
在英雄內戰事件中,臨近勝利時美國隊長發現自己的戰斗對人民造成的傷害而選擇投降后被送進監獄。內戰結束后,美國隊長在前往紐約市的聯邦法院準備接受審問時,被自己的宿敵紅骷髏設計殺害,享年89歲。其位置由隊長過去的副手巴基接替。(注:曾經一度流行隊長僅僅是假死、癱瘓的說法。然而這一說法并不為大眾所認同,因為不僅在漫威官網或其它任何即時更新的大型資料站上都無法找到驗證,甚至此段情節的漫畫原出處也無跡可尋。因此暫時可以認為,該說法的流行,源于隊長迷對于偶像的留戀。)
但也許是粉絲的熱情感動了漫畫公司。在2009年7月,驚奇漫畫推出了《美國隊長:重生》。新作講述美國隊長并沒有死——擊中他的槍將他傳送去了時空中一個固定地點。紅骷髏想利用隊長的女友莎倫·卡特和毀滅博士所制造的機器將美國隊長弄回來,但莎倫破壞了那個機器,美國隊長便不得不逐個度過他人生中的各個事件,如諾曼底登陸日、他母親的逝世、與巴基一起在二戰的歐陸戰場上……他把整個二戰又重新打了一遍。在重新度過克里與斯克魯爾戰爭時,他終于有機會通過幻視把關于自己處境的信息發送給了未來的神奇先生和黃衫俠,憑借數據資料,神奇先生得知了莎倫即是把美國隊長帶回現代的關鍵所在。不過已經為時過晚,紅骷髏已經控制、占有了美國隊長的身體……當然,最后還是正義大獲全勝,隊長帶著身體和靈魂回來了。
回來后的斯蒂芬·史提夫放棄了“美國隊長”的稱號,讓巴基繼續為新美國隊長。之后史提夫接受了美國總統的最高警察位置,但條件是要廢除英雄注冊法。他亦曾領導一隊名叫秘密復仇者的團隊。而2012年漫畫《恐怖之源》中,巴基被殺。史提夫知道美國需要他,所以決定再擔任“美國隊長”。