混合測序技術(shù)在高通量測序中的應(yīng)用

李成

混合測序技術(shù)在高通量測序中的應(yīng)用

李成

介紹了高通量測序在面向大樣本時(shí)所面臨的問題，分析了高通量測序技術(shù)的原理和特點(diǎn)及其在解決大樣本測序時(shí)的技術(shù)優(yōu)勢，并總結(jié)了檢測矩陣的構(gòu)建方法，指出了混合測序能夠應(yīng)用于部分高通量測序?qū)嶒?yàn)并可大幅節(jié)約測序成本，展望了混合測序技術(shù)在高通量測序中的應(yīng)用前景。

樣本混合；高通量測序；群試；分離矩陣

0 引言

隨著高通量測序技術(shù)的不斷發(fā)展和測序成本的不斷降低，利用高通量測序技術(shù)進(jìn)行醫(yī)學(xué)診斷具有較好的前景。同時(shí)，眾多醫(yī)學(xué)研究表明，許多疾病與某些稀有變異基因密切相關(guān)，針對(duì)某些已知稀有變異基因的檢測能夠預(yù)判或診斷出與之密切相關(guān)的疾病。在新一代測序技術(shù)應(yīng)用于這些稀有變異基因檢測的過程中，有2個(gè)方面是應(yīng)用中亟待解決的問題：

（1）新一代測序技術(shù)帶給人們大量遺傳信息的同時(shí)，卻成為限制其廣泛應(yīng)用的一個(gè)障礙。新一代測序儀的一個(gè)測序流程能夠產(chǎn)生巨量的片段信息，如ABI公司的新一代測序平臺(tái)SOLID單次運(yùn)行，便可分析6 GB的堿基序列；Illumina Genome Analyzer測序系統(tǒng)僅在2 h的運(yùn)行時(shí)間里就可得到10 TB的信息[1]，這些巨量信息僅僅用來提高某些固定堿基位點(diǎn)的測序覆蓋度，無疑是極為浪費(fèi)的。（2）在針對(duì)此類稀有變異疾病進(jìn)行大量人群篩查時(shí)，一個(gè)測序通道只針對(duì)一個(gè)個(gè)體樣本，而如今二代測序儀最多只有8個(gè)通道，因此一次測序流程只能測8個(gè)個(gè)體樣本，在針對(duì)大量人群稀有變異篩查的醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)中。……