,具有通鼻竅、除濕止痛、祛風(fēng)散寒之功效,主要用于治療鼻淵、風(fēng)寒頭痛以及濕痹等病證[1-4]。其成分復(fù)雜,主要包括酚酸類、木脂素類、黃酮類以及氨基酸類等[5-9]。現(xiàn)代藥理學(xué)研究[10-12]表明,其成分具有抗過敏、抗炎、抑菌以及抗腫瘤等作用,但其毒性也不容忽視。《本草品匯精要》《本草新編》等中醫(yī)古籍也記載,蒼耳子有毒。現(xiàn)代臨床與毒理學(xué)研究[13-15]表明,蒼耳子的毒性成分主要是蒼術(shù)苷、羥基蒼術(shù)苷、毒蛋白、倍半萜內(nèi)酯類、氫醌以及羧基蒼術(shù)酸鉀等,其產(chǎn)生毒性的主要機(jī)制是脂質(zhì)過氧化反應(yīng)、膽汁淤積、線粒體損傷,此外還會(huì)抑制ADP∕ATP 對蛋白質(zhì)在體內(nèi)的轉(zhuǎn)運(yùn),影響機(jī)體代謝并具有肝腎毒性等[14-18]。蒼耳子對機(jī)體的毒性作用并非單一途徑,而是多條途徑、多靶點(diǎn)共同作用的結(jié)果。蒼耳子的主要毒性表現(xiàn)在應(yīng)用中患者出現(xiàn)惡心、嘔吐、心悸、呼吸困難,甚者出現(xiàn)實(shí)質(zhì)性臟器損傷,其中尤以肝腎損傷較為嚴(yán)重[19-22],可導(dǎo)致死亡。蒼耳子作為中藥,具有多成分、多靶點(diǎn)的特征,難以用單一角度去解釋其毒理作用。其使用要注意炮制、服用劑量以及服用周期等[23]。

本研究采用網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)[24]的方法,通過構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)模型,從多角度對其毒理作用機(jī)制進(jìn)行了研究,以期更好地指導(dǎo)臨床合理應(yīng)用蒼耳子。

1 資料與方法

1.1 數(shù)據(jù)庫及軟件工具中國系統(tǒng)藥理數(shù)據(jù)庫與分析平臺(tái)[25](Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP,www.tcmspw.com∕tcmsp.php)、Uniprot數(shù)據(jù)庫[26](www.uniport.org)、比較毒物基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫[27](Comparative Toxicogenomics Database,CTD,http:∕∕ctdbase.org∕)、Pub Chem 數(shù)據(jù)庫(https:∕∕pubchem.ncbi.nlm.nih.gov∕)、Swiss Target Prediction 數(shù)據(jù)庫[28](http:∕∕www.swisstargetprediction.ch∕)、STRING 數(shù)據(jù)庫[29](https:∕∕string-db.org∕)、生物學(xué)信息注釋數(shù)據(jù)庫[30-31](The Database for Annotation,Visualization and Integrated Discovery,DAVID 6.8,https:∕∕david.ncifcrf.gov∕)以及cytoscape 軟件(version 3.7.2)。

1.2 蒼耳子成分篩選TCMSP是基于系統(tǒng)藥理學(xué)的研究方法,對藥物化學(xué)、藥物代謝動(dòng)力學(xué)以及藥物-成分-靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò)-疾病網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行整合的分析數(shù)據(jù)庫。CTD數(shù)據(jù)庫提供了影響人類化合物的數(shù)據(jù)信息,首先為全球研究人員提供了不同類型分子和生物體的毒理學(xué)數(shù)據(jù)。從TCMSP 中獲取蒼耳子目前已知的成分,進(jìn)一步根據(jù)生物利用度(OB≥30%)、類藥性(DL≥0.18)獲得符合要求的化合物。通過CTD 數(shù)據(jù)庫將TCMSP數(shù)據(jù)庫篩選出的蒼耳子的成分進(jìn)行查詢,獲得蒼耳子的有毒化合物。

