六個癌基因堿基序列的結構特點與聚類分析
2012-12-31 00:00:00楊紀青楊碩
湖北農業科學 2012年13期
摘要：提取６個癌基因（ＢＡＫ１、ｃｃｎｄ１、ＡＤＡＭＴＳ１、ＡＤＡＭ１７、ＡＤＡＭＴＳ８、ＡＧＥＲ）的堿基序列，借助ＭＡＴＬＡＢ軟件編寫程序代碼，檢索６個癌基因堿基序列的４種單一堿基（Ａ、Ｔ、Ｃ、Ｇ）的概率和６４種三堿基組（ＡＡＡ、ＡＡＴ、ＡＡＣ、……、ＧＧＧ）的概率；對６個癌基因堿基序列的各種分布進行相空間聚類。結果表明，所在染色體不同、所在細胞不同、序列長度不同的６個癌基因堿基序列的結構特點與其生物學功能之間存在著明確的相空間關聯。對生物學功能未知的基因和生物學功能已知的基因進行堿基序列結構特點分析和相空間聚類，可以由聚類結果預測功能未知基因是否具有與功能已知基因相似的生物學功能，這為尋找具有某種生物學功能的基因和預測基因是否具有某種生物學功能提供了一個有效途徑。
關鍵詞：癌基因；堿基序列；相空間聚類；生物學功能；相空間關聯
中圖分類號：Ｑ５２３＋．８ 文獻標識碼：Ａ 文章編號：0439－８114（２０12）13－2861-03
