高 雁
(忻州師范學(xué)院物理系,山西忻州034000)
DNA分析是利用鑒別核酸上的堿基序列而開發(fā)并進(jìn)一步應(yīng)用的技術(shù).生物芯片是一項(xiàng)越來越受歡迎的研究項(xiàng)目,在生物芯片上,未知堿基順序的分子被已知堿基序列的分子進(jìn)行熒光標(biāo)記.但是熒光標(biāo)記的方法會降低檢查的準(zhǔn)確性并增加成本和準(zhǔn)備時間.因此,一些無標(biāo)記的方法引起人們的興趣,THz光譜技術(shù)在這方面已顯示出一定的潛力.通過THz光譜得到樣品的色散和吸收性質(zhì),THz技術(shù)已經(jīng)顯示了分辨單股和雙股DNA的能力[1],并且能檢測飛摩爾靈敏度的單堿基對變異[2].
大豆是主要糧食作物之一,大豆種子純度檢測對大豆生產(chǎn)具有重要的意義.近幾年,品種鑒定常采用隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)DNA(RAPD)分子標(biāo)記技術(shù)[3],此技術(shù)對反應(yīng)條件要求嚴(yán)格,成本也較高.THz時域光譜技術(shù)不需要對分子進(jìn)行標(biāo)記.利用THz時域光譜技術(shù),從大豆種子的光譜獲得信息,在區(qū)分大豆種子的種類方面進(jìn)行嘗試.實(shí)驗(yàn)對大豆種子的DNA薄膜和胚芽切片進(jìn)行了初步的探測.
實(shí)驗(yàn)用的激光器是美國光譜物理公司的摻鈦藍(lán)寶石飛秒激光器,中心波長800 nm,脈寬100飛秒,重復(fù)頻率82 MHz.激光器的平均輸出功率為0.70W,斬波器的調(diào)制頻率為1443Hz,鎖相放大器的積分常數(shù)為900ms,GaAs<110>單晶作為產(chǎn)生THz脈沖的晶體,ZnTe<110>單晶作為THz脈沖的探測晶.
測量分兩步進(jìn)行:首先將基底放到樣品架上,掃描得到的THz脈沖時間波形作為參考信號;再將樣品放入樣品架上,掃描得到THz脈沖經(jīng)過樣品后的時間波形,此波形含有樣品在THz波段的光學(xué)信息.
對實(shí)驗(yàn)測得的參考波形和樣品波形分別進(jìn)行傅立葉變換得到它們的頻率譜,計算在頻率域參考信號與樣品信號的振幅之比.
實(shí)驗(yàn)使用高阻硅作為基底,其電阻率為1800Ωcm,厚度為0.396mm.DNA為固態(tài),用少量蒸餾水將其溶解,然后滴在硅片上,自然晾干.由于DNA的量很小,晾干后只有很薄的一層,如果分幾次滴,液滴小,分布的面積小,就稍厚些.我們把一中間帶孔的金屬圓盤粘在硅片上,把DNA液體滴入其中,等其自然風(fēng)干后,重復(fù)滴入.制得的DNA薄膜厚度約20 μm.

圖1 (a)參考波形(b)THz脈沖通過DNA樣品的波形
圖1(a)(b)分別是THz脈沖通過高阻硅基底(參考)和通過DNA樣品的波形.通過樣品的脈沖相對于參考脈沖,時間上略有延遲,由于樣品很薄,只有μm量級,因此時間延遲很小.振幅變化也不大,樣品信號波形峰值是參考信號的95%,說明樣品吸收不多.脈沖形狀基本相同,對應(yīng)的色散很弱.

圖2 參考信號的振幅譜(實(shí)線)和樣品的振幅譜(虛線)
經(jīng)過快速傅立葉變換后相應(yīng)的振幅譜如圖2所示.由圖可以看出,通過樣品信號的振幅與參考信號的振幅相比,略有減小,在不同頻率,振幅變化略有不同.

圖3 參考信號與樣品信號振幅的比值
圖3是圖2中參考信號的振幅與樣品信號的振幅的比值.由圖3可以看出,在0.5THz~2.5THz范圍內(nèi),曲線整體比較平滑,僅在0.8THz以下有波動,這是低頻噪聲的影響.在0.5THz~2.5THz,曲線沒有顯示出DNA樣品存在明顯的吸收峰.
大豆種子胚芽的切片是以高阻硅作為基底,其電阻率為1800Ω cm,厚度為0.396 mm.胚芽切片是由空軍總醫(yī)院采用醫(yī)學(xué)方法制作的,厚度為35 μm.

圖4 (a)參考波形(b)THz脈沖通過切片樣品的波形
圖4中(a)(b)分別是THz脈沖通過高阻硅基底(參考)和通過切片樣品的波形.由于樣品很薄,只有35 μm,幾乎觀察不到時間延遲.通過樣品的脈沖比參考脈沖的振幅反而增加了2.8%,這可能是噪聲的影響.圖4經(jīng)過快速傅立葉變換后相應(yīng)的振幅譜如圖5所示.樣品信號相對于參考信號,振幅差異不明顯.脈沖形狀基本相同,沒有明顯的色散.

圖5 參考信號的振幅譜(實(shí)線)和樣品的振幅譜(虛線)

圖6 參考信號與樣品信號振幅的比值
圖6是圖5中參考信號的振幅與樣品的振幅的比值,由圖可以看出,在0.5THz~2.5THz范圍內(nèi),曲線整體較平滑,沒有顯示出胚芽切片在此頻率范圍的明顯的吸收峰.
通過測量和分析表明,由于大豆種子的DNA薄膜和胚芽切片很薄,只有μm量級,對THz脈沖吸收很小,信號響應(yīng)微弱.在時域,樣品信號相對于參考信號,振幅變化不大.在實(shí)驗(yàn)測量的頻率范圍內(nèi),參考信號的振幅與樣品信號的振幅差異不大,從參考信號與樣品信號振幅的比值曲線沒有觀察到可分辨的吸收峰.
通過THz光譜得到樣品的色散和吸收性質(zhì),THz技術(shù)已經(jīng)顯示了分辨單股和雙股DNA的能力,并且能檢測飛摩爾靈敏度的單堿基對變異.對實(shí)驗(yàn)測得的參考波形和樣品波形分別進(jìn)行傅立葉變換得到它們的頻率譜,通過計算在頻率域參考信號與樣品信號的振幅之比,從大豆種子的光譜獲得信息,對大豆種子的DNA薄膜和胚芽切片探測和分析,在區(qū)分大豆種子的種類方面有顯著的效果.
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