辣椒小G蛋白CaROP的生物信息學(xué)分析

馬思潔,朱天生,2,何 璐,楊叔青,2

(1.塔里木大學(xué)農(nóng)學(xué)院,新疆阿拉爾 843300;2. 南疆農(nóng)業(yè)有害生物綜合治理兵團(tuán)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,新疆阿拉爾 843300)

0 引 言

【研究意義】辣椒(CapsicumannuumL.)為茄科辣椒屬植物[1],其果實(shí)含有豐富的營(yíng)養(yǎng)成分[2]。我國(guó)辣椒總產(chǎn)量高達(dá)6 400×104t[3]。辣椒抗逆品種的選育是保證辣椒產(chǎn)業(yè)健康可持續(xù)發(fā)展經(jīng)濟(jì)有效途徑,其中挖掘辣椒的抗逆元件是抗逆育種的基礎(chǔ)。【前人研究進(jìn)展】小G蛋白可以參與調(diào)控真核生物中細(xì)胞信號(hào)的轉(zhuǎn)導(dǎo)[4],其中植物含有一類(lèi)特有的亞家族Rho GTPases ROP(Rho-related GTPases of plants)[5]。ROP蛋白作為信號(hào)傳導(dǎo)中一類(lèi)重要的調(diào)節(jié)因子,它既可以參與植物的生長(zhǎng)發(fā)育,也可調(diào)控植物適應(yīng)外部環(huán)境的刺激[6-7]。ROP蛋白還可參與響應(yīng)植物抵抗干旱、高鹽、低溫、病蟲(chóng)等多種逆境脅迫[8],AtROP1負(fù)向調(diào)控植物防衛(wèi)反應(yīng)的建立過(guò)程,在馬鈴薯中超表達(dá)失活型的AtROP1蛋白可以抑制馬鈴薯致病疫霉的生長(zhǎng)[9]; AtROP2通過(guò)與MAP18互作進(jìn)而調(diào)控植物根毛的伸長(zhǎng)[10],AtROP2還可通過(guò)抑制下游效應(yīng)因子RIC1參與調(diào)控植物抵抗鹽脅迫[11];AtROP11通過(guò)抑制植物激素ABA信號(hào)的轉(zhuǎn)導(dǎo)進(jìn)而促進(jìn)植物抵抗干旱脅迫[12]。ROP蛋白在參與植物生長(zhǎng)發(fā)育和響應(yīng)植物抵抗逆境脅迫的過(guò)程中具有重要作用。【本研究切入點(diǎn)】前期研究以擬南芥中的11個(gè)ROP蛋白的氨基酸序列為模板,對(duì)茄科基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中6種茄科植物的ROP蛋白進(jìn)行了全基因組篩查等工作,共篩查到66個(gè)ROP蛋白,其中有9個(gè)ROP蛋白來(lái)自辣椒(CaROP)[13],需對(duì)辣椒中小G蛋白CaROP進(jìn)行生物信息學(xué)分析?！緮M解決的關(guān)鍵問(wèn)題】研究辣椒內(nèi)小G蛋白CaROP的生物學(xué)功能、蛋白理化性質(zhì)、蛋白結(jié)構(gòu)及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,為分析辣椒小G蛋白CaROP參與調(diào)控辣椒生長(zhǎng)發(fā)育及響應(yīng)、不同逆境脅迫的功能及分子機(jī)理奠定理論基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 材 料

9個(gè)CaROP蛋白的基因代碼分別為CA01g27430、CA03g28070、CA02g04310、CA00g84620、CA02g05500、CA02g21300、CA04g05500、CA08g19280和CA00g82910,其氨基酸及核苷酸序列自數(shù)據(jù)庫(kù)solgenomics(https://solgenomics.net/)中所獲得。

1.2 方 法

1.2.1 CaROP蛋白的Rho功能域、開(kāi)放閱讀框及氨基酸序列相似度預(yù)測(cè)

運(yùn)用SMARTS在線軟件(http://smart.embl-heidelberg.de/)對(duì)9個(gè)CaROP蛋白的Rho功能域進(jìn)行預(yù)測(cè)分析,其次使用在線軟件ORF finder(ORFfinder Home - NCBI(nih.gov))預(yù)測(cè)9個(gè)CaROP核苷酸序列的開(kāi)放閱讀框長(zhǎng)度,使用DNAMAN軟件對(duì)9個(gè)CaROP蛋白氨基酸序列進(jìn)行相似度比較分析[9]。

