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DNA數據庫親緣關系比對2例分析

2015-05-04 06:02:32劉亞舉
食管疾病 2015年1期
關鍵詞:案例數據庫

劉亞舉,張 博

DNA數據庫親緣關系比對2例分析

Analysis of Two Kinship Testing Cases of DNA Database

劉亞舉1,張 博2

法醫遺傳學;DNA數據庫;親緣關系

DNA數據庫經過數年的建設發展,庫容規模數量日益增加。由于建設初期受一些因素制約,致使入庫STR基因座及其數量種類繁多,尤其是STR基因座數量一般維持在16個以下,隨著DNA數據庫庫容的不斷遞增,就會給隨機親緣關系的匹配帶來一定的風險。作者在兩起失蹤人員認定案例中遇到此類問題,報道如下。

1 案例資料

1.1 簡要案情 案例1:1995年2月6日,邵某(男)與人發生口角械斗,殺人后潛逃。案例2:1997年12月15日,李某(男)在本村殺人、砍人后逃跑。啟動案件偵破新機制后,遂即采集其“配偶—子女”樣本,用Identifiler?Plus PCR擴增試劑盒(美國AB公司)檢驗后錄入全國DNA數據庫。1周后,該系統的15個基因座無容差比中數條數據,其中案例1分別比中外省庫的1個陌生男和1個陌生女,案例2比中本省庫的1個陌生男和外省庫的1個陌生男(見表1)。

1.2 復核檢驗及結果 收集上述樣本,使用sbeadex?法醫試劑盒(英國LGC公司)提取基因組DNA,采用STRtyper-21G試劑盒(寧波海爾施基因科技有限公司)進行STR檢驗,發現兩個案例所比中的親緣關系分別在Penta E、Penta D、D12S391、D6S1043、D1S1656等5個基因座不符合遺傳規律(見表2)。同時增加Yfiler?Plus試劑盒(美國AB公司)進行Y染色體檢驗,其中案例1陌生女未檢出STR分型,其余均與孩子不符合遺傳規律。

表1 Identifiler? Plus試劑盒STR分型結果

注:左側為案例1,右側為案例2。

表2 STRtyper-21G試劑盒5個基因座的STR分型結果

注:左側為案例1,右側為案例2。

2 討論

本文案例所涉及的親緣關系,根據Identifiler?Plus系統15個基因座得到的累計親權指數遠遠大于10 000,按《法庭科學DNA親子鑒定規范》(GA/T965-2011)中有關規定,是支持親權關系的存在,但STRtyper-21G和Yfiler?Plus系統檢驗結果卻否定了上述結論。案例1中,符合遺傳關系的比對對象顯示為女性,懷疑是男性系Y片段缺失[1],但后續的檢驗證明應為錯判,由于Amelogenin基因座的Y片段位于Y染色體短臂區,為避免此類現象的出現,建議PCR擴增系統增加長臂區的DYS391(最小單倍型)或Y-indel(缺失/插入)。

隨著歐洲標準(ESS)的推廣,美國FBI對CODIS基因座重新進行了評估升級,并最終確立了含20個STR基因座的擴展核心基因座。而國內DNA數據庫庫容也迅猛增加,原有的15個基因座已不能滿足親緣關系比對需要[2],如案例1、2,為了防范此類案件的風險,既要與國際接軌,又要適合中國人群的STR檢測體系,同時節約檢驗成本,可以通過以下措施來進行:①檢驗體系應包含20個以上的常染色體基因座,在傳承原CODIS基因座的基礎上,增加非父排除率較高的基因座[3],最好有Penta D和Penta E[4],以此提高系統效能,且基因座的等位基因分布符合中國人群特點。②可以采用6色熒光標記技術,根據SNP和InDel二等位基因標記具有分布廣泛、遺傳穩定、突變率低、易于分析等優點,再增加5~7個SNP或InDel基因座到上述系統作為補充檢驗,以此來滿足突變的結果解釋[5],同時SNP或InDel最小等位基因頻率要接近于0.5。③增加線粒體、X-STR、Y-STR輔助檢驗[6-7],解決復雜親緣關系鑒定。

總之,隨著DNA檢驗技術的精確化,為使疑難生物檢材達到高效、全方位檢驗和分析,避免后續復核工作無法延續,以利于親緣關系比對等拓展功能的應用,因此DNA實驗室PCR擴增試劑要多樣化,且快速方便各種檢驗數據的入庫查詢,最終大量的DNA檢驗信息使生物物證的作用最大化,滿足各種DNA信息的傳承和利用。

[1] 劉亞舉,張俊濤,徐超,等.男性個體Amelogenin基因座變異1例[J].中國法醫學雜志,2012,27(6):508-509.

[2] 張慶霞,劉雅誠.DNA數據庫中失蹤人員親屬“錯中”信息的分析研究[A].DNA數據庫建設應用成果與展望Ⅱ[C].北京:中國人民公安大學出版社,2011:169-171.

[3] 伍新堯,楊慶恩,劉雅誠,等.親權鑒定判斷標準和結論表述的建立[J].中山大學學報:醫學科學版,2010,31(1):20-22.

[4] 伍新堯.高級法醫學[M].2版.鄭州:鄭州大學出版社,2011:426-427.

[5] 任賀,郭劍章,陳星,等.3個STR基因座變異親子鑒定1例[J].法醫學雜志,2010,26(6):479-480.

[6] 劉亞舉,張俊濤,李瑾,等.X-STR聯合常染色體STR用于親緣關系鑒定1例[J].中國司法鑒定,2014,76:123-124.

[7] 劉亞舉,張俊濤.Y-STR家系排查2例[J].法醫學雜志,2014,30(6):476-477.

2014-12-12

1.許昌市公安局刑事科學技術研究所,河南許昌 461000 2.禹州市公安局刑偵大隊,河南禹州 461670

劉亞舉(1978-),男,河南襄城人,副主任法醫師,從事DNA檢驗及法醫遺傳學統計工作。

DF795.2

B

1672-688X(2015)01-0070-03

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