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一種基于計算機的白血病細胞治療效果數學模型

2007-01-01 00:00:00王光源
計算技術與自動化 2007年2期

摘 要:根據熵值在生物系統中的應用原理,改建一種可用計算機模擬的白血病細胞藥物治療效果的數學模型,并應用于新型誘導分化劑氨基甾體對K562白血病細胞的作用中#65377;結果表明藥物作用后細胞系統的熵值增加,良好的藥物取決于降低癌基因表達率,升高誘導分化率,以致抑制白血病細胞的增殖#65377;該模型亦可用于其他抗癌藥物治療效果的計算機模擬#65377;

關鍵詞:生物建模;計算機模擬;誘導分化劑;氨基甾體;白血病細胞

中圖分類號:TP391文獻標識碼:A

1 引 言

患者一經被確診為白血病后,最常用的治療方法就是抗白血病藥物治療#65377;盡管骨髓移植為根治白血病帶來了希望,但該方法受到供體和配型等多方面的限制,而藥物治療乃是目前較經濟實用的方法之一#65377;藥物治療方法主要是通過抑制白血病細胞的增殖,誘導白血病細胞的分化來實現#65377;由于藥物治療可產生耐藥性和白血病的復發,人們希望了解藥物治療失敗的原因,從而提高白血病的治愈率#65377;我們研究了一種新型誘導分化劑氨基甾體,發現該類藥物對白血病細胞,尤其是對慢粒K562白血病細胞具有效好的治療效果[1]#65377;因此,我們在改進的基礎上建立了一種計算機模型[2],去除了不合理的部分,使其與實驗情況更加吻合,并用以分析白血病細胞在藥物作用下的生存率,從而模擬藥物對白血病細胞的治療效果,并將氨基甾體類藥物的實測治療效果與該計算機模型進行比較,以檢驗該模型的預測性和準確性,為藥物治療白血病療效的提高提供新的思路#65377;

2 模型的建立

2.1 基本思路

人體內的各類血細胞是由骨髓的造血細胞增殖分化衍變而來,而這種增殖分化是受人體基因嚴密調控的#65377;在正常狀態下,人體的各類血細胞在數量和形態上是維持恒定不變的#65377;目前已知人體內有兩類基因:致癌基因和抑癌基因#65377;當環境和自身因素的改變,導致致癌基因高度表達時,人體就可能產生白血病,即造血細胞產生惡變,大量增殖,又不具備正常血細胞的功能,這被稱為癌變(m alignant transformation)#65377;

怎樣確定造血細胞是否癌變,細胞表型的改變是一個較佳指標#65377;細胞表型涉及到細胞的增殖,分化,凋亡等等變化,而這些表型的變化又與細胞的表觀熵值改變密切相關[3]#65377;所以我們試圖用細胞的表觀熵值來描述細胞表型的改變,從而確定細胞的增殖與分化狀態#65377;反言之,用藥物作用于白血病細胞后,細胞的表型會改變,細胞的表觀熵值亦會改變,從而可確定該藥物的治療效果(圖1)#65377;

計算技術與自動化2007年6月第26卷第2期王光源等:一種基于計算機的白血病細胞治療效果數學模型

我們將細胞表觀熵定義為細胞癌變#65380;增殖#65380;分化#65380;凋亡#65380;抑制等方面的細胞行為的綜合表現#65377;故可得定量方程式式中P為細胞總的表觀熵,P1為癌變的表觀熵,P2為分化的表觀熵,P3為凋亡的表觀熵,P4為增殖的表觀熵#65377;P值為實測值與預測值的比值#65377;

如果進一步將癌變(Transformation)和分化(Differentiation)兩種狀態定義為T和D,那么根據生物系統中熵的經典定義[4]:在任何一種生物系統中,當存在W種相關狀態時,該系統的熵值便為:

熵值E=cln (∑W)(2)

式中c為比例常數#65377;那么,就可得出:

在(3)式中,我們假設當癌變白血病細胞向下增殖分化時(即由1個細胞變為2個細胞時),其中有1個細胞仍保留癌變細胞的特性#65377;

在細胞群中,我們定義細胞總數為N,而將實際計數的細胞數定義為n,則有:凋亡的細胞數(或被抑制的細胞數)=N-n,那么,將(4)式經過數學中的Stirling概約[5],又設R=n/N,則(4)式整理為:

其中R值的定義域為:0

將公式(1),(3)和(5)合并得:

從(6)式可得出,白血病細胞的細胞表觀熵與癌變狀態(可用癌基因表達百分率T表示)有關,與細胞分化狀態(可用分化百分率D表示)有關,亦與白血病細胞的細胞數(可用計數百分率R表示)有關#65377;如果在相同實驗條件下,生物體系的比例常數c是恒定的,則細胞的表觀熵值:

式(7)就是該模型的主要公式,可根據該公式模擬藥物對白血病細胞的抑制增殖,誘導分化和癌基因表達效果(模擬結果見表1)#65377;

2.2 模型的推廣

如果我們將藥物對白血病細胞的百分抑制率引入到式(7), 并設百分抑制率為I#65377;又因為R=1-I,則式(7)變為:

根據公式(8),當藥物對白血病細胞的百分抑制升高時,細胞表觀熵值應該是增加的#65377;那么根據熱力學第二定律:

E治療前

即藥物治療后細胞表觀熵值增加#65377;或:

即得:H

采用Mathcad軟件編程,在假設D1,D2,T1,T2和I1已知的情況下,就可預測可能的I2值,即藥物治療后,白血病細胞可能的生長狀態(或抑制率)#65377;

3 計算機模擬結果與討論

3.1 計算機編程流程方框圖

計算機編程采用Mathcad軟件完成, 方框圖如下(圖2):

3.2 新型誘導分化劑對細胞表觀熵變的影響

表1計算了在不同D#65380;T和I值情況下,細胞的表觀熵值#65377;從表1可知,當藥物治療處理開始時(治療效果級別1),抑制率I僅為20%,癌基因的表達率T較高,為90%,此時的分化率D較低,為20%,該系統的細胞表觀熵值為負值(-0.35)#65377;隨著藥物作用的加強,抑制率I從20%上升到90%,此時癌基因的表達率T則從90%降到20%,分化率D則從20%上升到90%,這是一種理想的治療效果(治療效果級別5)#65377;

縱觀E值, 此時細胞的表觀熵值由-0.35增加至3.30,說明隨著治療效果的提高,白血病細胞表觀熵值增加#65377;根據熱力學第二定律,系統熵值的增加,意味著系統內分子混亂性或無序性的增加#65377;那么在白血病細胞內,藥物可能引起了化學分子的轉運,變化,斷裂和重構,從而導致白血病細胞的分化和凋亡#65377;表1說明該模型與藥物治療效果吻合#65377;

我們研究的新型誘導分化劑氨基甾體[6],基本上與以上的模型接近#65377;我們證實該類誘導分化劑可干擾K562白血病細胞的增殖,在10-6mol/L濃度時,第4天的抑制率I值約為50%,T值約為48%(bcr/abl癌基因表達),而D值約為90%(向紅系分化的CD71表達)#65377;根據這些參數,計算出的細胞表觀熵值為:

E=ln[0.9(0.48+1)/(1-0.5)(0.5)0.5/(1-0.5)]=1.67

將該值與表1中的熵值比較,該治療效果約相當于表1中的第3級治療效果(E=1.62)#65377;可見新型誘導分化劑氨基甾體在次高濃度,在較短的時間對白血病細胞的治療效果亦較佳#65377;如果將其濃度提高到10-5mol/L,將作用時間延長到第5天,實驗已證實其治療效果接近該模型的理想治療效果(即第5級效果)#65377;

3.3 藥物治療前后細胞表現熵值的變化

根據公式(9),當固定藥物治療前的細胞抑制率I1值不變,假設藥物治療前后,D1變為D2(D1→D2),T1變為T2(T1→T2),那么可模擬估算出藥物作用后的細胞抑制率,如表2所示:

表2模擬的結果表明,在5種治療情況中,當輸入的藥物治療后抑制率I2從0%到99%變化時,系統均符合熵值增加的熱力學第二定律(H

4 結 論

我們改建的該計算機模型,可有效地模擬藥物治療后癌細胞的生長情況,并可將癌細胞在藥物治療前和治療后的生長狀況進行對比#65377;模擬結果顯示,癌基因表達的下降或消失,分化誘導率的提高,對抑制癌細胞的生長是至關重要的#65377;新型誘導分化劑氨基甾體即可降低癌基因的表達,又可誘導白血病細胞的分化,故可有效地抑制白血病細胞的增殖,其實驗結果較符合該模型的模擬#65377;故這類新型誘導分化劑氨基甾體值得更進一步深入研究#65377;該模型亦可用于其他抗癌藥物治療效果的模擬#65377;

注:本文中所涉及到的圖表、注解、公式等內容請以PDF格式閱讀原文。

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