1.2.2 CaROP蛋白基本理化性質(zhì)

使用Expasy數(shù)據(jù)庫(kù)內(nèi)ProtParam軟件(http://www.exPasy.org/tools/)對(duì)9個(gè)CaROP蛋白的理化性質(zhì)進(jìn)行預(yù)測(cè)分析,包括氨基酸數(shù)量、分子式、分子量、原子總數(shù)、帶正(負(fù))電荷氨基酸殘基及理論等電點(diǎn)等[12]。

1.2.3 CaROP蛋白親水性、疏水性

使用Expasy數(shù)據(jù)庫(kù)內(nèi)ProtScale軟件(https://web.expasy.org/protscale/)對(duì)9個(gè)CaROP蛋白的親水性、疏水性進(jìn)行預(yù)測(cè)分析[11]。

1.2.4 CaROP蛋白信號(hào)肽預(yù)測(cè)和跨膜結(jié)構(gòu)域

利用SignalP5.0軟件(http://www.cbs.dtu.dk/)對(duì)9個(gè)CaROP蛋白的信號(hào)肽進(jìn)行預(yù)測(cè)分析;利用TMHMM在線軟件(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)對(duì)9個(gè)CaROP蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)域進(jìn)行預(yù)測(cè)分析[13]。

1.2.5 CaROP蛋白磷酸化位點(diǎn)和糖基化位點(diǎn)

利用NetPhos3.1在線軟件(http://www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos/)對(duì)9個(gè)CaROP蛋白的磷酸化位點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測(cè)分析[14];利用NetCGlyc1.0在線軟件(http://www.cbs.dtu.dk/services/NetCGlyc/)對(duì)9個(gè)CaROP蛋白的糖基化位點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測(cè)分析[15]。

1.2.6 CaROP蛋白二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

利用SOPMA在線軟件(https://www.expasy.ch/)對(duì)9個(gè)CaROP蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè)分析[16];利用SWISS-MODEL軟件(https://swissmodel.expasy.org/)對(duì)9個(gè)CaROP蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè)分析[17]。

1.2.7 CaROP蛋白系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系

利用MEGA11軟件并選用最大似然法(Maximum Likelihood)的計(jì)算方法對(duì)辣椒9個(gè)CaROP和擬南芥11個(gè)AtROP的氨基酸序列構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),其中重復(fù)次數(shù)(Bootstrap-Replications)設(shè)置為1 000次。圖1

圖 1 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)參數(shù)設(shè)置

2 結(jié)果與分析

2.1 9個(gè)CaROP的Rho功能域、開(kāi)放閱讀框及氨基酸序列相似度預(yù)測(cè)

研究表明,9個(gè)CaROP蛋白均存在1個(gè)Rho功能域,均屬于Rho家族。CA01g27430開(kāi)放閱讀框長(zhǎng)度為633 bp,CA03g28070開(kāi)放閱讀框長(zhǎng)度為525 bp,CA02g04310開(kāi)放閱讀框長(zhǎng)度為594 bp, CA00g84620開(kāi)放閱讀框長(zhǎng)度為594 bp,CA02g05500開(kāi)放閱讀框長(zhǎng)度為594 bp,CA02g21300開(kāi)放閱讀框長(zhǎng)度為594 bp,CA04g05500開(kāi)放閱讀框長(zhǎng)度為633 bp,CA08g19280開(kāi)放閱讀框長(zhǎng)度為597 bp,CA00g82910開(kāi)放閱讀框長(zhǎng)度為675 bp。9個(gè)CaROP蛋白氨基酸序列相似度高達(dá)73.02%。圖2

圖 2 9個(gè)CaROP蛋白氨基酸序列 相似度的比較

2.2 9個(gè)CaROP蛋白理化性質(zhì)

