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光葉紫花苕種子貯藏蛋白分析

2013-05-09 11:13:38王清酈孫啟忠敖學(xué)成
草原與草坪 2013年4期

柳 茜,王清酈,傅 平,孫啟忠,敖學(xué)成

(1.四川省涼山州畜科所,四川 西昌 615042;2.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院研究生院,北京 100081;3.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院草原研究所,內(nèi)蒙古 呼和浩特 010010)

光葉紫花苕(Vicia villosavar.glabresens)為一年生草本植物,原產(chǎn)于美國俄勒岡州,20世紀40年代自美國引進南京,現(xiàn)廣泛種植于安徽、山東、河南、湖北、云南、四川、貴州等省[1]。光葉紫花苕適應(yīng)性廣,耐寒,耐旱,在田間、果園、山坡、生荒地上均可種植[2]。光葉紫花苕具有較高的飼用價值,粗蛋白含量在20%以上,氨基酸、礦物質(zhì)、維生素含量比較豐富,是牛、豬、雞的優(yōu)質(zhì)飼料[3-7]。此外,光葉紫花苕還是良好的綠肥和覆蓋作物,能改良土壤肥力,提高土壤固氮能力以及后續(xù)作物的產(chǎn)量和品質(zhì)[8,9],同時也是良好的蜜源植物[2]。涼山光葉紫花苕(Vicia villosavar.glabresenscv.Liangshan)是涼山州從云南引進的光葉紫花苕在長期推廣中選育出的地方品種,適應(yīng)性強,在海拔2 500~3 200m的地區(qū)都能種植[3],是高寒山區(qū)冬春季節(jié)的優(yōu)質(zhì)牧草。

種子貯藏蛋白是植物體中一類表達率高、能在種子內(nèi)大量積累且不易降解的蛋白質(zhì)[10]。貯藏蛋白可分為醇溶蛋白、谷蛋白、清蛋白和球蛋白等,這些蛋白質(zhì)的組成由遺傳決定,不受環(huán)境影響,其組分上的差異可以反映出基因型的不同,因而被稱為品種的生化“指紋”[11]。研究種子貯藏蛋白的方法有多種,其中蛋白質(zhì)電泳譜帶具有較高的多態(tài)性、專一性和穩(wěn)定性,在植物的遺傳生化標(biāo)記、品種鑒定、種群(居群)間的遺傳變異以及遺傳結(jié)構(gòu)的研究等方面得到廣泛應(yīng)用[12,13]。試驗采用十二烷基磺酸鈉聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDSPAGE)技術(shù)對涼山州境內(nèi)5個居群的光葉紫花苕的種子貯藏蛋白進行研究,從生化水平上探討涼山光葉紫花苕的遺傳多樣性,為涼山州種質(zhì)資源的研究和開發(fā)利用提供技術(shù)參考依據(jù)。

1 材料和方法

1.1 材料

試驗材料采自涼山州境內(nèi)的西昌、鹽源、普格、普格小興場和德昌5個地區(qū)光葉紫花苕的自然居群。每個居群隨機選取5個單株混合作為該居群的樣品。各居群的生態(tài)因子情況見表1。

1.2 試驗方法

參照文獻[14]SDS-PAGE垂直平板電泳方法,分別對各居群種子貯藏蛋白(清蛋白、谷蛋白、醇溶蛋白和鹽溶蛋白)及總貯藏蛋白進行電泳,并分析其多態(tài)性。

表1 光葉紫花苕居群的樣品來源Table 1 The Source of Vicia villosa Roth var.glabrescens cv.Liangshan samples

1.2.1 種子貯藏蛋白的提取 取10粒種子洗凈擦干,放入研缽中研碎,置于1.5mL離心管中,加入蛋白提取液[15-18]。

①清蛋白提取液:去離子水500μL。

②鹽溶蛋白提取液:加200μL脫脂劑(氯仿∶甲醇∶丙酮=2∶1∶1),振蕩混勻,脫脂2h(室溫),10 000 r/min離心10min,棄上清液后風(fēng)干,加入500μL鹽溶蛋白提取液(0.25mmol/L Na3PO4、2mol/L NaCl,pH =7.0)。

