安蓬蓬,湯 華,郭軍飛
(1.天津市血液中心質管科,天津300110;2.天津醫科大學天津市生命科學中心實驗室,天津300070)
論著
血漿miRNA-372/373在正常獻血者和HBV早期感染獻血者中的表達差異
安蓬蓬1,湯 華2,郭軍飛2
(1.天津市血液中心質管科,天津300110;2.天津醫科大學天津市生命科學中心實驗室,天津300070)
目的:研究miRNA-372/373與HBV早期感染的相關性,分析其在HBV早期感染診斷中的潛在應用價值。方法:收集來源于2013年3月至9月天津市內無償獻血者所獻血液的血漿標本留樣,共54份,分為正常組、酶免單陽組(E單陽組)和酶免核酸雙陽組(EN雙陽組)。提取此3組共54份血漿標本中的miRNA-372和miRNA-373,用實時熒光定量PCR方法進行檢測。分別比較miRNA-372和miRNA-373在3組血漿標本之間的表達差異,并對各組間的miRNA表達趨勢進行統計學分析;同時,對miRNA-372、miRNA-373的相對表達水平分別與核酸檢測HBV核酸陽性血漿標本中的HBV DNA拷貝數進行相關性分析。結果:經實時熒光定量PCR檢測,與正常獻血者相比,miRNA-372、miRNA-373在E單陽組和EN雙陽組中均表達上調,其中,miRNA-372、miRNA-373在EN雙陽組中表達上調更為顯著。進一步分析發現,在EN雙陽組中,miRNA-372、miRNA-373均與相應的HBV DNA拷貝數呈正相關性,且與miRNA-372相比,miRNA-373與相應的HBV DNA拷貝數的正相關性更為明顯。結論:miRNA-372、miRNA-373與HBV早期感染密切相關,提示miRNA-372、miRNA-373在HBV感染的早期診斷中具有潛在價值。
微小RNA;miRNA-372;miRNA-373;HBV早期感染
在我國,乙肝病毒是威脅血液安全的主要因素。目前,采供血機構多同時采用ELISA檢測和核酸檢測(NAT)兩種方法對血液進行HBV檢測。雖然NAT檢測大大縮短了HBV的檢測“窗口期”,很大程度上降低了經血傳播疾病發生的風險,但NAT檢測的準確性還是會受到病毒含量、病毒變異等因素的影響。1993年,Lee等[1]發現了第一個miRNA(lin-4),它是一類長度在21~25 nt的內源性非編碼單鏈小分子RNA。2008年,Lawrie首次在人類血清中發現miRNA,由于miRNA可以廣泛而穩定地存在于人類細胞外液,一直以來,科學家都致力于其在非侵襲性臨床疾病診斷中的應用。miRNA-373與miRNA-371a、miRNA-371b及miRNA-372同屬于miRNA-371-373簇[2],它們源自相同的初級miRNA的轉錄[3],對HBV感染來說,有研究表明miRNA-372/373可以增加HBV蛋白及核心DNA的表達[4]。目前相關研究都是集中在細胞、組織中的miRNA-372/373上,關于循環中、血漿中miRNA-372/373的研究甚少,本研究通過檢測HBV感染早期的無償獻血者血漿中和正常獻血者血漿中的miRNA(miRNA-372/373)表達差異,進而分析這兩種miRNA與HBV早期感染的相關性。
1.1 研究對象 血漿標本來源于2013年3月-9月天津市內無償獻血者所獻血液的標本留樣,共54份,每份血漿標本量為5 mL,54位無償獻血者均符合《獻血者健康檢查要求》,年齡18~55歲,為隨機抽取。
1.2 試劑與儀器 miRcute miRNA提取試劑盒(北京 TIANGEN),CyDyeTM熒光染料(Amersham Biosciences CyDye),rTaq PCR試劑盒、dNTP(10 mmol/L)、堿性磷酸酶、SYBR Premix EX Taq定量PCR試劑盒(日本TaKaRa),焦碳酸二乙酯DEPC(北京鼎國),RNA酶抑制劑、T4 RNA連接酶、T4多核苷酸激酶、Taq DNA聚合酶(深圳Fermentas),MMLV反轉錄酶(美國Promega),40%PAGE(丙烯酰胺單體:N’N’亞甲雙丙烯酰胺=19:1)(Genview美國),RNase-free水,氯仿,異丙醇,75%乙醇(RNasefree水配制),20×SSC,10×PBS,3 mmol/L氯化鈉,0.3 mmol/L檸檬酸鈉,10%SDS,5 mmol/L醋酸銨,0.5 mmol/L EDTA,1 mmol/L Tris-HCl(pH7.5)。所有試劑均在有效期內。Version3.0.0.0016(美國PerkinElmer),超凈工作臺(BCM-8)(蘇州凈化設備公司),iQ5定量PCR檢測儀(美國Bio-Rad),紫外分光光度計(美國Bio-tek),臺式離心機(德國Eppendorf),miniCyclerTMPCR儀(美國MJ Reasearch)。
1.3 方法
1.3.1 分組方法 所抽取的無償獻血者血漿標本均經過ELISA檢測及核酸檢測,分別為第1組(正常組):ELISA檢測HBsAg及核酸檢測HBV核酸均為陰性的正常的血漿標本18份;第2組(E單陽組):僅ELISA檢測HBsAg陽性而核酸檢測HBV核酸陰性的血漿標本18份;第3組(EN雙陽組):ELISA檢測HBsAg及核酸檢測HBV核酸均陽性的血漿標本18份。其中,以上3種血漿標本的其他血液中心常規檢測項目均為陰性,ALT水平正常。追查后兩組36份血漿標本的相應獻血者,均為無明顯癥狀的輕度早期感染者。ELISA檢測由Star全自動加樣儀、FAMI24/30全自動酶免分析儀、anthos 340r酶標儀共同完成;ALT檢測由TBA-120 FR全自動生化儀完成;核酸檢測由Procleix?TRGRIS?核酸檢測分析系統和羅氏cobas s201核酸檢測系統檢測并提供數據。
1.3.2 制備方法 (1)血漿miRNA提取:采用miRcute miRNA提取試劑盒(離心柱型)(北京TIANGEN公司)提取miRNA。(2)miRNA鑒定:采用紫外分光光度法測定miRNA在260 nm和280 nm的吸光度,計算miRNA含量(260 nm的OD=1相當于miRNA含量33 μg/mL),判斷提取的miRNA質量(miRNA OD260/OD280應在1.8至2.1之間,OD260/ OD230應大于2.0)。
1.3.3 實時熒光定量PCR方法 miRNA的定量分析采用基于莖-環引物的實時定量PCR方法[5]。
1.3.3.1 RT制備cDNA:RT引物序列見表1。應用hsa-miRNA-16作為內參照。配制反應體系,總體積為13 μL,其中含小片段RNA 2 μL;miRNA-372,miRNA-373,miRNA-16 1 μL;DEPC水10 μL。65℃變性10min,25℃5min,水浴2~5min。補加以下試劑,總體積為20 μL,其中含5×first stand buffer 4 μL;dNTPs(10 mmol/L)1 μL;RNA酶抑制劑(40 U/μL)1 μL;M-MLV(200 U/μL)1 μL。42℃延伸30 min。70℃滅活10 min。產物保存于-20℃。
1.3.3.2 實時定量PCR確定miRNA-372、miRNA-373的相對表達水平:引物序列見表1。反應體系總體積為20 μL。其中含2×SYBR Premix Ex Taq 10 μL;PCR Forward Primer(5 pmol/μL)1 μL;PCR Reverse Primer(5 pmol/μL)1 μL;模板(RT產物cDNA)2 μL;DDW6μL。循環體系為:95℃預變性3min;95℃30s,56℃30 s,72℃30 s,40個循環。收集結果,按照以下方法進行數據分析。目的miRNA的定量采用相對法,將2-ΔCt作為目的miRNA在樣品中的相對含量,其中ΔCt=CtmiRNA-CtmiRNA-16。
1.4 統計學分析 所有計量資料按照均數±標準差的方法進行統計。兩組間的比較應用兩獨立樣本t檢驗。3組及以上間的比較應用單因素方差分析(one-way analysis of variance,ANOVA),組間的進一步兩兩比較應用SNK-q檢驗。兩組變量的相關性分析應用Pearson相關系數法。檢驗統計量P<0.05時具有統計學差異。