研究表明,CA01g27430蛋白由210個(gè)氨基酸組成,分子式為C1037H1648N282O309S6,分子量為23 202.56,原子總數(shù)為3282,帶正電荷的氨基酸殘基(Asp + Glu)為19個(gè),帶負(fù)電荷的氨基酸殘基(Arg + Lys)為28個(gè),理論等電點(diǎn)(pI)為9.33;CA03g28070蛋白由174個(gè)氨基酸組成,分子式為C861H1333N225O256S6,分子量為19 124.77,原子總數(shù)為2 681,帶正電荷的氨基酸殘基(Asp + Glu)為17個(gè),帶負(fù)電荷的氨基酸殘基(Arg + Lys)為16個(gè),理論等電點(diǎn)(pI)為6.28;CA02g04310蛋白由197個(gè)氨基酸組成,分子式為C986H1575N263O286S7,分子量為21 914.36,原子總數(shù)為3 117,帶正電荷的氨基酸殘基(Asp + Glu)為18個(gè),帶負(fù)電荷的氨基酸殘基(Arg + Lys)為26個(gè),理論等電點(diǎn)(pI)為9.32;CA00g84620蛋白由197個(gè)氨基酸組成,分子式為C971H1543N255O283S5,分子量為21 477.77,原子總數(shù)為3 057,帶正電荷的氨基酸殘基(Asp + Glu)為17個(gè),帶負(fù)電荷的氨基酸殘基(Arg + Lys)為25個(gè),理論等電點(diǎn)(pI)為9.3;CA02g05500蛋白由197個(gè)氨基酸組成,分子式為C969H1538N256O284S5,分子量為21 478.72,原子總數(shù)為3 052,帶正電荷的氨基酸殘基(Asp + Glu)為18個(gè),帶負(fù)電荷的氨基酸殘基(Arg + Lys)為25個(gè),理論等電點(diǎn)(pI)為9.21;CA02g21300蛋白由197個(gè)氨基酸組成,分子式為C973H1546N256O284S5,分子量為21 534.82,原子總數(shù)為3 064,帶正電荷的氨基酸殘基(Asp + Glu)為17個(gè),帶負(fù)電荷的氨基酸殘基(Arg + Lys)為25個(gè),理論等電點(diǎn)(pI)為9.3;CA04g05500蛋白由210個(gè)氨基酸組成,分子式為C1050H1649N271O301S5,分子量為23 045.58,原子總數(shù)為3 276,帶正電荷的氨基酸殘基(Asp + Glu)為18個(gè),帶負(fù)電荷的氨基酸殘基(Arg + Lys)為25個(gè),理論等電點(diǎn)(pI)為9.17;CA08g19280蛋白由198個(gè)氨基酸組成,分子式為C982H1566N262O283S5,分子量為21 731.12,原子總數(shù)為3 098,帶正電荷的氨基酸殘基(Asp + Glu)為18個(gè),帶負(fù)電荷的氨基酸殘基(Arg + Lys)為27個(gè),理論等電點(diǎn)(pI)為9.39;CA00g82910蛋白由224個(gè)氨基酸組成,分子式為C1130H1775N305O324S13,分子量為25 234.15,原子總數(shù)為3 547,帶正電荷的氨基酸殘基(Asp + Glu)為21個(gè),帶負(fù)電荷的氨基酸殘基(Arg + Lys)為28個(gè),理論等電點(diǎn)(pI)為9.04。表1