③醇溶蛋白提取液:75%乙醇溶液500μL。

④谷蛋白提取液:0.2%NaOH溶液500μL。

⑤貯藏蛋白提取液:5mL 10%SDS,1.5mL 2-ME,1.25g溴酚蘭,3.44mL 甘油,2.0mL 1mol/L Tris-Hcl pH 6.8,加雙蒸水定容到25mL;500μL。

室溫振蕩浸提2h,10 000r/min離心10min,取上清液置于4℃冰箱備用。以1∶1的比例加入上樣緩沖液,煮沸5min后點樣。

1.2.2 SDS-PAGE電泳 SDS-PAGE的濃縮膠濃度3%,分離膠濃度12%。各類貯藏蛋白及總的貯藏蛋白的上樣量10μL,標(biāo)準(zhǔn)蛋白D532S(分子量6.5~200 kDa),上樣量5μL,用北京六一電泳儀器廠DYZ-28B型電泳槽,濃縮時電壓恒壓200V,分離時電流恒流60 mA電泳,室溫下電泳7~8h至指示劑跑到距底部1cm處,電泳結(jié)束后剝下膠片,染色3~10h,脫色至條帶清晰為止,照相并進行統(tǒng)計[18]。

1.3 統(tǒng)計分析

SDS-PAGE中蛋白單體分子量的電泳遷移率主要取決于它的分子量,而與所帶電荷和形狀無關(guān),單體電泳遷移率與其蛋白單體分子量的關(guān)系為lgMW=lgK-bm=K1-bm。其中MW為蛋白單體分子量,m為蛋白單體遷移率,K,K1和b為常數(shù)。相對遷移率(Rf)=脫色后蛋白質(zhì)移動距離×染色前分離膠長/染色前指示劑移動距離×脫色后分離膠長。根據(jù)已知分子量的標(biāo)準(zhǔn)蛋白(Marker)在相同電流條件下的遷移率,作出分子量和遷移率的標(biāo)準(zhǔn)曲線,然后計算出待測蛋白單體的分子量。

根據(jù)電泳結(jié)果對清晰蛋白質(zhì)條帶的有無進行標(biāo)記,有為1,無為0,得出(0,1)矩陣。利用 Popgene 1.31軟件進行Nei’s遺傳距離(D)和遺傳一致度(I)分析。利用NTSYS-pc 2.1系統(tǒng)進行聚類分析[19]。

2 結(jié)果與分析

2.1 貯藏蛋白譜帶遺傳多樣性分析

利用SDS-PAGE對5個不同居群的光葉紫花苕種子貯藏蛋白進行電泳,獲得清晰穩(wěn)定的遺傳蛋白圖譜(圖1)。

圖1 5個不同居群光葉紫花苕的貯藏蛋白電泳圖譜Fig.1 Electrophoregrams of seed storage proteins of 5 populations of Vicia villosa var.glabrescens cv.Liangshan

5個居群之間的貯藏蛋白譜帶存在差異,共檢測到31條蛋白譜帶,其中,11條譜帶為共有帶,包括第3號、7號、8號、14 號、16 號、22 號 、25 號 、26 號、28 號、30號、31號;其余20條為不同程度表達的多態(tài)性譜帶,多態(tài)性數(shù)目占總條帶的65.52%。西昌居群有19條帶,鹽源居群有22條帶,普格小興場居群有20條帶,普格居群有17條帶,德昌居群有22條帶。普格小興場居群有1條特有帶,德昌居群有8條特有帶。譜帶分子量在11.09~100.09kDa,相對遷移率在0.16~0.84。根據(jù)譜帶相對遷移率由小到大(分子量由大到小),將種子貯藏蛋白圖譜分為α、β、γ、ω區(qū)域。其中α區(qū)相對遷移率為0.7~1.0,β區(qū)相對遷移率為0.3~0.7,γ區(qū)相對遷移率為0.1~0.3,ω區(qū)相對遷移率為0~0.1。貯藏蛋白只在α、β、γ區(qū)域有條帶出現(xiàn),其中α區(qū)有6條,β區(qū)有19條,γ區(qū)有6條,ω區(qū)無譜帶出現(xiàn),表明光葉紫花苕種子貯藏蛋白主要集中在β區(qū)。

