吳靜漪
江蘇盛澤醫(yī)院兒科,江蘇 蘇州 215228
慢性腎臟病(CKD)患病率逐年增加,隨著病程進(jìn)展,其最終進(jìn)入終末期腎病(ESRD)。蛋白尿是促進(jìn)ESRD 進(jìn)展的獨(dú)立危險(xiǎn)因素[1-2],而足細(xì)胞損傷是產(chǎn)生蛋白尿的主要原因。足細(xì)胞凋亡可預(yù)測(cè)CKD患者蛋白尿增多和腎功能進(jìn)行性下降[3]。微小RNA(miRNA)是一類內(nèi)源性的高度保守的短鏈非編碼RNA,是基因表達(dá)的主要轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)因子,參與多種疾病的病理生理過程[4-5]。miRNA 在腎臟疾病中發(fā)揮了重要作用,但具體機(jī)制并不清楚。越來越多的研究顯示miR-199b-5p 在多種疾病進(jìn)展中發(fā)揮關(guān)鍵作用。但miR-199b-5p 與足細(xì)胞凋亡的關(guān)系并不明確。因此,2021 年1 月—2022 年7 月,本研究擬探討miR-199b-5p 對(duì)阿霉素誘導(dǎo)足細(xì)胞凋亡的影響及其機(jī)制,為CKD的治療提供新思路。
1.1 細(xì)胞、試劑及儀器 小鼠足細(xì)胞購(gòu)自上海ATCC細(xì)胞庫。阿霉素購(gòu)自美國(guó)MedChemExpress公司;miR-199b-5p mimic 和miR-199b-5p inhibitor 購(gòu)自上海吉瑪制藥技術(shù)有限公司;過表達(dá)/沉默脂肪細(xì)胞質(zhì)膜相關(guān)蛋白(APMAP)腺病毒購(gòu)自上海吉?jiǎng)P基因醫(yī)學(xué)科技股份有限公司;野生型APMAP 3′UTR(pRL-APMAP-3′UTR WT)、突變型APMAP 3′UTR(pRL-APMAP-3′UTR MUT)質(zhì)粒和轉(zhuǎn)染試劑盒購(gòu)自廣州銳博生物技術(shù)有限公司;Podocin 抗體購(gòu)自美國(guó)Santa Cruz Biotechnology 公司;Bax、Bcl-2 和GAPDH抗體購(gòu)自美國(guó)Affinity Biosciences 公司;Cleaved caspase-3、NF-κB 誘導(dǎo)激酶(NIK)、TNF 受體相關(guān)因子3(TRAF3)和APMAP 抗體購(gòu)自美國(guó)Abcam 公司;Allin-one miRNA 試劑盒購(gòu)自廣州易錦生物技術(shù)有限公司;HiScript Ⅲ RT SuperMix 和BCA 蛋白定量試劑盒購(gòu)自南京諾唯贊生物科技股份有限公司。
1.2 細(xì)胞培養(yǎng)及干預(yù) 將小鼠足細(xì)胞復(fù)蘇后用含10%胎牛血清、100 U/mL 青霉素、100 μg/mL 鏈霉素、10 U/mL γ 干擾素(IFN-γ)的RPMI-1640 培養(yǎng)液于37 ℃含5%二氧化碳的培養(yǎng)箱中培養(yǎng),待細(xì)胞于培養(yǎng)瓶中長(zhǎng)滿后,接種至12孔板或6孔板,并用不含IFN-γ 的培養(yǎng)基于培養(yǎng)箱中進(jìn)行分化成熟10~14 d。取部分足細(xì)胞隨機(jī)分為對(duì)照組、阿霉素組,阿霉素組取1 μL 阿霉素工作液(1 μg/mL)加入1 mL 無血清RPMI-1640培養(yǎng)基誘導(dǎo)24 h,阿霉素終濃度為1 ng/mL。
