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沉默lncRNA DNAH8-AS1靶向miR-186-5p/YY1調控前列腺癌細胞的增殖和侵襲

2022-12-21 02:40:46程漢波劉加元鄧思文姚俊波高瑞輝
臨床與實驗病理學雜志 2022年11期
關鍵詞:前列腺癌實驗檢測

程漢波,劉加元,賈 波,張 鵬,鄧思文,姚俊波,高瑞輝

前列腺癌是嚴重威脅男性生殖健康的惡性腫瘤,其發病率和病死率呈逐年上升趨勢[1]。前列腺癌的臨床治療主要包括手術、化療和激素等治療,由于前列腺癌的早期臨床診斷較困難,且發現多已為中晚期,患者的預后較差[2-3]。長鏈非編碼RNA(long-chain non-coding RNA, lncRNA)是在人體細胞內高度保守的非編碼RNA,可能在前列腺癌的發生、發展中發揮癌基因或抑癌基因的功能[4-5]。lncRNA在前列腺癌組織中異常表達,下調或上調其表達可顯著影響前列腺癌細胞的生長和侵襲[6-7]。lncRNA DNAH8-AS1由830個核苷酸連接構成,其在細胞中的功能尚未見報道。miR-186-5p在前列腺癌、膀胱癌、胃癌等組織中呈低表達,可顯著抑制腫瘤細胞的增殖、化療抵抗、侵襲等行為[8-10]。本文探討lncRNA DNAH8-AS1在前列腺癌中的表達,分析其對前列腺癌細胞生物學行為的影響及對miR-186-5p的靶向調控作用,為前列腺癌的診療提供新的靶點。

1 材料與方法

1.1 材料前列腺癌細胞系PC-3、LNCaP、DU-145、C4-2B與正常前列腺上皮細胞RWPE-1組均購自中科院上海生科院細胞庫。lncRNA DNAH8-AS1 siRNA(si-DNAH8-AS1組)、陰性對照siRNA(Control組)、miR-186-5p mimic、NC mimic、熒光素酶報告載體(Wt-DNAH8-AS1、Mut-DNAH8-AS1、Wt-YY1、Mut-YY1),均購自上海吉瑪制藥公司。qRT-PCR試劑盒和TRIzol試劑盒,均購自美國Sigma公司。RPMI 1640培養基、胎牛血清、KSFM培養基,均購自美國Hyclone公司。MTT試劑盒購自上海生工生物公司;生物素標記的雜交探針購自廣州銳博生物公司。轉染試劑Lipofectamine 3000和Matrigel基質膠,均購自美國Invitrogen公司。雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒和Transwell小室購自美國Promega公司。一抗MARK4、YAP、TAZ、α-Tubulin、YY1均購自美國BD公司。

1.2 細胞培養及轉染用含10%胎牛血清的KSFM培養基培養RWPE-1細胞,用含10%胎牛血清的RPMI 1640培養基培養PC-3、LNCaP、DU-145、C4-2B,置于37 ℃、5%CO2培養箱中培養。轉染前收集LNCaP細胞接種于12孔板,待細胞融合至60%,以無血清RPMI 1640培養基稀釋si-DNAH8-AS1、Control組為100 nmol/L,以Lipofectamine 3000脂質體進行轉染,分別為si-DNAH8-AS1組和Control組。收集各組對數生長期LNCaP細胞進行后續研究。

1.3 生物信息學技術分析lncRNA DNAH8-AS1表達及靶向基因采用GEPIA數據庫分析lncRNA DNAH8-AS1在前列腺癌和癌旁組織中的表達及與前列腺癌臨床分期的關系;采用LncBase Predicted v.2軟件預測lncRNA DNAH8-AS1存在結合位點的miRNA。

1.4 原位雜交實驗檢測lncRNA DNAH8-AS1在前列腺癌和癌旁組織中表達采用石蠟包埋組織,連續3 μm厚切片,脫蠟。采用4%過氧化氫對內源性過氧化物酶進行滅活,經2%多聚甲醛溶液在室溫下固定20 min。加入30 μL生物素標記的雜交探針,42 ℃孵育過夜。滴加辣根過氧化氫酶標記的鏈霉親和素,在37 ℃濕盒中孵育4 h。滴加DAB試劑進行DAB顯色,采用蘇木精試劑進行復染,乙醇脫水后采用中性樹脂封固。

