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麻雞脾臟總RNA提取方法初探

2010-05-01 05:14:40陳書明常云花梁新峰曹新鵬
山西農業科學 2010年10期

陳書明,常云花,梁新峰,曹新鵬,范 瑾

(山西農業大學動物科技學院,山西太谷030801)

白細胞介素(Interleukin,IL)簡稱白介素,是由白細胞產生并介導于細胞間相互作用的一類細胞因子。其主要作用是通過T和B淋巴細胞及NK細胞等多種靶細胞來傳遞免疫信息,以激活、調控血細胞的生長發育與分化成熟,并參與機體的免疫應答以及某些疾病的病理過程[1-3]。目前,IL已作為藥物應用于臨床,但用傳統的從組織中分離純化IL,很難實現IL的大量生產。因此,通過RT-PCR技術獲得IL的目的基因,再用基因工程技術規模化生產IL成為科研工作者努力的方向。而獲得IL的目的基因需要先從脾臟組織提取出純度高、完整性好的總RNA。目前,已有多種方法與產品應用于總RNA提取和純化,但在實驗過程中,總RNA極易被實驗室環境中存在的RNA酶降解,或提取出來的總RNA中常伴有大分子量染色體DNA的污染[4-7]。

本研究通過控制RNAiso Plus試劑和脾臟組織用量比例,對組織和實驗室環境進行特殊處理,反復研究,最終從麻雞脾臟組織中提取出純度高、完整性好的總RNA。該研究對分子克隆獲得相關目的基因等后續實驗具有重要意義。

1 材料和方法

1.1 試驗材料

1.1.1 試驗動物 自山西省太谷縣某雞場購進80日齡健康麻雞1只。

1.1.2 試驗試劑 Agarose(瓊脂糖)為Amresco原裝進口;RNAiso Plus購自大連寶生物工程有限公司;Tris和DEPC均購自上海生物工程技術服務有限公司;EDTA、硼酸、95%乙醇、異丙醇、氯仿、溴化乙錠均為國產分析純。75%乙醇、溴化乙錠等用RNase-free ddH2O配制。

1.2 試驗方法

1.2.1 樣品的制備 在潔凈環境下將麻雞殺死,迅速取出其脾臟,用刀片切成約140,120,80mg的小塊組織,用滅菌紗布包裹后懸吊于液氮罐中保存備用。提取RNA時,從液氮罐中取約140,120,80mg小塊組織各1塊,迅速轉移至3個液氮預冷的研缽中研磨,其間不斷加入液氮,直至研磨成粉末狀(無明顯的可見顆粒,否則會影響RNA的收率和質量);再向3個研缽中各加1mL RNAiso Plus,將研磨成粉末狀的樣品完全覆蓋,然后室溫下靜置,待其溶化;然后將各組勻漿液轉移至已標記的EP管中,室溫靜置5min。

1.2.2 制備RNA沉淀 將EP管中的勻漿液在4℃,12 000 r/min條件下離心5min;小心吸取上清液,分別移入已滅菌標記的EP管中(切勿吸取沉淀);再向EP管中分別加入0.2mL氯仿,蓋緊管蓋,用旋渦振蕩儀混勻至溶液呈乳白狀(無分層現象),室溫靜置 5min;4℃,12 000 r/min離心15min。此時,EP管中液體分為3層,即含有RNA的無色上清液,中間的白色蛋白層和帶有紅色的下層有機相。小心吸取上清液并分別轉移至新標記的3個已滅菌的EP管中(切勿吸取白色中間層),再分別加入等體積的異丙醇,上下顛倒EP管充分混勻,室溫下靜置10min;然后于4℃,12 000 r/min離心10min,可見EP管底部出現乳膠狀沉淀,小心棄去上清液,保留沉淀,即為RNA沉淀。

1.2.3 RNA沉淀的洗滌 沿保留RNA沉淀的EP管的管壁緩緩加入75%的乙醇1mL,輕輕上下顛倒EP管5次,在4℃下,12 000 r/min離心5min;然后小心棄凈EP管中的乙醇溶液,再將EP管插入超凈工作臺面的樣品孔中,通風干燥5min,使乙醇揮發干凈(不可以加熱干燥,否則RNA將很難溶解),再用RNase-free ddH2O溶解RNA沉淀,從而獲得RNA溶液。

1.2.4 RNA純度與完整性的檢測 取3μL RNA溶液與等量的上樣緩沖液混勻,點樣,進行瓊脂糖凝膠電泳,以檢測所提取RNA的純度與完整性。用紫外分光光度計測定剩余RNA溶液的A260與A280,并計算二者的比值A260/A280,進一步分析所提取RNA的純度。

2 結果與分析

對脾臟組織用量約為80 mg時提取的總RNA進行紫外分光光度檢測得出,A260=0.896,A280=0.452,A260/A280=1.982。

從圖1可以看出,當組織用量約140mg時,RNA幾乎全部降解(圖1-A);當組織用量約120mg時,RNA降解嚴重(圖1-B);當組織用量控制在約80mg左右時,提取到的RNA電泳圖譜中可見清晰的3條帶(圖1-C),分別為5S,18S,28 S,A260/A280=1.982,1.8<A260/A280<2.0,說明從雞脾臟組織中提取的RNA純度與完整性良好。表明用1mL的RNAiso Plus試劑,并且把脾臟組織用量控制在80mg左右時,可提取出純度高、完整性好的總RNA。

3 討論

本研究表明,用相同量的提取劑(RNAiso Plus)提取麻雞脾臟組織中的RNA時,并不是組織越多,提取的RNA量就越多;相反,過量的組織中存在過量的RNA酶,所加的RNAiso Plus試劑不能抑制過量RNA酶的活性,使得提取過程中RNA很快被降解。但是,試驗所用脾臟組織也不可太少,否則會因樣品中總RNA含量不足,難以提取出足夠量的純度高、完整性好的總RNA。

本實驗成功與否的關鍵是有無RNA酶的污染。RNA極不穩定,易被RNA酶降解,而RNA酶幾乎無處不在,且特別穩定,故在提取RNA時需最大程度地避免外源RNA酶的污染和抑制內源RNA酶的活力。因此,在本實驗中,除了用液氮迅速處理新鮮的麻雞脾臟組織、控制RNAiso Plus試劑和脾臟組織用量比例,以抑制內源RNA酶的活力外,還用DEPC溶液對本實驗所用物品進行了處理,使用RNA專用儀器設備,操作過程中使用一次性PE手套和口罩等。上述措施對本實驗的成功起了非常重要的作用。

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[2] 胡進東,崔志中,范偉興,等.雞白細胞介素18成熟蛋白全長基因的克隆與序列分析[J].中國獸醫學報,2004,24(2):119-121.

[3] 徐永莉,王紅寧,黃勇,等.雞白介素的分子生物學和應用研究進展[J].動物醫學進展,2007,28(6):57-60.

[4] 李晶,王亦學,鄭德剛,等.一種簡單高效提取棉花不同組織總 RNA的方法[J].山西農業科學,2009,37(5):17-19.

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[6] 王桂林,劉戈飛,黃東陽.從動物組織中提取高質量總RNA方法的改進[J].生物技術通訊,2003,14(6):512-514.

[7] 董增軍,李德春,陳紹先.快速法提取人淋巴細胞總RNA[J].中國免疫學雜志,1991,7(1):56-57.

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