1.3 毒性化合物的候選靶點(diǎn)選取Swiss Target Prediction數(shù)據(jù)庫是一個(gè)根據(jù)化合物的2 D和3 D結(jié)構(gòu)精準(zhǔn)預(yù)測化合物作用靶點(diǎn)信息的數(shù)據(jù)庫。使用PubChem 數(shù)據(jù)庫查詢從CTD 數(shù)據(jù)庫中獲得的有毒化合物,將化合物的Canonical SMILES 輸入Swiss Target Prediction 數(shù)據(jù)庫中,限定物種為人,得到靶點(diǎn)蛋白與Uniprot ID。使用uniprot數(shù)據(jù)庫的Uniprot KB功能,得到靶點(diǎn)基因,將其作為TCMSP 數(shù)據(jù)庫已獲得靶點(diǎn)的補(bǔ)充。

1.4 毒性成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建獲得蒼耳子的毒性成分及其相關(guān)靶點(diǎn)后,構(gòu)建毒性成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)。并使用Cytoscape 3.7.2軟件使其可視化。

1.5 靶點(diǎn)蛋白網(wǎng)絡(luò)(protein-protein interaction,PPI)構(gòu)建使用STRING 數(shù)據(jù)庫,將蒼耳子的有毒成分與成分相對應(yīng)的靶點(diǎn)導(dǎo)入其中。選擇人作為其物種,獲得靶點(diǎn)蛋白網(wǎng)絡(luò)關(guān)系互作圖,保存其TSV格式,保存其格式中的node 1、node 2與Combined score。導(dǎo)入cytoscape 3.7.2,并進(jìn)一步調(diào)整節(jié)點(diǎn)和相連線段的大小與顏色以反映度值(degree)的大小,以獲取PPI。

1.6 代謝通路與生物過程分析使用DAVID 6.8 數(shù)據(jù)庫將蒼耳子毒性成分對應(yīng)靶點(diǎn)的基因進(jìn)行基因本體(Gene Ontology,GO)生物過程(biological process,BP)功能富集分析與京都基因和基因組百科全書(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,并選擇人作為物種,得到蒼耳子影響的代謝通路。

2 結(jié)果

2.1 蒼耳子成分篩選從TCMSP 數(shù)據(jù)庫中獲得蒼耳子目前已知的活性成分111種,篩選出具有良好的口服生物利用度(OB≥30%)與類藥性(DL≥0.18)的化合物11 個(gè),見表1。從CTD 數(shù)據(jù)庫中共獲取7 種蒼耳子目前已知的有毒成分,見表2。

2.2 毒性成分靶點(diǎn)查詢結(jié)果蒼耳子的7 種有毒成分從TCMSP 數(shù)據(jù)庫和SwissTargetPrediction 數(shù)據(jù)庫中共得到367 個(gè)靶點(diǎn)蛋白,去除重復(fù)蛋白后獲得215 個(gè)靶點(diǎn)蛋白。

表1 蒼耳子成分篩選

表2 蒼耳子中的毒性化合物

2.3 毒性成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建將蒼耳子的毒性成分和其相關(guān)作用靶點(diǎn)導(dǎo)入Cytoscape 3.7.2 中,構(gòu)建毒性成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)。共有222個(gè)節(jié)點(diǎn)(215個(gè)靶點(diǎn)蛋白和7 個(gè)有毒成分)與367 條邊。紫色三角形表示有毒活性成分,綠色方形表示不同成分的同一靶點(diǎn),藍(lán)色八邊形表示同一成分的不同靶點(diǎn),見圖1。節(jié)點(diǎn)的重要性用degree 值與介數(shù)中心性(Betweenness Centrality)來反映,見表3。

