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甲基轉(zhuǎn)移酶3在肝細(xì)胞癌中的研究進(jìn)展

2023-04-16 13:04:13王朔柯煒煒盧再鳴
關(guān)鍵詞:研究

王朔,柯煒煒,盧再鳴

(中國醫(yī)科大學(xué)附屬盛京醫(yī)院放射科,沈陽 110004)

原發(fā)性肝癌居癌癥發(fā)病率第四位[1-2],是全球僅次于胰腺癌的第二大癌癥死亡原因[3]。其中,肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是肝臟最常見的原發(fā)性惡性腫瘤,約占所有原發(fā)性肝癌的90%[4]。HCC的主要危險(xiǎn)因素包括乙型肝炎病毒,丙型肝炎病毒,酗酒,肥胖,黃曲霉毒素感染等[5-6]。HCC患者診斷時(shí)常為晚期,中位生存期不超過2年,且HCC患者術(shù)后的腫瘤復(fù)發(fā)率和轉(zhuǎn)移率高,因此總體預(yù)后較差,5年生存率低,嚴(yán)重威脅人們的生命健康[7-8]。

N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)于1974年被發(fā)現(xiàn)[9],是一種可逆的轉(zhuǎn)錄后修飾 。m6A作為真核細(xì)胞最普遍的RNA甲基化修飾[10],占甲基化核糖核苷酸的50%,可影響信使RNA(messenger RNA,mRNA)的加工、轉(zhuǎn)運(yùn)、翻譯、降解等[11]。轉(zhuǎn)錄物的修飾水平由甲基轉(zhuǎn)移酶、結(jié)合蛋白和去甲基化酶動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié)。甲基轉(zhuǎn)移酶包括甲基轉(zhuǎn)移酶3(methyltransferase-like 3,METTL3),甲基轉(zhuǎn)移酶14(methyltransferase-like 4,METTL14),病毒樣甲基轉(zhuǎn)移酶相關(guān)蛋白(vir-like m6A methyltransferase associated protein,KIAA1429/VIRMA),核糖核酸結(jié)合蛋白15(ribonucleic acid binding motif protein 15,RBM15),腎母細(xì)胞瘤1相關(guān)蛋白(Wilms’ tumor 1-associating protein,WTAP),含有CCCH型鋅指結(jié)構(gòu)域的蛋白13(zinc finger CCCH-type containing 13,ZC3H13)等。結(jié)合蛋白包括異構(gòu)核核糖核蛋白(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein,HNRNP)和YT521-B同源性(YT521-B homology,YTH)結(jié)構(gòu)域家族成員,如YTH結(jié)構(gòu)域1(YTH domain-containing 1,YTHDC1),YTHm6A結(jié)合蛋白1(YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 1,YTHDF1)等。去甲基化酶包括ALKB同系物5(ALKB homolog 5,ALKBH5)、脂肪量和肥胖相關(guān)蛋白(fat mass and obesity-associated protein,F(xiàn)TO)等[12]。

m6A甲基轉(zhuǎn)移酶METTL3作為多組分甲基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合物(multicomponent methyltransferase complex,MTC)的核心之一[13],在多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展及治療中起重要作用。例如,METTL3可通過介導(dǎo)MYC基因過度表達(dá)促進(jìn)前列腺癌的發(fā)展[14]。METTL3介導(dǎo)的分泌型肝癌衍生生長因子(hepatoma-derived growth factor,HDGF)mRNA甲基化修飾,可通過激活血管生成通路,促進(jìn)胃癌的進(jìn)展及轉(zhuǎn)移[15]。基于生物信息學(xué)綜合分析的結(jié)果顯示,METTL3的表達(dá)與HCC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)呈正相關(guān),可成為預(yù)測(cè)HCC預(yù)后的基因標(biāo)記。隨著HCC分級(jí)的提高,METTL3的表達(dá)也逐漸升高[16]。本文對(duì)近十年來METTL3在HCC中的研究進(jìn)展進(jìn)行綜述,系統(tǒng)分析METTL3在HCC發(fā)生、治療及預(yù)后中的作用,以期為HCC的治療提供新的思路。

1 METTL3在HCC發(fā)生發(fā)展中的作用

HCC的發(fā)病機(jī)制復(fù)雜,與遺傳學(xué)、表觀遺傳學(xué)和轉(zhuǎn)錄變化之間的相互作用均有關(guān)。METTL3可通過作用于不同靶點(diǎn),調(diào)節(jié)下游調(diào)控因子的表達(dá),進(jìn)而調(diào)控肝癌的發(fā)生發(fā)展。

