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白細胞分化抗原6與進展性慢性腎臟病的相關性研究*

2022-03-24 13:28:50黃海珍黃學意陸玉甘
廣西醫(yī)科大學學報 2022年2期
關鍵詞:進展分析模型

黃海珍,馮 濤,黃學意,陸玉甘,黎 偉

(廣西醫(yī)科大學第二附屬醫(yī)院腎內科,南寧 530007)

慢性腎臟?。╟hronic kidney disease,CKD)是指各種原因引起的腎臟結構和功能障礙等于大于3個月,是不可逆的、進展性的疾病[1]。CKD進展是功能性的腎單位減少和腎臟結構上腎小球硬化、腎小管萎縮、腎間質炎癥浸潤和纖維化的過程,其診斷主要依據(jù)臨床表現(xiàn)和有創(chuàng)的腎活檢,缺乏有效早期預測診斷指標。因此,尋找早期診斷的分子標志物對于改善CKD 的預后至關重要。白細胞分化抗原6(cluster of differentiation 6,CD6)是淋巴細胞的表面糖蛋白[2],在胸腺發(fā)育、T 細胞活化和免疫應答中起關鍵作用[3-4],屬于富含半胱氨酸的清道夫受體糖蛋白超家族[5]。有研究報道,CD6 與某些腫瘤的發(fā)生發(fā)展[6]和自身免疫性疾病[7]有密切的關系,與腎移植后進行性腎小管萎縮和腎間質纖維化相關[8]。目前CD6 在CKD 發(fā)生發(fā)展中的作用尚未有相關研究。本研究發(fā)現(xiàn)CD6 可作為CKD 進展的分子標志物,其作用機制可能是腎臟的免疫細胞浸潤,為預防CKD進展提供了重要依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 GEO 芯片數(shù)據(jù)處理和分析 應用R“GEOquery”包[9]從GEO 數(shù) 據(jù)庫(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)下載數(shù)據(jù)集GSE60861及相關臨床資料[10]。使用R“l(fā)imma”包[11]對表達數(shù)據(jù)進行矯正,組間歸一化處理。使用Wilcoxon 檢驗行基因差異表達分析。用R“clusterProfiler”包[12]對差異表達基因本體(gene ontology,GO)分析和通路富集分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)。使用CIBERSORT 工具篩選出免疫浸潤的樣本,行CD6與免疫細胞相關性分析。

1.2 單側輸尿管梗阻(unilateral ureteral obstruction,UUO)模型構建 6 周齡SPF 級C57BL/6 雄性小鼠,體重18~20 g,取自廣西醫(yī)科大學動物中心(許可證號:SYXK 桂2014—0003),所有手續(xù)均由廣西醫(yī)科大學動物倫理委員會批準。將小鼠置于光/暗周期為12 h,(23±1)℃和55%的濕度的環(huán)境,可自由獲取食物和水。隨機分為4組(n=5):假手術組(Sham)、術后7 d 組(UUO-7 d)、術后14 d 組(UUO-14 d)、術后21 d 組(UUO-21 d)。按照0.2 mL/10 g的劑量腹腔注射1.25%阿佛丁麻醉,取左旁正中切口暴露左側輸尿管,在其中上1/3 處游離輸尿管并結扎剪斷輸尿管。sham 組只游離輸尿管而不結扎。術后第7,第14,第24天,在麻醉狀態(tài)下迅速從小鼠身上獲取梗阻側腎臟。

1.3 實時熒光定量聚合酶鏈式反應(RT-qPCR)檢測腎組織的CD6 和TGFβ1 相對表達量 使用TRIzol Reagent 提取腎組織總RNA,取1 μg 總RNA進行反轉錄成cDNA,對CD6、TGFβ1行RT-qPCR擴增。采用2-△△Ct法計算相對表達量。

1.4 統(tǒng)計學方法 本文所有統(tǒng)計分析均使用R 軟件(版本4.0.2)或SPSS(版本22.0)。采用Kaplan-Meier法比較的總生存率;采用Cox回歸分析風險因素;采用R“timeROC”包繪制ROC 曲線;采用Pearson 和Spearman 相關分析進行相關性分析;以P<0.05為差異具有統(tǒng)計學意義。

2 結果

2.1 CD6與CKD進展的相關性分析 隊列在獲取腎組織開始隨訪,時間為3~151個月,隊列平均年齡47.03 歲,男性占58.8%,腎小球濾過率平均值約63.57 mL/min/1.73 m2。CKD 進展定義為在隨訪時間內達到終末期腎病或者血肌酐翻倍,而未達到終末腎病或是血肌酐翻倍的為穩(wěn)定組。與CKD 穩(wěn)定組相比,CD6 mRNA 在進展組中表達水平升高;在不同CKD 分期的CD6 mRNA表達水平有統(tǒng)計學差異(圖1A~圖1B)。以CD6 mRNA的中位數(shù)為界值,將GES60861隊列分為CD6 高、低表達兩組。Kaplan-Meier 顯示兩組的總生存率有差異,ROC 曲線下面積(AUC值)1年、3年、5年分別達到0.877、0.853和0.948(圖1C~圖1D)。單因素COX 分析出性別、肌酐和CD6 與CKD 進展顯著相關(表1),在多因素COX 模型中,CD6 mRNA 升高是CKD 進展的危險因素(HR=3.673,P<0.001),見表2。

