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基于磁性顆粒微陣列與雙色熒光雜交的單核苷酸多態(tài)性分型方法研究

2010-04-12 00:00:00劉洪娜松劉麗賞賈英英李智洋何農(nóng)躍
分析化學(xué) 2010年12期

摘 要 基于磁性顆粒微陣列與雙色熒光雜交,建立了單核苷酸多態(tài)性(Single nucleoitide polymorphism, SNP)分型方法。將利用不對(duì)稱擴(kuò)增得到的含有待檢測(cè)位點(diǎn)生物素標(biāo)記的單鏈PCR產(chǎn)物固定在鏈親和素修飾的金磁納米顆粒(Gold magnetic nanoparticles, GMNPs)表面;將ssNAGMNPs混合物點(diǎn)樣在底部固定有磁鐵的載玻片上構(gòu)建磁性顆粒微陣列,然后在基因框中與雙色熒光探針雜交;雜交完全后,充分洗滌,通過掃描獲得分型結(jié)果。通過優(yōu)化不對(duì)稱PCR的擴(kuò)增條件,直接擴(kuò)增出產(chǎn)量較高的單鏈NA作為靶序列用于分型。利用本方法對(duì)2個(gè)樣本MFR基因的C677位點(diǎn)多態(tài)性進(jìn)行了檢測(cè)。實(shí)驗(yàn)證明,本方法步驟簡(jiǎn)單, 易實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化操作、非常適用于分子診斷與法醫(yī)鑒定。

關(guān)鍵詞 磁性顆粒微陣列; 不對(duì)稱擴(kuò)增; 雙色熒光雜交; 單核苷酸多態(tài)性

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