999精品在线视频,手机成人午夜在线视频,久久不卡国产精品无码,中日无码在线观看,成人av手机在线观看,日韩精品亚洲一区中文字幕,亚洲av无码人妻,四虎国产在线观看 ?

不同產地麥冬遺傳多樣性的SRAP分析

2012-12-24 00:53:34馬秀杰王冠明韓烈保
草業科學 2012年11期
關鍵詞:分析

馬秀杰,王冠明,韓烈保,3

(1.北京林業大學草坪研究所暨森林培育與保護省部共建實驗室,北京100083;2.鴻銘控股有限公司,北京100020;3.長江大學園藝園林學院,湖北 荊州434025)

“麥冬”指以麥冬為名的百合科沿階草族(Ophiopogoneae)沿階草屬(Ophiopogon)和山麥冬屬(Liriope)植物,在我國廣泛分布,除華北、東北和西北外,其他各省(區、市)均有分布。麥冬具有潤肺清津、養陰清熱的功能,塊根可入藥。一些麥冬品種具有四季常綠、耐踐踏、耗水少、易繁殖等特點,被廣泛應用于園林綠化。麥冬的抗逆性、生態效益、經濟效益優于其他冷季型和暖季型草坪草[1]。目前全國以麥冬為名的沿階草屬有18個種(變種),山麥冬屬植物共有8個種(變種)[2]。麥冬類植物的分類混亂,山麥冬屬和沿階草屬的劃分一直存在爭議[3],如湖北麥冬(L.spicata)與山麥冬(L.spicata)未開花時形態較為相似,難以鑒別[4]。因而,對我國不同產地的麥冬進行親緣關系和遺傳多樣性分析具有重要意義。

近年來,我國有關麥冬遺傳多樣性和分子標記的研究已逐漸展開。吳弢等[5]采用RAPD技術對4種山麥冬屬植物進行了分類學研究,李風濤和雷公藤[6]利用RAPD標記對福建省內不同產地的短葶山麥冬(L.muscari)進行了種源研究。黃玉吉等[7]測定了7個不同產地麥冬(O.japonious)和山麥冬的rDNA-ITS序列。但上述研究選用的樣品相對較少,分布狹窄。鑒于此,本研究采用SRAP分子標記技術對來自全國不同產地的48份麥冬材料進行遺傳多樣性研究,分析麥冬種質資源的遺傳多樣性,為麥冬的鑒定、種質資源篩選提供科學依據。

1 材料與方法

1.1 材料 對采自全國不同地區的98份麥冬進行分株擴繁后,選取48份材料進行測試,其中野生種19個,栽培種29個(表1),野生種用 W標識,栽培種用C標識。

1.2 DNA的提取 取新鮮麥冬葉片,液氮研磨后采用改良的CTAB法分別提取其基因組DNA[8]。

1.3 引物篩選與PCR擴增 SRAP所用引物及序列參照Li和Quiros發表的文獻[9],引物由上海生工生物有限公司合成(表2)。首先選取4個具有代表性的材料(杭麥冬、川麥冬、闊葉山麥冬、山麥冬)對64種引物組合進行篩選,獲得多態性好,且條帶清晰的11種引物進行擴增。擴增反應總體系為25μL:模板DNA 50ng,TransTaq-T酶1.25U,10× TransTaq-T buffer 2.5 μL,dNTPs 0.2 mmol·L-1,上、下游引物各0.2μmol·L-1,加滅菌水至25μL。SRAP-PCR采用復性變溫法:94℃預變性5min;94℃變性1min,35℃復性1min,72℃延伸10min,4℃條件下保存。

表1 供試材料及來源Table 1 Name and source of materials in this study

表2 本試驗所用引物組合Table 2 Primer sequences used in this study

1.4 數據處理 對清晰、可重復的DNA條帶進行統計,在相同遷移位置上,將穩定出現的有條帶的記為1,無帶的記為0,獲得0和1組成的原始矩陣。利用表型矩陣,統計SRAP擴增產物的條帶總數和多態性條帶數量。按照Nei-Li[10]相似系數的方法計算。

式中,X1、X2分別為成對比較的2個品種的擴增帶數,X1,2為共有帶數。

采用(Nei-Li)遺傳相似系數、UPGMA 法[11]進行聚類分析。數據處理采用DPSv 7.05軟件。

2 結果與分析

2.1 不同產地麥冬SRAP擴增產物的多態性分析 從64對引物組合中篩選出多態性好且條帶豐富的11對引物組合(表3),對48份麥冬種質進行PCR擴增,共產生621條清晰條帶,平均每對引物組合產生56.45條多態性條帶。me3+em7引物組合擴增最多,為88條,me7+em3引物組合擴增出65條(圖1),me7+em6擴增最少,為36條。多態性總條帶數目為621條,平均多態性比率(PPB)達到100%。說明供試麥冬具有很高的遺傳多樣性。