表2 5個不同居群光葉紫花苕貯藏蛋白電泳各譜帶的遷移率和蛋白分子量Table 2 Frequency of bands and molecular weight of seed storage proteins of 5populations of Vicia villosa var.glabrescens cv.Liangshan

光葉紫花苕5個居群貯藏蛋白的Nei’s的遺傳距離和遺傳一致度見表3,西昌與鹽源居群、普格小興場與普格居群的遺傳距離最小,均為0.101 8,普格小興場與德昌居群遺傳距離最大,為0.869 0;普格小興場與德昌居群遺傳一致度最小,為0.419 4,西昌與鹽源居群、普格小興場與普格居群的遺傳一致度最大,為0.903 2。

5個居群的貯藏蛋白譜帶遺傳相似系數(shù)在0.13~0.90,平均達0.60,遺傳相似性較高,表明遺傳多樣性較低,遺傳基礎(chǔ)較窄。居群1與2、3與4譜帶相似系數(shù)最高,達到0.90,說明居群間親緣關(guān)系較近;居群5與1、2、3、4號居群的遺傳相似系數(shù)小,分別為0.21、0.27、0.13、0.34,表明居群間親緣關(guān)系較遠。從聚類分析結(jié)果可以看出(圖2),在遺傳相似系數(shù)為0.47時5個居群分為2大類,第1類為1、2、3、4號居群,5號居群單獨聚為1類。

表3 貯藏蛋白Nei’s遺傳一致度(右上角)和遺傳距離(左下角)Table 3 Nei's of genetic identity and genetic distance of seed storage proteins

圖2 5個居群光葉紫花苕的貯藏蛋白聚類圖Fig.2 Dendrogram based on Nei’s genetic distance of 5populations of Vicia villosa var.glabrescens cv.Liangshan

2.2 鹽溶蛋白譜帶遺傳多樣性分析

5份供試材料的鹽溶蛋白譜帶存在差異,共檢測出22條蛋白譜帶,其中13條譜帶為穩(wěn)定表達譜帶,表達率為100%;其余9條為不同程度的多態(tài)性譜帶,多態(tài)性數(shù)目占總條帶的40.92%(圖3)。5(德昌居群)有8號、14號兩條特有譜帶,1(西昌居群)有17號1條特有譜帶。其中α區(qū)有5條,β區(qū)有12條、γ區(qū)有5條,ω區(qū)無譜帶出現(xiàn),分子量大小13.50~95.04kDa(表4)。

5個不同居群光葉紫花苕鹽溶蛋白的Nei’s的遺傳距離和遺傳一致度見表5,2(鹽源居群)與4(普格居群)的遺傳距離為0最小,5(德昌居群)與2(鹽源居群)、4(普格居群)的遺傳距離最大,為0.452 0;5(德昌居群)與2(鹽源居群)、4(普格居群)的遺傳一致度最小(0.636 4),4(普格居群)與2(鹽源居群)的遺傳一致度最大(1.000 0)。

圖3 5個不同居群光葉紫花苕的鹽溶蛋白電泳圖譜Fig.3 Electrophoregrams of salt-soluble proteins of 5populations of Vicia villosa var.glabrescens cv.Liangshan

表4 5個不同居群光葉紫花苕鹽溶蛋白電泳各譜帶的遷移率(Rf)和蛋白分子量Table 4 Frequency of bands and molecular weight of salt-soluble proteins of 5populations of Vicia villosa var.glabrescens cv.Liangshan

