張君莉,黃永秀,張 紅,王 丹,劉 騰,李 亞△,王建東△
1.成都醫(yī)學院 生物醫(yī)學系(成都 610500);2.成都醫(yī)學院 檢驗醫(yī)學院(成都 610500);3.成都醫(yī)學院第一附屬醫(yī)院 檢驗科(成都 610500)
線粒體是細胞能量供應的重要細胞器,能通過三羧酸循環(huán)和氧化磷酸化進行能量轉(zhuǎn)換[1]。線粒體健康與否決定了細胞的生存和死亡[2-4]。大量證據(jù)顯示,許多疾病都有一個共同的特征:功能障礙的線粒體大量堆積,包括心臟疾病[5]、阿爾茲海默癥[6]、帕金森疾?。?]、腫瘤[8]和糖尿病等[9]。Nix是近年來發(fā)現(xiàn)定位于線粒體外膜的一類功能蛋白,在調(diào)節(jié)細胞自噬和線粒體自噬的過程中發(fā)揮著重要作用[10-11]。本研究旨在構(gòu)建Nix基因過表達與shRNA慢病毒載體,為進一步深入探索Nix參與細胞自噬的分子機制奠定更好的基礎。
PC12細胞購自中國科學院典型培養(yǎng)物保藏委員會細胞庫。pcDNA3.1(+)-N2-FLAG-Nix質(zhì)粒由四川大學華西第二醫(yī)院姜長安教授惠贈。DMEM完全培養(yǎng)基購自HyClone公司。胎牛血清購自以色列BioInd公司。BCA蛋白定量試劑盒購自碧云天生物科技研究所??贵wanti-Nix購自Cell Signaling Technology 公 司。anti-β-actin 購 自Novus Biologicals公司。辣根過氧化物酶(HRP)標記的羊抗兔或鼠二抗購自CST公司。羊抗兔Alexa Fluor 488購自碧云天公司。PVDF膜和ECL化學發(fā)光試劑購自Millipore公司。嘌呤酶素(puromycin)購自北京索萊寶科技有限公司。Nix過表達、Nix shRNA慢病毒和對照慢病毒由上海漢恒生物科技有限公司提供。
1.2.1 Nix慢病毒表達載體的構(gòu)建 根據(jù)GenBank提供的大鼠Nix基因全長信息,設計PCR擴增引物,以pcDNA3.1(+)-N2-FLAG-Nix質(zhì)粒為模板進行PCR擴增。Nix基因序列信息:AT GTCTCACTTAGTCGAGCCGCCGCCGCCCCTGC ACAACAACAACAACAACTGCGAGGAAG G G G AGCAGTCCCTGCCGCCGCCCGCTGGCCTCAAC AGTTCCTGGGTGGAGCTACCCATGAAC A GCA GCAATGGCAACGGTAATGGAAATGGGAAGA ATGGGGGCCTGGAGCACGTTCCTTCCTCGT C TTCCATCCACAATGGAGACATGGAGAA G AT CCTTCTGGATGCGCAGCATGAGTCG G G A C A GAGCAGCTCAAGAGGCAGTTCTCACT G T G A CAGCCCTTCACCACAAGAAGACGGGC A A A T AATGTTTGATGTTGAGATGCACACCA G C AG GGACCACAGCTCTCAGTCAGAAGAAGA A G T TGTAGATGGAGAAAAAGAAGTTGAG G C T T TGAAGAAAAGTGCAGACTGGGTATCAGACT GGTCCAGTAGACCCGAAAACATCCCACCCAA AGAGTTCCATTTCAGACACCCTAAG C G T G C AGCCTCTCTAAGCATGAGGAAGAGTGGA G C CATGAAGAAAGGGGGCATTTTCTCTGCA G A GTTCCTGAAGGTCTTCATCCCATCTCTCT T C CTCTCTCACGTGTTGGCTTTGGGGCTGGGCA TCTATATCGGAAAACGACTGAGCAC A C C TT CTGCCAGCACCTACTGA。將處理好的目的片段連接到經(jīng)BamHⅠ、EcoRⅠ雙酶切的慢病毒pHBLV-CMVIE-IRES-Puro載體中,轉(zhuǎn)化感受態(tài)細胞DH5α,Nix平板篩選陽性重組子并進行測序鑒定。靶序列設計與合成均由上海漢恒生物科技有限公司完成。