表3 11對引物組合的SRAP擴增結果Table 3 Amplified results of SRAP with 11pairs of primers

圖1 引物組合me7+em3對48份麥冬的的擴增結果Fig.1 SRAP amplification profiles of 48Lilyturfs with primer combination me7+em3

2.2 遺傳距離與遺傳相似性分析 48份供試麥冬材料的相似系數GS值為0.058 4~0.936 7,平均為0.497 5,變幅為0.878 3,遺傳距離GD為0.066 3~0.941 6,平均為0.504,變幅為0.875 3。來自江蘇沭陽的7號日本矮生沿階草與來自廣西南寧的9號麥冬遺傳距離最小,為0.066 3,說明兩者具有較近的親緣關系。來自云南西雙版納的44號高腳沿階草與來自四川三臺的1號川麥冬遺傳距離最大,為0.941 6,說明兩者親緣關系較遠。分析結果表明,供試材料之間遺傳相似度低,差異明顯。

2.3 不同產地麥冬種質聚類分析 在遺傳距離0.81處可將供試材料分成六大類(圖2)。第Ⅰ類共13份材料,又可分為2個亞類。第1亞類供包括10個材料,主要為產地不同的麥冬,第2亞類有3個材料,全部為沿階草。第Ⅱ類19份材料,分屬麥冬(O.japonicus)、山麥冬(L.spicata)、闊葉山麥冬(L.platyphylla)、短葶山麥冬(L.muscari)、禾葉山麥冬(L.graminifolia)5個種。其中3、5、8號為麥冬,與其他材料遺傳距離較遠,優先聚為一個亞類,27、28、29號闊葉山麥冬、30號金邊闊葉麥冬和31號短葶山麥冬麥冬5份材料聚為一個亞類。第Ⅲ類共12份材料,除40號外,其余皆為沿階草,云南材料占該類群的75%。第Ⅳ類僅一份材料,形態學上鑒定為矮小沿階草(O.bodinierivar.pygmaeus),23、24和25號聚為一類。第Ⅴ類為細葉銀邊沿階草(O.intermediuscv.Argenteo-marginatus)。第Ⅵ類包括兩個沿階草材料。

圖2 48份麥冬種質遺傳距離分析聚類圖Fig.2 Dendrogram of 48Lilyturf accessions based on SRAP

3 討論

SRAP分子標記是由Li和Qurios[9]于2001年提出的一種新型的基于PCR的分子標記方法。SRAP技術具有簡便、快速,不需預知物種的序列信息等特點,在植物遺傳多樣性分析[12]和種質鑒定[13]方面得到了廣泛應用。近年來,SRAP開始應用于結縷草(Zoysiajaponica)[14]、野牛草(Buchloedactyloides)[15]和狗牙根(Cynodondactylon)[16]等草坪草和牧草的遺傳多樣性分析。本試驗篩選出11對條帶清晰、可重復的引物,共擴增出621條譜帶,平均多態性比率為100%。SRAP分子標記中,種內平均多態比率達90%以上的報道相對較少,多見于種間。劉曉宏[17]對31份漆樹(Toxicodendron vernicifluum)種質進行SRAP分析,11對引物組合擴增條帶平均多態性比率為98.04%。劉建豐[18]對29份野生煙草(Nicotianatabacum)種質進行SRAP-PCR擴增,18對引物組合擴增多態性比率達到100%。陶愛芬等[19]用23對引物組合對96份黃麻(Corchoruscapsularis)種質資源進行SRAPPCR擴增,多態性比率也為100%。

本研究選用的麥冬類材料分屬麥冬屬和沿階草屬,分化明顯、多樣性突出,表型豐富。擴增結果表明,使用SRAP分子標記技術可以有效地對麥冬進行遺傳多樣性分析。余伯陽和徐國鈞[2]觀察了湖北麥冬與山麥冬兩種植物的塊根和葉的組織形態,發現兩者之間無明顯差異,因此認為湖北麥冬的分類學位置有待進一步研究。吳弢等[5]對4種麥冬進行RAPD遺傳多樣性分析后認為,湖北麥冬與山麥冬的相對遺傳距離大于山麥冬與闊葉山麥冬的相對遺傳距離,湖北麥冬和山麥冬應該為兩個種。本研究采用SRAP分子技術對48種麥冬的遺傳多樣性分析顯示,14號湖北麥冬與來自不同產區的19、20、21和22號山麥冬可聚為一大類,但是相對遺傳距離大于同類中來自不同產區的26、27、28、29和30號麥冬,進一步支持了吳弢等[5]的觀點。31號短葶山麥冬與26、27、28、29和30號闊葉山麥冬可聚為一類,且遺傳距離非常小,這與徐炳聲和李林初[20]的闊葉山麥冬和短葶山麥冬無明顯界限,闊葉山麥冬為短葶山麥冬變種的觀點一致。

