戎玉蘭,史成梅,郭向陽
(北京大學第三醫院 麻醉科, 北京 100191)
DNA損傷在發育-衰老、神經退行性疾病以及腫瘤等病生理過程中發揮著重要的作用。近來很多研究發現,腦細胞DNA損傷和修復之間的失衡會造成神經元損傷,并影響多種神經退行性疾病的發生發展。多種內源和外源性因素會造成DNA損傷。不同刺激引起不同的DNA損傷類型,主要有堿基錯配、堿基缺失、DNA單/雙鏈斷裂、DNA交聯等,其中雙鏈斷裂(double-strand break,DSB)是最有害的一種損傷[1]。每個細胞每天大約會經歷10 000次單鏈斷裂損傷和10~50次DSB。如果DSB沒有被修復或錯誤修復的話,會直接導致細胞死亡。DSB可通過兩種途徑進行修復[2]:同源重組(homologous recombination,HR)和非同源末端連接(nonhomolog-ous ending joining,NHEJ)。增殖期細胞可以借助姐妹染色體通過HR進行精確修復DSB,而有絲分裂期后細胞中的DSB則主要通過NHEJ修復[3]。有效的修復對于維持神經元功能至關重要,并且編碼DNA修復蛋白的基因與神經退行性疾病存在千絲萬縷的聯系[4]。
圍術期認知功能障礙(perioperative cognitive dysfunction,POCD)是一種常見的手術麻醉并發癥,以記憶、注意力、語言理解和社交能力的損傷為特征,可導致患者生活質量下降,延長住院周期、增加病死率,在老年人中的發病率高達25%~40%[5],發生機制包括神經炎性反應、病理蛋白沉積、突觸功能障礙、線粒體功能障礙、DNA損傷與修復失衡、持續的腦損傷等,其中,DNA損傷及修復失衡是極其重要的一種機制。本文將以DNA損傷修復過程中主要參與蛋白質的功能為重點闡明NHEJ修復機制,并簡介其在POCD中的意義。
NHEJ修復DSB的過程包括識別、聯會、末端加工和連接。DSB發生后,Ku異源二聚體(Ku70/Ku80)最先反應,它快速識別斷端并通過環狀結構與斷端結合,直接或間接招募NHEJ所需下游蛋白。同時Ku70/Ku80會迅速招募下游DNA蛋白激酶(DNA-dependent protein kinase catalytic submits,DNA-PKcs)至斷端,形成DNA-Ku-PKcs三元復合物,穩定斷端,并進行聯會。接著核酸酶Artemis被DNA-PKcs募集到DSB位點,剪切斷端形成適合連接的結構。最后需要Ligase Ⅳ-XRCC4復合體、XLF和PAXX執行連接功能。
Ku二聚體由Ku70和Ku80組成,由基因XRCC6和XRCC5編碼,根據來源患者的姓名首字母和蛋白質的大小(70 ku和83 ku)命名。首次發現是一種自身免疫抗原,其與DSB斷端有高度親和性[6]。兩個蛋白含有相同的核心結構和N末端,只有C末端結構不同。它們可以組成穩定的環狀結構套在DSB末端并向內滑動,通過Ku80 C末端與DNA-PKcs相結合[7]。Ku70/Ku80在DSB末端的加載是整個NHEJ修復過程中至關重要的一步。它不僅可以像樞紐一樣與下游的修復蛋白合作,還可以與53BP1共同作用保護DSB末端免受核酸外切酶的加工[8],并阻止其他修復方式的啟動,比如HR等,從而起到選擇修復通路的作用。NHEJ修復通路的大部分核心蛋白都與Ku產生相互作用[9]。
DNA-PKcs分子質量高達469 ku,具有激酶活性。DNA-PKcs的N末端可以形成一個鉗子樣結構,為DNA提供結合通道。它與斷端結合可發生自磷酸化,或被共濟失調-毛細血管擴張突變基因(ataxia telangiectasia-mutated gene,ATM基因)編碼的ATM蛋白激酶或Rad-3相關蛋白(ATM and Rad-3 related,ATR)磷酸化,也可以磷酸化Artemis并與之結合,起到促進核酸酶活性的作用,其主要作用就是調節并加速NHEJ修復通路[10]。DNA-PKcs不僅在NHEJ修復通路中發揮著重要的作用,也參與調節DSB位點NHEJ和HR修復通路的選擇[11]。