1.2.2 Nix shRNA慢病毒表達載體的構(gòu)建 分別根據(jù)Genbank中大鼠Nix基因序列,設計與合成3對shRNA靶序列。其中,正義鏈5′端引入BamHⅠ酶切位點,反義鏈5′端引入EcoRⅠ酶切位點。Nix siRNA1序列:正義鏈5′-GATCCGGAAGAG TGGAGCCATGAAGATTCAAGAGATCTTCAT GGCTCCACTCTTCCTTTTTC-3′,反義鏈 5′-AA TTGAAAAAAGGAAGAGTGGAGCCATGAAG ATCTCTTGAATCTTCATGGCTCCACTCTTCCG-3′;Nix shRNA2 序 列:正 義 鏈 5′-GATCCGCACCAGCAGATTATAATCTTGTCAATTCAA GAGATTGACAAGATTATAATCTGCTGGTGTTTTTTC-3′,反 義 鏈5′-AATTGAAAAAACACCAGCAGATTATAATCTTGTCAATCTCTTGAATTGACAAGATTATAATCTGCTGGTGCG-3′;Nix shRNA3序列:正義鏈5′-GATCCGCACTCTG AGGGAATCTGTGTCTTATTTCAAGAGAATA AGACACAGATTCCCTCAGAGTGTTTTTTC-3′,反 義 鏈5′-AATTGAAAAAACACTCTGAGGGA ATCTGTGTCTTATTCTCTTGAAATAAGACA CAGATTCCCTCAGAGTGCG-3′(下劃線處為干擾序列)。將合成的DNA單鏈退火形成雙鏈,連接到經(jīng)BamHⅠ、EcoRⅠ雙酶切的慢病毒pHBLVU6-Scramble-Puro載體中,轉(zhuǎn)化感受態(tài)細胞 DH5α,Nix shRNA平板篩選陽性重組子并進行測序鑒定。靶序列設計與合成均由上海漢恒生物科技有限公司完成。
1.2.3 Nix和Nix shRNA慢病毒的包裝與滴度測定 取對數(shù)生長期的293T細胞,接種于75cm2細胞培養(yǎng)瓶中,接種量8×106個/孔,于37℃、5%CO2條件下培養(yǎng),待細胞密度達80%~90%時,按照漢恒生物LipofiterTM轉(zhuǎn)染試劑說明書操作,將含有重組子的慢病毒載體與病毒包裝輔助質(zhì)粒共感染293T細胞。轉(zhuǎn)染48和72h后分別兩次收集病毒上清,以0.45μm濾器過濾后,于40mL超速離心管中,4℃、離心120min(離心半徑20cm,轉(zhuǎn)速7 000r/min),500μL新鮮培養(yǎng)液重懸病毒沉淀,置于-80℃保存。分別取部分慢病毒濃縮液,采用梯度稀釋法測定,并按照滴度(TU/mL)=細胞數(shù)百分比×MOI(1)×病毒稀釋倍數(shù)×103,計算病毒滴度。慢病毒的包裝與滴度測定均由上海漢恒生物科技有限公司完成。
1.2.4 慢病毒感染PC12細胞和穩(wěn)定感染PC12細胞株的篩選 取對數(shù)生長期的PC12細胞,接種于24孔板中,接種量5×104個/孔,于37℃、5%CO2培養(yǎng)24h,待細胞密度達80%~90%時,以病毒液與培養(yǎng)液體積比1∶9的比例,加入對照慢病毒、Nix和Nix shRNA慢病毒進行感染,24h后更換新鮮培養(yǎng)液,48h后加入2.5μg/mL的puromycin篩選陽性細胞。持續(xù)篩選兩周后,獲得各組慢病毒穩(wěn)定感染PC12細胞株。
1.2.5 細胞熒光技術(shù)檢測Nix熒光數(shù)量 取對數(shù)生長期的對照慢病毒、Nix和Nix shRNA慢病毒穩(wěn)定感染的PC12細胞,接種于多聚賴氨酸包被圓玻片的24孔板中,接種量為5×104個/孔,37℃、5%CO2細胞培養(yǎng)箱培養(yǎng)24h后,吸去培養(yǎng)基,PBS洗滌3次,冰甲醇-20℃,固定15min,PBS洗滌3次,加入封閉液室溫封閉1h,吸出封閉液,加入一抗(Nix 1∶200)后,4℃過夜。吸出一抗,PBS洗滌3次,加入二抗(羊抗兔Alexa Fluor 488 1∶500)37℃孵育1h,吸出二抗,PBS洗滌3次,封片,利用熒光顯微鏡觀察照相。
