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利用Mlo蛋白質保守域MJ4—MrcD2區擴增小麥抗白粉病基因

2012-04-29 09:07:53賈倩李東方等
湖北農業科學 2012年24期

賈倩 李東方等

摘要:利用Mlo蛋白質保守域設計兼并引物,以24個抗性不同的小麥品種為試驗材料,采用抗病基因類似物(RGA)法探索小麥白粉病抗病基因快速有效篩選及利用的新方法。結果表明,所用的小麥抗病材料基因組DNA與兼并引物同源區的序列變化較感病材料大,導致擴增效率較低;兼并引物在抗病及感病材料中擴增結果類似,僅從這一結果無法判斷擴增出的RGA與小麥白粉病基因間的關系,需要通過下游轉化、克隆、測序來進一步篩選抗病相關RGA。

關鍵詞:白粉病;Mlo蛋白質;保守域;抗病基因類似物(RGA)

中圖分類號:Q943.2 文獻標識碼:A 文章編號:0439-8114(2012)24-5798-03

小麥白粉病是小麥生產上的重要病害。利用抗病品種是防治小麥白粉病最經濟有效的措施。培育、推廣不同來源的抗性基因聚合體品種或將抗性基因不同的品種進行合理布局,避免抗源單一化,可以有效地減緩小麥白粉病菌優勢菌株的繁殖速度和延緩品種抗性喪失的速度[1]。因此,如何獲取新抗源是小麥白粉病抗病育種的關鍵。大麥中隱性突變基因Mlo介導了一類單基因控制的、非小種專化的、持久的白粉病抗性[2],是獲取新抗源的又一重要途徑。

試驗通過對Mlo蛋白質保守域MJ4-MrcD2區的擴增來獲得小麥抗白粉病基因,為尋找快速有效的抗白粉病基因新篩選方法及其在作物育種上的有效利用提供技術支持。

1 材料與方法

1.1 材料

試驗選用的小麥材料見表1。

1.2 方法

1.2.1 兼并引物的設計 根據來自普通小麥、大麥、玉米、粳稻、秈稻等物種的8個Mlo基因所編碼蛋白質的跨膜區保守域設計兼并引物(所依據的保守域見表2,序列比對所用基因編碼的蛋白質見表3),采用的數據庫及序列分析比對軟件有CDD、ClustalX1.8、Primer5.0等。

1.2.2 小麥基因組DNA的提取 采用CTAB法。

1.2.3 PCR擴增及電泳 PCR體系采用20μL:DNA模板1μL,10×Buffer2μL,dNTPs2μL,ddH2O12.6μL,TaqDNA聚合酶0.4μL,上下游引物各1μL。PCR循環參數:94℃預變性4min;94℃變性1min,50℃退火1.5min,72℃延伸2min,40個循環;72℃延伸10min;4℃,保存。采用1.2%瓊脂糖凝膠進行電泳,緩沖液為1×TAE;電泳結果用凝膠成像系統進行拍照,保存。

2 結果與分析

由圖1和圖2可知,抗病材料中除1、2、3、5、6沒有擴增出結果外,7、8、12、13、14、15、18、20、23、24都擴增出了目標條帶,抗病材料中能擴增出目標條帶的頻率是66.7%(10/15);感病材料4沒有擴增出結果,9、10、11、16、17、19、21、22中都擴增出了目標條帶,感病材料中能擴增出目標條帶的頻率是88.9%(8/9)。所有目標擴增帶大小都在500bp左右,基本符合兼并引物設計時的預期結果。研究中兼并引物在抗病材料中擴增效率較低而在感病材料中擴增效率較高的事實,暗示試驗所用小麥感病材料的基因組DNA與兼并引物序列的同源區序列相似性要高于抗病材料,或者說抗病材料基因組DNA與兼并引物同源區序列變化較大導致擴增效率較低。

