王園,王晶,李淑霞
(寧夏大學農學院,寧夏 銀川 750021)
紫花苜蓿(Medicago sativa)是豆科苜蓿屬多年生牧草,其產量高、營養價值豐富、適口性好,再生能力強,因優異的飼用價值而在世界各地廣泛栽培,享有“牧草之王”的美譽[1]。而我國紫花苜蓿的生產和種植多受到土壤鹽漬化的影響,造成單位面積產量低和干草品質差等問題,同時苜蓿進口量也呈逐年上升趨勢,嚴重制約了我國苜蓿的產業化發展[2]。因此,利用生物學技術研究抗逆基因對紫花苜蓿的調控作用,對加快紫花苜蓿抗逆育種的進程具有重大意義。
BBX(B-box)是鋅指結構蛋白家族的一個亞族,含有一個或多個由Zn2+結合的三級結構域,根據結構域不同可劃分為5 個亞家族,其結構穩定,氨基酸序列中包含1 或2 個參與蛋白質-蛋白質互作的B-box 基序[3]。含Bbox 結構域的蛋白廣泛存在于真核生物中,并在多種細胞過程如泛素化、蛋白運輸以及轉錄調控等方面發揮著重要作用,研究報道,BBX 蛋白可與啟動子順式作用元件T/G-box 結合,從而激活基因的轉錄[4-5]。BBX 在調控植物的生長發育如光形態建成、花發育和避蔭響應中已有較多的研究。在植物中,擬南芥(Arabidopsis thaliana)含有32 個B-box 蛋白,水稻(Oryza sativa)含有30 個BBX 蛋白[6]。轉錄因子廣泛參與生物的生長、發育、代謝以及環境響應的調控過程,是重要的調控因子。最近的研究表明,BBX 作為轉錄因子參與調節各種細胞和生理過程,包括植物的生長發育及多種非生物脅迫等[7-8]。大豆(Glycine max)BBX 家族多數基因參與干旱和鹽脅迫響應,同時發現GmBBXs啟動子上含有逆境響應元件TC-rich 和干旱誘導MYB 轉錄因子結合位點MBS,從而能夠調控逆境脅迫[9];在菊花(Chrysanthemum morifolium)中發現過表達CmBBX19基因會降低植株的抗旱能力,而抑制該基因的表達能夠提高植物抗旱性[10];茶樹(Camellia sinensis)CsBBX少數基因在干旱和鹽脅迫條件下可被誘導表達,提高植物耐脅迫能力[11];香蕉(Musa nana)MaBBX基因可能參與低溫響應過程,大部分成員都能響應低溫脅迫,在不同低溫下表達量上調,進而提高植物抗寒性[12]。BBX 在調控植物非生物脅迫響應中的研究相對較少,關于其成員參與紫花苜蓿抗逆性的研究也尚未見報道,因此有必要充分利用現有的信息,對紫花苜蓿BBX 家族基因進行克隆和抗逆性研究。
本研究以紫花苜蓿為試驗材料,從轉錄組數據中篩選到顯著響應鹽脅迫的MsBBX24基因,通過對MsBBX24基因克隆、生物信息學分析、基因表達模式分析、過表達載體構建以及轉基因擬南芥的獲得,對其耐鹽性進行初步評估。本試驗旨在為后續深入研究MsBBX24基因的功能提供幫助,為紫花苜蓿抗逆分子育種提供理論依據和基因資源參考。
本試驗于2020年10 月-2021年10 月進行。試驗所用的植物材料紫花苜蓿和擬南芥(Col-0)由實驗室保存。植物材料種植于植物培養間,培養條件為:溫度25 ℃,濕度60%~70%,光照/黑暗周期16 h/8 h,光照強度160 μmol·m-2·s-1。RNA 提 取試劑盒(MiniBEST Plant RNA Extraction Kit)、反 轉錄試劑 盒(PrimeScript?Ⅱ1st Strand cDNA Synthesis Kit)、大腸桿菌DH5α 感受態細胞、StellarTM 感受態細胞、pMD19-T vector、限制性內切酶EcoR I、T4 DNA 連接酶、高保真酶PrimeSTAR?HS DNA Polymerase 試劑盒等均購自大連寶生物工程有限公司(TaKaRa);熒光定量試劑盒(ChamQ SYBR qPCR Master Mix)和重組酶試劑盒(ClonExpress II One Step Cloning Kit)均購自南京諾唯贊生物公司;質粒提取試劑盒和DNA 凝膠回收試劑盒均購自生工生物工程(上海)股份有限公司。