代謝紊亂可通過影響HCC細(xì)胞能量供應(yīng)、大分子生物合、氧化還原等方式抑制HCC細(xì)胞的生長和增殖[17]。LINC00958是一種與脂肪生成相關(guān)的長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA),可通過分泌miR-3619-5p上調(diào)HDGF的表達(dá),促進(jìn)HCC的脂肪生成和進(jìn)展[18-19]。有研究[18]表明,METTL3介導(dǎo)的m6A修飾,可通過穩(wěn)定其RNA轉(zhuǎn)錄物上調(diào)LINC00958。此外,通過評(píng)估METTL3在100例HCC病例標(biāo)本和TCGA數(shù)據(jù)集中的表達(dá)發(fā)現(xiàn),HCC中METTL3的RNA和蛋白表達(dá)均顯著上調(diào)。METTL3的表達(dá)與糖酵解基因的表達(dá)呈高度正相關(guān)。在Huh-7和SMMC-7721 等HCC細(xì)胞系中,下調(diào)METTL3可通過減少細(xì)胞的葡萄糖攝取和乳酸產(chǎn)生,抑制細(xì)胞的糖酵解能力。METTL3的下調(diào)與糖酵解抑制劑2-脫氧葡萄糖(2-deoxyglucose,2-DG)可協(xié)同抑制體外腫瘤生長[20]。另有研究[21]表明,敲除METTL3可通過降低丙酮酸脫氫酶激酶(pyruvate dehydrogenase,PDK4)降低糖酵解,從而抑制HCC和宮頸癌細(xì)胞的生長。YANG等[22]研究發(fā)現(xiàn),乙肝病毒X相互作用蛋白(hepatitis B virus X-interacting protein,HBXIP)在HCC組織中上調(diào),通過METTL3介導(dǎo)的缺氧誘導(dǎo)因 子-1α(hypoxia inducible factor-1,HIF-1α)的m6A修飾驅(qū)動(dòng)HCC細(xì)胞代謝重編程,促進(jìn)HCC的發(fā)生。

在HCC中,METTL3介導(dǎo)的m6A修飾可下調(diào)MEG3,促進(jìn)HCC細(xì)胞增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移[23]。Snail是上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial-to-mesenchymal transition,EMT)的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子。METTL3可通過SUMO1化增加Snail的表達(dá),促進(jìn)HCC的遷移和侵襲[24-25]。細(xì)胞因子信號(hào)抑制因子2(suppressor of cytokine signaling 2,SOCS2)是細(xì)胞因子信號(hào)抑制(suppressor of cytokine signaling,SOCS)家族成員之一,具有抑癌作用。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序m6A-seq和m6A MeRIP qRT-PCR結(jié)果顯示,SOCS2為METTL3下游目標(biāo),在細(xì)胞因子信號(hào)抑制中起重要作用。METTL3通過m6A-YTHDF2依賴途徑降低SOCS2mRNA的穩(wěn)定性,進(jìn)而促進(jìn)HCC細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移[16]。血管生成擬態(tài)(vasculogenic mimicry,VM)與經(jīng)典腫瘤血管生成途徑不同,是不依賴機(jī)體內(nèi)皮細(xì)胞的全新腫瘤微循環(huán)模式[26]。QIAO等[27]研究發(fā)現(xiàn),HCC組織中METTL3與VM呈正相關(guān)。對(duì)METTL3基因敲除的3D培養(yǎng)細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析結(jié)果顯示,m6A通過Hippo途徑介導(dǎo)VM形成,促進(jìn)HCC的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移。METTL3和胰島素樣生長因子2 mRNA結(jié)合蛋白2(insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 2,IGF2BP2)是m6A信號(hào)通路中的關(guān)鍵基因,在HCC組織中均處于上調(diào)狀態(tài)。機(jī)制研究[28]表明,METTL3-IGF2BP2通過增強(qiáng)瓣?duì)詈怂醿?nèi)切酶(flap endonuclease,F(xiàn)EN1)的表達(dá),促進(jìn)HCC增殖。綜上可知,METTL3通過作用于EMT、VM、FEN1等多種信號(hào)通路,促進(jìn)HCC的發(fā)生發(fā)展。