1.5 qRT-PCR檢測細胞中miR-186-5p、DNAH8-AS1和YY1 mRNA的表達TRIzol試劑盒提取前列腺癌細胞、正常前列腺上皮細胞和轉染后LNCaP細胞總RNA,通過超微量分光光度計測定RNA濃度,通過反轉錄試劑盒合成cDNA。配制PCR反應體系,以GAPDH為內參檢測lncRNA DNAH8-AS1和YY1 mRNA的表達,以U6為內參檢測miR-186-5p的表達。lncRNA DNAH8-AS1上游引物:5′-ACACCAACAGACACCAGCAG-3′,下游引物:5′-GGTTCAGCACTGTGGGTTTT-3′;GAPDH上游引物:5′-ACAACTTTGGTATCGTGGAAGG-3′,下游引物:5′-GCCATCACGCCACAGTTTC-3′;YY1上游引物:5′-ACGGCTTCGAGGATCAGATTC-3′,下游引物:5′-TGACCAGCGTTTGTTCAATGT-3′;miR-186-5p上游引物:5′-GCGGCGGCAAAGAATTCTCC-3′,下游引物:5′-ATCCAGTGCAGGGTCCGAGG-3′。采用2-ΔΔCt方法計算miR-186-5p、DNAH8-AS1和YY1 mRNA相對表達。

1.6 MTT法檢測敲減DNAH8-AS1對LNCaP細胞增殖的影響收集Control組和si-DNAH8-AS1組對數生長期LNCaP細胞,以每孔150 μL接種于96孔板。實驗分別在培養1、2、3、4、5天棄去培養基,加入15 μL質量濃度為5 g/L的MTT溶液,充分混勻,避光培養3.5 h,棄去上清;每孔加入130 μL的二甲基亞砜,充分混勻。通過酶標儀上檢測各孔在波長450 nm處的光密度值,代表LNCaP細胞增殖水平。

1.7 Transwell實驗檢測敲減DNAH8-AS1對LNCaP細胞侵襲的影響通過RPMI 1640培養基稀釋Matrigel膠,在Transwell上室加入200 μL稀釋后的Matrigel膠。收集Control組和si-DNAH8-AS1組對數生長期LNCaP細胞,制備無血清單細胞懸液,分別加入200 μL細胞懸液至Transwell上室,在下室加入500 μL含胎牛血清的RPMI 1640。恒溫培養箱培養24 h后,棉簽除去未穿過Matrigel膠的細胞,經5%多聚甲醛固定,0.3%結晶紫染液染色。洗去多余染液,晾干后于100倍顯微鏡下拍照,選取6個視野計數穿膠細胞數。

1.8 熒光素酶報告基因實驗檢測lncRNA DNAH8-AS1與miR-186-5p/YY1的靶向關系采用Lipofectamine 3000脂質體分別將Wt-DNAH8-AS1、Mut-DNAH8-AS1與miR-186-5p mimic、NC mimic共轉染到LNCaP細胞;采用Lipofectamine 3000脂質體分別將Wt-YY1、Mut-YY1與miR-186-5p mimic、NC mimic共轉染到LNCaP細胞。檢測NC組和miR-186-5p組LNCaP細胞中的相對熒光素酶活性,具體操作按雙熒光素酶報告基因實驗試劑盒說明書進行。

1.9 Western blot實驗檢測YY1蛋白和Hippo信號通路相關蛋白的表達收集Control組和si-DNAH8-AS1組對數生長期LNCaP細胞,加入細胞裂解液提取總蛋白,BCA法測定蛋白濃度,通過SDS-PAGE膠電泳目的蛋白,以半干膜轉膜法轉移至硝酸纖維素膜,加入10%脫脂牛奶封閉。加入一抗YY1(1 ∶2 000)、MARK4(1 ∶2 000)、YAP(1 ∶1 000)、TAZ(1 ∶1 000)、α-Tubulin(1 ∶3 000),置于冰箱內保存。加入二抗(1 ∶10 000),在室溫下保存3 h。加入ECL顯影液,在凝膠成像分析系統中曝光,通過Quantity One軟件分析蛋白條帶的灰度值。

2 結果

2.1 前列腺癌組織中lncRNA DNAH8-AS1的表達GEPIA數據庫顯示,與癌旁組織相比,lncRNA DNAH8-AS1在前列腺癌組織中呈高表達(P<0.01,圖1);lncRNA DNAH8-AS1表達水平與前列腺癌臨床分期呈正相關(P<0.05,圖2)。原位雜交檢測顯示,前列腺癌組織中lncRNA DNAH8-AS1的表達明顯高于癌旁組織(圖3)。

