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lncRNA PAX8-AS1 對結直腸癌細胞增殖、凋亡和侵襲的作用及其機制

2023-07-18 11:03:38閆圣玉劉昌化許志杰丁雅婷謝亞鋒劉菀瑩
吉林大學學報(醫學版) 2023年3期
關鍵詞:水平檢測

閆圣玉, 劉昌化, 許志杰, 丁雅婷, 謝亞鋒, 張 僑, 劉菀瑩

(1.南華大學衡陽醫學院附屬第二醫院肛腸科,湖南 衡陽 421000;2.南華大學衡陽醫學院附屬第二醫院胃腸外科,湖南 衡陽 421001)

結直腸癌(colorectal cancer,CRC)是一種常見的惡性腫瘤,其無特異臨床表現且生存時間與確診時疾病分期密切相關。CRC 在我國消化道腫瘤中發病率位于第3 位,且呈逐年上升的趨勢。為了提高CRC 治療效果、減少副作用并降低發生繼發性腫瘤的風險,仍需尋找更好的治療手段。因此針對CRC 發病特點的定點靶向治療對CRC 的治療和預后具有重要意義[1]。研究[2-3]發現:長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)參與CRC的發生發展,可介導CRC 細胞增殖、侵襲和轉移。lncRNA 配對盒8 反義RNA 1 (lncRNA PAX8-AS1)在鼻咽癌和乳頭狀甲狀腺癌組織中低表達,其過表達可抑制腫瘤細胞生長[4-5]。但也有研究[6]表明:PAX8-AS1 在非小細胞肺癌中過表達,其沉默可降低非小細胞肺癌的細胞增殖活性和遷移能力。PAX8-AS1 在CRC 組織中高表達,因此CRC細胞惡性生物學行為可能與PAX8-AS1 高表達有關聯。微小RNA (microRNA,miRNA)作為一種長度為18~25 個核苷酸的單鏈非編碼RNA,也參與了惡性腫瘤的不同過程,如在CRC 組織和細胞中,miR-22-3p 明顯下調,miR-22-3p 能夠通過介導RAS 癌基因家族成員RAP2B/磷脂酰肌醇 3-激酶(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B (protein kinase B,Akt)通路明顯抑制CRC細胞增殖和侵襲[7]。然而PAX8-AS1 是否通過miR-22-3p 介導CRC 的生物學行為尚未完全闡明。本研究探討PAX8-AS1 和miR-22-3p 在CRC 細胞中表達及其對CRC 細胞增殖、凋亡和侵襲的影響,并闡明其作用機制。

1 材料與方法

1.1 臨床資料選擇2018 年7 月—2020 年12 月在南華大學衡陽醫學院附屬第二醫院肛腸科行手術切除的94 例CRC 患者為研究對象,所有患者均經證實患有CRC,收集CRC 患者癌組織及對應癌旁組織(距癌灶邊緣>5 cm 取材)標本。根據國際抗癌聯盟(Union for International Cancer Control,UICC)制訂的TNM 分期第8 版標準[8]對CRC 患者進行臨床分期,其中Ⅰ~Ⅱ期35 例,Ⅲ~Ⅳ期59 例。

1.2 納入和排除標準納入標準:①初次診斷為CRC 者;②臨床資料完整;③依從性較好者;④生存時間超過6 個月。排除標準:①并發其他惡性腫瘤者;②患有自身免疫性疾病者;③精神疾病患者。本研究經本院倫理委員會批準,且所有患者知情并簽署同意書。