1.3 細(xì)胞轉(zhuǎn)染及分組 將足細(xì)胞接種于12孔板或6孔板中,使細(xì)胞培養(yǎng)至40%~50%融合。為證實(shí)miR-199b-5p在阿霉素誘導(dǎo)足細(xì)胞凋亡中的作用,取部分細(xì)胞隨機(jī)分為對(duì)照組、阿霉素組、阿霉素+miR-199b-5p mimic 組(過表達(dá))、阿霉素+NC mimic 組,阿霉素+miR-199b-5p inhibitor 組(沉默表達(dá))、阿霉素+NC inhibitor組并給予相應(yīng)方法轉(zhuǎn)染。為證實(shí)APMAP在足細(xì)胞凋亡中的作用,取部分細(xì)胞隨機(jī)分為阿霉素+miR-199b-5p mimic+Ad-APMAP 組(過表達(dá))、阿霉素+miR-199b-5p mimic+Ad-NC mimic 組,阿 霉 素+miR-199b-5p inhibitor+Ad-APMAP RNAi組(敲低表達(dá))和阿霉素+miR-199b-5p inhibitor+Ad-NC RNAi組,分別轉(zhuǎn)染過表達(dá)或敲低APMAP腺病毒,使APMAP過表達(dá)或沉默表達(dá)。
1.4 細(xì)胞內(nèi)miR-199b-5p及足細(xì)胞標(biāo)志蛋白(Podocin)、凋亡相關(guān)基因(Bax、Bcl-2、Cleaved caspase-3)、APMAP mRNA 表達(dá)檢測(cè) 采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR。用TRIzol試劑提取細(xì)胞總RNA,采用逆轉(zhuǎn)錄試劑盒合成cDNA,按照PCR 試劑盒說明書以cDNA 為模板進(jìn)行熒光定量PCR。miR-199b-5p 反應(yīng)條件:95 ℃ 10 min;95 ℃ 10 s,60 ℃ 30 s,共40個(gè)循環(huán)。APMAP、Bax、Bcl-2、Cleaved caspase-3、Podocin mRNA 反應(yīng)條件:95 ℃ 39 s;95 ℃ 10 s,60 ℃ 30 s,共40個(gè)循環(huán)。引物序列見表1。用2-ΔΔCt法計(jì)算目標(biāo)基因的相對(duì)表達(dá)量。

表1 各基因引物序列
1.5 細(xì)胞內(nèi)Podocin、Bax、Bcl-2、Cleaved caspase-3、APMAP 及NF-κB 信號(hào)通路相關(guān)蛋白(NIK、TRAF3)表達(dá)檢測(cè) 采用Western blotting 法。用RIPA 法提取細(xì)胞總蛋白,采用BCA 蛋白定量法測(cè)定蛋白濃度,將適量變性蛋白樣本進(jìn)行SDS-PAGE 電泳、轉(zhuǎn)膜、抗原抗體反應(yīng)后,在ECL 發(fā)光液和凝膠成像分析系統(tǒng)下顯影,采用Image J 進(jìn)行圖像分析。一抗稀釋 濃度:Podocin(1∶1 000)、Bax(1∶1 000)、Bcl-2(1∶1 000)、Cleaved caspase-3(1∶1 000)、APMAP(1∶1 000)、NIK(1∶1 000)、TRAF3(1∶1 000)、GAPDH(1∶2 000)。以GAPDH 作為對(duì)照,以目的條帶灰度值/GAPDH條帶灰度值作為目的蛋白相對(duì)表達(dá)量。
1.6 miR-199b-5p特異性下游靶基因分析 采用生物信息學(xué)分析。通過Targetscan(http://www. targetscan. org/)數(shù)據(jù)庫尋找miR-199b-5p 的特異性下游靶基因。
1.7 miR-199b-5p直接靶基因驗(yàn)證 采用雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)。將細(xì)胞接種于24孔板中,待細(xì)胞生長(zhǎng)至60%融合時(shí),隨機(jī)分為NC mimic+WT-APMAP組、miR-199b-5p+WT-APMAP 組、NC mimic+MUTAPMAP 組、miR-199b-5p+MUT-APMAP 組,使用轉(zhuǎn)染試劑分別將構(gòu)建的野生型(WT-APMAP)、突變型(MUT-APMAP)質(zhì)粒、miR-199b-5p mimic、NC-mimic共培養(yǎng)24 h,加入細(xì)胞裂解液充分裂解細(xì)胞,按照雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)操作測(cè)定熒光素酶活性。
