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沉默長鏈非編碼RNA FAM83H-AS1提高肺腺癌細胞的化學治療敏感性

2022-03-23 10:08:52郭家辰徐然
中國醫科大學學報 2022年3期
關鍵詞:耐藥

郭家辰,徐然

(中國醫科大學附屬盛京醫院 1.檢驗科;2.胸外科,沈陽 110004)

肺癌是最常見的惡性腫瘤之一,在我國其發病率和致死率均居首位。其中,肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD) 的發病率呈明顯上升趨勢,在許多國家已超過鱗狀細胞癌成為最常見的肺癌組織學類型[1]。手術切除配合放射化學治療是目前治療LUAD的主要手段。中華醫學會肺癌臨床診療指南對LUAD的一線治療方案之一為培美曲塞和鉑類藥物(如順鉑) 的聯合治療。化學治療(簡稱化療) 能明顯改善LUAD患者的預后,但化療耐藥嚴重限制了化療的臨床應用。因此,研究并發現提高LUAD化療敏感性的方法非常重要。

近年來,許多非編碼RNA,特別是長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA) 被證明參與了包括LUAD在內的幾乎所有類型腫瘤化療耐藥的發生和維持[2-3]。FAM83H-AS1基因位于8q24.3,由于缺乏蛋白質編碼能力,屬于lncRNA。目前,已有多篇文獻[4-5]報道FAM83H-AS1在胃癌、前列腺癌等腫瘤中的存在表達和功能異常。WANG等[6]報道FAM83HAS1高表達與LUAD患者預后不良相關,且能夠促進LUAD的惡性進展并抑制細胞凋亡。然而,FAM83HAS1在LUAD化療耐藥中的作用尚不清楚。

本研究發現FAM83H-AS1與LUAD化療(培美曲塞和順鉑) 耐藥相關,能通過調控多藥耐藥相關基因ATP結合盒亞家族C成員1(ATP binding cassette subfamily C member 1,ABCC1) 促進LUAD化療耐藥。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 研究對象:104例LUAD及相應的正常肺組織(normal lung tissue,NLT) 標本均經支氣管鏡活檢或經皮肺活檢獲得,并由2名病理學家診斷為LUAD。本研究獲得本院倫理委員會批準,所有患者均簽署書面知情同意書。本研究包括男37例,女67例,年齡35~79歲,中位年齡為62.9歲。納入標準:所有患者均確診為LUAD,在確診前未接受治療。排除標準:患者病例信息不完整,或患有其他疾病。

確診后,57例LUAD患者選擇新輔助化療或姑息化療(培美曲塞和順鉑)。化療2~3個療程后復查胸部增強CT及血清腫瘤標志物。根據病灶大小及血清腫瘤標志物水平的變化,將患者分為敏感組(39例) 和不敏感組(18例)。

人肺動脈內皮細胞(pulmonary artery endothelial cells,PAEC) 購自武漢云克隆公司,肺腺癌細胞系(PC9和A549) 購自寧波明舟公司;多藥耐藥細胞系A549/CR為本課題組前期構建[7]。

1.1.2 主要試劑:培美曲塞和順鉑購自美國Sigmaaldrich公司;SYBR RT-PCR試劑盒購自大連寶生物公司;TRIzol和Lipofectamine 3000購自美國賽默飛公司;FAM83H-AS1抑制劑(sh-FAM83H-AS1) 及陰性對照(sh-NC) 購自廣州銳博公司;CCK8試劑盒購自上海碧云天公司;ABCC1和GAPDH抗體購自武漢云克隆公司。

1.2 方法

1.2.1 實時定量PCR:TRIzol法從組織或細胞標本中提取總RNA,檢測RNA的純度和完整性。應用一步法SYBR RT-PCR試劑盒擴增FAM83H-AS1基因,按照說明書設定反應條件。引物序列見表1。反應體系和反應條件參照說明書。根據內參基因GAPDH的表達進行歸一化后,應用比較Ct值法計算FAM83H-AS1的相對表達量,并基于相對表達量的平均值,將所有LUAD患者分為高表達組和低表達組。