1.3 細胞、主要試劑和儀器人CRC 細胞(SW480、SW620、HT-29 和LoVo)購自中國科學院細胞庫,人正常結腸上皮細胞NCM460 購自武漢普諾賽生命科技有限公司。DMEM 和RPMI-1640 培養基(美國Hyclone 公司),胎牛血清(美國Gibco 公司),磷酸鹽(phosphate buffer solution,PBS)緩沖液、0.25%胰蛋白酶和DMSO(美國Sigma 公司),MTT 試劑盒(北京索萊寶科技有限公司),Annexin Ⅴ-FITC/PI 凋亡檢測試劑盒(上海碧云天生物技術有限公司),TRIzol 試劑(美國Ambion 公司),SYBR FAST qPCR Master Mix(美國KAPA Biosystems 公司),ECL 顯影液(美國Millipore 公司),兔抗人B 細胞淋巴瘤2(B-cell lymphoma-2,Bcl-2)抗體、兔抗人Bcl-2 相關 X 蛋白(Bcl-2-associated X protein,Bax)抗體、兔抗人cleaved Caspase-3 抗體和兔抗人甘油醛-3-磷酸脫氫酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)抗體(英國Abcam 公司),HRP 標記羊抗兔二抗(武漢愛博泰克生物科技有限公司),小分子si-PAX8-AS1 和miRNA-22-3p 抑制劑(miR-22-3p inhibitors)均由廣州銳博生物科技有限公司合成,雙熒光素酶報告基因檢測質粒由北京擎科生物技術有限公司合成。倒置顯微鏡(型號:DMIL LED,德國Leica 公司),酶標儀(型號:AMR-100,杭州奧盛儀器有限公司),流式細胞儀(型號:Accuri C6,美國BD 公司),實時熒光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,RTqPCR)儀(型號:CFX-Connect 96,美國Bio-Rad公司),全自動化學發光分析儀(型號:Tanon-5200,上海天能科技有限公司)。

1.4 細胞轉染和分組取凍存的人CRC 細胞(SW480、SW620、HT-29 和LoVo)和人正常結腸上皮細胞NCM460 復蘇后,NCM460 細胞采用含10%胎牛血清的DMEM 培養基培養,CRC 細胞采用含10%胎牛血清的RPMI-1640 完全培養基培養,置于37 ℃、5%CO2的培養箱內,培養2~3 d傳代1 次。

取對數生長期SW480 細胞,以每孔1×104個細胞的密度接種于24 孔細胞培養板中。待細胞生長融合至80%時,采用LipofectamineTM2000 轉染試劑將si-PAX8-AS1 及其小分子序列陰性對照(siRNA-negative control,si-NC)分別或同時與miR-22-3p inhibitors 及其小分子抑制劑陰性對照(inhibitors negative control,inhibitors NC)轉染至細胞中,分為si-NC 組(轉染陰性序列)、si-PAX8-AS1 組 (轉染 PAX8-AS1 siRNA)、si-PAX8-AS1+inhibitors NC 組(共轉染PAX8-AS1 siRNA 和 inhibitors NC)和 si-PAX8-AS1+inhibitors 組(共轉染PAX8-AS1 siRNA 和miR-22-3p inhibitors),另取未經任何轉染的SW480細胞作為對照組。轉染48 h后收集各組細胞沉淀用于后續實驗。

1.5 RT-qPCR 法檢測CRC 患者癌組織、細胞和各組SW480 細胞中PAX8-AS1 mRNA 和miR-22-3p表達水平收集CRC 患者癌組織、癌旁組織及細胞,采用TRIzol 試劑提取癌組織和各組細胞總RNA,逆轉錄試劑盒將RNA 反轉錄合成cDNA,以cDNA 為模板,采用RT-qPCR 儀進行PCR 擴增,反應總體積20 μL (SYBR FAST qPCR Master Mix:10 μL,上、下游引物各0.5 μL,cDNA:1 μL,DNase/RNase-Free water:8 μL),反應條件及過程:95 ℃預變性3 min,95 ℃變性5 s,56 ℃退火10 s,72 ℃延伸25 s,40 個循環,每個樣本設3 個復孔。采用2-ΔΔCt法計算目的基因mRNA 表達水平。引物序列見表1。

表1 PCR 引物序列Tab.1 Primer sequences of PCR

1.6 MTT 法檢測各組細胞增殖活性取轉染后的各組細胞,以 1×103mL-1的密度接種于96 孔細胞培養板中,分別于培養 24、48 和72 h 后,吸去原培養基,每孔加入20 μL MTT 充分混勻,室溫培養4 h,每孔加入 100 μL DMSO混勻,培養15 min,于酶標儀上檢測波長490 nm 處吸光度(A)值,以A(490)值代表細胞增殖活性。