1.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用GraphPad Prism8.0 統(tǒng)計(jì)軟件。符合正態(tài)分布的計(jì)量資料以±s表示,兩組比較采用t檢驗(yàn);多組比較采用方差分析,進(jìn)一步兩兩比較采用Bonferroni方法。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 對(duì)照組與阿霉素組miR-199b-5p、足細(xì)胞標(biāo)志蛋白、凋亡相關(guān)基因表達(dá)比較 對(duì)照組、阿霉素組miR-199b-5p相對(duì)表達(dá)量分別為1.00 ± 0.02、1.89 ± 0.70,阿霉素組miR-199b-5p 相對(duì)表達(dá)量高于對(duì)照組(P<0.05)。兩組足細(xì)胞標(biāo)志蛋白、凋亡相關(guān)基因表達(dá)比較見表2。

表2 對(duì)照組與阿霉素組足細(xì)胞標(biāo)志蛋白、凋亡相關(guān)基因表達(dá)比較(ˉx ± s)
2.2 過表達(dá)或敲低miR-199b-5p 對(duì)阿霉素誘導(dǎo)足細(xì)胞凋亡的影響 過表達(dá)miR-199b-5p 對(duì)阿霉素誘導(dǎo)足細(xì)胞凋亡的影響:阿霉素+NC mimic 組、阿霉素+miR-199b-5p mimic 組miR-199b-5p 相對(duì)表 達(dá) 量分別為1.00 ± 0.20、9.36 ± 0.24,阿霉素+miR-199b-5p mimic 組miR-199b-5p 相對(duì)表達(dá)量高于阿霉素+NC mimic 組(P<0.05)。兩組Podocin、Bax、Bcl-2、Cleaved caspase-3 表達(dá)比較見表3。敲低miR-199b-5p對(duì)阿霉素誘導(dǎo)足細(xì)胞凋亡的影響:阿霉素+NC inhibitor 組、阿 霉 素+miR-199b-5p inhibitor 組miR-199b-5p相對(duì)表達(dá)量分別為1.00 ± 0.10、0.43 ± 0.02,阿霉素+miR-199b-5p inhibitor組miR-199b-5p相對(duì)表達(dá)量低于阿霉素+NC inhibitor組(P<0.05)。兩組Podocin、Bax、Bcl-2、Cleaved caspase-3表達(dá)比較見表4。
表3 過表達(dá)miR-199b-5p對(duì)阿霉素誘導(dǎo)足細(xì)胞凋亡的影響(±s)

表3 過表達(dá)miR-199b-5p對(duì)阿霉素誘導(dǎo)足細(xì)胞凋亡的影響(±s)
組別阿霉素+NC mimic組阿霉素+miR-199b-5p mimic組<0.05 Podocin蛋白1.00 ± 0.22 0.51 ± 0.08<0.05 mRNA 1.02 ± 0.01 0.45 ± 0.13<0.05 Bax蛋白0.98 ± 0.12 1.94 ± 0.02<0.05 mRNA 1.11 ± 0.02 1.95 ± 0.03<0.05 Bcl-2蛋白1.00 ± 0.05 0.56 ± 0.18<0.05 mRNA 1.01 ± 0.02 0.60 ± 0.02<0.05 Cleaved caspase-3蛋白1.00 ± 0.02 1.88 ± 0.40<0.05 mRNA 1.03 ± 0.60 1.76 ± 0.03<0.05
表4 敲低miR-199b-5p對(duì)阿霉素誘導(dǎo)足細(xì)胞凋亡的影響(±s)

表4 敲低miR-199b-5p對(duì)阿霉素誘導(dǎo)足細(xì)胞凋亡的影響(±s)