圖1 GSE06861中CD6表達水平與CKD臨床特征的相關性分析

表1 CKD病程進展危險因素的單因素COX回歸分析

表2 CD6與性別、血肌酐的多因素COX回歸分析

2.2 差異基因的GO 和KEGG 分析 以| log2FC |>1.0 且P<0.01 為標準,在CD6 高、低表達的兩組樣品中篩查出了76個差異基因。GO分析表明差異基因主要參與免疫相關反應(圖2A)。在KEGG 富集分析,以校正后P<0.05 為標準,共富集了到33 條KEGG 信號通路,除外關于腫瘤和其他疾病特有通路,主要涉及Th1/Th2、Th17 等淋巴細胞分化、細胞黏附分子和NF-κB 等免疫炎性反應相關性的信號通路(圖2B)。

圖2 差異表達基因的GO和KEGG分析

2.3 CD6與腎臟免疫細胞浸潤相關 使用CIBERSORT 篩選出18 個顯著免疫浸潤樣本的表達矩陣,可見各類T 細胞、B 細胞和巨噬細胞等免疫細胞浸潤,免疫細胞間存在相關性。CD6 與CD8+T 細胞、M1 型巨噬細胞和γδT 細胞呈正相關關系,與幼稚CD4+T 細胞和靜止的NK 細胞呈負相關關系(P<0.05),見表3。

表3 GSE60861隊列中CD6與免疫細胞的相關性

2.4 UUO 纖維化模型驗證結果 在UUO 小鼠模型中輸尿管結扎的腎臟明顯膨脹,腎皮質被壓迫萎縮(圖3A);相對Sham組,UUO-7 d組、UUO-14 d組及UUO-21 d 組CD6 mRNA 表達水平升高,其中在UUO-21 d組中表達水平最高(圖3B)。TGF β1在腎小管纖維化的機制中起著核心作用,CD6 mRNA與TGF β1呈正相關關系(r=0.900,P<0.001,見圖3C)。

圖3 實驗驗證CD6在纖維化模型中表達水平

3 討論

越來越多證據(jù)表明免疫浸潤和炎癥反應在CKD的發(fā)生發(fā)展中起著重要的作用。目前,已有研究篩選了與CKD 腎組織免疫細胞浸潤相關的基因[13-14],但在免疫相關基因與CKD 進展的相關性研究仍較少。本研究利用公共數(shù)據(jù)庫的芯片數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn)了免疫相關性分子CD6是CKD 進展的分子標志物,與免疫細胞浸潤和炎性反應密切相關。腎小管間質萎縮、炎癥浸潤和纖維化是CKD進展的病理性標志。UUO 模型是研究腎小管間質纖維化的經(jīng)典模型[15],本研究通過構建UUO 小鼠模型,驗證了在纖維化模型中CD6 mRNA的表達水平升高,與TGFβ1 呈正相關關系。本研究發(fā)現(xiàn)CD6 可作為早期識別CKD進展的分子標志物,其可能通過免疫浸潤介導腎小管纖維化影響CKD 發(fā)生發(fā)展,對預防CKD進展提供重要思路。

早在19 世紀80 年代,CD6 被認為淋巴細胞表面受體之一,已知的兩種CD6配體CD166和CD318在免疫細胞和其他各種細胞類型中廣泛表達,包括各種上皮和間充質細胞類型以及許多腫瘤細胞,并參與其生理病理過程[16]。淋巴T細胞和巨噬細胞的活化在腎纖維化中起著重要的角色。研究報道,CD6 過表達可促進T 細胞的增殖和分化為Th1/Th17細胞加速免疫反應[17-18]。在本研究中,在GO功能分析中主要參與淋巴細胞的活化及細胞分子黏附作用,KEEG 主要涉Th1/Th2 和Th17 細胞分化及NF-κB 炎性反應信號通路。另一方面,CIBERSORT 分析發(fā)現(xiàn)CD6 與CD8+T 細胞、M1 型巨噬細胞、γδT細胞呈正相關關系,與幼稚CD4+細胞和靜止的NK細胞呈負相關關系。這與既往研究結果相一致,這在一定程度上說明了CD6可能是通過調節(jié)腎臟局部淋巴T細胞和巨噬細胞等免疫細胞的活化和慢性炎性反應促進CKD進展。

這項研究也存在幾個局限性。首先,本研究用主要用公共數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)進行回顧性分析,有必要提供更多前瞻性的臨床試驗來驗證其臨床實用性。其次,CD6影響CKD進展的免疫相關機制是通過基因功能富集預測,尚未通過實驗來驗證。再次,本研究納入對象的疾病亞型是多方面的,本課題組知道不同亞型疾病的發(fā)病機制是不同的,可能存在混雜因素。

綜上,CD6 是CKD 進展的分子標志物,其作用機制可能與免疫細胞的浸潤有關,為改善CKD預后提供了重要線索。目前CKD 免疫功能障礙與病程進展的潛在機制尚未明確,值得進一步研究。

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