1.7 流式細胞術檢測各組細胞凋亡率取轉染后的各組細胞,以1.5×104mL-1的細胞密度接種于6 孔細胞培養板中,培養24 h 后收集細胞,500 g 離心5 min,棄上清,加入1 mL 預冷PBS 緩沖液重懸,500 g 離心5 min,棄上清,加入500 μL 1×Binding Buffer 重懸細胞,避光條件下加入 5 μL Annexin Ⅴ-FITC 混勻,再加入10 μL PI 混勻,室溫避光孵育15 min,采用流式細胞儀檢測細胞凋亡率。細胞凋亡率=凋亡細胞數/總細胞數×100%。

1.8 Transwell 小室實驗檢測各組細胞遷移和侵襲率取轉染后的各組細胞,無血清培養液重懸細胞,調整細胞濃度至1.0×105mL-1,取100 μL接種于Transwell 上室,下室加入含血清培養液,培養48 h,棄去培養液,棉簽擦去上層細胞,甲醛固定,加入結晶紫染色30 min,漂洗干燥,用棉簽小心擦去Transwell 小室中未遷移細胞,置于200 倍顯微鏡下觀察,計數每個視野中遷移細胞數。采用基質膠包被Transwell 上室,其余操作同遷移實驗,計數侵襲細胞數,并計算各組細胞遷移和侵襲率。細胞遷移率=遷移細胞數/接種細胞數×100%;細胞侵襲率=侵襲細胞數/接種細胞數×100%。

1.9 Western blotting 法檢測各組細胞中Bcl-2、Bax 和cleaved Caspase-3 蛋白表達水平收集轉染后各組細胞,RIPA 裂解液提取細胞全蛋白。采用BCA 法測定蛋白濃度,取25 μg 蛋白配置上樣體系,沸水浴變性后采用SDS-PAGE 凝膠電泳分離蛋白,電泳分離后通過濕轉法將蛋白轉移至PVDF膜上,5 %脫脂奶粉于室溫條件下封閉2 h,分別加入一抗Bcl-2 (1∶2 000)、Bax (1∶2 000)、cleaved Caspase-3 (1∶1 000)和GAPDH (1∶5 000),于4 ℃孵育過夜。洗膜后,采用HRP 標記的羊抗兔二抗于室溫條件下孵育1 h;洗膜后,采用ECL 發光試劑盒A 液和B 液等比混勻,在凝膠成像系統中顯影。采用Image J Plus 7.0 分析蛋白條帶灰度值,以GAPDH 為內參,計算目的蛋白表達水平。目的蛋白表達水平=目的蛋白條帶灰度值/內參蛋白條帶灰度值。

1.10 雙熒光素酶報告基因實驗驗證PAX8-AS1 與miR-22-3p 的靶向關系采用生物信息學網站Target San 預測PAX8-AS1 與miR-22-3p 的靶向關系。將PAX8-AS1 野生型(WT)和突變型(MUT)基因靶點熒光素酶表達載體分別與mimics NC 和miR-22-3p mimics 共轉染至SW480 細胞中,轉染48 h 后采用酶標儀檢測螢火蟲熒光素酶熒光強度(F)值和海腎熒光素酶熒光強度(R)值,計算各組細胞熒光素酶活性。熒光素酶活性=F 值/R 值。

1.11 統計學分析采用SPSS 22.0 統計軟件進行統計學分析。CRC 組織及癌旁組織中PAX8-AS1 mRNA 和 miR-22-3p 表達水平,各組細胞增殖活性、細胞凋亡率、細胞遷移率和細胞侵襲率,各組細胞中Bcl-2、Bax 和 cleaved Caspase-3 蛋白表達水平和熒光素酶活性均符合正態分布,以±s 表示,多組間樣本均數比較采用單因素方差分析,組間樣本均數兩兩比較采用LSD-t檢驗。以P<0.05為差異有統計學意義。