表1 9個(gè)CaROP蛋白的理化特性相關(guān)信息

2.3 9個(gè)CaROP蛋白親水性及疏水性

研究表明,CA01g27430蛋白的不穩(wěn)定指數(shù)為47.19,脂肪系數(shù)為82.14,親水性平均系數(shù)為-0.277,屬不穩(wěn)定的親水蛋白;CA03g28070蛋白的不穩(wěn)定指數(shù)為43.18,脂肪系數(shù)為85.69,親水性平均系數(shù)為-0.04,屬不穩(wěn)定的親水蛋白;CA02g04310蛋白的不穩(wěn)定指數(shù)為38.96,脂肪系數(shù)為90.56,親水性平均系數(shù)為-0.138,屬穩(wěn)定的親水蛋白;CA00g84620蛋白的不穩(wěn)定指數(shù)為33.45,脂肪系數(shù)為88.53,親水性平均系數(shù)為-0.096,屬穩(wěn)定的親水蛋白;CA02g05500蛋白的不穩(wěn)定指數(shù)為36.01,脂肪系數(shù)為87.56,親水性平均系數(shù)為-0.121,屬穩(wěn)定的親水蛋白;CA02g21300蛋白的不穩(wěn)定指數(shù)為37.31,脂肪系數(shù)為88.53,親水性平均系數(shù)為-0.122,屬穩(wěn)定的親水蛋白;CA04g05500蛋白的不穩(wěn)定指數(shù)為29.96,脂肪系數(shù)為91.43,親水性平均系數(shù)為-0.029,屬穩(wěn)定的親水蛋白;CA08g19280蛋白的不穩(wěn)定指數(shù)為42.05,脂肪系數(shù)為90.61,親水性平均系數(shù)為-0.12,屬不穩(wěn)定的親水蛋白;CA00g82910蛋白的不穩(wěn)定指數(shù)為33.89,脂肪系數(shù)為33.89,親水性平均系數(shù)為-0.054,屬穩(wěn)定的親水蛋白。表2,圖3

表2 9個(gè)CaROP蛋白的親疏水性參數(shù)信息

圖 3 9個(gè)CaROP蛋白的親水性和疏水性

2.4 9個(gè)CaROP蛋白的信號(hào)肽及跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)

研究表明,9個(gè)CaROP蛋白均無(wú)信號(hào)肽,均非分泌蛋白。圖4

9個(gè)CaROP蛋白均跨膜結(jié)構(gòu)域,均非跨膜蛋白。圖5

2.5 9個(gè)CaROP蛋白磷酸化位點(diǎn)和糖基化位點(diǎn)的預(yù)測(cè)

研究表明,CA01g27430蛋白含有11個(gè)絲氨酸,5個(gè)蘇氨酸,2個(gè)絡(luò)氨酸;CA03g28070蛋白含有5個(gè)絲氨酸,4個(gè)蘇氨酸,4個(gè)絡(luò)氨酸;CA02g04310蛋白含有8個(gè)絲氨酸,6個(gè)蘇氨酸,6個(gè)絡(luò)氨酸;CA00g84620蛋白含有9個(gè)絲氨酸,4個(gè)蘇氨酸,4個(gè)絡(luò)氨酸;CA02g05500蛋白含有11個(gè)絲氨酸,5個(gè)蘇氨酸,4個(gè)絡(luò)氨酸;CA02g21300蛋白含有10個(gè)絲氨酸,3個(gè)蘇氨酸,4個(gè)絡(luò)氨酸;CA04g05500蛋白含有10個(gè)絲氨酸,4個(gè)蘇氨酸,3個(gè)絡(luò)氨酸;CA08g19280蛋白含有10個(gè)絲氨酸,2個(gè)蘇氨酸,4個(gè)絡(luò)氨酸;CA00g82910蛋白含有9個(gè)絲氨酸,5個(gè)蘇氨酸,5個(gè)絡(luò)氨酸。9個(gè)CaROP蛋白均不存在糖基化位點(diǎn)。表3,圖6

表3 9個(gè)CaROP蛋白磷酸化位點(diǎn)相關(guān)信息

圖 6 9個(gè)CaROP蛋白磷酸化位點(diǎn)的預(yù)測(cè)

2.6 9個(gè)CaROP蛋白二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)

