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核桃SSR反應(yīng)體系的優(yōu)化

2007-01-01 00:00:00劉曉麗何天明張美勇張立杰慈志娟張春雨陳學(xué)森
果樹學(xué)報 2007年2期

摘 要:以清香、香鈴、愛米格為試材,利用CTAB法提取基因組DNA,將PCR體系的主要成分設(shè)定5個梯度,根據(jù)每個成分的變化引起的PCR—SSR的效果差異,探討了核桃SSR技術(shù)中PCR體系的主要成分對擴(kuò)增結(jié)果的影響,并對引物WCA321的適宜退火溫度進(jìn)行優(yōu)化。最終確定了引物WGA321的最適退火溫度為48~52℃,PCR反應(yīng)體系的最佳條件為:15μL體系中,Mg2+1.0mmol/L,dNTPs濃度0.40mmol/L,TaqE用量為0.5U,DNA模板1.0ng/μL,引物濃度為0.4μmol/L。利用此反應(yīng)體系對部分核桃品種進(jìn)行PCR擴(kuò)增并電泳檢測,擴(kuò)增結(jié)果清晰且有較高的多態(tài)性,表明該體系適合核桃的親緣關(guān)系分析。

關(guān)鍵詞:核桃;SSR;優(yōu)化

中圖分類號:S664.1

文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A

文章編號:1009—9980(2007)02—140—06


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