馬小雯,范明偉,杜江
(中國醫科大學 1.基礎醫學院病理學教研室;2.臨床二系106期,沈陽 110122)
肺癌是全球發病率最高的癌癥,嚴重影響人類健康[1]。肺腺癌是肺癌的主要組織學亞型,發病率逐年增加,其5年生存率僅約為 15%,絕大多數患者在診斷時已為晚期[2]。因此,尋找肺腺癌的預后標志物和治療靶點至關重要。
p53是一種經典的抑癌基因,被稱為“基因組守護者”,其在保持基因組完整性方面具有關鍵作用[3-4]。p53在肺癌患者中被認定為早期診斷標志物[5]。當細胞受到外界環境刺激時,p53可以介導細胞周期阻滯,從而導致細胞衰老或細胞凋亡[6]。GADD45是p53的靶基因,已被證明其可以在G2/M細胞周期檢查點抑制細胞周期進程。GADD45在G2/M檢查點通過抑制細胞周期特異性激酶CyclinB1和CDC2來阻滯細胞周期[7]。鋅指蛋白502 (zinc finger protein 502,ZNF502) 是C2H2型鋅指蛋白家族成員,定位于人類染色體3p21.31。LI等[8]研究顯示ZNF502可能是抑郁癥的易感基因,截至目前,ZNF502在惡性腫瘤組織中的表達模式和生物學功能尚不清楚。
本研究采用生物信息學分析方法和Western blotting實驗探討ZNF502在肺腺癌患者中的表達模式,利用一系列細胞功能實驗探究ZNF502對肺腺癌細胞增殖能力的影響,為進一步研究ZNF502在肺腺癌發生發展中的具體作用機制提供線索和依據。
1.1.1 TCGA數據庫:采用仙桃學術在線網站(https://www.xiantao.love/products) 對TCGA數據庫中肺腺癌數據集進行表達差異和預后相關性分析。
1.1.2 GEPIA數據庫:采用GEPIA數據庫 (http://gepia.cancer-pku.cn/detail.php) 對ZNF502和TP53mRNA的表達相關性進行預測。設置篩選條件為 (1) Gene:ZNF502,TP53;(2) Datasets selection:BRCA;(3) Correlation Coefficient:Person。
1.1.3 Linkedomics在線網站:應用Linkedomics (http://www.linkedomics.org/login.php) 對ZNF502進行基因集富集分析 (Gene Set Enrichment Analysis,GSEA) 。
永生人支氣管上皮細胞系HBE,人類肺腺癌細胞系H1299、LK2,A549購自武漢普諾賽 (中國Procell公司)。所有細胞均使用RPMI-1640 (美國Invitrogen公司) 培養,培養基中添加10% 胎牛血清 (美國Invitrogen公司),1%青霉素和鏈霉素 (美國Sigma-Aldrich公司)。所有細胞均置于溫度37 ℃,5% CO2的細胞培養箱中。所有細胞系均采用短串聯重復序列(short tandem repeat,STR) 進行鑒定,無支原體污染。
過表達質粒pCMV6-ZNF502-Myc-DDK和對照質粒PCMV6購自美國Origene公司。敲除序列pLV2-U6-ZNF502-sgRNA-cas9-GFP由吉凱基因 (中國吉凱基因公司) 設計。轉染均使用lipo3000(美國Invitrogen公司)。
采用NP40裂解液 (中國碧云天公司) 從細胞中提取總蛋白。12 000 r/min,4 ℃離心保留上清液,并使用BCA試劑盒定量 (中國碧云天公司)。100 ℃金屬浴加熱樣品5 min,使蛋白質變性。采用10% SDSPAGE分離40 μg蛋白,100 V,60 min將蛋白轉印到PVDF膜 (美國Millipore公司) 上。5%的脫脂奶粉室溫封閉PVDF膜2 h后,在4 ℃與以下抗體孵育過夜:ZNF502、GAPDH、P53、CyclinB1、CDK1、GADD45a和Myc-tag (均以1∶1 000稀釋,美國Abcam公司)。24 h后將PVDF膜與以1∶3 000稀釋的辣根過氧化物酶偶聯抗小鼠IgG和抗兔IgG (中國碧云天公司) 室溫孵育2 h。增強化學發光法 (electrochemiluminescence,ECL) 檢測蛋白表達,采用ChemiDoc Imaging System進行采集圖像。采用GAPDH作為對照來計算相對蛋白表達量。
