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環狀RNA circCDYL對肝細胞癌遷移和侵襲的影響

2022-04-15 13:39:00王海雨
國際檢驗醫學雜志 2022年7期
關鍵詞:差異水平實驗

王海雨,王 然

南京醫科大學附屬淮安第一醫院醫學檢驗中心,江蘇淮安 223001

超過90%的人類轉錄體不具備蛋白質編碼能力,但可以轉錄為非編碼RNA(ncRNA),包括微小RNA(miRNA),長鏈非編碼RNA(lncRNA)和環狀RNA(circRNA)[1]。circRNA由前體mRNA反向剪接而成,具有環形共價閉合結構,對核酸外切酶的耐受性更高,因而具有更高的穩定性[2]。研究人員已在各種生物體中鑒定出數千種circRNAs,它們在許多疾病(尤其是各類癌癥)中起到了關鍵作用[3-6]。circRNA通過與miRNA結合充當“miRNA海綿”,通過影響其對目的轉錄體的降解發揮間接調控的作用。轉錄組數據分析發現:環狀Y樣結構域(circCDYL)與RNA結合蛋白(RBP)的相互作用促進膀胱癌細胞的增殖和轉移,且與患者的不良預后相關[7-8]。目前關于circCDYL在肝細胞癌(HCC)中的作用尚未完全闡明,故本研究探討了HCC組織及癌旁組織中circCDYL的表達差異,同時分析了HCC組織中circCDYL的表達與患者臨床資料的關系及對預后的影響,運用體外細胞實驗驗證了circCDYL對HCC遷移和侵襲能力的影響。

1 材料與方法

1.1標本及細胞系來源 cDNA芯片(包括90對HCC組織和癌旁組織標本提取RNA后逆轉錄為cDNA)由芯超生物科技有限公司提供,包括完整的臨床/病理參數及隨訪資料,手術時間從2007年6月至2008年11月,隨訪截至2012年3月,隨訪期間死于HCC的患者32例,患者術前均未接受任何治療。4株HCC細胞(HepG2、QGY-7703、MHCC97-H、SMMC-7721)和1株正常肝臟上皮細胞(LO2)由中科院生物化學研究所(上海)提供,細胞在含有10% 胎牛血清(FBS)的DMEM培養基、37 ℃、5% CO2孵育箱中培養。

1.2方法

1.2.1circCDYL表達水平檢測 使用總RNA抽提試劑提取HCC細胞株及正常肝臟上皮細胞的RNA,之后逆轉錄為cDNA。使用qPCR試劑在伯樂T100 PCR儀上檢測細胞株和芯片中circCDYL表達水平。以甘油醛3-磷酸脫氫酶(GAPDH)作為circCDYL的內參,測得circCDYL與GAPDH的閾值循環數(Ct),運用2—ΔΔCt公式計算circCDYL的相對表達量。以上檢測重復5次。將90例HCC組織按circCDYL相對表達水平排序,低于中位數定義為circCDYL低表達組,高于中位數則定義為circCDYL高表達組。

1.2.2細胞轉染 敲減circCDYL的3條小干擾RNA(siRNA)由吉凱基因有限公司(上海)提供。將4×105個細胞均勻鋪在6孔板中孵育,當細胞密度達到60%~70%時,轉染siRNA和陰性對照序列,孵育48~72 h后收集細胞并提取RNA,檢測circCDYL的敲減效率。circCDYL、GAPDH引物及siRNA寡核苷酸序列見表1。

表1 實驗所用引物及siRNA寡核苷酸序列

1.2.3細胞遷移及侵襲實驗 使用無血清DMEM培養基調整細胞密度約5×105~6×105個/mL,吸取300 μL懸液加入上層小室中(侵襲實驗在遷移實驗基礎上多鋪一層凝膠),加入500 μL 10% FBS培養液在下層小室;孵育24 h,將未通過孔篩的細胞拭去,而將通過孔篩的細胞使用甲醛固定、結晶紫染色,在普通光學顯微鏡下計數。

2 結 果

2.1HCC組織與癌旁組織中circCDYL表達水平的比較 HCC組織中circCDYL相對表達水平(4.01±1.63)高于癌旁正常組織(0.74±0.21),差異有統計學意義(t=17.37,P<0.05)。

2.2HCC組織中circCDYL相對表達水平與患者臨床/病理參數的關聯性 HCC組織中circCDYL表達與HBsAg狀態、血管浸潤、肝硬化結節個數、淋巴結轉移、TNM分期、復發情況、PD-L1和CTLA-4狀態有關聯,差異均有統計學意義(P<0.05),而與患者性別、年齡、腫瘤最大徑及血清AFP水平等均無關聯(P>0.05),見表2。

表2 HCC組織中circCDYL的相對表達水平與患者臨床/病理參數的關聯性[n(%)]

續表2 HCC組織中circCDYL的相對表達水平與患者臨床/病理參數的關聯性[n(%)]

