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環(huán)狀RNA circ_0010423 在宮頸癌中的表達(dá)及臨床意義△

2023-12-20 05:58:32毛雪寶王秀虹邱彬李美靈馬丹蔣金朋
癌癥進(jìn)展 2023年19期
關(guān)鍵詞:水平檢測

毛雪寶,王秀虹,邱彬,李美靈,馬丹,蔣金朋

咸寧市中心醫(yī)院(湖北科技學(xué)院附屬第一醫(yī)院)婦科,湖北咸寧 437100

當(dāng)前宮頸癌已被列為全球范圍內(nèi)最常見的惡性腫瘤之一,在女性腫瘤死亡原因中居第四位[1]。流行病學(xué)資料顯示,約85%的宮頸癌發(fā)生在低收入地區(qū)和國家[2]。高危型人乳頭瘤病毒(human papilloma virus,HPV)感染與宮頸癌的發(fā)生密切相關(guān),約95%的腫瘤組織中已鑒定出HPV 基因組,其中HPVE7和E6基因整合到宿主基因組被認(rèn)為是宮頸癌發(fā)生發(fā)展的關(guān)鍵步驟[3]。目前,接種HPV 疫苗是預(yù)防宮頸癌最直接有效的方法,但各國由于醫(yī)療負(fù)擔(dān)的不同尚未能實(shí)現(xiàn)有效推廣。宮頸癌早期臨床癥狀與宮頸炎十分相似,因而容易漏診,而當(dāng)確診時(shí)往往已處于中晚期,預(yù)后不佳[4]。因此,探究高靈敏度和特異度的無創(chuàng)生物標(biāo)志物對宮頸癌的早期篩查、診斷、治療和預(yù)后監(jiān)測具有重要意義。

環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)是近年來發(fā)現(xiàn)的一類具有共價(jià)閉合環(huán)結(jié)構(gòu)的內(nèi)源性非編碼RNA,經(jīng)證實(shí)其在宮頸癌的發(fā)生發(fā)展中具有關(guān)鍵的調(diào)控作用[5]。circ_0010423 來源于親本基因磷酸酶張力蛋白同源物誘導(dǎo)激酶1(phosphatase and tensin homolog induced kinase 1,PINK1),位于人染色體chr1:20966384-20971165 區(qū)域,由其第3 和4 號(hào)外顯子頭尾剪接拼接形成,長度為284 bp。作為一種新的circRNA,目前尚無研究報(bào)道circ_0010423與宮頸癌的關(guān)系。研究組前期通過生物信息學(xué)分析基因表達(dá)綜合(Gene Expresion Omnibus,GEO)數(shù)據(jù)庫中有關(guān)宮頸癌的circRNA 微陣列表達(dá)譜發(fā)現(xiàn),circ_0010423 在宮頸癌中高表達(dá)。本研究驗(yàn)證circ_0010423 在宮頸癌中的表達(dá)水平,分析臨床意義,并探討其與宮頸癌患者預(yù)后的關(guān)系,以期為改善該病的診療提供相關(guān)理論依據(jù),現(xiàn)報(bào)道如下。

1 資料與方法

1.1 一般資料

收集2015 年1 月至2017 年12 月咸寧市中心醫(yī)院收治的宮頸癌患者的病歷資料。納入標(biāo)準(zhǔn):經(jīng)病理檢查證實(shí)為宮頸癌;術(shù)后隨訪依從性好;病歷資料完整。排除標(biāo)準(zhǔn):其他部位腫瘤伴宮頸轉(zhuǎn)移;因嚴(yán)重肝、腎、心及肺功能不全,凝血功能障礙,血糖、血壓控制不良等無法耐受手術(shù);嚴(yán)重精神障礙;無手術(shù)治療意愿。根據(jù)納入、排除標(biāo)準(zhǔn),共納入180 例宮頸癌患者,年齡33~74 歲,平均(56.08±12.07)歲,<60歲77例,≥60歲103例;腫瘤大小:<4 cm 125 例,≥4 cm 55 例;組織學(xué)類型:鱗狀細(xì)胞癌148 例,腺癌32 例;分化程度:高分化140 例,低分化40 例;高危型HPV 感染:無115 例,有65 例;宮頸浸潤:<2/3 53 例,≥2/3 127 例;淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移:無68例,有112 例;國際婦產(chǎn)科聯(lián)盟(International Federation of Gynecology and Obstetrics,F(xiàn)IGO)分期:Ⅰ~Ⅱ期61例,Ⅲ~Ⅳ期119例;糖類抗原125(carbohydrate antigen 125,CA125):<35 U/ml 87 例,≥35 U/ml 93 例;鱗狀上皮細(xì)胞癌抗原(squamous cell carcinoma antigen,SCC-Ag):<4 μg/L 46 例,≥4 μg/L 134例。取180 例宮頸癌患者的宮頸癌組織和癌旁組織。本研究經(jīng)醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)通過,所有患者均知情同意。

