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GREB1L基因突變致后天性單側腎萎縮一例報道并文獻復習

2023-02-01 09:04:12孫濤彭映潮史卓高春林夏正坤
中國全科醫學 2023年8期
關鍵詞:基因突變

孫濤,彭映潮,史卓,高春林,夏正坤

腎發育不良和腎發育不全(renal agenesis and hypodysplasia,RAH)是導致兒童慢性腎臟病的主要原因之一,包括腎發育不良、腎發育不全,具有高度遺傳異質性。突變的 GREB1L(growth regulation by estrogen in breast cancer 1-like)基因在2017年被首次報道為RAH易感基因[1]。作為新型易感基因,GREB1L基因突變導致RAH的報道較少,其確切發病率尚不明確。大型全外顯子測序研究顯示,2.8%的RAH患兒合并有GREB1L基因突變[1]。GREB1L基因突變所致的患者臨床表現異質性大,主要表現為先天性單側或雙側RAH,病變甚至可累及膀胱、子宮、骨骼、耳朵[2],遺傳上具有不完全外顯的特點。迄今為止,該基因的遺傳和表達特點仍不清楚。本文報道1例GREB1L基因突變患兒的臨床特征和遺傳特點,有利于加深臨床醫生對該基因的認識。本研究通過中國人民解放軍東部戰區總醫院倫理委員會批準(批準文號:2021NZGKJ-023),患兒監護人均簽署知情同意書。

1 病例簡介

患兒,男,5歲2個月,因“反復蛋白尿3年余”于2021-04-14就診中國人民解放軍東部戰區總醫院。2018年無明顯誘因出現全身水腫伴尿量減少于外院就診,查24 h尿蛋白定量4.864 g,血生化示:白蛋白14.9 g/L(參考范圍:40~55 g/L),總膽固醇11.02 mmol/L(參考范圍:0~5.18 mmol/L),診斷為“腎病綜合征(nephrotic syndrome,NS)”,外院給予足量醋酸潑尼松誘導治療,足量激素治療4周,尿蛋白未轉陰,加用環孢素口服液早晚各40 mg治療,1周后尿蛋白轉陰。其后激素及環孢素按規律減量,減至小劑量時易復發,每年復發1~2次。病程中定期復查發現右腎進行性萎縮,左側腎臟大小正常,行泌尿系統CT及血管造影等檢查排除了血栓、尿路梗阻、腫瘤及結核等繼發因素所致的后天性腎萎縮。2021-04-14因尿蛋白再次復發,至本院兒科門診就診,查腎臟超聲示:右腎65 mm×25 mm,左腎大小正常。入院診斷:(1)NS;(2)右腎萎縮。入院查體:身高110 cm,體質量22 kg,智力正常,心肺查體無明顯異常,雙下肢輕度水腫。

入院完善相關檢查,腎臟超聲示:右腎,上下徑63 mm,左右徑29 mm;左腎,上下徑96 mm,左右徑39 mm。腎臟發射單光子計算機斷層掃描儀(ECT)檢查示:(1)右腎體積偏小,右腎腎小球濾過率(GFR) 28.3 ml/min;(2)左腎GFR 93.6 ml/min;考慮右腎功能不全。全腹CT示:右腎萎縮,右腎血管未見狹窄,未見局部壓迫。

因患兒出現右腎進行性萎縮,已排除繼發因素所致,故高度懷疑可能存在基因突變。為進一步明確病因,經患兒家長同意后,取患兒及父母外周靜脈血各2 ml,使用北京智因東方公司全基因組測序方法進行測序,結果顯示患兒存在GREB1L基因c.4688A>G雜合突變,突變源自母親,但母親尚無臨床表型。

該患兒GREB1L基因的突變在第18號常染色體19088505位置的第4 688位堿基。該處在正常情況下為腺嘌呤(A),先證者的父親表型正常且基因型與野生型相同,而其母親雖表型正常但基因發生改變,由A突變成鳥嘌呤(G)并遺傳給后代。先證者此處的堿基由A變異成G,使得其第1 563位氨基酸由天冬酰胺(Asn)變為絲氨酸(Ser),為錯義突變,該位點為A/G雜合,見表1、圖1。該突變在先證者上的變異深度與總深度的比值為563/1 174,其父親為野生型,比值為0/729;而其母親為雜合型,比值為307/590。

表1 全基因測序顯示基因變異結果Table 1 Whole genome sequencing shows the results of gene variation

圖1 患兒GREB1L基因c.4688A>G雜合突變及家系驗證Figure 1 Heterozygous mutation of GREB1L gene c.4688A>G of this child case and pedigree verification

致病性分析:根據美國遺傳學及基因組學學會(ACMG)指南(2015年)[3],該病例基因錯義變異被評級為可能致病(likely pathogenic),致病證據:PM1+PM2+PP2+PP3。中等致病證據PM1:變異位于致病熱點區(突變左右10 bp范圍內存在3個以上有害突變);中等致病證據PM2:在所有正常人群數據庫中頻率<0.000 5,為罕見變異;支持致病證據PP2:在GnomAD數據庫中屬于z-score≥3.09的基因突變;支持致病證據PP3:多種蛋白質危害預測軟件(Polyphen2和mutationtaster等)預測出變異對基因(基因產物)有影響。本例患兒臨床表現符合GREB1L基因突變相關的部分臨床特征,因該基因突變不完全外顯,或可解釋母親攜帶同樣突變基因但表型正常的現象。以上均提示本例GREB1L基因變異的危害性與患兒表型存在相關性。