Wilson等[21]認為種質的地理分布與分子標記間存在相關性,在苜蓿(Medicagosativa)22、狗牙根[23]、白三葉(Trifoliumrepens)[24]等草坪草和牧草上的遺傳分析也證實了來自相似地理環境的種質可以優先聚為一類。本研究通過對產地不同的麥冬進行SRAP統計分析和聚類分析,發現供試材料也呈現一定的地域分布規律。第Ⅰ類群來自四川的1和2號以及來自浙江的4和6號分別聚在一起,可能與它們起源以及分布相似性有關。第Ⅱ類群中,來自北京的3、15和16號生態環境相似,也可以聚在一起。第Ⅲ類群中,來自云南的32、34、35、36、38、41、42、43、46和47號沿階草材料可以聚為一類,這可能由于云南特有的海拔高度、土壤氣候及降雨對沿階草的自然選擇造成的影響,使得該地區材料基因型趨近一致。來自浙江慈溪的5號栽培種麥冬及6號野生種麥冬未能聚在一起,這可能是由人為選擇導致的。

[1]張進友.優良的草坪地被植物沿階草[J].草業科學,2003,22(2):69-70.

[2]余伯陽,徐國鈞.麥冬類中藥的藥源調查和商品鑒定[J].中國藥科大學學報,1991,22(3):150-153.

[3]Hume H H.The Ophiopogon-Liriope complex[J].Baileya,1961,9(46):134-158.

[4]劉霞,曹秀榮,陳科力,等.湖北麥冬的研究進展[J].醫藥導報,2008,27(10):1231-1234.

[5]吳弢,周開亞,王義權,等.RAPD在山麥冬屬四種植物分類中的應用[J].中草藥,1998,29(1):37-40.

[6]李風濤,雷公藤.基于道地藥材短葶山麥冬RAPD種源鑒別研究[D].福州:福建農林大學,2009:32-34.

[7]黃玉吉,陳菁瑛,蘇海蘭,等.不同產區麥冬、山麥冬rDNA-ITS序列分析[J].福建農業學報,2009,24(6):508-512.

[8]王冠明,韓烈保,馬秀杰,等.麥冬基因組DNA提取方法研究[J].生物技術通報,2010(6):100-106.

[9]Li G,Quiros C F.Sequence-related amplified polymorphism (SRAP),a new marker system based on a simple PCR reaction:Its application to mapping and gene tagging inBrassica[J].Theoretical and Applied Genetics,2001,103:455-461.

[10]Nei M,Li W H.Mathematical model for studying genetic variation in term of restriction endonucleases[J].Proceeding of the national Academy Scineces,1979,76:5269-5273.

[11]Rohlf F J.NTSYS-pc.Nuberical Taxonomy and Multivariate Analysis System (Version 2.0)[M].New York:Exeter Software,2001:16-29.

[12]Ferriol M,Pico B,Nuez F.Genetic diversity of a germplasm collection of Cucurbitapepo using SRAP and AFLP markers[J].Theoretical and Applied Genetics,2003,107:271-282.

[13]張建成,王傳堂,焦坤,等.SRAP標記技術在花生種子純度鑒定中的應用[J].中國農學通報,2005,21(12):35-39.

[14]郭海林,鄭軼琦,陳宣.結縷草屬植物種間關系和遺傳多樣性的SRAP標記分析[J].草業學報,2009,18(5):201-210.

[15]周瑩潔,王顯國,張新全.野牛草種質基于SRAP標記的遺傳多樣性研究[J].草業科學,2011,28(11):1930-1935.

[16]王志勇,袁學軍,劉建秀.狗牙根SRAP-PCR反應體系優化及引物篩選[J].草業學報,2008,17(3):79-85.

[17]劉曉宏.漆樹種質資源遺傳多樣性及親緣關系的SRAP分析[D].揚州:揚州大學,2009:27-41.

[18]劉建豐.煙草核心種質DNA遺傳多樣性研究[D].北京:中國農業科學院,2007:34-39.