組別阿霉素+NC inhibitor組阿霉素+miR-199b-5p inhibitor組P Podocin蛋白1.00 ± 0.22 1.62 ± 0.02<0.05 mRNA 1.05 ± 0.01 1.65 ± 0.04<0.05 Bax蛋白1.00 ± 0.04 0.45 ± 0.02<0.05 mRNA 1.01 ± 0.02 0.55 ± 0.03<0.05 Bcl-2蛋白1.01 ± 0.05 1.92 ± 0.50<0.05 mRNA 1.00 ± 0.03 1.83 ± 0.02<0.05 Cleaved caspase-3蛋白1.01 ± 0.02 0.59 ± 0.16<0.05 mRNA 1.01 ± 0.01 0.56 ± 0.03<0.05
2.3 miR-199b-5p 靶向APMAP 對(duì)足細(xì)胞凋亡的影響 生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示,APMAP-3′UTR 具有miR-199b-5p 高度保守的結(jié)合位點(diǎn)。NC mimic+WT-APMAP 組、miR-199b-5p+WT-APMAP 組、NC mimic+MUT-APMAP 組、miR-199b-5p+MUT-APMAP組熒光素酶活性分別為1.00 ± 0.10、0.53 ± 0.02、0.97 ± 0.03、1.00 ± 0.02。 與NC mimic+MUTAPMAP組比較,miR-199b-5p+WT-APMAP組APMAP的熒光素酶活性低(P<0.05)。各組APMAP及足細(xì)胞標(biāo)志蛋白、凋亡相關(guān)基因表達(dá)比較見表5~7。
表5 各組APMAP表達(dá)比較(±s)

表5 各組APMAP表達(dá)比較(±s)
注:與正常組比較,aP<0.05;與阿霉素+NC mimic 組比較,bP<0.05;與阿霉素+NC inhibitor比較,cP<0.05。
組別對(duì)照組阿霉素組阿霉素+NC mimic組阿霉素+miR-199b-5p mimic組阿霉素+NC inhibitor組阿霉素+miR-199b-5p inhibitor組APMAP蛋白1.00 ± 0.10 0.53 ± 0.02a 0.52 ± 0.20 0.33 ± 0.12b 0.59 ± 0.12 1.35 ± 0.23c mRNA 1.01 ± 0.02 0.45 ± 0.10a 0.56 ± 0.12 0.26 ± 0.13b 0.55 ± 0.02 1.50 ± 0.13c
表6 阿霉素+miR-199b-5p mimic+Ad-NC組、阿霉素+miR-199b-5p mimic+Ad-APMAP組足細(xì)胞標(biāo)志蛋白、凋亡相關(guān)基因表達(dá)比較(±s)

表6 阿霉素+miR-199b-5p mimic+Ad-NC組、阿霉素+miR-199b-5p mimic+Ad-APMAP組足細(xì)胞標(biāo)志蛋白、凋亡相關(guān)基因表達(dá)比較(±s)
組別阿霉素+miR-199b-5p mimic+Ad-NC組阿霉素+miR-199b-5p mimic+Ad-APMAP組P Podocin蛋白1.00 ± 0.02 1.85 ± 0.30<0.05 mRNA 1.00 ± 0.01 1.95 ± 0.03<0.05 Bax蛋白0.98 ± 0.12 0.45 ± 0.10<0.05 mRNA 1.01 ± 0.02 0.52 ± 0.50<0.05 Bcl-2蛋白1.00 ± 0.05 1.98 ± 0.40<0.05 mRNA 1.01 ± 0.02 1.86 ± 0.12<0.05 Cleaved caspase-3蛋白1.02 ± 0.02 0.46 ± 0.03<0.05 mRNA 1.00 ± 0.01 0.36 ± 0.13<0.05
表7 阿霉素+miR-199b-5p inhibitor+Ad-NC組、阿霉素+miR-199b-5p inhibitor+Ad-APMAP組足細(xì)胞標(biāo)志蛋白、凋亡相關(guān)基因表達(dá)比較(±s)