1.2 檢測方法

1.2.1 離心吸附柱法提取樣本中總RNA 取出液氮中保存的組織塊10~20 mg,加入300 μl 裂解液(含β-巰基乙醇),剪碎組織塊并用研磨杵徹底研磨。加入590 μl ddH2O 和10 μl 蛋白酶K,56 ℃放置15 min,13 000 r/min 離心5 min,取上清。上清中加入0.5 倍體積的無水乙醇,混勻后置于吸附柱中,13 000 r/min 離心60 s。首先吸附柱中添加350 μl去蛋白液RW1,13 000 r/min 離心60 s。隨后吸附柱中添加80 μl 的DNase Ⅰ工作液,37 ℃放置15 min,并加入350 μl 去蛋白液RW1,13 000 r/min離心60 s。然后吸附柱中加入500 μl 漂洗液RW,37 ℃靜置2 min,13 000 r/min 離心60 s。最后將吸附柱轉(zhuǎn)入一個(gè)新的離心管中,加入50 μl ddH2O,37 ℃靜置2 min,13 000 r/min 離心2 min,即得到總RNA,并測定純度與濃度。

1.2.2 隨機(jī)引物法進(jìn)行互補(bǔ)DNA 合成 取微型離心管,依次加入1 μl 隨機(jī)引物(50 ng/μl)、1 μl dNTP mix(10 mmol/L)、2 μg 總RNA 以及適量ddH2O 至總體積為13 μl,充分混勻,65 ℃反應(yīng)5 min,然后放置冰上至少1 min。隨后向離心管中依次加入4 μl 5×SSIV Buffer、1 μl 100 mmol/L 二硫蘇糖醇、1 μl 核糖核酸酶抑制劑以及1 μl Super-Script?Ⅳ反轉(zhuǎn)錄酶(200 U/μl),充分混勻,23 ℃反應(yīng)10 min,53 ℃反應(yīng)10 min,80 ℃反應(yīng)10 min,即得到互補(bǔ)DNA,并放置-20 ℃保存。

1.2.3 實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(poIymerase chain reaction,PCR)法檢測circ_0010423、基質(zhì)金屬蛋白酶(matrix metaIIoproteinase,MMP)2、MMP9mRNA 水平 取微型離心管,依次加入12.5 μl 2×TB Green Premix Ex Taq ⅡROX plus buffer、1 μl 上游引物(10 μmol/L)、1 μl 下游引物(10 μmol/L)、2 μl 互補(bǔ)DNA(<100 ng)以及8.5 μl ddH2O至總體積為25 μl,充分混勻。95 ℃反應(yīng)30 s,一個(gè)循環(huán);95 ℃反應(yīng)5 s,60 ℃反應(yīng)45 s,40 個(gè)循環(huán);72 ℃反應(yīng)5 min,4 ℃反應(yīng)20 min,一個(gè)循環(huán)。引物由生工生物工程公司合成,circ_0010423 上游:5'-GTCGACTACCCTGATGTGCT-3',下游:5'-GTAAGTGACTGCTCCATACTCC-3';MMP2上游:5'-TACAGGATCATTGGCTACACACC-3',下游:5'-GGTCACATCGCTCCAGACT-3';MMP9上游:5'-TGTACCGCTATGGTTACACTCG- 3',下游:5'-GGCAGGGACAGTTGCTTCT-3';GAPDH上游:5'-GGAGCGAGATCCCTCCAAAAT- 3',下游:5'-GGCTGTTGTCATACTTCTCATGG-3'。以GAPDH為內(nèi)參對照,并使用2-ΔΔCt法計(jì)算樣本中circ_0010423、MMP2及MMP9mRNA 表達(dá)水平。

1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

采用SPSS 26.0 統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,GraphPad Prism 5.0 軟件制圖。計(jì)量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,組間比較采用t檢驗(yàn);采用Kaplan-Meier 生存曲線和Log-rank 檢驗(yàn)分析circ_0010423 表達(dá)與預(yù)后的關(guān)系;采用受試者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲線分析circ_0010423、CA125、SCC-Ag 檢測對宮頸癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移與宮頸浸潤的診斷價(jià)值,并計(jì)算曲線下面積(area under the curve,AUC);相關(guān)分析采用Pearson 相關(guān)性分析;以P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 宮頸癌組織和癌旁組織中circ_0010423 表達(dá)水平的比較

實(shí)時(shí)熒光定量PCR 檢測結(jié)果顯示,宮頸癌組織中circ_0010423 表達(dá)水平為(0.611±0.154),明顯高于癌旁組織的(0.394±0.107),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=15.253,P<0.01)。

