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miR-605和miR-149基因多態性以及相關因素與肺癌易感性的關聯研究

2011-05-31 10:02:32張明五余運賢金明娟潘益峰李其龍馬新源張善春
浙江大學學報(醫學版) 2011年3期
關鍵詞:肺癌研究

張明五,余運賢,金明娟,潘益峰,姜 俠,李其龍,馬新源,張善春,陳 坤

1.浙江大學公共衛生學院流行病學與衛生統計學系,浙江 杭州 310058;2.浙江省嘉善縣腫瘤防治所,浙江 嘉善 314100)

監測數據表明,上海在上世紀80年代初期肺癌發病率接近日本[1],在2000年 -2004年期間,上海市女性肺癌的粗發病率為33.73/10萬,標化發病率為30.90/10萬,男性的粗發病率和標化發病率則分別為81.65/10萬和33.73/10 萬[2],接近西方國家[3]。肺癌發病率增加與環境污染等因素密切相關,同時吸煙也是導致肺癌發病率不斷上升的重要因素之一。就目前而言,確定肺癌相關的危險或保護因素,篩選合適的易感性分子標志物,對于肺癌的早期預警和預防有重要價值和意義。

microRNAs(miRNA)是一類大小約21-23個堿基的單鏈小分子RNA,是由具有發夾結構的約70-90個堿基大小的單鏈RNA前體經過Dicer酶加工后生成。這些非編碼小分子RNA(miRNA)參與調控基因表達,miRNA通過與靶基因的mRNA堿基配對引導沉默復合體(RISC)降解mRNA或阻礙其翻譯[4-5]。研究表明在一些miRNA的編碼基因區域存在多態性位點,這些位點可能會對miRNA表達或剪切、成熟過程產生影響,進而影響其對靶基因的調控效應[6]。

研究表明,位于miR-196a2的多態性位點與肺癌的發病風險增加顯著相關[7],而且該位點與肺癌的預后也密切相關[8]。在K-ras的3'端非編碼區域的let-7結合位點的SNP位點也與肺癌的發病風險改變有關[9],這些研究從另外一個側面證實了miRNA在肺癌發生發展中的作用。本研究試圖探討miR-605(rs2043556)和miR-149(rs2292832)這2個多態性位點與肺癌發病風險的關系;通過檢索miRNA多態性位點數據庫(http://www.patrocles.org/),未見有關miR-605(rs2043556)和miR-149(rs2292832)2個多態性位點與肺癌易感性進行研究的報道。

1 材料方法

1.1 研究對象 采用以人群為基礎的病例對照研究[10]。本研究納入了2002年-2008年期間在浙江省嘉善縣腫瘤研究所報告的244例肺癌病例,病例納入要符合以下標準:①為嘉善縣的本地常住居民;②經確診為肺癌患者;③未接受過放療及化療。對照的選擇方法:以年齡(±5歲)、性別和居住地為匹配因素,從同一時期的自然人群對照庫中隨機抽取。所有的研究對象都簽署了知情同意書。采用問卷調查的方式獲取研究對象的基本資料和吸煙、飲酒、喝茶以及性格特征等相關信息。

1.2 標本的收集和處理 采集研究對象外周靜脈血5ml,枸櫞酸鈉抗凝,低溫凍存;參考試劑盒說明書,DNA分離純化試劑盒(北京天根生化科技有限公司)分離純化淋巴細胞DNA;采用核酸定量儀(德國Eppendorf公司)檢測其濃度和純度,調整DNA終質量濃度為100 ng/μl,置低溫冰箱凍存。

1.3 候選基因和SNP位點的選擇 鑒于目前對miRNA功能的研究和報道比較有限,在miRNA 數據庫(http://www.mirbase.org/)中檢索擬定研究miRNA的靶基因,結合文獻報道對其可能的功能或調控機制的確認,選擇可能與腫瘤發生、發展相關的多態性位點。同時,在miRNA多態性位點數據庫(http://www.patrocles.org/)選擇多態性位點在中國人群中的突變頻率 >0.05;最后選擇了 miR-605(rs2043556)和miR-149(rs2292832)2個多態位點。