表7 阿霉素+miR-199b-5p inhibitor+Ad-NC組、阿霉素+miR-199b-5p inhibitor+Ad-APMAP組足細(xì)胞標(biāo)志蛋白、凋亡相關(guān)基因表達(dá)比較(±s)
組別阿霉素+miR-199b-5p inhibitor+Ad-NC組阿霉素+miR-199b-5p inhibitor+Ad-APMAP組P Podocin蛋白1.02 ± 0.02 0.45 ± 0.12<0.05 mRNA 1.00 ± 0.02 0.42 ± 0.03<0.05 Bax蛋白1.00 ± 0.13 1.88 ± 0.15<0.05 mRNA 1.00 ± 0.02 1.90 ± 0.50<0.05 Bcl-2蛋白1.01 ± 0.05 0.34 ± 0.10<0.05 mRNA 1.00 ± 0.01 0.46 ± 0.02<0.05 Cleaved caspase-3蛋白1.02 ± 0.03 1.86 ± 0.13<0.05 mRNA 1.00 ± 0.02 1.99 ± 0.15<0.05
2.4 miR-199b-5p 靶向APMAP 對(duì)NF-κB 信號(hào)通路的影響 見表8、9。
表8 各組TRAF3、NIK蛋白表達(dá)比較(±s)

表8 各組TRAF3、NIK蛋白表達(dá)比較(±s)
注:與對(duì)照組比較,aP<0.05;與阿霉素+NC mimic 組比較,bP<0.05;與阿霉素+NC inhibitor組比較,cP<0.05。
組別對(duì)照組阿霉素組阿霉素+NC mimic組阿霉素+miR-199b-5p mimic組阿霉素+NC inhibitor組阿霉素+miR-199b-5p inhibitor組TRAF3蛋白1.00 ± 0.02 0.63 ± 0.12a 0.61 ± 0.12 0.34 ± 0.22b 0.55 ± 0.12 1.55 ± 0.22c NIK蛋白1.01 ± 0.02 1.87 ± 0.13a 1.90 ± 0.21 2.50 ± 0.21b 1.86 ± 0.16 0.65 ± 0.20c
有研究顯示,在阿霉素處理的足細(xì)胞中miR-199b-5p 表達(dá)升高,沉默miR-199b-5p 表達(dá)通過靶向RGS10 抑制阿霉素誘導(dǎo)的足細(xì)胞凋亡[6]。本研究發(fā)現(xiàn),miR-199b-5p 過表達(dá)可以促進(jìn)足細(xì)胞凋亡,下調(diào)miR-199b-5p表達(dá)可緩解阿霉素誘導(dǎo)的足細(xì)胞凋亡。這與先前的報(bào)道一致。
miRNA作用機(jī)制之一是通過不完全互補(bǔ)結(jié)合至基因mRNA 3′UTR區(qū),從而阻斷mRNA的翻譯過程[7]。因此,本研究擬通過尋找miR-199b-5p的下游靶基因,探討miR-199b-5p在足細(xì)胞凋亡中的潛在作用機(jī)制。通過分析TargetScan、miRDB 數(shù)據(jù)庫發(fā)現(xiàn),APMAP 可能是miR-199b-5p的下游靶基因。APMAP是一類脂肪細(xì)胞質(zhì)膜相關(guān)蛋白,在多種疾病進(jìn)展中發(fā)揮重要作用[8-10]。但是,目前尚無研究表明APMAP在腎臟疾病足細(xì)胞凋亡中的作用。為了證實(shí)APMAP是否為miR-199b-5p的真正分子靶標(biāo),本研究使用雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn),結(jié)果顯示,miR-199b-5p 可顯著降低HEK-293T細(xì)胞中野生型APMAP的熒光素酶活性,但突變體APMAP未觀察到該結(jié)果。表明在阿霉素干預(yù)的足細(xì)胞中APMAP表達(dá)明顯降低,沉默miR-199b-5p后APMAP表達(dá)明顯升高,說明miR-199b-5p可能通過負(fù)性調(diào)控APMAP參與足細(xì)胞凋亡。接下來為了證實(shí)APMAP對(duì)足細(xì)胞凋亡的影響,本研究對(duì)APMAP進(jìn)行挽救實(shí)驗(yàn)。過表達(dá)APMAP可以逆轉(zhuǎn)miR-199b-5p對(duì)足細(xì)胞凋亡的影響,沉默APMAP 可以加劇miR-199b-5p對(duì)足細(xì)胞凋亡的促進(jìn)作用。表明miR-199b-5p可以通過負(fù)性靶向調(diào)控APMAP促進(jìn)足細(xì)胞凋亡。
