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采用X射線衍射解析人鳥嘌呤核苷酸解離刺激因子RalGDSRas結合結構域的空間結構

2015-06-18 10:45:18黃雪英雷明沈陽張巍劉艷麗劉珂趙浩斌祁超
分析化學 2015年6期

黃雪英 雷明 沈陽 張巍 劉艷麗 劉珂 趙浩斌 祁超

摘 要 Ras結合結構域(RBD)是鳥嘌呤核苷酸解離刺激因子(RalGDS)家族成員C端的高保守區,通過它連接Ras和Ras相關蛋白。利用Red Wings和SGC1 screens相關的懸滴法設盤結晶,按體積比1∶1加蛋白液到含1∶100胞內蛋白酶GluC(w/w)的結晶溶液(2 mol/L (NH4)2SO4, 0.2 mol/L NaAc, 0.1 mol/L HEPES, 5% MPD, pH 7.5)中,晶體3天長成可組裝大小。利用X射線晶體衍射技術解析了人RalGDS的Ras結合域(RalGDSRBD)的晶體結構,對比鼠和人RalGDSRBD,主要是Ras結合區的C端不同。人RalGDSRBD通過Glu838和Glu840在RalGDS和Ras蛋白間形成氫鍵, 而在同一位點,鼠RalGDSRBD通過Asp820和Asp822形成氫鍵。人RalGDSRBD結構中含ββαββαβ型三維結構的泛素樣構象, 一個單體的C端殘基與相鄰單體的β折疊形成平行βββββ結構。

關鍵詞 鳥嘌呤核苷酸解離刺激因子(RalGDS); Ras結合結構域(RBD); Ras蛋白endprint

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