2.4 靶點(diǎn)PPI 構(gòu)建將得到的蒼耳子的215 個(gè)靶點(diǎn)導(dǎo)入STRING 數(shù)據(jù)庫里,共有169 個(gè)靶點(diǎn)蛋白發(fā)生相互作用,共有2802 條代表靶點(diǎn)蛋白相互作用的邊。節(jié)點(diǎn)越大與之相對應(yīng)的degree值就越大,節(jié)點(diǎn)顏色由藍(lán)變橙對應(yīng)的degree值也越大。見圖2。

2.5 生物過程與通路分析使用DAVID 6.8 數(shù)據(jù)庫對蒼耳子的215個(gè)靶點(diǎn)基因進(jìn)行GO生物學(xué)過程富集分析和KEGG 信號(hào)通路富集分析。篩選得到GO_BP條目392 個(gè)(P<0.05)和KEGG 信號(hào)通路91 條(P<0.05),按照P值從小到大排列,前10 條主要生物過程和前15條的信號(hào)通路富集分析分別見表4和表5。

圖1 蒼耳子毒性化合物-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)

表3 蒼耳子主要毒性成分的網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵W(xué)參數(shù)

3 討論

3.1 蒼耳子毒性成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建結(jié)果分析本研究在獲得蒼耳子的有毒成分與靶點(diǎn)后,構(gòu)建毒性成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò),獲得PTPN 1、BCHE、CHRM 2 等節(jié)點(diǎn)degree值較高的靶點(diǎn)蛋白。

Degree 值 為5 的PTPN 1(Protein Tyrosine Phosphatese Non-receptor type 1),又稱PTPIB,是一種以調(diào)節(jié)絡(luò)氨酸磷酸蛋白的磷酸化來發(fā)揮其功能的蛋白絡(luò)氨酸磷酸酶,可以調(diào)節(jié)細(xì)胞的增殖、生長、分化以及凋亡等過程的多個(gè)信號(hào)通路。PTPN 1 的異常會(huì)導(dǎo)致阿爾茲海默癥、腫瘤、肝損傷[32-34]等多種疾病的發(fā)生和發(fā)展,蒼耳子引起的肝損傷可能與此有關(guān)。

Degree 值為5 的丁酰膽堿酯酶(butyrylcholinesterase,BCHE),是由肝臟合成的,廣泛存在于血漿、神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞的膽堿酯酶,與糖尿病以及精神系統(tǒng)疾病等有關(guān)。據(jù)文獻(xiàn)[35-36]報(bào)道,激活膽堿能通路能緩解炎癥反應(yīng)導(dǎo)致的臟器損傷,蒼耳子導(dǎo)致的肝腎功能損傷可能與此有關(guān)。

Degree 值為5 的CHRM 2,可調(diào)節(jié)鈣離子或鉀離子通路,從而影響神經(jīng)元的興奮性,可能會(huì)引起抑郁癥等病[37-38]。

3.2 蒼耳子有毒成分對應(yīng)靶點(diǎn)PPI 構(gòu)建結(jié)果分析由蒼耳子有毒活性成分對應(yīng)靶點(diǎn)互作網(wǎng)絡(luò)可得到其中degree 值較高的靶點(diǎn)蛋白,如MAPK 3、TP 53 以及EGFR 等,蒼耳子可能通過這些靶點(diǎn)蛋白而產(chǎn)生毒性作用。

Degree 值為77 的是絲裂原活化蛋白激酶3(mitogen-activated protein kinase 3,MAPK 3)。絲裂原活化蛋白激酶是細(xì)胞的重要傳遞者,對細(xì)胞生長、分化具有調(diào)節(jié)作用,還能調(diào)節(jié)細(xì)胞的應(yīng)激反應(yīng)、炎癥反應(yīng)等多種細(xì)胞過程。其異常表達(dá)會(huì)導(dǎo)致多種疾病的發(fā)生、發(fā)展(如腫瘤、膽汁淤積等)。從CTD 數(shù)據(jù)庫中得知,某些藥物還會(huì)通過此靶點(diǎn)造成肝腎功能損傷[39-40]。