表1 RT引物信息表Tab 1 The information table of RT primers
2.1 miRNA-372在3組無償獻血者血漿中的相對表達水平差異 相比較于正常組,miRNA-372在E單陽組、EN雙陽組無償獻血者血漿中的相對表達水平均明顯上調;其中,miRNA-372在EN雙陽組中的相對表達水平比在E單陽組上調更為明顯(圖1)。

圖1 miRNA-372在3組無償獻血者血漿中的相對表達水平差異Fig 1 The differential expressions of miRNA-372 in the plasma of the three groups
2.2 miRNA-373在3組無償獻血者血漿中的相對表達水平差異 相比較于正常組,miRNA-373在E單陽組、EN雙陽組無償獻血者血漿中的相對表達水平均明顯上調;其中,miRNA-373在EN雙陽組中的相對表達水平比在E單陽組上調更為明顯(圖2)。

圖2 miRNA-373在3組無償獻血者血漿中的相對表達水平差異Fig 2 The differential expressions of miRNA-373 in the plasma of the three groups
2.3 miRNA-372在EN雙陽組與相應的HBV DNA拷貝數的相關性 miRNA-372的相對表達水平隨HBV DNA的拷貝數增加而增加,與相應的HBV DNA拷貝數呈正相關性(圖3)。

圖3 miRNA-372與HBV DNA拷貝數的相關性Fig 3 The correlation between the miRNA-372 and the copy number of HBV DNA

