美國隊長的故事：內戰篇

《英雄內戰》事件發生。美國政府通過了一項法令，要求所有的超能力者必須登記注冊，引起英雄們極大不滿。英雄們分裂為以鋼鐵俠為首的支持法令的一派，和以美國隊長為首的反對派。兩派爆發內戰，新復仇者們也由于成員們各自的立場不同而分崩離析。瑪麗亞·希爾帶領神盾局追捕斯蒂夫。

神盾局很多成員都要定期看心理醫生檢查心理狀況，不料這心理醫生卻是反派浮士德博士所假扮，他懂得很厲害的催眠術，和盧金合謀操控了莎倫。巴基受尼克·弗瑞之命潛入神盾局的基地，控制住一個機械人，查出盧金的行蹤，發現他曾往拉脫維亞尋找毀滅博士，毀滅博士給了他一件儀器作交易，盧金亦和佐拉聯手對付斯蒂夫。

盡管內戰中美國隊長一方漸漸占了上風，但當他目睹內戰造成的破壞，意識到這樣的戰斗恰恰證明了對方的觀點——英雄們帶給人們的是損害時，他停止了抵抗，選擇了投降。斯蒂夫隨即遭到逮捕，被帶往法院受審。他在法院門前被狙擊槍射中肩膊，隨后在混亂中，再次被用手槍擊中。巴基和獵鷹立即追擊第一個槍手，發現那人就是交叉骨，將他擒下。在醫院內，原罪假扮成護士向莎倫說了一句催眠的密碼，令莎倫記起一切，原來近距離槍殺斯蒂夫的人，就是被催眠的莎倫。

斯蒂夫死后，他的身體變得非常瘦弱，可能是因為他體內的超級士兵藥物出現反效果所致。莎倫向神盾局辭職，曾因此事想過自殺卻下不了手，獵鷹來找她，要她一起去找尋巴基。

斯蒂夫臨死時留下遺囑給鋼鐵俠，即希望巴基成為下任的美國隊長。于是鋼鐵俠派出黑寡婦去找巴基。巴基為拿回斯蒂夫的盾，和黑寡婦大打出手。他打暈黑寡婦并拿走了盾。原罪闖入了神盾局救出了交叉骨，也因為這樣，鋼鐵俠知道了有些神盾局的成員被人催眠而變節，他重看當日斯蒂夫被殺的錄影，想到莎倫有可能也被人催眠而槍殺斯蒂夫。

巴基想對付盧金，卻反被他擒住。另一方面莎倫發現自己有了身孕，同時她仍然處于半催眠狀態，打暈獵鷹及黑寡婦回到盧金的基地。浮士德博士嘗試催眠巴基但不成功，然后獵鷹及黑寡婦來襲，逃走時莎倫把巴基拋出飛機外，被獵鷹接住。巴基被帶到天空母艦上，他認為斯蒂夫的死歸罪于鋼鐵俠，出手攻擊他，鋼鐵俠讓巴基看了斯蒂夫的遺囑。巴基繼承斯蒂夫的遺愿，成為新的美國隊長。

盧金利用被催眠的神盾局特工搗亂，同時又命原罪及交叉骨刺殺參議員戈登·懷特，都被新任美國隊長巴基阻止，隨后懷特宣布參加競選下任總統。

莎倫在紅骷髏的基地發現了斯蒂夫，不過這其實是整容后的第四任美國隊長 威廉姆·伯恩賽德。他落到紅骷髏手上，浮士德博士將他催眠，令他以為自己才是真正的斯蒂夫 ，并在電視上亮相再次救回參議員懷特，聲望大增。新美國隊長巴基和假美國隊長大戰。莎倫嘗試逃走，卻被原罪插了一刀而流產。

盧金讓佐拉繼續研究毀滅博士的儀器，并希望把他和紅骷髏的思想分開。浮士德博士則暗地里離開他們，臨走前留下GPS儀器讓神盾局能找到這里，而他也一直在幫助參議員懷特，所以其實懷特競選總統是盧金的陰謀。黑寡婦攻入基地，巴基則去救參議員，并擋住了飛彈，群眾和記者都認同他為美國隊長。佐拉把將莎倫鎖在毀滅博士的儀器上，但開動儀器前莎倫脫困了，莎倫射殺了盧金，假美國隊長亦出現刺死了佐拉。神盾局發現了參議員懷特和紅骷髏之間的關系，懷特被逼宣布辭職。

莎倫記起了自己曾有身孕及流產的事，她同時記起了佐拉曾將她鎖在一個儀器前，她隱約看到光芒中有一個熟悉的人影。

在第六百期有不同的作者及畫家編寫多個故事，有些是記念斯蒂夫的，有一個則講述斯蒂夫逝世一周年（漫畫內的時間），莎倫回到了事發現場，她記起被催眠時曾把手槍交給另一人，于是去舊址尋找這人和手槍，發現那并不是一柄普通的手槍。新復仇者眾人來到一周年記念現場，莎倫突然出現并說斯蒂夫還未死。