1.2.1 紫花苜蓿MsBBX24基因的克隆及生物信息學分析 根據實驗室之前紫花苜蓿耐鹽轉錄組數據,篩選出顯著響應鹽脅迫的MsBBX24基因,利用Primer Premier 5 軟件設計MsBBX24基因全長擴增引物MsBBX24-F/R(表1)。根據RNA 試劑盒操作說明提取紫花苜蓿總RNA,并反轉錄成cDNA。以cDNA 為模板進行MsBBX24基因的CDS 序列擴增,反應體系:20 μL,cDNA 1 μL、引物各1 μL、2×Taq Master Mix 10 μL、雙蒸水7 μL;反應程序:95 ℃5 min,95 ℃15 s,58 ℃15 s,72 ℃1 min(35 個循環),72 ℃5 min。將擴增產物進行電泳檢測后克隆到pMD-19T 載體上,通過菌液PCR 檢測,將陽性克隆送至上海生工生物公司進行測序。

表1 本試驗所用引物Table 1 Primers used in this experiment
利用NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov)對MsBBX24基因的核酸序列、氨基酸序列以及對應蛋白質的理化性質進行預測分析。使用在線軟件SOPMA(https://npsa-prabi. ibcp. fr/cgi-bin/npsa_automat. pl?page=npsa_sopma. html)對氨基酸的二級結構和親水性/疏水性進行預測分析。使用TMHMM Server 2.0 軟件(http://www. cbs. dtu. dk/services/TMHMM)對蛋白質的跨膜結構域進行預測分析。通過DNAMAN 軟件(https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_sopma.html)對紫花苜蓿MsBBX24 的氨基酸序列進行比對。使用MEGA 6 軟件(https://www.megasoftware.net/)進行MsBBX24 蛋白進化樹的構建。
1.2.2MsBBX24基因在紫花苜蓿中的表達分析 將保定苜蓿種子用5%的次氯酸鈉溶液消毒5 min,用蒸餾水沖洗數次后置于鋪有兩層濕濾紙的培養皿中,放于培養間發芽。萌發4~5 d 后將幼苗移至水培盆中,用改良后的霍格蘭營養液培養。培養至一個月左右時,挑選生長狀況良好、大小一致的植株進行150 mmol·L-1NaCl 處理,分別于0、2、4、8 和12 h 采取根部和葉片樣品,并將采集的樣品放入-80 ℃冰箱保存備用。根據RNA 試劑盒操作說明提取各樣品總RNA,并反轉錄成cDNA,方法同1.2.1。利用Primer Premier 5 軟件設計MsBBX24基因定量引物qMsBBX24-F/R,以紫花苜蓿MsActin-F/R 為內參基因引物,進行實時熒光定量PCR(qRT-PCR)。反應體系為:20 μL,2×ChamQ SYBR qPCR Master Mix 10 μL、引物各0.4 μL、cDNA 3 μL,雙蒸水6.2 μL。反應程序:第1 步:95 ℃預變性30 s;第2 步:95 ℃循環10 s、60 ℃循環30 s;第3 步:熔解:95 ℃15 s、60 ℃60 s、95 ℃15 s。根據得到的Ct 循環閾值,用2-△△CT方法[13]計算MsBBX24基因的組織特異性表達;再分別以根和葉在0 h 表達量為對照,2、4、8 和12 h 為處理,計算NaCl 處理條件下根和葉的相對表達量,計算方法如下:ΔΔCT=(CT目的基因-CT內參基因)NaCl處理-(CT目的基因-CT內參基因)對照,試驗設置3 個生物學重復和3 個技術重復。