表1 引物序列Tab.1 Primer sequences

1.2.2 細胞培養及轉染:所有細胞系均應用含10%胎牛血清的DMEM高糖培養基,置于5% CO2,37 ℃的條件下培養。將5×104個A549/CR細胞接種于6孔板中,培養24 h。按照說明書,應用Lipofectamine 3000將FAM83H-AS1抑制劑轉染入A549/CR細胞,培養5~6 h,更換培養基后繼續常規培養。

1.2.3 藥物敏感性檢測:分別用培美曲塞(0.5 μg/mL、1 μg/mL、5 μg/mL、10 μg/mL、20 μg/mL和50 μg/mL)和順鉑(5 μg/mL、10 μg/mL、20 μg/mL、50 μg/mL和75 μg/mL) 處理A549/CR細胞。然后,按照說明書使用CCK8試劑盒檢測細胞活力。酶標儀檢測每個樣本的吸光度(450 nm),并計算半數抑制濃度(half maximal inhibitory concentration,IC50)。

1.2.4 Western blotting:提取A549/CR細胞總蛋白,進行蛋白定量分析。取樣進行聚丙烯酰胺凝膠電泳,轉移到聚偏二氟乙烯膜上,4 ℃過夜封閉,與一抗(ABCC1抗體) 雜交,二抗孵育,化學發光,凝膠成像儀獲取圖像。利用Image J軟件對圖像中的條帶進行分析。

1.3 統計學分析

采用Graphpad prism 5軟件分析數據。每組實驗重復5次,數據以±s表示。差異比較采用單因素方差分析、t檢驗和χ2檢驗。P< 0.05為差異有統計學意義。

2 結果

2.1 FAM83H-AS1在LUAD中高表達

與NLT組織相比,LUAD組織中FAM83H-AS1的相對表達量顯著上調(圖1A,P< 0.001)。與PAEC細胞相比,在PC9和A549細胞中FAM83H-AS1的相對表達量明顯增加(圖1B,P< 0.001)。

LUAD組織中FAM83H-AS1的表達與患者的吸煙史和化療(培美曲塞和順鉑) 不敏感相關(P< 0.05),與年齡、性別和TNM分期無相關性(P> 0.05)。見表2。基于癌癥基因組圖譜(the cancer genome atlas,TCGA)數據庫的預后分析結果顯示,與FAM83H-AS1低表達的LUAD患者相比,FAM83H-AS1高表達的LUAD患者的生存時間更短,預后更差(圖1C,P< 0.05)。

表2 104例LUAD患者的FAM83H-AS1表達與臨床病理信息的相關性Tab.2 Correlation between FAM83H-AS1 expression and clinical pathological characteristics of 104 LUAD patients

圖1 FAM83H-AS1在LUAD中高表達Fig.1 High expression of FAM83H-AS1 in LUAD

2.2 FAM83H-AS1高表達與LUAD化療不敏感相關

與化療敏感組LUAD組織相比,不敏感組LUAD組織中FAM83H-AS1的表達顯著增加(圖2A,P<0.05)。如圖2B和2C所示,A549細胞對培美曲塞和順鉑的IC50分別為(2.17±0.58) μg/mL和(10.86±1.97)μg/mL,而A549/CR細胞對培美曲塞和順鉑的IC50分別 為(13.48±1.37) μg/mL和(48.72±3.85) μg/mL。A549/CR細胞對培美曲塞和順鉑的耐藥系數分別為6.21和4.49,其表現出對培美曲塞和順鉑較強的耐受性。而且,與A549細胞相比,A549/CR細胞中FAM83H-AS1的表達顯著上調(圖2D,P< 0.05)。

圖2 FAM83H-AS1高表達與LUAD患者的化療不敏感相關Fig.2 High-expression of FAM83H-AS1 is related with insensitivity to chemotherapy in LUAD