2.2 不同臨床特征宮頸癌患者宮頸癌組織中circ_0010423 表達(dá)水平的比較

有高危型HPV 感染、宮頸浸潤≥2/3、有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及FIGO 分期為Ⅲ~Ⅳ期的宮頸癌患者宮頸癌組織中circ_0010423 表達(dá)水平分別明顯高于無高危型HPV 感染、宮頸浸潤<2/3、無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及FIGO 分期為Ⅰ~Ⅱ期患者,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01);不同年齡、腫瘤大小、分化程度、組織學(xué)類型及CA125、SCC-Ag 水平宮頸癌患者宮頸癌組織中circ_0010423 表達(dá)水平比較,差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。(表1)

表1 不同臨床特征宮頸癌患者宮頸癌組織中circ_0010423表達(dá)水平的比較

2.3 circ_0010423 表達(dá)與宮頸癌患者預(yù)后的關(guān)系

以腫瘤組織中circ_0010423 表達(dá)水平的均數(shù)(0.611)為界,將宮頸癌患者分為circ_0010423 高表達(dá)患者95 例與circ_0010423 低表達(dá)患者85 例。Kaplan-Meier 生存曲線分析結(jié)果顯示,circ_0010423 高表達(dá)患者5 年生存率明顯低于circ_0010423 低表達(dá)患者,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=6.493,P<0.01)。(圖1)

圖1 circ_0010423高表達(dá)(n=95)與circ_0010423低表達(dá)(n=85)宮頸癌患者的生存曲線

2.4 宮頸癌組織中circ_0010423 與MMP2、MMP9表達(dá)的相關(guān)性

實(shí)時(shí)熒光定量PCR 檢測結(jié)果顯示,宮頸癌組織中MMP2、MMP9mRNA 表達(dá)水平分別為(1.03±0.18)、(4.62±0.80),分別明顯高于癌旁組織中的(0.34±0.09)、(1.55±0.23),差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=13.290、21.584,P<0.01)。宮頸癌組織中circ_0010423 與MMP2、MMP9的表達(dá)水平均呈正相關(guān)(r=0.703、0.855,P<0.01)。

2.5 circ_0010423、CA125、SCC-Ag 檢測對淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和宮頸浸潤的診斷價(jià)值

ROC 曲線分析結(jié)果顯示,circ_0010423 單獨(dú)檢測診斷淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和宮頸浸潤的AUC 大于CA125和SCC-Ag 單獨(dú)檢測,但三者聯(lián)合檢測時(shí)AUC 最大。(表2、表3)

表2 circ_0010423、CA125、SCC-Ag 單獨(dú)及聯(lián)合檢測對淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的診斷價(jià)值

表3 circ_0010423、CA125、SCC-Ag 單獨(dú)及聯(lián)合檢測對宮頸浸潤的診斷價(jià)值

3 討論

circRNA 是一類內(nèi)源性、保守的單鏈RNA,由于沒有5'帽和3'poly-A 尾結(jié)構(gòu),使得其穩(wěn)定表達(dá)于各種組織和細(xì)胞外液中[6]。隨著高通量測序和生物信息學(xué)的發(fā)展,越來越多的circRNA 在各種物種、組織及細(xì)胞系中被鑒定出來[7]。目前一些circRNA 已被證明可參與腫瘤相關(guān)的生物學(xué)過程,包括增殖、凋亡、侵襲及轉(zhuǎn)移等[8-9]。例如,circ_P4HB 通過調(diào)節(jié)miRNA-1184/溶質(zhì)載體家族7成員 11(solute carrier family 7 member 11,SLC7A11)通路保護(hù)肺腺癌免于鐵死亡并促進(jìn)惡性進(jìn)展[10]。circ_NFATC3 作為腫瘤抑制因子通過調(diào)節(jié)JUN 氨基末端激酶(JUN N-terminal kinase,JNK)、c-Jun、蛋白激酶B(protein kinase B,PKB,又稱AKT)和雷帕霉素靶蛋白(mechanistic target of rapamycin kinase,MTOR)信號(hào)通路抑制肝細(xì)胞癌進(jìn)展[11]。此外,宮頸癌中circ_0000745 下調(diào)通過降低E-鈣黏蛋白表達(dá)來增強(qiáng)細(xì)胞增殖、遷移和侵襲的能力[12],而circ_0087429 上調(diào)則可抑制細(xì)胞增殖、遷移和侵襲的能力[13]。因此,針對circRNA 作為腫瘤候選生物標(biāo)志物和潛在治療靶點(diǎn)的研究具有十分廣闊的應(yīng)用前景和科學(xué)意義[14]。