2 METTL3在HCC治療中的作用

近年來,隨著METTL3的研究不斷深入,越來越多的METTL3作用通路成為研究治療HCC的新靶點(diǎn)。例如,在研究METTL3與糖代謝的關(guān)系時(shí),研究者首次闡明下調(diào)METTL3的表達(dá)可以抑制糖酵解,而這一途徑可成為對(duì)抗HCC的潛在治療策略[20]。FEN1作為IGF2BP2的下游靶點(diǎn),在肺癌、胃癌、乳腺癌等多種癌癥中表達(dá)均處于上調(diào)狀態(tài)[29-31]。因此,在IGF2BP2的研究中,研究者認(rèn)為METTL3-IGF2BP2-FEN1軸可作為潛在的HCC治療靶點(diǎn)[28]。免疫系統(tǒng)在HCC發(fā)生中起重要作用[32]。HCC細(xì)胞中METTL3低表達(dá)可增加免疫細(xì)胞浸潤,從而增強(qiáng)抗腫瘤免疫應(yīng)答[33]。由于炎癥亞型的免疫檢查點(diǎn)通路的激活和上調(diào),免疫炎癥表型的患者更可能受益于免疫治療[34]。METTL3與其他腫瘤免疫治療也密切相關(guān)。例如,METTL3缺陷型腫瘤,通過抗程序性細(xì)胞死亡蛋白(programmed cell death-1,PD-1)抗體治療,減緩CT26結(jié)直腸癌和B16黑色素瘤小鼠的腫瘤生長[35]。在人索拉非尼耐藥的HCC細(xì)胞中,METTL3顯著下調(diào)。在培養(yǎng)的HCC細(xì)胞中,METTL3可促進(jìn)索拉非尼耐藥和血管生成基因的表達(dá),并激活自噬相關(guān)途徑。機(jī)制研究[36]表明,METTL3可以通過下調(diào)FOXO3提高HCC對(duì)索拉非尼的耐藥性。

3 METTL3與HCC預(yù)后的關(guān)系

近年來,越來越多的學(xué)者通過分析數(shù)據(jù)和構(gòu)建模型,研究m6A相關(guān)基因與腫瘤預(yù)后的關(guān)系,結(jié)果表明METTL3在預(yù)測(cè)HCC的預(yù)后中有重要意義。有研究[12]基于腫瘤基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)數(shù)據(jù)庫,通過生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),METTL3高表達(dá)的患者存活率較低。單因素和多因素Cox回歸分析及受試者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲線下面積的計(jì)算結(jié)果顯示,METTL3可成為HCC預(yù)后指標(biāo)。通過獨(dú)立數(shù)據(jù)分析研究,METTL3和YTHDF1過表達(dá)與總生存率降低密切相關(guān),具有獨(dú)立預(yù)測(cè)HCC預(yù)后的意義[37-38]。HUANG等[39]通過建立由m6A相關(guān)基因組成的HCC預(yù)后模型,發(fā)現(xiàn)與正常組織相比,HCC中的METTL3等m6A基因表達(dá)存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,并與HCC的預(yù)后明顯相關(guān)。METTL3等m6A RNA甲基化調(diào)控子與HCC的世界衛(wèi)生組織(World Health Organization,WHO)分期顯著相關(guān),也是總生存率的獨(dú)立預(yù)后標(biāo)志物,其中METTL3是HCC惡性進(jìn)展的關(guān)鍵參與者,在預(yù)后和治療決策方面具有潛在價(jià)值[40]。WU等[41]通過分析374例HCC患者的基因表達(dá)特征,確定預(yù)測(cè)基因并進(jìn)行LASSO分析,最終開發(fā)了1種由METTL3、YTHDF2、YTHDF1、KIAA1429、ZC3H13組成的預(yù)后標(biāo)志物。HCC高危患者中風(fēng)險(xiǎn)基因(METTL3、KIAA1429、YTHDF1、YTHDF2)呈高表達(dá)狀態(tài),而保護(hù)性基因ZC3H13呈低表達(dá)狀態(tài),由此可從基因水平鑒別出HCC高危的患者。

4 展望

METTL3作為m6A甲基化修飾關(guān)鍵的調(diào)控基因,可通過介導(dǎo)MYC、Snail等基因的表達(dá),激活血管生成通路等途徑,在體內(nèi)發(fā)揮重要作用。已有多項(xiàng)研究[13-14]證實(shí),在前列腺癌、胃癌等腫瘤中,METTL3均存在異常表達(dá)。在HCC中,METTL3的表達(dá)多處于上調(diào)狀態(tài),且與HCC的病理分級(jí)呈正相關(guān)。機(jī)制研究[26]證實(shí),METTL3在HCC的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用,可通過調(diào)控腫瘤微循環(huán)模式促進(jìn)HCC的惡性轉(zhuǎn)歸。此外,METTL3在HCC中的高表達(dá)狀態(tài),也被證實(shí)可預(yù)測(cè)患者的不良預(yù)后。鑒于METTL3在HCC中的重要作用,目前已通過免疫治療方法調(diào)控METTL3,增強(qiáng)PD-1等藥物對(duì)HCC的療效,或降低肝癌對(duì)索拉菲尼的耐藥性,提高化療藥物的治療。然而,目前尚無針對(duì)METTL3的靶向藥物。在未來深入探究METTL3在HCC發(fā)生發(fā)展及治療中的作用機(jī)制,開發(fā)可靶向針對(duì)METTL3的化合物,或可為HCC的治療提供新的思路與方案。

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