1.2.3MsBBX24基因過表達載體構建及轉基因擬南芥獲得 以紫花苜蓿cDNA 為模板,以含有EcoR I 酶切位點和部分載體接頭序列的cMsBBX24-F/R 為引物,用高保真酶擴增MsBBX24基因全長。用限制性內切酶EcoR I 酶切pCAMBIA1300 載體,用T4 DNA 連接酶將MsBBX24基因片段和酶切好的pCAMBIA1300 載體連接,并轉化至大腸桿菌DH5α 中,測序正確后提取質粒,即為pCAMBIA1300-MsBBX24 重組質粒。將重組質粒通過電轉化法轉入至農桿菌菌株GV3101 中,通過蘸花法[14]將其轉入野生型擬南芥。
收獲侵染后的擬南芥T0代種子,播種于蛭石中并用50 mmol·L-1的Basta 噴灑篩選,經過連續兩代的陽性苗篩選獲得純合的T2代種子,將該種子用作后續試驗。培養純合植株提取RNA 并反轉錄為cDNA,以MsBBX24-F/R 為特異性引物,以AtActinF/R 為內參基因引物,通過半定量RT-PCR 技術檢測轉基因擬南芥中MsBBX24的表達情況。
1.2.4MsBBX24轉基因擬南芥耐鹽性分析 將野生型擬南芥Col-0 和收獲的T2代轉基因種子用75%的酒精消毒5 min,然后在超凈工作臺中用無菌水沖洗4~5 遍,均勻地點播于1/2 MS 固體培養基(MS 粉2.37 g·L-1,蔗糖10 g·L-1,瓊脂粉9 g·L-1,pH=5.8)上,置于4 ℃冰箱中春化,2 d 后將其移至正常生長條件下進行培養。生長4~5 d 后,挑選長勢一致的幼苗將其轉移至含有0、100 和150 mmol·L-1NaCl 的1/2 MS 固體培養基上。在移苗時將野生型(對照)和轉基因幼苗移至同一種處理的培養基上以避免不同平板之間的差異,然后將平板豎直放在培養架上,培養7 d 后拍照并統計根長、側根數和子葉綠化率,每個重復5 株。
為了進一步確定MsBBX24基因對擬南芥成苗耐鹽性的影響,本試驗對生長3 周的擬南芥植株進行150 mmol·L-1NaCl 溶液處理,并于10 d 后測定如下指標:參照Dahro 等[15]的方法測定相對電導率(ion leakage,IL),采用硫代巴比妥酸比色法[16]測定丙二醛(malondialdehyde,MDA)含量,95% 無水乙醇浸提法[17]測定葉綠素(chlorophyll,Chl)含量,對Jiang 等[18]的方法做修改測定過氧化氫(hydrogen peroxide,H2O2)含量,分光光度計法[19]測定脯氨酸(proline,Pro)含量,愈創木酚法[20]測定過氧化物酶(peroxidase,POD)活性,氮藍四唑光還原法[21]測定超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)活性。
使用Excel 2016 和SPSS 25.0 進行數據統計與分析,采用T檢驗,*表示P<0.05,**表示P<0.01。使用Origin 2021 作圖。所有試驗均設置3 個生物學重復和3 個技術重復,試驗數據為3 次生物學重復的平均值。
通過PCR 擴增從紫花苜蓿中克隆得到了MsBBX24基因,編碼區序列長723 bp,編碼240 個氨基酸(圖1)。基因編碼的蛋白質理化性質預測分析發現,MsBBX24 蛋白的相對分子質量為30.58 kDa,理論等電點(theoretical isoelectric point,pI)為7.74,預測的不穩定系數為47.91,穩定系數大于40,屬于不穩定蛋白。MsBBX24 蛋白的親水性預測值為-0.301,因此屬于親水性蛋白(圖2A)。跨膜結構域預測結果顯示該蛋白沒有跨膜結構域(圖2B)。二級結構預測結果顯示MsBBX24 蛋白包含22.5%的α-螺旋、16.25%的延伸鏈、2.08%的β-轉角和59.17%的不規則卷曲(圖2C)。

圖1 MsBBX24 基因的核苷酸序列及其編碼的氨基酸序列Fig.1 Nucleotide and predicted amino acid sequences of MsBBX24 geneATG:起始密碼子;*:終止密碼子;橫線標記:保守區域。ATG:Initiation codon;*:Temination codon;Horizontal line mark:Conserved domains.