圖1 GEPIA數據庫顯示lncRNA DNAH8-AS1在前列腺癌和癌旁組織中的表達

圖2 GEPIA數據庫顯示前列腺癌中lncRNA DNAH8-AS1表達與臨床分期的關系

2.2 lncRNA DNAH8-AS1在前列腺癌細胞系中的表達qRT-PCR檢測結果顯示,與正常前列腺上皮細胞RWPE-1相比,lncRNA DNAH8-AS1在前列腺癌細胞PC-3、LNCaP、DU-145、C4-2B中呈高表達(P<0.05);其中lncRNA DNAH8-AS1在LNCaP細胞中的表達水平最高(P<0.01,圖4)。因此,用LNCaP細胞進行進一步研究。

AB

圖4 前列腺癌和正常前列腺上皮細胞中lncRNA DNAH8-AS1的表達

2.3 si-DNAH8-AS1敲減LNCaP細胞中lncRNA DNAH8-AS1的表達qRT-PCR檢測結果顯示,Control組和si-DNAH8-AS1組LNCaP細胞中lncRNA DNAH8-AS1表達分別為6.44±0.56和1.08±0.37。與Control組比較,si-DNAH8-AS1組LNCaP細胞中lncRNA DNAH8-AS1表達水平顯著降低(P<0.01)。

2.4 敲減lncRNA DNAH8-AS1表達與LNCaP細胞增殖的關系MTT法檢測結果顯示,與Control組相比,si-DNAH8-AS1組LNCaP細胞在轉染后第2、3、4、5天時增殖活力均顯著降低(P<0.05,圖5),表明敲減lncRNA DNAH8-AS1可抑制LNCaP細胞的增殖。

2.5 敲減lncRNA DNAH8-AS1表達與LNCaP細胞侵襲的關系Transwell實驗結果顯示,Control組和si-DNAH8-AS1組LNCaP細胞穿過Matrigel基質膠的細胞數分別是(63.39 ± 8.03)個和(23.94 ± 3.86)個。與Control組比較,si-DNAH8-AS1組侵襲細胞數明顯減少(P<0.01,圖6),表明敲減lncRNA DNAH8-AS1可抑制LNCaP細胞的侵襲。

圖5 敲減lncRNA DNAH8-AS1對LNCaP細胞增殖的影響

圖6 敲減lncRNA DNAH8-AS1對LNCaP細胞侵襲的影響:A.Transwell檢測侵襲細胞數;B.侵襲細胞數直方圖

2.6 lncRNA DNAH8-AS1靶向結合miR-186-5p/YY1用生物信息學軟件LncBase Predicted v.2軟件預測顯示:lncRNA DNAH8-AS1與miR-186-5p存在結合位點,miR-186-5p與YY1 mRNA存在結合位點(圖7)。雙熒光素酶報告基因實驗結果顯示:與NC組相比,miR-186-5p mimic顯著抑制Wt-DNAH8-AS1的熒光素酶活性(P<0.01),對Mut-DNAH8-AS1熒光素酶活性無明顯抑制作用(P>0.05,圖8A)。與NC組相比,miR-186-5p mimic顯著抑制Wt-YY1的熒光素酶活性(P<0.01),對Mut-YY1熒光素酶活性無明顯抑制作用(P>0.05,圖8B)。

圖7 lncRNA DNAH8-AS1、YY1 mRNA的結合位點:均含有與miR-186-5p互補的核苷酸序列

圖8 雙熒光素酶報告基因實驗:A.lncRNA DNAH8-AS1可互補結合miR-186-5p;B.YY1 mRNA可互補結合miR-186-5p

2.7 敲減lncRNA DNAH8-AS1對LNCaP細胞中miR-186-5p和YY1 mRNA表達的影響qRT-PCR檢測結果顯示,Control組和si-DNAH8-AS1組LNCaP細胞中miR-186-5p的表達分別為1.02±0.22和5.62±0.98,si-DNAH8-AS1組明顯高于Control組(P<0.01);Control組和si-DNAH8-AS1組LNCaP細胞中YY1 mRNA的表達分別為5.24±1.21和1.09±0.27,si-DNAH8-AS1組明顯低于Control組(P<0.01)。

2.8 miR-186-5p對LNCaP細胞中YY1 mRNA表達的影響qRT-PCR檢測結果顯示,NC組和miR-186-5p組LNCaP細胞中miR-186-5p的表達分別為1.04±0.37和8.91±1.27,miR-186-5p組明顯高于NC組(P<0.01)。NC組和miR-186-5p組LNCaP細胞中YY1 mRNA的表達分別為7.82±1.38和1.07±0.36,miR-186-5p組明顯低于NC組(P<0.01)。