圖2 靶點(diǎn)蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖

表4 生物過程富集分析結(jié)果

Degree 值為72 的是細(xì)胞腫瘤抗原53(Tumor Protein 53,TP 53),位于17 號(hào)染色體上。其主要功能是調(diào)節(jié)細(xì)胞分裂與增殖、維護(hù)基因的完整性與促進(jìn)細(xì)胞凋亡。TP 53 的異常會(huì)誘導(dǎo)多種腫瘤的發(fā)生和發(fā)展,此外,蒼耳子造成的肝腎損傷與TP 53 也有一定關(guān)系[41-42]。

Degree 值為69 的是表皮生長因子受體(epidermal growth factor receptor,EGFR)。EGFR 作為信號(hào)傳導(dǎo)的受體,其功能是調(diào)節(jié)細(xì)胞的生理、生化過程,與腫瘤密切相關(guān)。此外,EGFR的異常會(huì)影響呼吸系統(tǒng)、泌尿系統(tǒng)以及消化系統(tǒng)的正常功能[43-44]。

表5 KEGG信號(hào)通路富集分析結(jié)果

3.3 蒼耳子毒理作用機(jī)制及原理分析在臨床應(yīng)用中,蒼耳子的不良反應(yīng)主要有:以惡心、嘔吐為主要表現(xiàn)的消化系統(tǒng)功能損害;以呼吸困難、咳嗽為主要表現(xiàn)的呼吸系統(tǒng)功能損害;以少尿、血尿、蛋白尿?yàn)橹饕憩F(xiàn)的泌尿功能損害;以頭暈、昏迷為主要表現(xiàn)的神經(jīng)系統(tǒng)功能損害;以血壓升高和心悸為主要表現(xiàn)的循環(huán)系統(tǒng)功能損傷。此外,蒼耳子外用還會(huì)出現(xiàn)局部瘙癢和紅腫等毒性作用[15]。GO 生物過程富集分析結(jié)果表明,蒼耳子可能通過調(diào)節(jié)多種生物過程而產(chǎn)生毒性作用。通過KEGG通路富集分析得出,蒼耳子可能通過氮素代謝、雌激素信號(hào)、鈣離子信號(hào)、TNF信號(hào)以及cAMP信號(hào)等通路而產(chǎn)生毒性。

氮素代謝(nitrogen metabolism)是機(jī)體內(nèi)一種重要的合成與代謝生理途徑,對維持細(xì)胞內(nèi)外的穩(wěn)態(tài)起著重要的作用[45]。從CTD數(shù)據(jù)庫得知,多種疾病的發(fā)生、發(fā)展與此有關(guān)。

雌激素信號(hào)通路不僅與維持雌性機(jī)體的第二性征有關(guān),還與骨質(zhì)疏松、乳腺癌以及心血管疾病的發(fā)生和發(fā)展有很大關(guān)系。此外,還可通過調(diào)控多個(gè)基因(如ADCY 5、ITPR 1、EGFR),造成肝腎功能損傷及對循環(huán)系統(tǒng)產(chǎn)生影響[46-47]。

細(xì)胞內(nèi)外鈣離子的濃度與細(xì)胞生理活動(dòng)和維持細(xì)胞的存活密切相關(guān)。某些藥物可破壞細(xì)胞膜的通透性以及細(xì)胞膜上相關(guān)的酶,導(dǎo)致細(xì)胞內(nèi)外鈣離子的濃度改變,從而引起血壓升高、肝腎損傷等一系列生理病理改變。蒼耳子亦可能通過調(diào)控鈣離子信號(hào)通路導(dǎo)致毒性的發(fā)生發(fā)展。

