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雜合抗菌肽MgJ 基因真核表達載體的構建

2013-04-23 11:53:30
中國釀造 2013年8期

尹 佳

(吉林化工學院環境與生物工程學院,吉林 吉林 132022)

抗菌肽(antimicrobial peptides)是具有抗菌活性的一類肽的總稱。通常由13~50個氨基酸組成,為陽離子型多肽[1]。兩性α-螺旋結構和兩性β-折疊結構是抗菌肽最顯著的結構特征。抗菌肽對細菌具有很強的殺傷作用,不宜在原核系統中直接表達,一般采用融合表達或在酵母中表達[2-3]。

本研究通過對抗菌肽Magainin-Ⅱ和JaponicinⅡ兩個基因(簡稱M和J)的一級結構和二級結構的分析,用一段編碼ser-ser-gly-ser-gly-ser的柔性連接肽序列將M基因和J基因相連,以利于M和J基因各自的空間折疊。選用巴斯德畢赤酵母(Pichia pastoris)偏愛的密碼子,通過重疊區基因擴增法(SOE法)[4]人工合成MgJ基因,然后將其連接至在巴斯德畢赤酵母中高效表達的表達載體pPICZα A上。其設計目的是獲得比MagaininⅡ和JaponicinⅡ生物活性更高的抗菌肽,為雜合抗菌肽MgJ的高效分泌表達奠定了基礎。

1 材料與方法

1.1 材料

大腸桿菌(Escherichia coli)DH5α、質粒pPICZα A 均由本實驗室保存,內切酶、dNTP、T4連接酶、DNA marker、PCR 擴增試劑盒、DNA凝膠回收試劑盒購自TaKaRa寶生物工程有限公司。引物由聯星生物合成,其他試劑均為國產分析純試劑。

1.2 方法

1.2.1 基因的合成

引物設計:根據GenBank中的基因序列,在M基因和J基因中間用鉸鏈ser-ser-gly-se r-gly-ser連接,按照畢赤酵母偏愛密碼子表[5]設計合成8個引物,其中Up1含有EcoRⅠ酶切位點,Down2含有XbaⅠ酶切位點。各引物序列見表1。

表1 合成MgJ基因的引物序列Table 1 MgJ primers sequencs

各引物與模板之間的互補關系見圖1。

圖1 各引物與模板之間的互補關系示意圖Fig.1 Complementation of primers

MgJ基因的合成:M1+M2(J1+J2):94℃、5min;94℃、30s,60℃、30s,72℃、30s,每一個循環增加0.2℃,共35個循環;72℃、10min。經電泳檢測后割膠回收DNA片段,并命名為M基因。相同條件下J1和J2合成J基因。

Up1-M-Down1(Up2-J-Down2):94℃預變性5min;94℃變性30s、56℃退火30 s、72℃延伸30s;每一個循環增加0.1℃,共30個循環;72℃延伸10min。

全長片段:Up1-M-Down1、Up2-J-Down2互為引物,94℃預變性5min;94℃變性30s、56℃退 火30s、72℃延伸30s;每一個循環增加0.1℃,共30個循環;72℃延伸10min。

以上各PCR體系均為100mL。

1.2.2 目的基因的鑒定目的基因經PCR擴增后,取5μLPCR產物與DNA marker 2.0%瓊脂糖凝膠電泳。

1.2.3 表達載體的構建目的基因表達載體的構建策略見圖2。

圖2 重組質粒pPICZαA-MgJ構建策略Fig.2 Construction of recombinant pPICZα A-MgJ

1.2.4 酶切和連接

目的基因全片段和pPICZα A均用EcoRⅠ和XbaⅠ雙酶切,膠回收后,16℃連接過夜。

1.2.5 感受態細胞DH5α的制備和轉化

按常規方法操作[6-8]。

1.2.6 陽性克隆的篩選

Zeocin篩選法[9]。

1.2.7 重組質粒的鑒定及DNA序列分析

挑取重組菌培養,提取質粒[10],用EcoRⅠ/XbaⅠ雙酶切初步鑒定重組子。DNA序列分析由上海生工生物工程公司完成。

2 結果與分析

2.1 MgJ基因的合成

各引物片斷拼接采用重疊PCR擴增出完整的基因。PCR產物經2%瓊脂糖凝膠電泳檢測,大小與預計的163bp相符。結果見圖3、圖4。

圖3 目的基因的2%瓊脂糖凝膠電泳Fig.3 Agarose gel electrophoresis of genes

圖4 MgJ的2%瓊脂糖凝膠電泳Fig.4 Agarose gel electrophoresis ofMgJ

2.2 陽性克隆的篩選結果

目的基因PCR擴增產物回收后與pPICZα A載體連接轉化至EcoDH5α中,由于EcoRⅠ/XbaⅠ雙酶切線性化的pPICZα A不可能自身環化[11-12],因此Zeocin 抗性菌落應含有所需要的重組質粒pPICZα A-MgJ。

2.3 重組質粒的鑒定及測序

將獲得的重組質粒pPICZα A-MgJ用EcoRⅠ和XbaⅠ雙酶切,經瓊脂糖凝膠電泳檢測,在相應位置出現條帶,表明pPICZα A-MgJ構建成功,結果見圖5。測序表明,基因序列與預期相符。

圖5 pPICZα A-MgJ雙酶切的瓊脂糖凝膠電泳Fig.5 Agarose gel electrophoresis of pPICZα A-MgJ digestion

3 結論

抗菌肽必須具備兩親結構和正電荷,較多的正電荷與穩定的兩性α-螺旋結合,有助于提高殺菌活性。因此,可利用這一原則來設計新型的雜合抗菌肽[13]。本研究在MagaininⅡ和JaponicinⅡ之間用一段ser-ser-gly-ser-gly-ser的柔性連接肽序列將2個基因相連,以利于增強兩段序列的連接,而且還可防止連接的過程中兩條序列單獨表達互補配對形成二聚體。為了獲得抗菌肽MgJ的全長基因片段,本研究采用了重疊區擴增基因拼接法,用互有一段互補序列的8個引物,通過PCR擴增得到了具有EcoRⅠ/XbaⅠ雙酶切位點的全長基因。

本研究以pPICZα A作為表達載體。因為pPICZα A即可以在原核細胞中表達,也可在真核細胞中表達,同時其表達盒的N端帶有引導分泌的α交配因子(α-MF)信號序列,表達產物可以分泌到細胞外的培養基中[14-15]。由于酵母本身分泌到培養基中的蛋白很少,因此表達上清中的雜質蛋白含量很低,為進一步純化表達蛋白提供了極大的方便。

研究結果表明,成功地構建了抗菌肽MgJ基因穿梭表達載體pPICZα A-MgJ,為雜合抗菌肽MgJ的高效分泌表達奠定了基礎。

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