2.3 沉默FAM83H-AS1提高A549/CR細胞對培美曲塞和順鉑的敏感性

實時定量PCR檢測證實轉染sh-FAM83H-AS1能夠顯著降低A549/CR細胞中FAM83H-AS1的表達(圖3A,P< 0.05)。與對照組相比,FAM83H-AS1沉默將A549/CR細胞對培美曲塞的IC50由(14.13±1.33) μg/mL降為(6.71±0.75) μg/mL(圖3B,P< 0.05),將對順鉑的IC50由(48.21±4.27) μg/mL降為(20.16±2.57) μg/mL(圖3C,P< 0.05)。沉默FAM83H-AS1提高了A549/CR細胞對培美曲塞和順鉑的敏感性。

圖3 沉默FAM83H-AS1提高A549/CR細胞對培美曲塞和順鉑的敏感性Fig.3 Silencing of FAM83H-AS1 enhances pemetrexed and cisplatin sensitivity of A549/CR cells

2.4 沉默FAM83H-AS1降低A549/CR細胞中的ABCC1蛋白的表達水平

基于TCGA的數據庫,應用生物信息學軟件GEPIA2進行基因表達相關性分析。結果顯示,FAM83HAS1與ABCC1基因的表達在LUAD中呈正相關(圖4A,P< 0.01)。而且,沉默FAM83H-AS1能夠抑制A549/CR細胞中ABCC1蛋白的表達(圖4B,P< 0.05)。

圖4 沉默FAM83H-AS1降低A549/CR細胞中的ABCC1蛋白的表達水平Fig.4 Silencing of FAM83H-AS1 decreases ABCC1 protein expression level in A549/CR cells

3 討論

近年來,諸多腫瘤學研究證實非編碼RNA參與了包括LUAD在內的多種腫瘤化療耐藥的發生和維持。尤其是lncRNAs,因其數量眾多、功能和機制復雜等特點,引起研究者的廣泛關注。例如,SLCO4A1-AS1通 過miR-4701-5p/NFE2L1途徑激活WNT通路,促進LUAD細胞的生長并誘導其對順鉑的耐藥[8];LINC00485作為分子海綿結合microRNA-195調節其靶基因CHEK1,進而降低LUAD細胞對順鉑的化療敏感性[9]。

本研究結果顯示,FAM83H-AS1在LUAD中高表達。FAM83H-AS1的異常高表達與LUAD患者吸煙史及化療不敏感有關,而且其高表達與LUAD患者的不良預后相關。這些提示FAM83H-AS1參與了LUAD的化療耐藥,可能發揮癌基因的作用。

本研究還發現FAM83H-AS1在化療(培美曲塞和順鉑) 不敏感的LUAD組織和細胞系中高表達,而且FAM83H-AS1的沉默顯著提升了化療耐藥細胞株A549/CR對培美曲塞和順鉑的敏感性。進一步證明了FAM83H-AS1參與了LUAD的化療耐藥。

生物信息學分析結果顯示,LUAD中FAM83HAS1與ABCC1基因的表達正相關。而且,沉默FAM83H-AS1能夠抑制A549/CR細胞中ABCC1蛋白的表達。ABCC1是一個經典的多藥耐藥相關基因,屬于ATP結合盒轉運蛋白超家族。ABCC1蛋白介導物質進出細胞,能在化療藥物起效前將其排出細胞外。諸多研究[10-11]證實ABCC1參與了幾乎所有惡性腫瘤的化療耐藥的發生,包括LUAD。據此,本研究認為FAM83H-AS1能夠通過正性調節ABCC1基因,促進化療藥物從細胞中排出,導致LUAD化療耐藥的發生。

綜上,FAM83H-AS1在LUAD中高表達,且與LUAD患者的化療不敏感相關,FAM83H-AS1能通過正性調節ABCC1基因,參與LUAD化療耐藥的形成。本研究有助于明確LUAD化療耐藥發生的分子機制,亦能夠為LUAD的臨床綜合治療提供新靶點。

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