1.2.6 Western blot檢測各組慢病毒穩(wěn)定感染PC12細胞中Nix蛋白的表達 分別收集對照慢病毒、Nix和Nix shRNA慢病毒穩(wěn)定感染的PC12細胞,加入ripa裂解液冰上裂解30min,于4℃、離心15min(離心半徑20cm,轉(zhuǎn)速1 2000r/min),收集裂解上清液,BCA法測定蛋白濃度。SDS-PAGE電泳,每組上樣60μg/泳道,PVDF膜濕轉(zhuǎn)60~80 min,一抗(Nix 1∶800、β-actin 1∶5 000)4℃孵育過夜,TBST洗膜3次,二抗(HRP標記的羊抗兔或鼠二抗1∶5 000)37℃孵育1h,TBST洗膜3次,凝膠成像法檢測相關(guān)蛋白的表達情況。
測序結(jié)果顯示,Nix過表達載體測序結(jié)果與設計的Nix靶序列完全一致。3條Nix shRNA慢病毒載體序列與設計的3對shRNA靶序列完全一致(圖1),表明成功構(gòu)建針對Nix基因的重組慢病毒載體。
計算得到各組慢病毒滴度均達到2×108PFU/mL,滴度較高,可以用于下一步實驗要求。
熒光顯微鏡觀察各組慢病毒穩(wěn)定感染的PC12細胞,顯示Nix穩(wěn)定感染PC12細胞與對照細胞相比,Nix熒光水平明顯增強,Nix shRNA1穩(wěn)定感染PC12細胞與對照細胞相比,熒光水平明顯減弱(圖2)。
對各組慢病毒穩(wěn)定感染PC12細胞中Nix蛋白的表達情況分別進行Western blot檢測,可以看到Nix基因過表達感染PC12細胞中Nix蛋白表達顯著升高(圖3)。shRNA1、shRNA2和shRNA3慢病毒感染的PC12細胞中Nix蛋白表達明顯降低,其中shRNA1感染PC12細胞中Nix蛋白降低最顯著(圖4)。

圖1 慢病毒載體的測序結(jié)果

圖2 熒光顯微鏡觀察各組慢病毒穩(wěn)定感染PC12細胞中Nix熒光水平(×200)

圖3 Western blot檢測Nix基因過表達慢病毒穩(wěn)定感染PC12細胞中Nix蛋白的表達情況

圖4 Western blot檢測Nix shRNA各組慢病毒穩(wěn)定感染PC12細胞中Nix蛋白的表達情況
線粒體自噬是細胞生物學研究的熱點,線粒體自噬功能障礙與多種疾病的發(fā)生有著密切聯(lián)系,比如神經(jīng)退行性疾病、血液病、心血管疾病、代謝性疾病和腫瘤等[12]。深入研究線粒體自噬調(diào)控的分子機制將有利于更深入了解疾病的發(fā)病機制,為疾病的預防和治療提供新的靶點。
Nix是近年來發(fā)現(xiàn)的隸屬BCL-2家族中的BH3-only促凋亡家族成員,定位于線粒體,雖然具有BCL-2家族特征性的BH3域和羧基末端跨膜結(jié)構(gòu)域(TM),也能與BCL-2形成二聚體,但Nix促凋亡活動明顯不同于其他BCL-2家族成員[13]。研究[13]發(fā)現(xiàn),Nix可以通過一種微弱或推遲的方式引起細胞死亡,并能誘導自噬,調(diào)節(jié)線粒體的清除。這些不同活動都涉及一個統(tǒng)一的主題,即線粒體。線粒體是Nix誘導自噬的重要中介,Nix通過不同機制使線粒體功能障礙,促進死亡因子釋放,最終細胞在發(fā)展過程中或壓力應激下通過Nix針對性清除線粒體。越來越多的證據(jù)顯示,Nix參與了人類疾病的發(fā)展[14-15]。在缺血性損傷和心臟疾病中,Nix表達水平降低,Nix缺失可保護由Gaq介導的壓力負荷型心臟病[16]。Nix在癌癥中的作用更為復雜[10],在癌癥發(fā)展的不同時期,它既能促進細胞死亡又能促進細胞存活。在神經(jīng)退行性疾?。?7]如帕金森病、亨廷頓病和阿爾茨海默癥中,Nix表達水平明顯升高。Nix表達的失調(diào)很大程度上影響了疾病的進展。在未來的研究中,我們將進一步闡明依賴Nix的細胞死亡機制,并確定其在疾病中的作用。
本研究采用酶切連接的方法,成功構(gòu)建了有關(guān)Nix基因過表達和shRNA慢病毒表達載體,并獲得Nix過表達與干擾細胞模型,為進一步研究Nix介導細胞自噬及線粒體自噬的分子機制奠定了基礎。
[1]Novak I.Mitophagy:a complex mechanism of mitochondrial removal[J].Antioxidants Redox Signaling,2012,17(5):794-802.