2.3circCDYL對HCC細胞系遷移和侵襲能力的影響 對4株HCC細胞(HepG2、QGY-7703、MHCC97-H、SMMC-7721)和1株正常肝臟上皮細胞(LO2)中circCDYL表達進行檢測,結果發現4株HCC細胞中circCDYL相對表達水平(4.50±0.30、2.93±0.21、2.37±0.15、1.60±0.10)均高于正常肝臟上皮細胞(1.00±0.20),差異均有統計學意義(P<0.05),見圖1A。選取HepG2轉染3個siRNA用以敲減circCDYL,其中siRNA-1效果最顯著(P<0.001),見圖1B。選擇siRNA-1轉染的細胞進行后續遷移、侵襲實驗,敲減circCDYL后,HepG2細胞的遷移和侵襲能力均下降,差異均有統計學意義(P<0.05),見圖2。

注:A為4種HCC細胞與正常肝臟上皮細胞(LO2)中circCDYL相對表達水平比較;B為HepG2細胞系轉染siRNA后敲減效果的比較;***表示P<0.001,**表示P<0.01,*表示P<0.05。

注:A、C表示HepG2細胞轉染siRNA-1后遷移能力明顯下降;B、D表示HepG2細胞轉染siRNA-1后侵襲能力明顯下降;***表示P<0.001;si-NC為對照;si-circCDYL為采用siRNA-1敲減circCDYL;放大倍數為100。

2.4circCDYL相對表達水平與HCC患者預后之間的關聯性 經生存分析,對TNMⅠ~Ⅲ期(作為整體)、Ⅰ期、Ⅱ期的HCC患者分別進行生存分析,circCDYL高表達患者總體生存率均低于低表達患者,差異具有統計學意義(Log-rankχ2=52.06、30.65、15.49,P<0.05);circCDYL高表達患者無復發生存率均低于低表達組,差異有統計學意義(Log-rankχ2=38.24、28.13、7.63,P<0.05);見圖3。Cox比例風險模型探討影響HCC患者不良預后的暴露因素,發現circCDYL高表達是HCC患者不良預后的獨立危險因素(HR=22.712,P<0.05),見表3。

注:A、D為對80例TNMⅠ~Ⅲ期HCC患者進行的評估;B、E為對39例TNMⅡ期患者進行的評估;E、F為對36例Ⅲ期患者進行的評估。

表3 Cox回歸分析影響HCC患者預后的因素

續表3 影響HCC患者預后的暴露因素相關Cox回歸分析

3 討 論

本研究發現,HCC組織中circCDYL相對表達水平顯著高于癌旁組織,這表明circCDYL可能參與了HCC的發生,其異常表達可能促進肝臟正常上皮細胞過度增殖,其長期作用會促進腫瘤形成。腫瘤細胞發生轉移一般先侵襲上皮細胞基底面的附著層或微血管,再經過淋巴循環或血循環形成遠處轉移,因此腫瘤細胞亞型是否具有侵襲性、有無局部淋巴結轉移或血管浸潤對預后判斷起到十分關鍵的作用[9-12]。進一步分析發現:circCDYL表達與淋巴結轉移和局部血管浸潤有關;體外遷移和侵襲實驗驗證circCDYL能促進HCC細胞的遷移和侵襲,提示circCDYL可能有促進腫瘤細胞發生局部侵襲及遠處轉移的作用,同時circCDYL表達水平與患者TNM分期及復發情況也有關。TNM分期和復發是反映腫瘤進展的重要指標,TNM分期越高,患者預后往往不佳[13-14],治療后腫瘤復發往往會導致患者的生存期大幅縮短,對患者的預后有十分不利的影響[15-16],以上結果提示circCDYL與HCC的發展密切相關。circCDYL的表達與PD-L1和CTLA-4呈陽性有關,PD-L1和CTLA-4是腫瘤逃脫免疫監視和清除的重要分子,目前新興腫瘤治療的靶點多針對PD-L1和CTLA-4[17-18],提示circCDYL可能通過促進PD-L1和CTLA-4表達促進HCC發生、發展,該推論需要進一步的機制研究來驗證。既往研究表明,circCDYL具有促進套細胞淋巴瘤細胞增殖的功能[19];但本研究發現circCDYL表達與腫瘤最大徑無關,推測circCDYL與HCC細胞增殖無關,這種差異可能由于組織特異性造成的。

本研究針對不同TNM分期的HCC患者進行分析,發現circCDYL高表達者的總體生存率和無復發生存率均低于低表達者,同時多因素回歸分析發現HCC組織中circCDYL高表達是促進患者不良預后的獨立危險因素。以上結果提示circCDYL對HCC患者預后判斷可能具有一定價值,其高表達提示HCC患者預后不良。

綜上所述,circCDYL在HCC組織中的表達水平顯著高于癌旁組織,其可能促進了HCC細胞的遷移和侵襲,后期仍需體內實驗的進一步驗證。其高表達提示HCC患者預后不良,有望成為新的診斷和預后標志物。

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