被識別的DNA斷端經過加工,才能進行下一步的連接,通常參與的蛋白質具有多種功能。Artemis具有5′-3′核酸外切酶活性,在體內、體外可被ATM、ATR或PKcs等多種蛋白激活,并且在不同的損傷條件下,會發生不同的激活途徑。Artemis與PKcs結合后,PKcs自磷酸化后可激活Artemis內切酶活性,切割突出末端以及V(J)重組過程中形成的發夾結構[12]。Artemis不僅是NHEJ修復通路的重要核酸酶,它同時也在調節細胞周期以及DNA損傷反應中發揮重要的作用[13]。
Ligase Ⅳ只參與NHEJ修復通路,需要與XRCC4結合才能發揮作用。無論缺乏Ligase Ⅳ還是XRCC4都會出現對輻射敏感并且嚴重損害NHEJ修復通路[12]。XLF又稱為Cernunnos,雖然與XRCC同源序列有限,但因與XRCC4結構相似而得名,二者均以二聚體形式存在。在人類細胞中,只有XLF可與DNA-PKcs相互作用,并與DNA斷端結合形成核蛋白絲狀結構,起到支架作用,促進末端連接[14]。XLF不僅在NHEJ中起到重要作用,還可以穩定DNA的復制過程[15]。
保持基因的穩定性是每一個細胞的重要功能,因此每個細胞都具有大量高效的修復蛋白來保證基因穩定。當DNA損傷不能被修復或發生錯誤修復時,就會導致進行性的或持續的神經損傷,從而影響認知或運動功能[16-17]。研究提示,如果腦中DNA 損傷和修復失衡,會造成神經元損傷,學習和記憶受損,并且被證實參與了很多神經退行性疾病的病理生理過程,比如阿爾茨海默病、帕金森病以及肌萎縮性側索硬化癥等。POCD是一種與年齡相關的神經退行性疾病。課題組研究顯示,圍術期因素可以通過氧化應激反應,誘導中樞前額葉區DSB發生,相關標志物蛋白γH2A.X的表達顯著增加,并在細胞核顯著聚集[18]。麻醉暴露還可以抑制中樞海馬區的P53水平,從而影響DSB程度,P53又可以影響NHEJ修復通路中的關鍵因子,從而調控NHEJ修復和細胞存活,另外NHEJ與P53之間也存在相互作用[19]??梢妵g期因素可以影響DNA損傷和NHEJ修復之間的動態平衡,從而影響POCD的發生。
損傷和修復之間的失衡造成的DSB的積累是影響POCD的核心。減少DSB的發生,促進NHEJ,則成為干預、治療POCD的新靶點。已經發現通過補充葉酸或S-腺苷甲硫氨酸可以抑制DSB等DNA損傷的發生。因此,通過抑制氧化應激反應等途徑減少DSB的發生,可以降低POCD的發生率。對于脆弱腦細胞,NHEJ相關蛋白表達減少,從而造成DSB積累[20],故如何促進NHEJ成為干預POCD的難點。
有關NHEJ的核心蛋白的研究已經很多,但是每個蛋白的具體工作機制還有很多需要探究,并且也有很多研究對NHEJ修復通路的經典過程提出了質疑和挑戰。新的研究提示XRCC-XLF是NHEJ修復通路的新核心蛋白,Ligase IV并不是NHEJ修復通路的必需蛋白質,XLF-XRCC復合體可以在DSB末端形成袖套結構,并在DNA鏈上滑動,成功高效的修復DSB,不依賴于Ligase IV的存在[21]。細胞試驗提示,與傳統的NHEJ序貫修復過程相反,在損傷初期,DSB位點就會形成一個超級NHEJ復合體,其中包括DNA-Ku-PKcs和連接蛋白,這些蛋白既可以獨立發揮作用,也可以相互促進,共同完成修復[22]。新的NHEJ調節復合物Shieldin(REV7、RINN1、RINN2、RINN3新型復合體)在2018年由多個課題組鑒定發現,它與CTC1-STN1-TEN1(CST)復合物相互作用,通過抑制DNA末端切除,促進NHEJ修復[23]。這些研究大大豐富了對NHEJ的認識。
雖然對于NHEJ修復通路的核心蛋白和機制已經研究的比較清楚,但其精確的作用方式及相互關系還存在很多空白:1)XRCC和XLF的C末端的結構還不是很清楚,在NHEJ中如何起到穩定作用?2)超級NHEJ復合體是否真的存在?3)POCD中,NHEJ修復通路是否受損?如何從修復角度進行干預,以影響POCD的發生和發展?
解決以上問題,需要結合蛋白組學、細胞生物學、有機化學等相關知識,深入研究NHEJ修復通路中的相關蛋白的空間結構,以及相互作用的順序與位點,探究NHEJ修復通路分子機制中的空白和疑惑。應用細胞、動物模型研究P53、γH2A.X等關鍵因子與NHEJ修復通路的相互作用,從而揭示DSB和NHEJ之間相互影響的分子機制。并開展相關臨床研究,探究脆弱腦功能患者的體液中,NHEJ修復通路相關蛋白的表達水平,以期能以NHEJ為核心,找到圍術期認知功能障礙的干預新靶點。