研究表明,CA01g27430蛋白含有77個(gè)α-螺旋(Hh),占比36.67%;含40個(gè)β-折疊(Ee),占比19.05%;10個(gè)β-轉(zhuǎn)角(Tt),占比4.76%;含83個(gè)無(wú)規(guī)則卷曲,占比39.52%。CA03g28070蛋白含有68個(gè)α-螺旋(Hh),占比39.08%;含35個(gè)β-折疊(Ee),占比20.11%;12個(gè)β-轉(zhuǎn)角(Tt),占比6.90%;含59個(gè)無(wú)規(guī)則卷曲,占比33.91%。CA02g04310蛋白含有66個(gè)α-螺旋(Hh),占比33.50%;含41個(gè)β-折疊(Ee),占比20.81%;12個(gè)β-轉(zhuǎn)角(Tt),占比6.09%;含78個(gè)無(wú)規(guī)則卷曲,占比39.59%。CA00g84620蛋白含有69個(gè)α-螺旋(Hh),占比35.03%;含42個(gè)β-折疊(Ee),占比21.32%;13個(gè)β-轉(zhuǎn)角(Tt),占比6.60%;含73個(gè)無(wú)規(guī)則卷曲,占比37.06%。CA02g05500蛋白含有72個(gè)α-螺旋(Hh),占比36.55%;含40個(gè)β-折疊(Ee),占比20.30%;11個(gè)β-轉(zhuǎn)角(Tt),占比5.58%;含74個(gè)無(wú)規(guī)則卷曲,占比37.56%。CA02g21300蛋白含有72個(gè)α-螺旋(Hh),占比36.55%;含40個(gè)β-折疊(Ee),占比20.30%;11個(gè)β-轉(zhuǎn)角(Tt),占比5.58%;含74個(gè)無(wú)規(guī)則卷曲,占比37.56%。CA04g05500蛋白含有75個(gè)α-螺旋(Hh),占比35.71%;含43個(gè)β-折疊(Ee),占比20.48%;11個(gè)β-轉(zhuǎn)角(Tt),占比5.24%;含81個(gè)無(wú)規(guī)則卷曲,占比38.57%。CA08g19280蛋白含有67個(gè)α-螺旋(Hh),占比33.84%;含40個(gè)β-折疊(Ee),占比20.20%;12個(gè)β-轉(zhuǎn)角(Tt),占比6.06%;含79個(gè)無(wú)規(guī)則卷曲,占比39.90%。CA00g82910蛋白含有82個(gè)α-螺旋(Hh),占比36.61%;含56個(gè)β-折疊(Ee),占比25.00%;11個(gè)β-轉(zhuǎn)角(Tt),占比4.91%;含75個(gè)無(wú)規(guī)則卷曲,占比33.48%。表4,圖7

表4 9個(gè)CaROP蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)的參數(shù)信息

圖 7 9個(gè)CaROP蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)

CA01g27430蛋白的全局模型質(zhì)量評(píng)估(GMQE)為0.77,QMEAN評(píng)分為0.82;CA03g28070蛋白的GMQE評(píng)分為0.85,QMEAN評(píng)分為0.82;CA02g04310蛋白的GMQE評(píng)分為0.81,QMEAN評(píng)分為0.82;CA00g84620蛋白的GMQE評(píng)分為0.81,QMEAN評(píng)分為0.83;CA02g05500蛋白的GMQE評(píng)分為0.81,QMEAN評(píng)分為0.84;CA02g21300蛋白的GMQE評(píng)分為0.81,QMEAN評(píng)分為0.84;CA04g05500蛋白的GMQE評(píng)分為0.76,QMEAN評(píng)分為0.79;CA08g19280蛋白GMQE評(píng)分為0.81,QMEAN評(píng)分為0.83;CA00g82910蛋白的GMQE評(píng)分為0.72,QMEAN評(píng)分為0.72。GMQE和QMEAN的整體模型質(zhì)量測(cè)量值范圍在0～1,數(shù)字越高表示預(yù)期質(zhì)量越高,9個(gè)CaROP蛋白的全局模型質(zhì)量評(píng)估(GMQE)和QMEAN評(píng)分均大于0.7,結(jié)果表明9個(gè)CaROP蛋白的三級(jí)建模預(yù)期均比較可靠,但CA00g82910蛋白與其他8個(gè)CaROP蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)相比差異較大,推測(cè)可能與其脂肪系數(shù)有關(guān)。圖8

圖 8 9個(gè)CaROP蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)