本研究發(fā)現(xiàn),宮頸癌組織中circ_0010423 表達(dá)水平高于癌旁組織,與GSE169057 和GSE166466芯片報(bào)道結(jié)果一致。通過分析circ_0010423 表達(dá)與宮頸癌臨床特征之間的關(guān)系發(fā)現(xiàn),circ_0010423表達(dá)與高危型HPV 感染有關(guān),提示circ_0010423 可能參與HPV 介導(dǎo)的宮頸癌致癌過程;circ_0010423表達(dá)與FIGO 分期有關(guān),說明circ_0010423 可以影響宮頸癌進(jìn)展,與已發(fā)表的調(diào)控宮頸癌進(jìn)展相關(guān)的circRNA 具有相似性,如circ_ABCB10[15]、circ_0087429[13]、circ_CLK3[16]等;此外,circ_0010423 表達(dá)與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及宮頸浸潤有關(guān),說明circ_0010423 可以影響宮頸癌侵襲轉(zhuǎn)移。MMP2 和MMP9屬于基質(zhì)金屬蛋白酶家族成員,是一種細(xì)胞外基質(zhì)蛋白水解酶,與宮頸癌侵襲轉(zhuǎn)移密切相關(guān)[17]。本研究發(fā)現(xiàn),宮頸癌組織中MMP2、MMP9mRNA表達(dá)水平均高于癌旁組織,該結(jié)果與既往文獻(xiàn)報(bào)道一致[18]。并且circ_0010423 與MMP2、MMP9表達(dá)水平均呈正相關(guān),進(jìn)一步說明circ_0010423 可以調(diào)控宮頸癌侵襲轉(zhuǎn)移。以上證據(jù)表明,circ_0010423 在宮頸癌進(jìn)展中具有重要作用。

通過生存曲線分析circ_0010423 表達(dá)與宮頸癌患者預(yù)后的關(guān)系發(fā)現(xiàn),circ_0010423 高表達(dá)患者5 年生存率低于circ_0010423 低表達(dá)患者,說明circ_0010423 表達(dá)與預(yù)后有關(guān),可以作為宮頸癌預(yù)后監(jiān)測的一個(gè)重要指標(biāo)。眾所周知,腫瘤預(yù)后與侵襲轉(zhuǎn)移密切相關(guān),高侵襲轉(zhuǎn)移患者往往預(yù)示預(yù)后不良。因此,早期監(jiān)測宮頸癌侵襲轉(zhuǎn)移從而合理制訂治療方案對提高患者預(yù)后具有重大意義。本研究通過ROC 曲線比較circ_0010423、CA125、SCC-Ag 檢測對淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移與宮頸浸潤的診斷價(jià)值發(fā)現(xiàn),circ_0010423 單獨(dú)檢測對淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和宮頸浸潤的診斷效能高于CA125 和SCC-Ag 單獨(dú)檢測,但三者聯(lián)合檢測時(shí)診斷效能最高,說明circ_0010423 聯(lián)合CA125 和SCC-Ag 是診斷淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移與宮頸浸潤的潛在標(biāo)志物。

眾多研究表明,miRNA參與調(diào)控宮頸癌進(jìn)展,如miRNA-93-5p[19]、miRNA-18a[20]、miRNA-485-5p[21]及miRNA-132 等[22]。circRNA 可作為競爭性內(nèi)源性RNA調(diào)控miRNA表達(dá)從而影響腫瘤發(fā)生發(fā)展[23]。為了進(jìn)一步從分子機(jī)制層面解釋circ_0010423與宮頸癌進(jìn)展有關(guān),研究組采用生物信息學(xué)工具(https://circinteractome.nia.nih.gov/mirna_target_sites.html)發(fā)現(xiàn)一批miRNA 可能受circ_0010423 調(diào)控,其中包括miRNA-1290、miRNA-149、miRNA-296-5p、miRNA-331-3p、miRNA-432、miRNA-503、miRNA-524-3p、miRNA-525-3p、miRNA-564、miRNA-589、miRNA-639 及miRNA-885-3p。這些miRNA 中miRNA-149[24]、miRNA-296-5p[25]、miRNA-331-3p[26]、miRNA-432[27]及miRNA-503[28]已被證實(shí)可以抑制宮頸癌進(jìn)展。據(jù)此推測,circ_0010423 可能通過調(diào)控上述miRNA 參與宮頸癌進(jìn)展,但仍有待細(xì)胞實(shí)驗(yàn)與動(dòng)物模型驗(yàn)證。

綜上所述,circ_0010423 在宮頸癌中表達(dá)上調(diào),與高危型HPV 感染、宮頸浸潤、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、FIGO分期及預(yù)后有關(guān)。circ_0010423 聯(lián)合CA125 和SCC-Ag 有作為淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移與宮頸浸潤診斷標(biāo)志物的潛力。

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