1.4 基因型檢測 采用PCR-限制性片段長度多態性(PCR-Restrictedfragmentslength polymorphism,RFLP)技術檢測miR-605(rs2043556)和miR-149(rs2292832)基因多態性位點的基因型。在檢測過程中,隨機抽取5%的樣品進行重復檢測,2次檢測結果的一致率為99%以上。

1.5 統計學分析 研究中采用SPSS 14.0統計軟件對數據進行分析處理;其中年齡為連續變量,采用t檢驗對病例組和對照組的分布進行比較;體重指數(body mass index,BMI)轉化為(≤24和>24)分類變量后和性別、職業等因素,采用χ2檢驗對其分布特征進行比較;采用多因素logistic回歸分析吸煙與肺癌發病風險的關系時,年齡、性別、BMI、職業作為協變量,而在分析多態性位點與肺癌發病風險的關系時,以上提到的協變量加上吸煙、飲酒、飲茶、是否容易生氣作為協變量納入方程進行分析;同時,以性別和吸煙作為分層變量,探討它們與基因之間對肺癌易感性的交互作用。統計分析均采用雙側檢驗,以α=0.05作為統計學顯著性水平的判斷標準。

2 結果

2.1 研究對象的基本人口學特征 表1顯示,病例組和對照組在年齡、性別、職業、BMI和教育程度等特征方面,差異均無統計學意義(P>0.05);但是,病例組的吸煙率(64.8%)明顯高于對照組(51.9%,P<0.01)。

2.2 吸煙與肺癌發病風險的關系 在校正了年齡、性別、職業、BMI后,采用非條件Logistic對行為習慣因素進行分析,結果表明,每天吸煙<20支者肺癌的發病風險是不吸煙者的1.7倍(OR=1.7,95%CI:1.0-3.0);每天吸煙20支及以上者的發病風險增加到4.2倍(OR=4.2,95%CI:2.3 -7.6);飲酒、容易生氣、喝茶等因素與肺癌的發病風險之間無統計學關聯(表2)。

2.3 miR-149和miR-605多態性與肺癌易感性的關系 表3顯示,在校正了年齡、性別、BMI、職業、吸煙、飲酒、飲茶和容易生氣后,與miR-605 AA基因型攜帶者相比,AG和GG攜帶者的OR分別為1.2(95%CI:0.4-3.4)和1.7(95%CI:0.6-4.8)。將AG和GG基因型合并后,即至少1個G等位基因攜帶者的OR=1.2(95%CI:0.8-1.7),關聯均無統計學意義(P>0.05)。與miR-149 TT基因型攜帶者相比,CT和TT攜帶者的OR分別為0.7(95%CI:0.3-2.2)和0.6(95%CI:0.2-1.9),而至少1個C等位基因型攜帶者的OR=0.9(95CI:0.6-1.3);以上關聯均無統計學意義(P >0.05)。

2.4 性別和吸煙分層后miR-149和miR-605與肺癌的相關性 表4顯示,在吸煙和不吸煙的人群中,miR-605至少1個G(AG+GG)等位基因攜帶者的OR分別為1.4(95%:0.9-2.3)和0.9(95%CI:0.5-1.7),miR-149至少1個C(CT+CC)等位基因攜帶者的OR分別為0.8(95%CI:0.5-1.3)和1.1(95%CI:0.6-2.0),關聯均無統計學意義。

在男性人群中,與miR-605 AA基因型相比,至少1個G等位基因攜帶者的OR分別為1.5(95%CI:1.0-2.3),P=0.071;而該基因型在女性人群中的OR=0.6(95%CI:0.3-1.4),P=0.245。在男性人群中,與 miR-149 TT基因型攜帶者相比,至少1個C(CT+CC)等位基因攜帶者的OR=0.9(95%CI:0.6-1.4)和在女性人群中的OR=1.9(95%CI:0.4-1.9),關聯均無統計學意義。

表1 研究對象的基本特征Table 1 Distributions of socio-demographic variables among case and control groups

表2 行為習慣因素與肺癌發病風險的相關性Table 2 Associations of life-style related factors with lung cancer risk