2 討論

本研究中患兒就診時以NS、右腎萎縮為主要表現,不明原因腎萎縮提示可能為復雜的遺傳性疾病。經全基因組測序技術確診存在GREB1L基因突變。近幾年,GREB1L基因被鑒定是RAH的致病新基因。2017年BROPHY等[1]首次在2個腎發育不全的家系中發現了GREB1L基因變異,通過CRISPR/Cas9技術將變異引入斑馬魚和小鼠模型并證實GREB1L基因變異和腎發育不良相關。

繼2017年以來,全球共報道了76個GREB1L基因突變位點[2,4-7],攜帶致病突變的個體可能存在各種系統器官的發育異常,包括腎臟、膀胱、子宮、骨骼、耳朵[2]。本報道的先證者及其母親存在相同的GREB1L基因雜合突變位點(c.4688A>G),目前未見有關此突變位點的文獻報道,可能擴展了與RAH相關基因突變譜。WANG等[4]在一個中國家系中發現GREB1L基因雜合突變,先證者為2歲女孩,臨床表現為右腎萎縮,祖父患左側腎萎縮,父親為致病基因攜帶者,但無臨床表現。HERLIN等[8]在一個家系中發現了一個GREB1L的共分離錯義突變,該家系2名女性表親有生殖系統發育不全合并單側腎發育不全,1名男性親屬單側腎發育不全,還包含1例因雙側腎發育不全而未能出生的男性胎兒。SCHRAUWEN等[6]報道了1例GREB1L基因突變合并先天性內耳畸形、聽力異常,但缺乏腎臟系統異常表現。臨床表現的異質性說明了GREB1L基因表達的復雜性。即便攜帶相同致病變異位點,患者的臨床表現可能不完全相同。

GREB1L基因的遺傳方式為常染色體顯性遺傳,具有不完全外顯性。同一家系中即便多人攜帶同樣的雜合變異,有人癥狀嚴重,有人癥狀輕微,有人無臨床表現[9-10]。本病例先證者出現右腎萎縮,攜帶相同突變位點的母親無臨床表型,與國外相關報道發病特點相符合,本研究認為GREB1L雜合變異可能需要額外的遺傳因素或環境因素來實現完全外顯率。HERLIN等[11]認為同卵雙胞胎存在不同表型也一定程度上支持環境病因學,其還指出GREB1L變異基因只有來自母親時,才會出現表型[8]。但有報道發現如果GREB1L的突變來自父親,也可出現腎發育不良表型,但死亡率更高[5]。據統計,約75%的病例中的變異基因源自母親,這種母性偏差可能與基因印跡有關,還有可能是由于GREB1L變異對男性生育能力影響更大,導致父系遺傳率較低[8-9]。

GREB1L基因變異導致RAH的機制尚未明確。有研究表明GREB1L基因是視黃酸受體基因的共激活因子,而視黃酸參與胚胎發育過程中的多種生物過程,GREB1L基因的表達對脊柱動物腎臟系統的細胞分化、形態發生和細胞穩態有重要影響[11]。DE TOMASI等[9]使用RNA原位雜交技術通過原位雜交,證實了GREB1L基因在小鼠胚胎期的腎源性區表達,提示GREB1L基因在小鼠和人類的胚胎期腎臟發育起著重要作用。目前多認為GREB1L基因與先天性RAH相關,現有報道均未對攜帶致病突變但無臨床表型的患者進行隨訪,因此GREB1L基因對兒童成長期間腎臟發育的作用有待進一步探討。本病例患兒2歲時超聲提示雙腎大小正常,隨后出現右腎進行性萎縮,屬于在生長發育過程中出現的單側腎萎縮,可能是國內外首例后天性腎萎縮合并GREB1L基因突變的報道,可能拓寬了GREB1L基因變異的臨床譜,提示該基因異常可能導致兒童生長發育過程中出現腎臟萎縮。基于此,本研究將對該患兒的腎臟發育情況進行長期隨訪。未來需要更深入的機制研究,以及相關位點的驗證,以明確GREB1L基因對人類腎臟發育的作用機制。

綜合文獻分析,GREB1L基因突變臨床表現多為先天性RAH,且存在不完全外顯性。本例患兒可能為國內外首例GREB1L基因突變合并后天性單側腎萎縮。GREB1L基因突變位點c.4688A>G雜合突變為新發位點,未見文獻報道。本病例可能拓展了與RAH相關的基因突變譜和臨床譜。

作者貢獻:孫濤負責文章的構思與設計及論文的撰寫和修訂;彭映潮、史卓負責文獻資料收集和圖表繪制;高春林負責文章審校,參與分析與討論;夏正坤負責文章的質量控制,整體監督,對論文負責。

本文無利益沖突。

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