表5 鹽溶蛋白Nei’s遺傳一致度(右上角)和遺傳距離(左下角)Table 5 Nei's of genetic identity and genetic distance of salt-soluble proteins

5個居群的鹽溶蛋白譜帶遺傳相似系數(shù)在0.55~1.00,平均達0.78,譜帶相似系數(shù)最高的是居群2與4,達到1.00,居群間親緣關(guān)系最近;居群5與2、4號居群的遺傳相似系數(shù)較低,為0.55,居群間親緣關(guān)系最遠。從聚類分析結(jié)果可以看出(圖4),在遺傳相似系數(shù)為0.66時5個居群分為2大類,第1大類又可分2個亞類,2、3、4號居群聚為1類,1號居群單獨為1類。5號居群單獨聚為第2大類。

2.3 清蛋白、谷蛋白和醇溶蛋白電泳結(jié)果

經(jīng)電泳染色脫色后,點樣孔加入醇蛋白的泳道無清晰譜帶出現(xiàn),點樣孔加入清蛋白、谷蛋白的泳道中出現(xiàn)幾條痕跡很淺的條帶,由于蛋白含量過少故對此不做過多討論。

圖4 5個不同居群光葉紫花苕的鹽溶蛋白聚類圖Fig.4 Dendrogram based on Nei’s genetic distance of 5 Vicia villosa var.glabresens cv.Liangshan

3 討論與結(jié)論

SDS-PAGE凝膠電泳的電泳速度與蛋白分子量大小有關(guān)而與電荷和形狀無關(guān)。因其具有電泳結(jié)果穩(wěn)定、不受貯藏年限和外界環(huán)境影響等優(yōu)點而得到廣泛應(yīng)用[20]。李擁軍等[20]利用SDS-PAGE方法對我國18個苜蓿地方品種和北美9個苜蓿基本種質(zhì)來源的代表品種及14份豆科牧草種(品種)種子貯藏蛋白進行了分析,結(jié)果表明貯藏蛋白譜帶差異較小;閆偉紅等[21]對引種栽培篩選出的5種12個冰草屬植物居群醇溶蛋白進行遺傳結(jié)構(gòu)分析,發(fā)現(xiàn)同一物種不同來源材料間遺傳差異較小。

對5個不同居群光葉紫花苕的蛋白電泳譜帶進行統(tǒng)計,不同提取液所獲得的蛋白譜帶各不相同。其中使用75%乙醇溶液提取的種子醇溶蛋白含量甚微或無,使用去離子水和0.2%NaOH溶液提取的種子清蛋白和谷蛋白只出現(xiàn)幾條痕跡很淺的條帶。利用鹽溶蛋白和貯藏蛋白提取液所得的總蛋白譜帶的分子量介于11.09~100.09kDa,相對遷移率在0.17~0.90。鹽溶蛋白的蛋白譜帶總數(shù)為22條,多態(tài)率為40.92%;貯藏蛋白的為31條,多態(tài)率為65.52%,說明5個居群的鹽溶蛋白的條帶位點少于貯藏蛋白,種內(nèi)變異小于貯藏蛋白。聚類結(jié)果表明,利用鹽溶蛋白和貯藏蛋白獲得的蛋白質(zhì)圖譜能區(qū)分鑒別5個不同居群的光葉紫花苕。供試材料分為2類:1)西昌、鹽源、普格小興場、普格居群;2)德昌居群。表明同一物種不同生態(tài)居群的遺傳差異較小,與閆偉紅研究結(jié)果相似[21]。涼山光葉紫花苕具有較高的遺傳保守性,在不同生態(tài)區(qū)都能保持較穩(wěn)定的遺傳性,這可能與光葉紫花苕為自花授粉植物有關(guān)。德昌居群種子千粒質(zhì)量比其他居群小,但植物學(xué)特性表現(xiàn)一致,是否是光葉紫花苕新類型,還需要結(jié)合其他手段做進一步的研究證明。

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