表3 miR-605和miR-149基因多態性與肺癌易感性的關系Table 3 Associations of miR-605 and miR-149 polymorphisms with lung cancer risk

表4 按吸煙和性別分層后miR-149和miR-605多態性與肺癌易感性的關系Table 4 Adjusted associations of miR-149 and miR-605 polymorphisms with lung cancer risk after stratification by smoking and sex

3 討論

肺癌是嚴重威脅人類健康的惡性疾病,尋找影響肺癌發生、發展的因素對實現肺癌的預防具有重要價值。本研究進一步證實吸煙會明顯增加肺癌的發病風險,但沒有發現miR-149多態性與肺癌的發病風險之間有統計學關聯;但是,在男性人群中,miR-605突變與肺癌的發病風險存在一定的關聯,提示該突變位點可能會增加男性肺癌的發病風險。另外,本研究沒有發現吸煙與miR-605和miR-149之間有交互作用。

基于miRNA參與調控基因表達的分子機制,miRNA參與腫瘤易感性改變要滿足2個基本條件:第一,該位點能改變miRNA的表達水平;第二,相關miRNA調控的靶基因與腫瘤的發生、發展密切相關。本課題組前期對腸黏膜組織的研究結果顯示,該多態性位點與其成熟miRNA的表達水平有關,提示選擇的這2個位點是有功能的位點。研究表明,miR-149*可以通過調控E2F1和Akt的表達誘導腫瘤細胞的凋亡,該研究證實E2F1和Akt是miR-149的靶基因[11]。而E2F1和 Akt在信號轉導和細胞增殖、凋亡以及分化的調控過程中發揮重要的作用[12-13]。而本研究則發現,miR-149基因多態性與肺癌的發病風險之間沒有統計學關聯,與前期在中國人群的另一項研究結果相近[7]。提示miR-149的表達可能具有較強的組織特異性,對于該位點是否會影響miR-149的表達,而最終會影響到哪些基因的表達調控還有待進一步的研究。

研究發現,miR-605是P53調控網絡的重要組成部分之一[14]。P53基因除了參與細胞增殖和凋亡調控外,還參與部分miRNAs的表達調控[15],相互之間形成了有機的調控網絡[16]。miR-605作為調控網絡中的一個分子,其表達異常必然會影響腫瘤的發生和發展。但本研究沒有發現miR-605編碼基因多態性與肺癌的發病風險有關聯,而關于miR-605在肺癌組織中的表達及其與肺癌的相關性還沒有見到文獻報道,具體的分子機制還有待研究。

本研究按照性別分層分析的結果表明,在男性人群中miR-605的突變基因型與肺癌發病風險的關聯有臨界的統計學意義,在女性人群中未發現類似的結果,提示該位點可能是男性的危險基因型。而結果未達到統計學的顯著性水準可能與樣本量不足有關,尤其是經過分層后,進行分析的樣本量限制了統計分析的效率。

除了遺傳因素外,個體行為習慣往往也是影響腫瘤發病風險的重要因素,本研究沒有發現飲酒、喝茶和容易生氣等與肺癌的發病風險有關聯。而對吸煙行為習慣的分析結果與大量的研究結果類似,本研究表明吸煙頻率增加是肺癌的重要危險因素,相對于不吸煙的人群,隨著吸煙頻率的增加,肺癌的發病風險將增加1-3倍。該研究結果提示,吸煙可能會導致遺傳損傷的機會和概率增加,進而增加基因乃至細胞突變的機會和概率[17]。

但總體來說該研究還存在以下不足之處:首先樣本量不足可能會對研究結果的穩定性產生重要影響;其次,在分析吸煙的危險時因為資料缺陷,沒有分析吸煙的暴露總量對肺癌發病風險的影響;第三,本研究沒有從組織水平對該多態性位點的功能性進行確認;第四,本研究采用病例對照研究,對照的選擇可能不當,造成選擇性偏倚。另外,本研究對象對吸煙等變量可能產生回憶性偏倚。以上這些不足都將會對本研究結果或結論產生影響。

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