2.7 9個(gè)CaROP蛋白系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系

研究表明,20個(gè)ROP蛋白聚為4個(gè)分支,不同顏色代表不同分支,紅色代表分支Ⅰ,橙色代表分支Ⅱ,綠色代表分支Ⅲ,藍(lán)色代表分支Ⅳ,其中CA01g27430和CA02g04310分別聚于分支Ⅰ和分支Ⅲ中,CA00g82910和CA03g28070聚于分支Ⅱ中,剩余5個(gè)CaROP(CA00g84620、CA04g05500、CA02g05500、CA02g21300及CA08g19280)均聚于分支Ⅳ中。圖9

3 討 論

3.1蛋白的親水性可以保持結(jié)構(gòu)及水分的穩(wěn)定也可預(yù)測(cè)跨膜區(qū),蛋白的脂肪系數(shù)越高蛋白相對(duì)越穩(wěn)定,蛋白的穩(wěn)定性可使蛋白在不良條件下仍然具備優(yōu)良的理化性能[18-22]。運(yùn)用生物信息學(xué)手段預(yù)測(cè)分析蛋白質(zhì)的親水性、穩(wěn)定系數(shù)等理化特性及蛋白結(jié)構(gòu),可為后續(xù)深入研究蛋白的功能奠定理論基礎(chǔ),并且可減少試驗(yàn)中的盲目及失敗[23]。研究蛋白預(yù)測(cè)分析結(jié)果顯示,9個(gè)CaROP蛋白氨基酸序列相似度高達(dá)73.02%,其均具有磷酸化位點(diǎn),均為非分泌性蛋白。9個(gè)CaROP蛋白親水值均小于0,其均為親水蛋白;9個(gè)CaROP蛋白其均無(wú)跨膜結(jié)構(gòu)域和信號(hào)肽,表明均為非跨膜蛋白。9個(gè)CaROP蛋白的主要二級(jí)結(jié)構(gòu)原件為無(wú)規(guī)則卷曲和α-螺旋,其次是β-折疊,最后是β-轉(zhuǎn)角,其三級(jí)結(jié)構(gòu)建模的預(yù)測(cè)評(píng)分均高于0.7,結(jié)果都較為可靠,但CA00g82910蛋白相比其他8個(gè)CaROP蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)模型差異較大。

圖 9 辣椒和擬南芥ROP蛋白的 系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系

3.2系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析結(jié)果表明,9個(gè)CaROP蛋白共聚為4個(gè)分支,其中CA01g27430和CA02g04310分別聚于分支Ⅰ和分支Ⅲ中,CA00g82910和CA03g28070聚于分支Ⅱ中,剩余5個(gè)CaROP(CA00g84620、CA04g05500、CA02g05500、CA02g21300及CA08g19280)均聚于分支Ⅳ中。Yang Z等人將擬南芥中的11個(gè)AtROP蛋白劃分為4個(gè)進(jìn)化分支[24],研究將辣椒中的9個(gè)CaROP和擬南芥中的11個(gè)AtROP也劃分為4個(gè)進(jìn)化分支,分支結(jié)果與Yang Z等[25]的研究結(jié)果一致。Yang S等將6種茄科物種中的66個(gè)ROP蛋白和11個(gè)擬南芥AtROP蛋白劃分為5個(gè)進(jìn)化分支,Yang Z等[24]的研究中,第IV分支具有2個(gè)明顯的亞分支,但是隨著Yang S等[25]將植物物種數(shù)增加后,第IV分支徹底分為2個(gè)分支,即新的分支II和分支V。研究中的第IV分支也具有明顯的2個(gè)亞分支,其中CA08g19280單獨(dú)聚為一個(gè)亞分支,其他3個(gè)CaROP蛋白的聚于另一個(gè)亞分支,預(yù)示其生物學(xué)功能可能也不盡相同。

4 結(jié) 論

9個(gè)CaROP蛋白具有完整的Rho功能域,均為非分泌性親水蛋白,其中6個(gè)ROP蛋白CA02g04310、CA00g84620、CA02g05500、CA02g 21300、CA04g05500和CA00g82910為穩(wěn)定的親水蛋白。9個(gè)CaROP蛋白在系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)中共聚為了4個(gè)分支,其三級(jí)結(jié)構(gòu)建模的預(yù)測(cè)結(jié)果也均較為理想,9個(gè)CaROP蛋白結(jié)構(gòu)較穩(wěn)定。