2 結 果

2.1 CRC 組織和細胞中PAX8-AS1 mRNA 和miR-22-3p 表達水平RT-qPCR 結果顯示:與癌旁組織比較,CRC 組織中PAX8-AS1 mRNA 表達水平明顯升高(P<0.01),miR-22-3p 表達水平明顯降低(P<0.01)。與NCM460 細胞比較,SW480、SW620、HT-29 和LoVo 細胞中PAX8-AS1 mRNA表達水平明顯升高(P<0.05 或P<0.01),miR-22-3p 表達水平明顯降低(P<0.05 或P<0.01),其中以SW480 細胞中表達水平差異最為明顯。見圖1 和2。

圖1 CRC 患者癌組織和癌旁組織中PAX8-AS1 mRNA 和miR-22-3p 表達水平Fig.1 Expression levels of PAX8-AS1H mRNA and miR-22-3p in cancer tissue and adjacent tissue of CRC patients

圖2 各種細胞中PAX8-AS1 mRNA 和miR-22-3p 表達水平Fig.2 Expression levels of PAX8-AS1 mRNA and miR-22-3p in different kinds of cells

2.2 各組SW480 細胞中PAX8-AS1 mRNA 和miR-22-3p 表達水平與對照組和si-NC 組比較,si-PAX8-AS1 組細胞中PAX8-AS1 mRNA 表達水平明顯降低(P<0.01),miR-22-3p 表達水平明顯升高(P<0.01)。與si-NC 組比較,si-PAX8-AS1+ inhibitors NC 組細胞中miR-22-3p 表達水平明顯升高(P<0.01),si-PAX8-AS1+inhibitors 組細胞中miR-22-3p 表達水平差異無統計學意義(P>0.05)。見圖3。

圖3 各組SW480 細胞中PAX8-AS1 mRNA 和miR-22-3p 表達水平Fig.3 Expression levels of PAX8-AS1 mRNA and miR-22-3p in SW480 cells in various groups

2.3 不同時間點各組SW480 細胞增殖活性

MTT 法檢測結果顯示:與對照組比較,si-PAX8-AS1 組、si-PAX8-AS1+inhibitors NC 組和si-PAX8-AS1+inhibitors 組細胞在培養48 和72 h 時細胞增殖活性均明顯降低(P<0.01)。與si-NC 組比較,si-PAX8-AS1 組和si-PAX8-AS1+ inhibitors NC 組細胞在培養48 和72 h 時細胞增殖活性均明顯降低(P<0.01),si-PAX8-AS1+inhibitors 組細胞在培養24、48 和72 h 時細胞增殖活性差異無統計學意義(P>0.05)。見圖4。

圖4 不同時間點各組SW480 細胞增殖活性Fig.4 Proliferation activities of SW480 cells at different time points in various groups

2.4 各組SW480 細胞凋亡率流式細胞術檢測結果顯示:與對照組比較,si-PAX8-AS1 組細胞凋亡率明顯升高(P<0.01)。與si-NC 組比較,si-PAX8-AS1 組和si-PAX8-AS1+ inhibitors NC 組細胞凋亡率明顯升高(P<0.01)。見圖5。

圖5 各組SW480 細胞凋亡率Fig.5 Apoptotic rates of SW480 cells in various groups

2.5 各組細胞遷移率和侵襲率Transwell 實驗結果顯示:與對照組比較,si-PAX8-AS1 組細胞遷移率和侵襲率明顯降低(P<0.01)。與si-NC 組比較,si-PAX8-AS1 組和si-PAX8-AS1+ inhibitors NC 組細胞遷移率和侵襲率明顯降低(P<0.01),si-PAX8-AS1+inhibitors 組細胞遷移率和侵襲率差異無統計學意義(P>0.05)。見圖6。

圖6 各組細胞侵襲和遷移率Fig.6 Migration and invasion rates of cells in various groups

2.6 各組SW480 細胞中Bcl-2、Bax 和cleaved Caspase-3 蛋白表達水平Western blotting 法檢測結果顯示:與對照組和si-NC 組比較,si-PAX8-AS1 組SW480 細胞中Bax 和cleaved Caspase-3 蛋白表達水平明顯升高(P<0.01),Bcl-2 蛋白表達水平降低(P<0.05)。見圖7。