圖2 MsBBX24 蛋白生物信息學分析Fig.2 Bioinformatics analysis of MsBBX24 proteinA:MsBBX24 蛋白質親水性分析;B:MsBBX24 蛋白跨膜結構域預測;C:MsBBX24 蛋白二級結構預測(圖中線條由高到低依次表示:α-螺旋、延伸鏈、β-轉角、不規則卷曲)。A:Hydrophilicity analysis of MsBBX24 protein;B:Transmembrane structure prediction of MsBBX24 protein;C:Secondary structure prediction of MsBBX24 protein(The lines in the figure were alpha helix,extended strand,beta turn and random coil in descending order).
蛋白質多序列比對分析發現MsBBX24 蛋白包含兩個B-box 保守結構域(5~47 和53~98),與其他植物的BBXs(B-box zinc finger genes)蛋白具有高度的同源性,其中與蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)、刺毛黧豆(Mucuna pruriens)、大豆和紅豆(Abrus precatorius)的相似性分別達到了97%、82%、81%和80%(圖3)。進化樹結果分析表明MsBBX24 與鷹嘴豆(Cicer arietinum)和蒺藜苜蓿的親緣關系較近,與其他豆科植物的親緣關系較遠(圖4)。

圖3 MsBBX24 氨基酸多序列比對Fig.3 Multiple sequence alignment of MsBBX24 amino acids

圖4 MsBBX24 蛋白進化樹構建Fig.4 Phylogenetic tree analysis of MsBBX24 protein
以紫花苜蓿根和葉組織的cDNA 為模板,利用qRT-PCR 技術分析MsBBX24基因在正常條件和鹽(150 mmol·L-1NaCl)脅迫條件下的相對表達量變化,150 mmol·L-1NaCl 脅迫下MsBBX24基因的表達量分別以正常條件下根和葉的表達量為一個單位作對照進行統計。結果顯示,正常條件下,MsBBX24基因在葉中的表達量顯著高于根的(P<0.01),為根的24.56 倍(圖5A);在12 h 的脅迫時間內,隨著脅迫時間的延長,MsBBX24基因在根和葉的表達量均呈先上升再下降的趨勢,在4 h 時根和葉片組織中的表達量都達到最大值,其中根中的表達量為對照的17.65 倍,葉中為對照的4.33 倍,根的表達量顯著高于葉的表達量(P<0.05 或P<0.01);在12 h 時,葉片中的表達量下降為對照的1.73 倍,根中下降為0.69 倍(圖5B)。

圖5 MsBBX24 基因的表達量分析Fig.5 Analysis of MsBBX24 gene relative expression levelA:組織特異性表達,**表示根和葉表達量差異極顯著(P<0.01);B:150 mmol·L-1 NaCl 處理下根和葉的表達量,*和**分別表示同一組織中不同處理時間的表達量與0 h 相比差異顯著(P<0.05)和差異極顯著(P<0.01)。A:Tissue-specific expression,** indicated that significant differences in root and leaf expression(P<0.01);B:Relative expression level of roots and leaves under 150 mmol·L-1 NaCl treatment;* and ** respectively indicated the difference between different time in same organization and 0 h is significant(P<0.05)and extremely significant(P<0.01).