腫瘤壞死因子(TNF)信號(hào)通路不僅參與殺傷腫瘤細(xì)胞,還與全身炎癥反應(yīng)有關(guān)。肝腎功能損傷和膽汁淤積等多種生理損傷可能與TNF 信號(hào)通路有關(guān)[48-49]。此外,有研究[50]證實(shí),TNF 會(huì)導(dǎo)致肝損傷小鼠的腎小球?yàn)V過率降低。

綜上,蒼耳子對機(jī)體的毒性作用是多種組分經(jīng)多條途徑、多種靶點(diǎn)而產(chǎn)生的。本研究使用網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)的方法報(bào)告了蒼耳子對人體可能產(chǎn)生的毒性機(jī)制和途徑,對今后蒼耳子的研究與臨床應(yīng)用具有一定的意義。

猜你喜歡
數(shù)據(jù)庫信號(hào)
信號(hào)
鴨綠江(2021年35期)2021-04-19 12:24:18
完形填空二則
孩子停止長個(gè)的信號(hào)
數(shù)據(jù)庫
數(shù)據(jù)庫
數(shù)據(jù)庫
數(shù)據(jù)庫
基于LabVIEW的力加載信號(hào)采集與PID控制
數(shù)據(jù)庫
一種基于極大似然估計(jì)的信號(hào)盲抽取算法
主站蜘蛛池模板: 伊人天堂网| 欧美有码在线观看| 有专无码视频| www成人国产在线观看网站| 午夜天堂视频| 毛片免费视频| 国产一区二区丝袜高跟鞋| 国产成人亚洲精品无码电影| 乱码国产乱码精品精在线播放 | 九色在线观看视频| 亚洲天堂网视频| 国产高清国内精品福利| 波多野结衣视频网站| 91成人精品视频| 就去吻亚洲精品国产欧美| 四虎亚洲精品| 波多野一区| 国产第一页亚洲| 国产在线视频导航| 免费一级毛片不卡在线播放| 最新国产精品第1页| 欧美激情,国产精品| 国产成人精品高清在线| 2021亚洲精品不卡a| 91在线一9|永久视频在线| h网址在线观看| 亚洲日本中文字幕乱码中文 | 免费无码一区二区| 国产91视频观看| 亚洲国产精品久久久久秋霞影院| 人妻出轨无码中文一区二区| 国产精品美女网站| 91成人免费观看| 欧美一区精品| 久久99国产综合精品女同| 免费精品一区二区h| 人妻丝袜无码视频| 成人国产精品视频频| 国产精品3p视频| 欧美中文字幕在线播放| 欧美第一页在线| 无码精油按摩潮喷在线播放 | 国产午夜无码片在线观看网站 | 精品国产91爱| 三上悠亚精品二区在线观看| 内射人妻无套中出无码| 真实国产乱子伦高清| 午夜视频在线观看免费网站 | 久久精品国产亚洲麻豆| 亚洲制服丝袜第一页| 亚洲成人网在线播放| 国产精品流白浆在线观看| 国产福利小视频在线播放观看| 三级视频中文字幕| 素人激情视频福利| 久久性妇女精品免费| 99视频全部免费| 亚洲天堂在线免费| 秋霞国产在线| 精品国产免费观看| 91精品人妻互换| 久久成人国产精品免费软件| 亚洲欧美日韩中文字幕在线一区| 夜夜爽免费视频| 九九热视频在线免费观看| 精品视频在线观看你懂的一区| 国内精自线i品一区202| 波多野结衣一区二区三区AV| 毛片a级毛片免费观看免下载| 国产黄在线观看| 青草免费在线观看| 精品国产网站| 亚洲啪啪网| 成人免费午夜视频| 亚洲日韩精品欧美中文字幕| 91色国产在线| 国产手机在线观看| 亚洲天堂免费观看| 极品国产在线| 国产青榴视频| 国产a在视频线精品视频下载| 国产精品短篇二区|