圖7 各組SW480 細胞中Bcl-2、Bax 和cleaved Caspase-3 蛋白表達電泳圖(A)和直條圖(B)Fig.7 Electrophoregram (A) and histogram(B) of expressions of Bcl-2, Bax and cleaved Caspase-3 proteins in SW480 cells in various groups

2.7 PAX8-AS1 和miR22-3p 的靶向關系和各組細胞中熒光素酶活性生物信息學網站TargetScan 預測顯示:PAX8-AS1 與miR22-3p 存在靶向結合位點。雙熒光素酶報告基因實驗結果顯示:與共轉染mimics NC 的細胞比較,共轉染miR-22-3p mimics的PAX8-AS1-WT 細胞中熒光素酶活性明顯降低(P<0.01),而共轉染miR-22-3p mimics PAX8-AS1- MUT 細胞中熒光素酶活性差異無統計學意義(P>0.05)。見圖8。

圖8 各組細胞中熒光素酶活性Fig.8 Lucriferase activities of cells in various groups

3 討 論

CRC 是全球最常見的癌癥之一,由于其在全球范圍內的高發病率和高死亡率,CRC 已成為全球公共衛生問題[9]。尋找CRC 特異性腫瘤標志物和治療靶點對于 CRC 早期檢測和預后預測的準確性具有重要意義。

由于高通量基因組測序工具的發展,發現新的 lncRNAs 通常與癌癥有關,特別是與 CRC 有關。在生理條件下,lncRNA 調節基因表達、表觀遺傳印記或可變剪接,充當原癌基因或腫瘤抑制基因[10]。研究[11]表明:lncRNA 與人類疾病密切相關。作為癌基因或抑癌基因,lncRNA 表達失調與癌癥的進展密切相關,其可以調節上皮間質轉化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)、細胞轉移、凋亡、遷移和侵襲[12-16]。本研究結果顯示:PAX8-AS1 在 CRC 組織和細胞中高表達。si-PAX8-AS1 轉染的CRC 細胞增殖、遷移和侵襲能力受到抑制,凋亡增加。表明PAX8-AS1 在CRC 中作為癌基因影響腫瘤細胞的惡性生物學行為。

研究[17-18]表明:miR-22-3p 作為抑癌基因,在CRC 組織中明顯下調,并在體外抑制 CRC 細胞增殖、集落形成、細胞遷移和侵襲能力,在體內抑制 CRC 異種移植腫瘤的生長。本研究結果顯示:miR-22-3p 在 CRC 組織和細胞中低表達,與PAX8-AS1 基因高表達呈負相關關系。通過抑制PAX8-AS1 基因的表達,抑制了CRC 細胞的增殖、遷移和侵襲能力,且促進了miR-22-3p 表達水平。提示PAX8-AS1 與miR-22-3p 可能存在靶向調控關系。

研究[19]表明:lncRNA 通過海綿化miRNAs參與內源競爭RNA(competing endogenous RNAs,ceRNAs)。lncRNA HULC 過表達通過海綿化miR-372 促進肝癌的發展和癌細胞侵襲[20]。此外,lncRNA RP4 充當miR-7-5p 的ceRNA 以調控CRC進展[21]。本研究通過生物信息學分析發現PAX8-AS1 可能靶向miR-22-3p。通過熒光素酶報告基因實驗驗證PAX8-AS1 與miR-22-3p 之間的直接相互作用。抑制PAX8-AS1 表達能夠促進 miR-22-3p 表達上調,并進一步抑制CRC 細胞增殖、遷移和侵襲能力,誘導細胞凋亡。

綜上所述,PAX8-AS1 通過海綿化吸附 miR-22-3p 對CRC 細胞增殖、凋亡及侵襲產生影響,調控CRC 進展。本研究結果為PAX8-AS1 作為CRC的治療靶點提供了新的理論依據。

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