通過植物抗病(Resistance,R)基因的保守域擴增RGA的主要目的是分離植物的抗病基因或作為分子標記跟蹤抗病基因。RGA與R基因的關系可分為3種:RGA是R基因或其假基因的一部分;RGA與R基因緊密連鎖;RGA與已知的R基因無關[3]。兼并引物在抗病及感病材料中擴增結果類似,僅從這一結果無法判斷擴增出的RGA與小麥白粉病基因間的關系。由于兼并引物序列的兼并性,其在不同小麥材料中即使擴增產物大小一致但序列應該是不一樣的。可以對試驗中得到的擴增片段進行回收,然后進行測序及序列比對分析驗證。從每個回收的擴增帶轉化的單克隆中挑選多個(10~25個)進行測序應該能找到抗病品種中所特異出現的序列,該序列很有可能是抗病基因的一部分或與抗病基因緊密連鎖。這為進一步克隆抗病基因或進行抗病基因分子標記篩選打下了堅實基礎。

3 討論

在不同抗源材料中全面發掘新抗源,培育積累不同類型的植物抗病(Resistance,R)基因盡可能多的小麥新品種;或者在農作物生產上保證多樣性抗源使具有不同R基因的品種合理布局,以R基因的遺傳多樣性來抑制新毒性小種的產生和蔓延,這些措施對于加快小麥新抗病品種培育及提高抗病品種的抗性持久性有重要意義[4-6]。研究表明,R基因具有特殊的保守域,通過保守域擴增抗病基因類似序列(RGA)是分離植物抗病基因的重要途徑,也是篩選抗病基因分子標記的重要手段[7]。保守域擴增中簡并引物的設計是關鍵,簡并度越低,產物特異性越強,但擴增效率會隨之降低;反之,簡并度越高,擴增效率越高,但產物的特異性會降低,簡并度的大小需要根據不同抗病基因及其具體的保守域位點來確定。

大麥Mlo基因與以往克隆的任何R基因的結構都沒有同源關系,是一類植物所特有的新型的抗病基因[2]。Kim等[8]克隆了水稻Mlo(OryzasativaMlo,OsMlo)基因,并闡明OsMlo編碼一個62ku的蛋白質,其功能也是負向調節廣譜抗病性與葉細胞死亡。研究采用類似RGA法,以Mlo蛋白質保守域MJ4-MrcD2區為目標,通過PCR擴增來獲得小麥新的抗白粉病基因,獲得了初步結果,可以為尋找快速有效的抗白粉病基因新篩選方法及其在作物育種上有效利用提供一定的參考。

參考文獻:

[1]韓德俊,曹 莉,陳耀鋒,等.植物抗病基因與病原菌無毒基因互作的分子基礎[J].遺傳學報,2005,32(12):1319-1326.

[2]韓德俊,李振岐,曹 莉,等.大麥抗白粉病基因Mlo的研究進展[J].西北植物學報,2003,23(3):496-502.

[3]秦跟基,李萬隆,陳佩度.植物抗病基因結構特征及其類似序列的研究進展[J].南京農業大學學報,1999,22(3):102-107.

[4]陳曉梅,郭順星.RGA植物抗病性物質的研究進展[J].植物學通報,1999,16(6):658-664.

[5]徐冰強,杜中軍,黃俊生.RGA法克隆候選抗病基因的研究進展[J].分子植物育種,2004,2(3):421-428.

[6]李春來,張懷渝.植物抗病基因同源序列(RGA)研究進展[J].分子植物育種,2004,2(6):853-860.

[7]KONGW,FANGXJ.CloningandmappingofNBS-LRRtyperesistancegeneanalogsincotton(GossypiumbarbadenseL1)[J].MolecularPlantBreeding,2003,1(3):427-429.

[8]KIMMC,LEESH,KIMJK,etal.Mlo,amodulatorofplantdefenseandcelldeath,isanovelcalmodulin-bindingprotein.[J].TheJournalofBiologicalChemistry,2002,227(22):19304-19314.

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