表9 各組TRAF3、NIK蛋白表達(dá)比較(±s)

表9 各組TRAF3、NIK蛋白表達(dá)比較(±s)
注:與阿霉素+miR-199b-5p mimic+Ad-NC 組比較,aP<0.05;與阿霉素+miR-199b-5p inhibitor+Ad-NC RNAi組比較,bP<0.05。
組別阿霉素+miR-199b-5p mimic+Ad-NC組阿霉素+miR-199b-5p mimic+Ad-APMAP組阿霉素+miR-199b-5p inhibitor+Ad-NC RNAi組阿霉素+miR-199b-5p inhibitor +Ad-APMAP RNAi組TRAF3蛋白0.32 ± 0.01 1.36 ± 0.12a 1.56 ± 0.12 0.43 ± 0.02b NIK蛋白1.67 ± 0.14 0.60 ± 0.20a 0.52 ± 0.10 2.00 ± 0.02b
有研究報(bào)道,APMAP 參與了NF-κB 信號(hào)通路的調(diào)控,下調(diào)APMAP 表達(dá)可促進(jìn)NF-κB 信號(hào)通路激活[11]。NF-κB信號(hào)通路參與調(diào)控多種生物功能,激活NF-κB 信號(hào)通路可降低TNF 誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡,而在NF-κB活性缺乏的情況下,TNF誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡的敏感性將顯著增加[12]。研究表明,NF-κB信號(hào)通路在足細(xì)胞凋亡中起至關(guān)重要的作用。在糖尿病腎病小鼠模型和高糖干預(yù)下,足細(xì)胞中NF-κB 和下游TLR 信號(hào)通路被激活,促進(jìn)各種炎癥因子釋放,從而促進(jìn)足細(xì)胞凋亡[13]。研究顯示,NF-κB信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通常有兩種激活通路,一種為經(jīng)典的NF-κB信號(hào)通路,炎癥因子與相關(guān)受體結(jié)合,激活I(lǐng)kBa 激酶,使IkBa 磷酸化,NF-κB啟動(dòng),信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)被激活[14]。本研究利用另一種非經(jīng)典的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)方式,通過檢測(cè)TRAF3 和NIK 蛋白的表達(dá)探討NF-κB 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)對(duì)足細(xì)胞凋亡的影響。發(fā)現(xiàn)在阿霉素的干預(yù)下,NF-κB通路激活。通過沉默miR-199b-5p和過表達(dá)APMAP發(fā)現(xiàn)NF-κB信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)被抑制,由此說明miR-199b-5p 能夠通過抑制APMAP表達(dá)激活TRAF3/NIK/NF-κB信號(hào)通路。
綜上所述,miR-199b-5p可能與慢性腎臟病足細(xì)胞凋亡有關(guān),可通過靶向調(diào)控APMAP 激活TRAF3/NIK/NF-κB 信號(hào)通路促進(jìn)足細(xì)胞凋亡。miR-199b-5p有望成為慢性腎臟病治療的新靶點(diǎn)。