在細胞傳代培養時,將細胞接種到預先放置蓋玻片的24孔板中,待細胞融合率接近80%時,磷酸鹽緩沖液清洗2次。室溫下用4% 多聚甲醛敷育細胞10 min,0.5% Triton X-100通透液室溫下敷育細胞10 min,使用含有3% 牛血清白蛋白的磷酸鹽緩沖液封閉細胞2 h。將細胞與溶有ZNF502抗體 (1∶100) 的磷酸鹽緩沖液在4°C下孵育過夜。24 h后將細胞使用磷酸鹽緩沖液洗滌2次,與熒光二抗Alexa Fluor 488或Alexa Fluor 594 (1∶50,中國碧云天公司) 在室溫下孵育1 h,避光。最后,用含4,6-二氨基-2-苯基吲哚 (4,6-diamino-2-phenyl indole,DAPI) 的封片劑染色細胞核10 min。將細胞爬片使用共聚焦顯微鏡獲取圖像。實驗重復3次以上。
培養過表達ZNF502的A549細胞和敲除ZNF502的LK2細胞到對數生長期。取96孔細胞培養板,每孔加入0.1 mL 2 000個上述細胞的RPMI1640培養液,設置5個復孔。在37 ℃ 5%CO2的培養箱中分別培養24、48、72和96 h后,每孔加入20 μL MTS,繼續培養1.5 h后進行顯色。在酶聯檢測儀波長490 nm處檢測各孔吸光度 (optical density,OD)。實驗重復3次以上。
培養過表達ZNF502的A549細胞和敲除ZNF502的LK2細胞到對數生長期。在6孔板每個孔中加入1 000個細胞,放入CO2培養箱培養。1周后,當肉眼可見集落形成時,取出6孔板。每孔加入1 mL冰甲醇固定15 min后,加入結晶紫染色10 min,自來水反藍。計數集落,實驗重復3次以上。
培養過表達ZNF502的A549細胞和敲除ZNF502的LK2細胞至融合率為70%~80%時,用20 μmol/L的EdU溶液 (中國雅酶生物公司) 在37 ℃ 5% CO2培養箱中孵育細胞1 h后,棄培養基。用磷酸鹽緩沖液清洗細胞3次之后,所有步驟按照免疫熒光實驗進行。
采用SPSS 22.0軟件進行統計分析,組間差異采用t檢驗。采用Kaplan-Meier法和多因素Cox回歸法分析ZNF502與生存預后的關系。P< 0.05為差異有統計學意義。所有實驗至少重復3次。
對TCGA公共數據庫中的多種癌和癌旁樣本進行差異分析。結果顯示,ZNF502在多種腫瘤組織中的mRNA表達水平顯著低于癌旁組織 (圖1A)。且在配對的肺腺癌組織中表達顯著低于癌旁組織 (P<0.01,圖1B)。肺腺癌細胞系A549,H1299和LK2中ZNF502的蛋白水平明顯低于正常支氣管上皮細胞HBE (圖1C)。本研究選取表達量最低的A549細胞系進行后續的過表達實驗,選取表達量相對較高的LK2細胞進行后續的敲除實驗。免疫熒光實驗結果顯示,內源和外源的ZNF502均主要表達于肺腺癌細胞的細胞核中 (圖1D)。

圖1 ZNF502在肺腺癌組織和細胞中低表達Fig.1 ZNF502 was low expressed in lung adenocarcinoma tissues and cells
對TCGA數據庫中的肺腺癌患者臨床數據進行Kaplan-Meier生存分析。結果顯示,ZNF502高表達的肺腺癌患者總體生存期 (overall survival,OS) 和疾病特異性生存期 (disease specific survival,DSS) 顯著高于ZNF502低表達的患者,且風險比率 (hazard ratio,HR) 均<1 (P= 0.014和P= 0.018,圖2A、2B)。將患者按ZNF502的mRNA表達量分群并繪制風險因子圖,發現ZNF502高表達的患者存活更多且有更低的風險評分 (圖2C)。接下來對肺腺癌相關的臨床病理因素和ZNF502的表達進行多因素Cox分析,結果顯示,ZNF502可以作為評價肺腺癌預后的獨立保護因素。ZNF502可以聯合T分期和N分期作為肺腺癌的預后評價因子 (HR=0.738,P< 0.001,圖2D)。

圖2 ZNF502高表達患者預后良好Fig.2 A high level of ZNF502 expression was associated with a good prognosis