2.9 敲減lncRNA DNAH8-AS1對YY1蛋白和Hippo信號通路相關蛋白表達的影響Western blot檢測結果顯示,敲減lncRNA DNAH8-AS1后,YY1蛋白表達下調,MARK4、YAP、TAZ等Hippo信號通路相關蛋白表達下調(圖9)。

圖9 敲減lncRNA DNAH8-AS1對LNCaP細胞中YY1和Hippo信號通路相關蛋白表達的影響

3 討論

大量lncRNA芯片研究顯示,lncRNA是前列腺癌早期診斷、預后評估的獨立分子標志物,廣泛參與組織細胞的再生和惡性轉化[11-12]。lncRNA表達失調影響前列腺癌的血管生成、激素抵抗、化療耐藥等生物學過程[13]。Cui等[14]研究表明,lncRNA AC245100.4在前列腺癌中表達上調,其主要定位于細胞質中,敲低lncRNA AC245100.4有效抑制前列腺癌細胞的增殖。Li等[15]研究表明,lncRNA BLACAT1在前列腺癌組織樣本和細胞系中表達下調,與其啟動子的甲基化程度相關,lncRNA BLACAT1可通過靶向吸附并降低miR-361的表達,抑制前列腺癌細胞的增殖。lncRNA可能作為前列腺癌的分子標志物和治療靶點,具有廣泛的臨床應用價值[16]。

lncRNA DNAH8-AS1在前列腺癌中的表達及對前列腺癌發生的調節機制并未闡明。本實驗發現lncRNA DNAH8-AS1在前列腺癌組織和細胞中均呈高表達,lncRNA DNAH8-AS1表達水平越高,患者的臨床分期越差,提示lncRNA DNAH8-AS1高表達可能與前列腺癌癌變過程有關。本組進一步研究顯示,敲降lncRNA DNAH8-AS1表達后,LNCaP細胞的增殖和侵襲能力均明顯下降,證實lncRNA DNAH8-AS1在前列腺癌發生過程中起癌基因的作用。

lncRNA能夠與miRNA互補配對結合,通過抑制miRNA表達,正向調控miRNA靶基因的表達,影響細胞的生命活動[17-18]。本組通過生物信息學網站預測lncRNA DNAH8-AS1可能競爭性吸附miR-186-5p,雙熒光素酶報告基因實驗驗證兩者的靶向結合。Liu等[19]研究表明,miR-186-5p在順鉑抗性的非小細胞肺癌組織和細胞(A549和H1299)中表達下調,miR-186-5p過表達可以抑制A549和H1299細胞的增殖、遷移和侵襲,促進凋亡率。Jin等[8]研究表明,miR-186-5p在前列腺癌組織和細胞中低表達,上調miR-186-5p能夠抑制前列腺癌細胞的增殖、遷移和侵襲。進一步研究顯示,抑制lncRNA DNAH8-AS1表達后,可逆轉miR-186-5p在前列腺癌細胞中的低表達;提示敲減lncRNA DNAH8-AS1可通過促進miR-186-5p表達,抑制前列腺癌LNCaP的細胞增殖和侵襲。本實驗通過生物信息學網站預測miR-186-5p可能競爭性吸附YY1 mRNA,雙熒光素酶報告基因實驗驗證兩者的靶向結合。本組miR-186-5p表達上調后,YY1基因表達顯著降低,進一步證實miR-186-5p靶向抑制YY1基因表達。YY1蛋白是一種包含鋅指結構的內源性轉錄因子,影響細胞的分化、增殖、轉移等行為[20]。近年研究顯示,YY1蛋白在前列腺癌等腫瘤中高表達,促進腫瘤細胞的增殖和侵襲,發揮癌基因的功能[21]。文獻報道YY1蛋白通過激活Hippo信號通路,促進腫瘤細胞的惡性生物學過程[22]。本組YY1蛋白表達下調后,MARK4、YAP、TAZ等Hippo信號通路相關蛋白表達下調,表明Hippo信號通路活化程度降低。

綜上所述,lncRNA DNAH8-AS1在前列腺癌中呈高表達,與臨床分期呈正相關。敲減lncRNA DNAH8-AS1通過靶向調控miR-186-5p/YY1基因表達,影響Hippo信號通路活化,抑制前列腺癌LNCaP細胞的增殖和侵襲。因此,lncRNA DNAH8-AS1有望成為前列腺癌潛在的早期診斷標志物和治療靶點。

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