圖4 miRNA-373與HBV DNA拷貝數的相關性Fig 4 The correlation between the miRNA-373 and the copy number of HBV DNA
3.1 近年來,miRNA-371-373簇的調節功能引起了人們的關注,但其作用機制還有待深入研究,相關工作還有待繼續開展。曾洋等[6]報道,miR-373參與調控Flk1+MSC向骨細胞分化;武衛華等[7]也證實,人工構建的has-miRNA-373載體經轉染后可增加腫瘤細胞中E-鈣黏蛋白的表達量;同時,劉琳等[8]的研究發現,miRNA-373在宮頸癌組織和Hela細胞中低表達,又起到了抑癌基因的作用。在HBV感染的肝臟組織和HepG2.2.15細胞中,miRNA-373和miRNA-371-373簇的表達均顯著上調[4]。人們通過研究發現,在1.3×HBV轉染的HepG2細胞中,miRNA-373和miRNA-371-373簇的高表達可以通過靶向核因子I/B,刺激HBV蛋白和HBV核心DNA的產生,從而促進HBV的復制。由于miRNA是在細胞中產生的,而循環miRNA來自于凋亡或壞死的細胞、細胞的主動釋放以及循環細胞的裂解,本研究應用實時熒光定量PCR方法檢測miRNA-372/ 373在各組無償獻血者血漿中的相對表達水平,發現相比較于正常組,miRNA-372/373在E單陽組、EN雙陽組無償獻血者血漿中的相對表達水平均明顯上調(圖1~2),由此看出,HBV感染者血漿中的miRNA-372/373與 HBV感染的肝臟組織和HepG2.2.15細胞中的miRNA-372/373表現是一致的。這一結果提示血漿中的miRNA-372/373與HBV感染密切相關。
另外,miRNA-372/373在EN雙陽組的相對表達水平比在E單陽組上調更為明顯。這是由于相對于E單陽組,EN雙陽組獻血者體內有較活躍的病毒復制且拷貝數較高,這一結果初步表明了血漿miRNA-372/373的相對表達水平不僅與HBV的感染相關而且與HBV的復制及活動性相關。
3.2 將EN雙陽組中的miRNA-372/373相對表達水平與HBV DNA拷貝數做相關性分析(圖3~4),miRNA-372/373的相對表達水平與HBV DNA拷貝數呈正相關關系。在組織和細胞中,miRNA-373和miRNA-371-373簇的表達水平與HBV DNA拷貝數呈正相關,miRNA-373和miRNA-371-373簇的高表達可以刺激HBV蛋白和HBV核心DNA的產生,從而促進HBV的復制[4]。因此我們推測,在血漿中,miRNA-373和miRNA-371-373簇也產生同樣的作用,miRNA-372/373相對表達水平的高低可以反應此時的HBV復制情況。同時,miRNA-373的相對表達水平與HBV DNA拷貝數的正相關性更為明顯。
綜上所述,miRNA-372、miRNA-373的相對表達水平與HBV早期感染密切相關,有望為HBV早期感染的診斷和治療提供新的依據和方法。當然,對于臨床研究來說,本試驗中的血漿樣品數量偏少,只有54份,因此本研究得出的結論有一定的局限性,僅供參考,相關研究還有待進一步深入探討。
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(2015-04-23收稿)
Differential expression of miRNA-372/373 in plasma between the normal donors and the HBV donors at early stage
AN Peng-peng1,TANG Hua2,GUO Jun-fei2
(1.Department of Quality Control,Tianjin Blood Center,Tianjin 300110,China;2.Tianjin Life Science Research Center,Tianjin Medical University,Tianjin 300070,China)
Objective:To explore the relationship between the miRNA-372/373 levels in plasma and the early-stage infection of HBV,to uncover the potential of miRNA-372/373 in the diagnosis of the early-stage infection of HBV.Methods:Blood samples for miRNA detecting were collected from 54 donors who donated blood from 2013.3 to 2013.9 in Tianjin.All the samples were divided into 3 groups:eighteen samples were Normal;18 samples were ELISA testing(+)and NAT(-)(HBV-S);the last 18 samples were ELISA testing(+)and NAT(+)(HBV-D).Quantization of miRNA-372 and miRNA-373 in all the 54 plasma samples were performed using quantitative RT-PCR. At last,compared thederegulated miRNA(miRNA-372/-373)in the plasma of the three groups respectively,and the expression patterns of miRNA-372 and miRNA-373 were analyzed using statistical methods;the correlation between the expression level of miRNA-372/-373 and the copy number of HBV DNA in NAT(+)plasma was statistically analyzed.Results:Compared with the Normal,miRNA-372 and miRNA-373 in both HBV-S and HBV-D were up-regulated.Furthermore,both miRNA-372 and miRNA-373 were up-regulated more significantly in HBV-D than in HBV-S.Moreover,the levels of both miRNA-372 and miRNA-373 were positively correlated with the copy number of HBV DNA in HBV-D.Compared with miRNA-372,miRNA-373’s positive correlation with the copy number of HBV DNA was significantly higher.Conclusion:The correlation between miRNA-372/373 in plasma and the early-stage infection of HBV is high, indicating their potential values in the early-stage diagnosis of HBV infection.
microRNA;miRNA-372;miRNA-373;the early-stage infection of HBV
R457.1
A
1006-8147(2015)06-0503-04
安蓬蓬(1979-),女,主治醫師,碩士在讀,研究方向:輸血;通信作者:湯華,E-mail:htang2002@yahoo.com。