利用linkedomics網站進行在線GSEA富集分析,結果顯示,ZNF502主要與細胞周期、帕金森病和泛素化等通路呈負相關 (圖3A、3B)。對TCGA數據庫的肺腺癌數據集進行通路相關性分析,ZNF502與G2/M檢查點通路顯著負相關 (P= 0.013,圖3C)。結果顯示,ZNF502可能通過調控細胞周期來影響患者的預后。細胞周期主要控制細胞的增殖能力。Western blotting實驗結果顯示,ZNF502在A549細胞中被成功過表達,在LK2細胞中被成功敲除 (圖3D)。MTS、集落形成實驗和EdU增殖實驗結果顯示,過表達ZNF502顯著抑制肺腺癌細胞的增殖能力。而敲除ZNF502則顯著增強肺腺癌細胞的增殖能力 (圖3E~3G)。

圖3 ZNF502過表達抑制肺腺癌細胞增殖Fig.3 Overexpression of ZNF502 inhibited the proliferation of lung adenocarcinoma cells
利用GEPIA網站對ZNF502和下游基因進行相關性分析,結果顯示,ZNF502和TP53的表達呈正相關(r= 0.14,P= 0.001 4,圖4A)。接下來在過表達ZNF502的A549細胞中檢測p53下游蛋白表達水平。Western blotting實驗結果顯示,p53,GADD45a表達明顯上升,而G2/M檢查點關鍵蛋白CyclinB1和CDK1表達明顯下降 (圖4B)。在ZNF502敲除的LK2細胞中,上述蛋白表達量的變化恰恰相反 (圖4C)。過表達ZNF502可能通過激活p53-GADD45a通路抑制細胞G2/M轉化,從而抑制肺腺癌細胞的增殖能力。

圖4 ZNF502通過激活p53通路抑制細胞周期Fig.4 ZNF502 inhibited the cell cycle by activating the p53 pathway
ZNF502是鋅指蛋白轉錄因子家族的成員,其在肺癌中的表達模式和生物學功能仍未有文獻報道。此外,ZNF502表達與患者預后之間的相關性也未見文獻報道。本研究結果顯示,與癌旁組織相比,ZNF502在肺腺癌組織中的表達相對較低。ZNF502主要定位在細胞核中發揮生物學功能。此外,ZNF502的高表達與患者的良好預后呈正相關,ZNF502或許可以作為一個新的評價肺腺癌良好預后的標志物。而且,ZNF502mRNA的表達可以作為評估為肺腺癌進展的獨立保護因素。
GSEA富集分析以及一系列檢測細胞增殖能力的功能學實驗表明,ZNF502可能通過調節p53信號通路來抑制細胞增殖能力。ZNF502和TP53的表達呈正相關。p53已被證實是調控細胞周期的上游關鍵因子,發揮抑制腫瘤細胞增殖的作用[9-10]。野生型p53的高表達與腫瘤放化療敏感性和良好預后密切相關。在基因組受到外界損傷時,p53響應外界刺激,介導細胞周期阻滯,開啟DNA損傷修復通路。當基因組損傷不可修復時,p53主要開啟細胞凋亡通路,引導細胞程序性死亡[11-12]。
本研究進一步采用Western blotting檢測p53通路關鍵下游蛋白。結果顯示,ZNF502通過上調p53的表達水平,激活下游關鍵因子GADD45a,從而使細胞周期阻滯在G2/M檢查點。突變型p53在腫瘤中將發揮與野生型p53截然不同的功能[13]。臨床約有50%的肺癌患者存在p53突變。p53蛋白可以發揮轉錄因子的功能,其突變位點主要位于中央的DNA結合結構域。R175、G245、R248、R249、R273和R282是最常見的6個錯義突變位點。突變的p53半衰期明顯延長,不再具有野生型p53抑制細胞增殖的能力。突變型p53誘導上皮-間充質轉化,放化療抵抗在腫瘤細胞的侵襲和轉移中起關鍵作用[14]。本研究中使用的A549和LK2細胞都不存在p53突變,僅檢測了ZNF502對野生型p53的調控作用,ZNF502對突變型p53的影響將在未來的實驗中進一步探究。
綜上所述,ZNF502在肺腺癌組織中顯著低表達,主要定位于細胞核中且與肺腺癌患者的良好預后呈正相關。ZNF502通過激活p53-GADD45a通路抑制細胞G2/M轉化,從而抑制肺腺癌細胞的增殖能力。