[19]陶愛芬,祁建民,粟建光,等.SRAP和ISSR及兩種方法結合在分析黃麻屬起源與演化上的比較[J].作物學報,2011,37(12):2277-2284.

[20]徐炳聲,李林初.短葶山麥冬種群分類問題的探討[J].植物分類學報,1980,19(4):456-461.

[21]Wilson B L,Kitzmilier J,Rolle W,etal.Isozyme variation and its environmental correlates inElymus glaucusfrom the California Floristic Province[J].Canadian Journal of Botany,2001,79:139-153.

[22]何慶元,吳蘋,張曉紅,等.不同秋眠性苜蓿SRAP體系優化及遺傳多樣性分析[J].草業學報,2011,20(2):201-209.

[23]凌瑤,張新全,齊曉芳,等.西南五省區及非洲野生狗牙根種質基于SRAP標記遺傳多樣性分析[J].草業學報,2010,19(2):196-203.

[24]張婧源,彭燕,羅燕,等.不同產地白三葉種質遺傳多樣性的SRAP分析[J].草業學報,2010,19(5):130-138.

猜你喜歡
分析
禽大腸桿菌病的分析、診斷和防治
隱蔽失效適航要求符合性驗證分析
電力系統不平衡分析
電子制作(2018年18期)2018-11-14 01:48:24
電力系統及其自動化發展趨勢分析
經濟危機下的均衡與非均衡分析
對計劃生育必要性以及其貫徹實施的分析
現代農業(2016年5期)2016-02-28 18:42:46
GB/T 7714-2015 與GB/T 7714-2005對比分析
出版與印刷(2016年3期)2016-02-02 01:20:11
網購中不良現象分析與應對
中西醫結合治療抑郁癥100例分析
偽造有價證券罪立法比較分析
主站蜘蛛池模板: 国产在线自在拍91精品黑人| 激情影院内射美女| 欧美精品高清| 国产综合亚洲欧洲区精品无码| 不卡午夜视频| 午夜综合网| 久久久久亚洲Av片无码观看| 强奷白丝美女在线观看| 国产激情在线视频| 日韩人妻精品一区| 免费观看成人久久网免费观看| 亚洲成人精品久久| 亚洲精品中文字幕无乱码| 日本在线国产| 91精品日韩人妻无码久久| 日本一本正道综合久久dvd| 成人在线欧美| 免费人欧美成又黄又爽的视频| 青青网在线国产| 2021天堂在线亚洲精品专区 | 美女内射视频WWW网站午夜| 永久免费AⅤ无码网站在线观看| 久草青青在线视频| 18黑白丝水手服自慰喷水网站| 国产香蕉97碰碰视频VA碰碰看 | 久久精品娱乐亚洲领先| 久久人妻xunleige无码| 午夜少妇精品视频小电影| 国产精品亚洲一区二区在线观看| 中日韩一区二区三区中文免费视频| 美女视频黄频a免费高清不卡| 亚洲精品无码抽插日韩| 免费又爽又刺激高潮网址 | 日韩毛片基地| 亚洲欧美另类色图| 好吊日免费视频| 国产精品九九视频| 日韩在线成年视频人网站观看| 午夜人性色福利无码视频在线观看| 国产交换配偶在线视频| 成人在线不卡视频| 福利在线一区| 免费国产一级 片内射老| a免费毛片在线播放| 美女无遮挡拍拍拍免费视频| 少妇露出福利视频| 色综合婷婷| 成人午夜在线播放| 国产一区二区三区在线观看视频| 日韩精品一区二区三区中文无码| 成人av专区精品无码国产| 狠狠色综合网| 国产嫖妓91东北老熟女久久一| 1769国产精品视频免费观看| 久久综合成人| 制服丝袜无码每日更新| 亚洲成人高清无码| 秋霞午夜国产精品成人片| 少妇精品在线| 在线观看国产网址你懂的| 国产精品极品美女自在线网站| AV熟女乱| a在线观看免费| 精品成人一区二区| 亚洲爱婷婷色69堂| 一级毛片网| 免费大黄网站在线观看| 国产1区2区在线观看| 一级爆乳无码av| 在线国产你懂的| 尤物精品国产福利网站| 亚洲精品第一在线观看视频| 成人在线观看一区| 色偷偷男人的天堂亚洲av| 成人在线观看不卡| 在线日本国产成人免费的| 亚洲不卡影院| 久久久久青草大香线综合精品 | 中文字幕亚洲另类天堂| 国产成年女人特黄特色大片免费| 91成人在线观看视频| 最新精品久久精品|