一種新的DNA序列進化距離的修正方法
2012-04-29 00:44:03邢林林郭茂祖王娟
智能計算機與應用 2012年4期
邢林林 郭茂祖 王娟
摘要： 進化樹是推演生命歷史的一個重要工具。在構建進化樹的所有算法中，基于進化距離的算法是其中研究的重點。但是，這一方法較為嚴重地依賴著距離矩陣的質量。人們開發了多種基于生物事實的進化模型來改進距離矩陣的構建過程，很大程度上提高了進化距離的準確性。同時，也提出了許多方法來檢測距離矩陣的質量。文中提出了基于模型的距離以及p距離，采用一種組合的新距離的方式來構建距離矩陣。同時采用直接檢測距離矩陣的統計學計分方法以及構建進化樹，對比實驗結果表明文中的方法實用且有效。
關鍵詞：
中圖分類號：TP391文獻標識碼：A文章編號：2095-2163（2012）04-0035-06
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