通過擬南芥蘸花法將含有MsBBX24基因的農桿菌(GV3101)轉入野生型擬南芥(WT)中,通過Basta(50 mg·L-1)逐代篩選得到T2代純合種子,共篩選得到25 個純合株系。從中隨機挑選2 個轉基因株系(L8,L13)進行陽性鑒定。通過半定量RT-PCR 技術檢測轉基因擬南芥中MsBBX24的表達情況(圖6),在WT中沒有MsBBX24基因的表達,轉基因株L8和L13中都有目的基因表達的條帶,說明MsBBX24基因在擬南芥中成功過表達,可用作后續試驗。

圖6 轉基因擬南芥陽性苗驗證Fig.6 Validation of transgenic Arabidopsis positive seedlings
2.4.1MsBBX24轉基因擬南芥幼苗耐鹽性分析 為了檢測MsBBX24基因對擬南芥幼苗的影響,將在1/2 MS 培養基上生長了5 d 的幼苗轉移至含有0、100 和150 mmol·L-1NaCl 的1/2 MS 固體培養基上進行處理,每天觀察不同株系之間的表型差異。如圖7 所示,在0 mmol·L-1NaCl 條件下,轉基因株系L8和L13和WT 幼苗植株之間沒有差異,而在100 和150 mmol·L-1NaCl 處理條件下,L8和L13的幼苗根長顯著長于WT(P<0.05 或P<0.01)(圖7A,B),側根數也顯著多于WT(P<0.05 或P<0.01)(圖7C),說明MsBBX24基因受鹽脅迫誘導表達。同時在150 mmol·L-1NaCl 處理條件下,L8和L13的子葉綠化率顯著高于WT(P<0.05 或P<0.01)(圖7D)。以上結果表明:MsBBX24基因的過表達能夠提高擬南芥的耐鹽性。

圖7 WT 和轉MsBBX24 基因擬南芥的幼苗耐鹽性分析Fig.7 Salt tolerance analysis of WT and MsBBX24 transgenic Arabidopsis seedlings*和**分別表示轉基因擬南芥植株與野生型相比差異顯著(P<0.05)和差異極顯著(P<0.01),下同。* and ** respectively indicated the transgenic Arabidopsis plants showed significant difference(P<0.05)and extremely significant difference(P<0.01)compared with wild type,the same below.
2.4.2MsBBX24轉基因擬南芥耐鹽生理指標分析 為了進一步確定MsBBX24基因對擬南芥成苗耐鹽性的影響,本研究將生長3 周的WT 和轉基因植株用150 mmol·L-1NaCl 溶液處理,10 d 后對IL、MDA、H2O2、Chl 和Pro 含量以及POD 和SOD 活性等生理指標進行測定。結果表明,在正常生長條件下,WT 和MsBBX24轉基因植物的IL 無顯著差異,經鹽脅迫處理后,兩種植物中的IL 都明顯升高,但轉基因植物的顯著低于WT(P<0.05 或P<0.01)(圖8A),表明在鹽脅迫下,轉基因擬南芥能減少植物質膜受損程度。類似地,在鹽脅迫處理條件下,MsBBX24轉基因植物中的MDA 和H2O2含量顯著低于WT(P<0.05 或P<0.01)(圖8B,C)。同時通過測定Chl、Pro 含量和抗氧化酶活性發現,在正常生長條件下,轉基因植物和WT 的各指標間均無顯著差異,但在鹽脅迫條件下,轉基因株系的Chl 和Pro 含量、POD 和SOD 活性都顯著高于WT(P<0.05 或P<0.01)(圖8D~G)。以上結果說明轉基因株系植株的細胞質膜受損程度更低,光合作用和滲透調節能力更強,同時抗氧化能力高于WT。

圖8 150 mmol·L-1 NaCl 脅迫下WT 和MsBBX24 轉基因擬南芥生理響應Fig.8 Physiological response of WT and MsBBX24 transgenic Arabidopsis under 150 mmol·L-1 NaCl stress
Box 蛋白家族廣泛存在于真核生物中,家族成員數量龐大,在植物色素積累、光形態發生、種子發育及逆境脅迫反應等過程中具有重要的調節作用。鹽脅迫對植物生長、發育、產量和品質均有影響,表現為抑制植物組織和器官的生長和分化,導致發育遲緩[22]。