[2]Galluzz L,Kepp O,Trojel-Hansen C,et al.Mitochondrial control of cellular life,stress,and death[J].Circ Res,2012,111(9):1198-1207.
[3]Li LY,Luo X,Wang X.Endonuclease G is an apoptotic DNase when released from mitochondria[J].Nature,2001,412(6842):95-99.
[4]Wallace DC.Mitochondrial diseases in man and mouse[J].Science,1999,283(5407):1482-1488.
[5]Gerald GW.Mechanisms of non-apoptotic programmed cell death in diabetes and heart failure[J].Cell Cycle,2010,9(17):3442-3448.
[6]Palikaras K,Tavernarakis N.Mitophagy in neurodegeneration and aging[J].Front Genet,2012,3:297.
[7]DiMauro S,Schon EA.Mitochondrial disorders in the nervous system [J].Annu Rev Neurosci,2008,31:91-123.
[8]Chan DC.Mitochondria:dynamic organelles in disease,aging,and development[J].Cell,2006,125(7):1241-1252.
[9]Taylor R,Goldman SJ.Mitophagy and disease:new avenues for pharmacological intervention[J].Curr Pharm Des,2011,17(20):2056-2073.
[10]Sowter HM,Ratcliffe PJ,Watson P,et al.HIF-1-dependent regulation of hypoxic induction of the cell death factors BNIP3and NIX in human tumors[J].Cancer Res,2001,61(18):6669-6673.
[11]Bursch W,Karwan A,Mayer M,et al.Cell death and autophagy:cytokines,drugs,and nutritional factors [J].Toxicology,2008,254(3):147-157.
[12]Kitamura N,Nakamura Y,Miyamoto Y,et al.Mieap,ap53-Inducible protein,controls mitochondrial quality by repairing or eliminating unhealthy mitochondria[J].PLoS One,2011,6(1):e16060.
[13]Zhang J,Ney PA.Mechanisms and biology of B-cell leukemia/lymphoma 2/adenovirus E1Binteracting protein 3and Niplike protein x [J].Antioxidants Redox Signaling,2011,14(10):1959-1965.
[14]Redmann M,Dodson M,Boyer-Guittaut M,et al.Mitophagy mechanisms and role in human diseases[J].Int J Biochem Cell Biol,2014,53:127-133.
[15]Nakamura Y,Kitamura N,Shinogi D,et al.BNIP3and NIX mediate mieap-induced accumulation of lysosomal proteins within mitochondria[J].PLoS One,2012,7(1):30767.
[16]Diwan A,Wansapura J,Syed FM,et al.Nix-mediated apoptosis links myocardial fibrosis,cardiac remodeling,and hypertrophy decompensation[J].Circulation,2008,117(3):396-404.
[17]Wilhelm M,Xu ZH,Kukekov NV,et al.Proapoptotic nix activates the JNK pathway by interacting with POSH and mediates death in a Parkinson disease model [J].J Biol Chem,2007,282(2):1288-1295.