本研究克隆得到的MsBBX24基因,其編碼區序列長723 bp,編碼240 個氨基酸,包含兩個B-box 保守結構域。預測其屬于不穩定親水性蛋白,無跨膜結構域,二級結構的主要構成元件是α-螺旋。氨基酸序列比對和系統進化樹中MsBBX24 與鷹嘴豆和蒺藜苜蓿的同源性較高,表明該蛋白在進化上的保守性。
本研究發現,在鹽(150 mmol·L-1NaCl)脅迫條件下的12 h 內,MsBBX24基因在紫花苜蓿根和葉的表達量呈現先增加后減少的趨勢,與之前竇錦青等[23]報道的光皮樺(Betula luminifera)的BBX 類基因BlCOL13表達情況一致,同時劉欣[24]發現蘋果(Malus domestica)MdBBX10基因在鹽脅迫下表達量上調,本研究結果與此一致。此外,楊寧等[25]發現EgrBBX 家族不同基因具有不同的組織表達特異性,其中巨桉(Eucalyptus grandis)EgrBBX7基因葉的表達量也是大于根的,本研究結果與此一致。MsBBX24基因受鹽脅迫的顯著誘導表達,且在根和葉不同組織具有表達特異性,推測該基因在響應鹽脅迫時在不同組織發揮的功能也可能存在差異。此外,本研究發現MsBBX24基因的過表達顯著提高了轉基因擬南芥幼苗在鹽脅迫下的根長、側根數和子葉綠化率。結合本研究中MsBBX24的蛋白結構、被鹽脅迫誘導表達及對鹽脅迫下轉基因擬南芥表型的改善,推測MsBBX24可能具有提高植物耐鹽性的功能。
IL 是逆境傷害的一個生理指標,植物遭受逆境傷害時細胞膜會受損,表現為選擇透性喪失、膜透性增加和細胞內部分電解質外滲[26]。MDA 是一種脂質過氧化產物,研究表明其在植物中的積累量與細胞膜的透性變化呈正相關,作為細胞膜的受損程度的指標[27-28]。研究結果顯示,MsBBX24基因的過表達能夠降低鹽脅迫下擬南芥的IL 和MDA,說明MsBBX24轉基因植株受到的膜脂過氧化損傷程度更低,該結果表明MsBBX24可以通過降低細胞膜損傷和膜脂過氧化來緩解鹽脅迫。Chl 是一類與光合作用有關的重要色素,常作為評價植物光合作用能力的一個重要指標[29],其含量的多少反映了植物光合能力的強弱。研究表明,鹽脅迫能夠損傷植物細胞內的葉綠體,進而降低植物光合作用能力[30]。本研究結果表明鹽脅迫下轉基因擬南芥Chl 含量高于WT,說明轉基因擬南芥的光合能力更強,推測轉基因植株可能是通過提高光合作用能力來改善耐鹽性。逆境脅迫時的Pro 是公認的滲透調節劑[31]。逆境時,植物體內的游離氨基酸含量會明顯增加,通過平衡細胞代謝以維持細胞內環境的相對穩定[32]。本研究發現,在鹽脅迫下MsBBX24轉基因擬南芥中Pro 積累量明顯高于WT,說明MsBBX24過表達增強了擬南芥轉基因植株的滲透調節能力,維持了滲透平衡,提高了耐鹽性。植物處于逆境時產生的活性氧(reactive oxygen species,ROS)傷害會被SOD、POD 和過氧化氫酶(catalase,CAT)組成的抗氧化酶系統消除和抵御,減少膜脂過氧化,在一定范圍內維持膜穩定,增強其清除超氧陰離子自由基(O2·-)和H2O2的能力,能夠保護膜結構從而維持細胞正常的生理功能[33-34]。Liu 等[35]研究發現擬南芥MdBBX10的過表達可以增強植物在鹽脅迫下清除ROS 的能力,在本研究中,鹽脅迫下MsBBX24轉基因植株中H2O2的含量明顯降低,對應地,SOD 和POD 的活性顯著升高,由此猜測可能是轉基因植株通過增強抗氧化酶系統來清除鹽脅迫下植物體內增加的ROS,減輕鹽脅迫對植株造成的傷害,從而使轉基因植株具有更高的耐鹽性。
本研究克隆了保定苜蓿的MsBBX24基因,發現其與蒺藜苜蓿的親緣關系最近,是不穩定親水性蛋白,屬于BBXs 家族的成員。該基因能夠顯著響應鹽脅迫,并具有組織表達特異性。MsBBX24基因的過表達顯著提高了轉基因擬南芥幼苗的根長、側根數和子葉綠化率,同時降低了轉基因擬南芥的IL、MDA 和H2O2含量,提高了Chl和Pro 含量以及POD 和SOD 活性,表明MsBBX24基因具有調控植物耐鹽性的功能。因此,MsBBX24可作為紫花苜蓿耐鹽育種的候選基因,為苜蓿耐鹽品種的選育奠定了基礎。